• 제목/요약/키워드: Sequence effect

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염소의 베타-락토글로불린 유전자 프로모터의 음성 조절 인자 규명 (Identification of the Negative Regulatory Element on the Caprine $\beta$ Lactoglobulin Promoter)

  • 김재만;유명희
    • 한국동물학회지
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    • 제38권3호
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    • pp.433-441
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    • 1995
  • 염소 베타-락토글로불린 유전자 프로모터의 유선 조직 특이성은, 비 발현 세포에서 -470 에서 -205 부위에 의해서 매개되는 억제 조절에 의해서 보증된다. 이 음성 조절 기작과 억제 조절을 매개하는 인자를 확인하기 위하여 상류 염기 서열을 자세히 분석하였다. 상류 염기 서열은 어느 방향으로 위치하든 연결된 베타-락토글로불린 유전자 프로모터의 활성을 억제할 수 있었다. 이와 같이 규명된 염소 베타-락토글로불린 유전자의 잠정적 음성 조절 인자는 다른 유전자의 프로모터들에 대해서는 다양한 활성을 보였는데, herpes simplex 바이러스의 thimidine kinase 프로모터는 상류 염기서열의 방향에 따라 억제 또는 활성화되었으며, SV40 프로모터는 억제되기보다는 오히려 활성화되었다. 염소 베타-락토글로불린 유전자의 억제 조절 인자를 포함하는 조절 부위는 비 유선 세포인 HeLa 및 CV-1 세포에서 추출된 핵 추출물에 의해서 이동성이 강력하게 지연되는 반면, 유선세포인 HC11 세포의 핵 추출물에 의해서는 약하게 지연되었다. 이와 같은 활성 억제와 인자 결합간의 연관성은 foot-printing 분석에서 관찰된 결합 부위가 염소의 베타-락토글로불린 유전자의 조직특이적 억제에 작용할 음성 조절 인자일 가능성을 시사한다.

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폴리(에틸렌 테레프탈레이트)/폴리(에틸렌 나프탈레이트) 공중합체의 유연기판 특성 (Characteristics of PET-PEN Copolymer as a Material for Flexible Substrate)

  • 염주선;김재현;강호종
    • 폴리머
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    • 제35권6호
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    • pp.599-604
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    • 2011
  • 폴리에스테르 유연기판 제조를 위하여 PET-PEN 공중합체를 합성하고 이들의 형태학적 변화가 유연기판 특성에 미치는 영향을 살펴보았다. 합성된 PET-PEN 공중합체는 DMT/NDC의 조성비에 따라 공중합체 block sequence가 달라짐을 확인하였다. 공중합체에 PET-PEN과 PEN의 block sequence가 증가할수록 유리전이온도가 증가하며 이에 따라 유연기판의 치수안정성이 증가됨을 확인하였으며 DMT/NDC의 조성비가 50/50인 경우, 열팽창계수(CTE)가 최소가 됨을 확인하였다. 합성된 PET-PEN 공중합체는 광투과 특성이 80% 이상을 유지하며 1시간 동안 $280^{\circ}C$에서의 열안정성도 0.4 wt% 이내를 유지하여 유연기판으로 적용이 가능함을 알 수 있었다.

자기공명영상 왜곡에서 마스카라와 아이섀도의 영향 (Effects of the mascara and eye shadow on theMR image distortion)

