• ALGAE
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• 제31권3호
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• pp.219-230
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• 2016

The Euglena deses group are common freshwater species composed of E. adhaerens, E. carterae, E. deses, E. mutabilis, and E. satelles. These species are characterized by elongated cylindrical worm-like cell bodies and numerous discoid chloroplasts with a naked pyrenoid. To understand the cryptic diversity, species delimitation and phylogenetic relationships among members of the group, we analyzed morphological data (light and scanning electron microscopy) and molecular data (nuclear small subunit [SSU] and large subunit [LSU] rDNAs and plastid SSU and LSU rDNAs). Bayesian and maximum likelihood analyses based on the combined four-gene dataset resulted in a tree consisting of two major clades within the group. The first clade was composed of two subclades: the E. mutabilis subclade, and the E. satelles, E. carterae, and E. adhaerens subclade. The E. mutabilis subclade was characterized by a lateral canal opening at the anterior end and a single pellicular stria, whereas the E. satelles, E. carterae, and E. adhaerens subclade was characterized by an apical canal opening at the anterior end of the cell and double pellicular striae. The second clade consisted of 20 strains of E. deses, characterizing by a subapical canal opening at the anterior end and double pellicular striae, but they showed cell size variation and high genetic diversity. Species boundaries were tested using a Bayesian multi-locus species delimitation method, resulting in the recognition of five cryptic species within E. deses clade.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제5권4호
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• pp.194-199
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• 1995

A portion (7.4 kb) of ribosomal DNA tandem repeat unit from a genome of the mushroom T. matsutake has been cloned. A 1.75 kb EcoRI fragment was cloned first using S. cerevisiae 255 rRNA gene as a probe, and this was then used for further cloning. A chromosomal walking experiment was carried out and the upstream region of the 1.75 kb fragment was cloned using SmaI/BamHI enzyme, the size was estimated to be 5.2 kb in length. Part of the downstream region of the 1.75 kb fragment was also cloned using XbaI/BamHI enzymes. Restriction enzyme maps of three cloned DNA fragments were constructed. Northern hybridization, using total RNA of T. matsutake, and the restriction fragments of three cloned DNAs as probes, revealed that all four ribosomal RNA genes (large subunit[LSU], small subunit [SSU], 5.85 and 5S rRNA genes) are present in the cloned region. The gene organization of the rDNA are regarded as an intergenic spacer [IGS]2 (partial) - SSU rRNA - internal transcribed spacer [ITS]1 - 5.8S rRNA - ITS2 - LSU rRNA - IGS1 -5S rRNA - IG52 (partial).

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제14권4호
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• pp.737-744
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• 2004

A multiplex polymerase chain reaction (PCR) was developed for the simultaneous detection and differentiation among Vairimorpha spp. and Nosema spp. and identification of Vairimorpha necatrix from Lepidoptera insects. Three sets of primers were selected from different genomic sequences to specifically amplify an 831 bp amplicon within the SSU rRNA gene, specific for both Vairimorpha spp. and Nosema spp. (MSSR primer); a 542 bp amplicon within the SSU rRNA gene, specific for Vairimorpha spp. (VSSU primer); and a 476 bp amplicon within the actin gene, specific for Vairimorpha necatrix (VNAG primer). Using the primers in conjunction with multiplex PCR, it was possible to detect Vairimorpha spp. and Nosema spp. and to differentiate between them. The sensitivity of this PCR assay was approximately 10 spores per milliliter. It is proposed that the multiplex PCR is a sensitive, specific, and rapid tool that can serve as a useful differential diagnostic tool for detecting Vairimorpha spp. and Nosema spp. in Lepidoptera insect.

• 한국정밀공학회:학술대회논문집
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• 한국정밀공학회 2006년도 춘계학술대회 논문집
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• pp.109-110
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• 2006

Various parametric methods, Larson-Miller (L-M), Orr-Sherby-Dorn (O-S-D), Manson-Haferd (M-H) parameters, and minimum commitment method (MCM), were used to predict longer rupture time from short-term creep data. A number of the creep data were collected through literature surveys and experimental data produced in KAERI for predicting the creep type of type 316LN SS. Polynomial equations for predicting the creep life were obtained by the time-temperature parameters (TTP) and the MCM. standard error (SE) and standard error or mean (SEM) values were compared for the each method with temperatures. The TTP methods were good in the creep-life prediction, but the MCM was much superior to the TTP ones at $700^{\circ}C\;and\;750^{\circ}C$. The MCM was found to be lower in the SE values compared to the TTP methods

• 한국정밀공학회:학술대회논문집
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• 한국정밀공학회 2006년도 춘계학술대회 논문집
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• pp.105-106
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• 2006

The creep properties have been evaluated for type 316LN stainless steel welded by the SAW method. The creep tests were conducted with different stress levels for both the base and weld metals at $550^{\circ}C\;and\;600^{\circ}C$. The results of the creep-rupture time of the weld metal did not show a large difference when compared to those of the base one, though it exhibited a little lower value at $600^{\circ}C$. The creep rate of the weld metal was lower than that of the base one at the same stress and rupture-time conditions. The creep-rupture ductility of the weld metal is found to be decreased by about 60%, compared to the base one. This is due to the decreasing of tensile elongation and the increasing of the yield stress in the weld metals.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제25권2호
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• pp.167-178
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• 2009

