• 대한원격탐사학회:학술대회논문집
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• 대한원격탐사학회 2004년도 Proceedings of ISRS 2004
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• pp.99-102
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• 2004

Recently according to developing of bioinformatics techniques, there are a lot of researches about large amount of biological data. And a variety of files and databases are being used to manage these data efficiently. However, because of the deficiency of standardization there are a lot of problems to manage the data and transform one into the other among heterogeneous formats. We are interested in integrating. saving, and managing gene and protein sequence data generated through sequencing. Accordingly, in this paper the goal of our research is to implement the system to manage sequence data and transform a sequence file format into other format. To satisfy these requirements, we adopt BSML (Bioinformatics Sequence Markup Language) as the standard to manage the bioinformatics data. And then we integrate and store the heterogeneous 리at file formats using BSML schema based DTD. And we developed the system to apply the characteristics of object-oriented database and to process XPath query, one of the efficient structural query. that saves and manages XML documents easily.

• 한국추진공학회:학술대회논문집
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• 한국추진공학회 2009년도 제33회 추계학술대회논문집
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• pp.130-133
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• 2009

액체 로켓 엔진의 경우 작동초기인 점화와 마지막의 소염시의 추진제 공급 순서는 안정적으로 시스템을 운영하는데 많은 영향을 끼친다. 안정적인 엔진의 작동확인을 위해 점화할 때 공급순서와 소염할 때 추진제의 공급 순서를 바꾸어 가면서 연소 실험을 수행 하였다. 본 연구에 사용된 분사기는 과산화수소와 케로신을 추진제로 사용하는 동축 스월형이며, 점화 방식은 촉매 점화를 방식을 사용하였다. 본 실험을 통해서 액체로켓엔진의 연소 시험을 안정적으로 수행하기 위해 점화와 소염할 때의 최적의 시퀀스를 찾아내었다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제28권1호
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• pp.49-54
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• 2012

In August 2010, a severe crown rot was observed on chrysanthemum ($Chrysanthemum$ $morifolium$ Ramat., variety Sinro) in several greenhouses located at Damyang and Muan, Jeonnam province, Korea. Three isolates (EML-CHS1, -CHS2, and -CHS3) of $Fusarium$ were isolated from the affected plants and identified based on morphological characteristics and rDNA internal transcribed spacer (ITS) sequence analysis. Sequence analysis by BLAST indicated that EMLCHS1, -CHS2 and CHS3 were closest to a $Fusarium$ species, $F.$ $solani$ with > 99% sequence similarity. Pathogenicity tests were performed on chrysanthemum with spore suspensions containing $3.4{\times}10^6$ spores/ml using the dipping method. Ten days after inoculation, similar symptoms to those observed in the greenhouses were seen on the inoculated plants. The causal fungus was reisolated from the artificially inoculated basal stems, fulfilling Koch's postulates. To our knowledge, this is the first report of crown rot by $Fusarium$ $solani$ on chrysanthemum ($Chrysanthemum$ $morifolium$) in Korea.

• 미생물학회지
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• 제40권3호
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• pp.211-216
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• 2004

세포외 phospholipase D (PLD)를 과량 생산하는 균주 JE-11을 토양으로부터 분리하였다. 16S rDNA에 의한 분석과 형태적, 생리적 특성을 조사한 결과 이 균은 Streptomyces somaliensis로 동정되었다. 선발한 S. somaliensis로 부터 PLD를 암호화하는 유전자(sspld) 분리하고 염기서열을 조사하였다. Open reading frame을 분석한 결과 33개의 아미노산으로 이루어진 분비 signal peptide와 505개의 아미노산으로 구성된 PLD단백질을 암호화하는 것으로 예상되었다. 또한, sspld의 염기 서열로부터 유추된 단백질 서열은 기존에 보고된 다른 Streptomyces PLD들과 70-88％의 서열 유사성을 보였다. 이 PLD는 96-98％(㏖/㏖)의 수율로서, Phosphatidylcholine을 glycerol과 serine을 기질로 하여 각각 phosphatidylglycerol 과phosphatidylserine으로 전환을 하였으나, 알코올 공여체인 inositol과 ethanolamine과는 반응하지 않았다.