  • 이현용;신운재;박병래
    • 대한방사선기술학회지:방사선기술과학
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    • 제28권1호
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    • pp.25-32
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    • 2005
  • 목 적 : 마스카라와 아이섀도가 자기공명영상 획득시 artifact를 어느 정도 일으키는가를 알아보고, pulse sequence에 따른 영상 왜곡의 차이를 비교하고자 한다. 대상 및 방법 : 실제 국내 여성들이 많이 사용 중인 3개 제조사의 제품 중 마스카라(M1, M2, M3)와 아이섀도(E1, E2, E3)를 선별하여 사용하였다. 자체 제작한 내경이 4 cm, 코일의 길이가 8 cm인 Tx/Rx 겸용의 quadrature type의 안장 코일을 사용하였다. 실험 1에서는 마스카라를 실험 2에서는 아이섀도를 실험 3에서는 마스카라에 아이섀도를 덧바른 후 영상을 획득하였다. Pulse sequence는 FSE(fast spin echo), SE(spin echo), GE(gradient echo)기법을 적용하였으며, 나타난 artifacts는 axial상에서 폭, sagittal상에서 길이를 각각 측정하였다. 각 sequence별로 측정된 영상왜곡 정도를 정량적 및 정성적으로 분석하였다. 결 과 : 마스카라와 아이섀도가 자기공명영상에서 부분적으로 artifact가 발생되어 영상왜곡을 유발하였다. Pulse sequence에 따른 artifact의 유발 정도도 다소 차이가 나타났다. 마스카라에 아이섀도를 덧바른 실험 3에서는 axial상에서 GE sequence에서 16.73 mm, SE에서 6.64 mm, FSE에서 6.19 mm의 폭으로 GE 기법에서 가장 많이 유발되었으며, SE, FSE 기법 순으로 높게 나타났다. sagittal상에서 GE sequence에서 22.84 mm, SE에서 18.15 mm, SE에서 17.81 mm의 길이로 GE 기법에서 가장 많이 유발되었으며, SE, FSE 기법 순으로 낮게 나타났다. 결 론 : 마스카라와 아이섀도로 화장한 여성의 뇌 및 안구 영상검사시 artifact가 영상진단에 영향을 미치는 것으로 판단된다. 뇌 및 안구 T2 강조영상을 얻고자 하는 경우는 pulse sequence를 GE보다 FSE 기법을 사용하는 것이 적합한 것으로 사료된다.

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한우 산유량에 미치는 Mitochondrial DNA D-loop영역의 염기서열 변이효과 (Effect of Sequence Variation in Bovine Mitochondrial DNA D-Ioop Region on ~ilk Production for Hanwoo)

  • 공홍식;오재돈;임현진;이학교;전광주;윤두학;전기준;최재관;최연호;조병욱
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제46권5호
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    • pp.729-734
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    • 2004
  • 본 연구는 한우의 mtDNA D-loop 영역 염기 변이가 산유량에 미치는 효과를 검증하기 위하여 수행하였다. 젖소의 mtDNA D-loop 영역에서 단일염기의 치환이 20 개의 지역에서 확인되었다. 그중 8, 169, 16042, 16051, 16057, 16093, 16119, 16122, 16209, 16255, 16302 bp 지역에서 높은 빈도의 염기치환이 검출되었다. 16119bp 지역에서는 T가 C로 치환된 빈도가 0 .138로 검출되었으며, 이 위치에서의 염기치환에 의한 산유량 효과는 -1.61 (p<0.1)로 나타났다. 16185bp 지역에서의 염기치환에 의한 산유량 효과는 3.557(p<0.05)로 나타났으며 G가 A로 치환된 빈도는 0.063로 나타났다. 본 연구에서 검출한 한우 다유계통 집단의 mtDNA내 D- loop 영역의 염기서열 변이 빈도와 유량과의 연관성분석 결과 등은 한우 집단의 유전적 변이성 추정과 좀 더 다양한 경제형질과의 관련성 분석으로 다양한 유전적 지표인자 발굴에 도움 될 것이며 이를 통해 분자유전학적 기법을 이용한 한우의 육종 전략을 확립하논데 기초 자료가 되는 것은 물론 우려나라 고유 품종인 한우의 유전자원 보존과 분자육종학적인 연구에 기초 자료로서 유용하게 활용 할 수 있을 것으로 기대된다.

한우 경제형질에 미치는 Mitochondrial DNA D-loop 영역의 염기서열 변이효과 (Effect of Sequence Variation in Bovine Mitochondrial DNA D-loop Region on Economic Traits for Hanwoo)

  • 오재돈;윤두학;공홍식;임현진;이학교;조병욱;홍기창;전광주
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제45권6호
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    • pp.933-938
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    • 2003
  • 본 연구는 한우 mt DNA D-loop 영역의 염기변이 다형성과 경제형질간의 관련성을 분석하기 위하여 수행하였다. 한우의 mtDNA D-loop 영역에서 단일염기의 치환 의해 총 25개의 polymorphic site가 확인되었다. 그중 주요 Polymorphic site의 염기변이 빈도는 169, 16042, 16093, 16119, 16255 및 16302번째 위치에서 0.891, 0.117, 0.109, 0.182, 0.197 및 0.117로 검출되었다. 169 및 16119번째 위치에서의 염기치환에 의한 MS의 효과는 -1.08(p〈0.05), 1.29(p〈0.01)로 나타났으며, 169 및 16042번째 위치에서의 염기치환에 의한 BF의 효과는 -0.31(p〈0.01)과 0.34(p〈0.01)로 나타났다. 본 연구에서 검출한 한우 mtDNA내 D-loop 영역의 염기서열 변이 빈도 등은 한우집단의 유전적 변이성 추정과 좀 더 다양한 경제형질과의 관련성 분석은 물론 모계유전 양상 분석을 통한 한우의 형성과정과 타 품종과의 계통분류적 상호 관계 등의 분석에 유용하게 활용할 수 있을 것으로 기대된다.

Transcriptional Regulation of a DNA Repair Gene in Saccharomyces cerevisiae

  • Jang, Yeon-Kyu;Sancar, Gwen-B.;Park, Sang-Dai
    • 한국동물학회:학술대회논문집
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    • 한국동물학회 1998년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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    • pp.113-113
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    • 1998
  • In Saccharomyces cerevisiae UV irradiation and a variety of chemical DNA -damaging agents induce the transcription of specific genes, including several involved in DNA repair. One of the best characterized of DNA -damage inducible genes is PHRI, which encodes the apoenzyme for DNA photolyase. Basal-level and damage-induced expression of PHRI require an upstream activation sequence, UASPHRI. Here we report the identification of the UlvIE6 gene of S. cerevisiae as a regulator of UASPHRl activity. Surprisingly, the effect of deletion of UME6 is growth phase dependent. In wild-type cells PHRI is induced in late exponential phase, concomitant with the initiation of glycogen accumulation that precedes the diauxic shift. Deletion of UNIE6 abolishes this induction, decreases the steady-state concentration of photolyase molecules and PHRI mRNA, and increases the UV sensitivity of a rad2 mutant. The results suggest that UM E6 contributes to the regulated expression of a subset of damage-responsive genes in yeast. Furthermore, the upstream repression sequence, URSPHRI, is required for repression and damage-induced expression of PHRl. Here we show identification of YER169W and YDR096W as putative regulators acting through $URS_{PHRI}$. These open reading frames were designated as RPHI (YERl69W) and RPH2 (YDR096W) indicating regulator of PHRI. Simultaneous disruption of both genes showed a synergistic effect, producing a four-fold increase in basal level expression and a similar decrease m the induction ratio following treatment of methyl methanesulfonate(MMS). Mutation of the sequence ($AG_4$) bound by Rphlp rendered the promoter of PHRI insensitive to changes in RPHI or RPH2 status. The data suggest that RPHI and RPH2 act as damage-responsive negative regulators of PHRI. Surprisingly, the sequence bound by Rphlp in vitro is found to be $AG_4$ which is identical to the consensus binding site for the regulators Msn2p and Msn4p involved in stress-induced expression. Deletion of MSN2 and MSN4 has little effect on the induction$.$ ratio following DNA damage. However, all deletions led to a significant decrease in basal-level and induced expression of PHRI. These results imply that MSN2 and MSN4 are positive regulators of P HRI but are not required for DNA damage repression. [Supported by grant from NIH]om NIH]

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아급성기 뇌졸중 환자에서 지각-운동 과제를 통한 내잠 학습의 효과 (The Effect of Implicit Motor Sequence Learning Through Perceptual-Motor Task in Patients with Subacute Stroke)