• Journal of Microbiology
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• 제35권3호
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• pp.206-212
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• 1997

Heliobacillus mobilis is a strictly anaerobic Gram-positive bacterium which contains a primitive Photosystem I-type reaction center. The membrane-bound cytochrome $C_{553}$ from the heliobacterium suggested to be the immediate electron donor to the photooxidized pigment (P798+) has been isolated and characterized. The heme protein was visualized as a major component with an apparent molecular size of 17kDa in TMBZ-staining analysis of the membrane preparation and showed characteristic $\alpha$ (552.5 nm), $\beta$ (522nm), and Soret absorption (416 nm) peaks of a typical reduced c-type cytochrome in the partially purified sample. The internal 43 amino acid sequence of the electron donor was obtained by chemical agent and protease treatments followed by N-terminal sequencing of the resulting fragments. The internal sequence carries lots of lysine residues and a Cys-X-X-Cys-His sequence motif which are the characteristics of typical c-type cytochromes. The analysis of the sequence by FAST or FASTA program, however, did not show any significant similarity to other known heme proteins.

• 한국멀티미디어학회논문지
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• 제22권6호
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• pp.655-664
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• 2019

In this paper, we propose a novel way of combining multiple deep convolutional neural network (DCNN) architectures which work well for accurate video face identification by adopting a serial combination of 3D and 2D DCNNs. The proposed method first divides an input video sequence (to be recognized) into a number of sub-video sequences. The resulting sub-video sequences are used as input to the 3D DCNN so as to obtain the class-confidence scores for a given input video sequence by considering both temporal and spatial face feature characteristics of input video sequence. The class-confidence scores obtained from corresponding sub-video sequences is combined by forming our proposed class-confidence matrix. The resulting class-confidence matrix is then used as an input for learning 2D DCNN learning which is serially linked to 3D DCNN. Finally, fine-tuned, serially combined DCNN framework is applied for recognizing the identity present in a given test video sequence. To verify the effectiveness of our proposed method, extensive and comparative experiments have been conducted to evaluate our method on COX face databases with their standard face identification protocols. Experimental results showed that our method can achieve better or comparable identification rate compared to other state-of-the-art video FR methods.

• 정보처리학회논문지D
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• 제10D권2호
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• pp.261-266
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• 2003

단백질은 아미노산의 선형 중합체(linear polymer)로서 생체의 조직을 구성하고 각종 생화학 반응을 조절하는 역할을 하는 가장 중요한 생체 분자에 속한다. 이러한 단백질의 특성과 기능은 해당 단백질을 구성하는 아미노산의 서열에 의해 결정되기 때문에, 주어진 단백질의 서열을 알아내는 것은 단백질 기능 연구의 출발점이다. 본 논문은 기존의 생화학적 단백질 서열 결정 방법의 단점을 극복할 수 있는 데이터 마이닝 기반 단백질 서열 예측 기법을 제안한다. 복수개의 단백질 절단효소(protease)를 적용함으로써, 서로 중첩된 단백질 조각을 얻어내고, 각 조각의 질량 정보와 단백질 데이타베이스를 이용하여 후보 서열을 식별한다. 얻어진 후보 서열의 조립을 통해 전체 서열을 결정하기 위한, 다중 분할 그래프(multi-partite graph) 구축 및 경로 탐색 기법을 제안한다. 아울러, 대표적인 단백질 서열 데이타베이스인 SWISS-PROT을 이용한 실험을 통해 제안한 방법의 성능을 평가한다.