  • 이미영;박래준;남기석
    • The Journal of Korean Physical Therapy
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    • 제20권3호
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    • pp.1-7
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    • 2008
  • Purpose: Implicit motor learning is the capacity to acquire skill through physical practice without conscious awareness of what elements of performance improved. This study investigated whether subacute stroke patients can implicitly learn a perceptual-motor task. Methods: We recruited 12 patients with subacute stroke and 12 age-matched controls. All participants performed a perceptual-motor task that involved pressing a button corresponding with colored circles (blue, green, yellow, red) on a computer screen. The task consists of 7 blocks composed of 10 repetitions for a repeating 12-element sequence (total 120 responses). Results: Both groups demonstrated significant improvement in acquisition performance. Reaction times deceased in both groups at similar rate within the sequential block trials (2-5 blocks), and reaction times increased at a similar rate when the task paradigm was transferred from the sequential block trial to the random block trial (5-6-7 blocks). Conclusion: The results of this study suggest that patients with sub-actue stroke can implicitly learn a perceptual motor skill. Although explicit instructions should be used to focus the learner's attention rather than provide information about the task, the application of implicit motor learning strategies in the rehabilitation setting may be beneficial.

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Closely Spaced Target Detection using Intensity Sorting-based Context Awareness

  • Kim, Sungho;Won, Jin-Ju
    • Journal of Electrical Engineering and Technology
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    • 제11권6호
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    • pp.1839-1845
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    • 2016
  • Detecting remote targets is important to active protection system (APS) or infrared search and track (IRST) applications. In normal situation, the well-known constant false alarm rate (CFAR) detector works properly. However, decoys in APS or closely spaced targets in IRST degrade the detection capability by increasing background noise level in the CFAR detector. This paper presents a context aware CFAR detector by the intensity sorting and selection of background region to reduce the effect of neighboring targets that lead to incorrect estimation of background statistics. The existence of neighboring targets can be recognized by intensity sorting where neighboring targets usually show highest ranks. The proposed background statistics (mean, standard deviation) estimation method from median local pixels can be aware of the background context and reduce the effects of the neighboring targets, which increase the signal-to-clutter ratio. The experimental results on the synthetic APS sequence, real adjacent target sequence, and remote pedestrian sequence validated that the proposed method produced an enhanced detection rate with the same false alarm rate compared with the hysteresis-CFAR (H-CFAR) detection.

DEA 기반 벤치마킹에서의 효율성 개선 경로 선정을 위한 최적화 접근법에 관한 연구 (An Optimization Approach to the Construction of a Sequence of Benchmark Targets in DEA-Based Benchmarking)

  • 박재훈;임성묵;배혜림
    • 대한산업공학회지
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    • 제40권6호
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    • pp.628-641
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    • 2014
  • Stepwise efficiency improvement in data envelopment analysis (DEA)-based benchmarking is a realistic and effective method by which inefficient decision making units (DMUs) can choose benchmarks in a stepwise manner and, thereby, effect gradual performance improvement. Most of the previous research relevant to stepwise efficiency improvement has focused primarily on how to stratify DMUs into multiple layers and how to select immediate benchmark targets in leading levels for lagging-level DMUs. It can be said that the sequence of benchmark targets was constructed in a myopic way, which can limit its effectiveness. To address this issue, this paper proposes an optimization approach to the construction of a sequence of benchmarks in DEA-based benchmarking, wherein two optimization criteria are employed : similarity of input-output use patterns, and proximity of input-output use levels between DMUs. To illustrate the proposed method, we applied it to the benchmarking of 23 national universities in South Korea.

NFC Tag와 스마트폰을 이용한 진동벨 시스템 개발 (The Vibration Bell System Development Using NFC Tag and Smart Phone)

  • 임종범;임양미
    • 한국멀티미디어학회논문지
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    • 제18권8호
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    • pp.968-979
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    • 2015
  • In this paper, we study a vibration bell App which shows waiting sequence numbers by utilizing smartphones to solve an inconveniently long waiting time from ordering to getting foods in restaurants and coffee shops. Unlike existing independently developed hardware and software, the vibration bell App is developed to manage and integrate customer management service, POS service in shops, and group shop management services. The functions of the vibration bell App include two-way communications based on NFC- issuing waiting sequence numbers and electronic coupon, showing event information, and transferring user information. Furthermore, the user's personal information is minimized by recognizing the pre-existing information of the user's smartphone. Replacing the shop's vibration bell system with the vibration bell APP, the shops can reduce the cost of construction and maintenance by up to 1/10, compared to the cost of for existing vibration bell systems. Moreover, the customer's preference and current sales trend can be easily figured out. Thus, it will have a great effect on the future marketing strategies.