• 한국어병학회지
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• 제26권1호
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• pp.39-44
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• 2013

자연산 다묵장어, Lethenterone reissneri에서 발생한 물곰팡이병의 원인체를 형태학적 및 유전학적 연구를 통하여 동정하였다. 분리균주는 격벽이 없는 균사를 형성하였고, 가늘고 긴 모양의 유주자낭 내에 활발한 운동성을 보이는 유주자가 여러 줄로 배열되었다가 유주자낭의 선단에서 휴면하지 않고 한꺼번에 방출되는 특징을 보였다. 한편 유성생식기관인 조란기와 조정기는 관찰되지 않았다. 또한 분리균주의 ITS sequence를 분석하고 Saprolegnia 속의 다른 분리균주와 유전학적 상관관계를 조사한 결과, S. parasitica가 속해있는 clade I에 분류되는 것을 확인할 수 있었다. 무성생식기관의 형태, 유주자 방출방식 및 ITS sequence의 phylogenetic analysis에 근거하여 자연산 다묵장어에서 관찰된 물곰팡이병의 원인체는 S. parasitica인 것으로 동정되었다.

• 한국멀티미디어학회논문지
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• 제7권11호
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• pp.1505-1514
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• 2004

시퀀스 매칭은 시계열 데이터베이스로부터 질의 시퀀스와 변화의 추세가 유사한 데이터 시퀀스들을 검색하는 연산이다. 기존의 대부분의 연구에서는 효과적인 시퀀스 매칭을 위하여 다차원 인덱스를 사용하며, 데이터 시퀀스를 이산 푸리에 변환(Discrete Fourier Transform: DFT)한 후, 단순히 앞의 두 개 내지 세 개의 DFT 계수만을 구성 속성 (organizing attributes)으로 사용함으로써 고차원의 경우 발생하는 차원 저주(dimensionality curse) 문제를 해결한다. 본 논문에서는 기존의 단순한 기법이 가지는 성능 상의 문제점들을 지적하고, 이러한 문제점들을 해결하는 최적의 다차원 인덱스 구성 기법을 제안한다. 제안된 기법은 대상이 되는 시계열 데이터베이스의 특성을 사전에 분석함으로써 변별력이 뛰어난 요소들을 다차원 인덱스의 구성 속성으로 선정하며, 비용 모델(cost model)을 기반으로 한 시퀀스 매칭 비용의 추정을 통하여 다차원 인덱스에 참여하는 최적의 구성 속성의 수를 결정한다. 제안된 기법의 우수성을 규명하기 위하여 실험을 통한기존 기법과의 성능 비교를 수행하였다 실험 결과에 의하면, 제안된 기법은 기존의 기법에 비교하여 매우 큰 성능 개선 효과를 가지는 것으로 나타났다.

• 한국석유지질학회:학술대회논문집
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• 한국석유지질학회 2000년도 제7차 학술발표회 발표논문집
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• pp.14-30
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• 2000

Hierarchically controlled sequence stratigraphic analysis shows that the Lower Ordovician mixed carbonate-siliciclastic Mungok Formation, Korea consists of three depositional sequences: T1, T2, and T3. Sequence boundaries are generally marked by abrupt transition from coarse-grained shallow-water carbonates to fine-grained deeper-water carbonates mixed with fine-grained siliciclastics, and show indication of subaerial exposure such as karstification. Within this sequence stratigraphic framework, facies characteristics indicate that the Mungok sequences were mostly deposited in subtidal ramp environments. High-frequency cycles consist of upward-shallowing facies successions. Cycles of shallow-water and basinal deposits are not represented well, probably due to cycle amalgamation. Cycle stacking patterns do not show a consistent thickness change that reflects a large-scale sea-level change due to unfilled accommodation space. The Mungok sequences show that many factors including relative sea-level change and topography are involved in controlling sequence development on carbonate ramps. The depositional setting evolved from the high-energy ramps in the sequences T1 and T2 into the low-energy ramp in the sequence T3. Topography is interpreted to have been responsible for the different energy regimes of the carbonate ramps in the Mungok sequences. The high ramp gradient in the sequences T1 and T2 seems to be caused by space-time-dissociated differential sedimentation resulting in spatially narrow distribution of sediment filling, which in turn may be related to high rate of relative sea-level change. In contrast, low ramp gradient was maintained in the sequence T3 during slow changes of relative sea level resulting in broad distribution of sediment filling.