Two poorly known and often confused pleurostomatid ciliates, Litonotus paracygnus Song, 1994 and L. pictus Gruber, 1884, were collected from the coastal waters of Yeonggeumjeong and Bongpo-port, Gangwondo in the East Sea and from the Iwon tide embankment near Ganwol-do, Chungcheongnam-do in the Yellow Sea, Korea. These species were described based on live observations, the protargol-impregnation and morphometrics of the species. Also provided are their diagnoses. The small subunit ribosomal DNA (SSU rDNA) sequences of these species were compared with previously known sequences of related species. The diagnostics of the two Litonotus species are as follows. L. paracygnus: 150-300 $\mu$m long in vivo, strongly contractile neck region, two ellipsoid macronuclei (Ma) and one micronucleus (Mi), 7 left (LSK) and 11-14 right somatic kineties (RSK), 2-4 contractile vacuoles (CV) located on the posterior end, extrusemes (Ex) distributed on the anterior region of the ventral margin only. L. pictus: about 200-600 $\mu$m long in vivo, extremely contractile, beautiful body color with rows of yellow to yellow-brownish cortical pigment granules, 12-21 Ma arranged in moniliform pattern, infrequently vermiform, 7-11 LSK and 18-26 RSK, several CV located on both margins, Ex distributed on the anterior region of the ventral margin only. In this study, this genus was firstly recorded in Korea.

• 한국해양학회지:바다
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• 제15권1호
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• pp.36-40
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• 2010

선박평형 수는 유독 와편모조류 및 다양한 미세조류의 국제적인 이동경로로 알려져 있다. 본 연구에서는 선박평형 수에 있는 와편모조류의 다양성을 조사하기 위하여 와편모조류 특이적인 PCR primer와 종 특이적인 real-time PCR 유전자 탐침자를 이용하였다. 선박평형 수 시료에 대한 광학현미경 조사에서는 와편모조류가 매우 낮은 농도로 관찰되었지만, SSU rDNA의 cloning 및 염기서열 분석 결과에서는 기생 와편모조류, 초미세플랑크톤, 어패류 폐사 원인종 등 다양한 종류가 확인되었다. 본 연구 결과는 종 톡이적 PCR primer와 같은 분자생물학적 방법이 선박 평형 수에 외래 유입종의 신속 정확한 진단에 유용함을 보여주고 있다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제34권2호
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• pp.127-134
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• 1996

형태학적으로 카스텔라니가시아메바 혹은 대식가시아메바로 동정된 12 분리주들과 쿨버트손가시 아메바. 힐리가시아메바(Aconthomoeba hedwi) 팔레스타인가시아메바(A. plestinenis) 별가시아메바의 small subunitribosomal RNA유전자(ssu rDNA) 중 conserved region을 PCRR 증폭하여 제한효노절단부위를 비교하떴다. 별가시아메바의 PCR증폭 산물의 크기는 1.170 bp였고 나머지 분기주들의 것은 910-930 bp 사이였다 카스텔라너가시아메바로 분류건 여섯 주간의 추정 염기치찬율의 평근은 9.BPg였고. 대식가시아떼바로 분류된 분리주간의 그 평근은 9 6U였다. 카스텔 라니가시아메바로 분류된 여섯 분리주들 사이의 최대 염기치환율은 Chang주와 Ma주 사이의 (7 3%)였고 대식가시아메바로 분류된 여섯 분리주간의 최대 염기치환율은 1A/S3주와 KA/S7주 사이의 (16.1%)였다. 이들 종내 최대 염기치환율은 Castellani주 혹은 CCAP 1501/12g주와 KA/S3 주 사이에거 나타난 카스텔라니가시아메바와 대식가시아떼바간의 종간 최소 염기치환율(2.6%)보 다 횔씬 컸나. 쿨버트손가시아메바. 힐리가시아메바 팔레스타인가시아메바 및 별가시아메바의 PCR-RFLP 양상은 카스텔라니가시아메바 또는 대식가시아메바로 동정된 분리주들의 것들과 그리 고 강호간에서도 높은 염기치환율(평균 23 6%)을 보였다. 이상의 성적으로 미루어 보아 가시아메바속의 분류는 재평가 해 보아야 할 건으로 생각된다 A. healyi와 A. palestinensis의 우리말 이름을 각각 힐리가시아메바와 팔레스타인가시아메바로 제안한다.

• 생명과학회지
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• 제22권1호
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• pp.62-73
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• 2012

본 연구는 팽이버섯(Flammulina velutipes)의 국내 균주와 외래 균주간의 유전적 유연관계를 조사하기 위하여 수행되었으며, 계통수 측정 결과 3개 그룹으로 나눠짐을 확인하였다. 20개 F. velutipes 균주들의 ITS region 염기 서열을 확보하였으며, 이들 서열을 바탕으로 multiple alignment를 보았으며, Neighbor-joining method를 이용하여 계통수를 작성하였으며, 2개 그룹으로 나눠짐을 확인하였다. 또한 F. velutipes 4154 균주의 rDNA-cluster를 최초로 분석한 결과, 총 10,974 bp임을 밝혔다. SSU는 1,806 bp, ITS region은 553 bp의 염기배열이 결정되었다. ITS 1 부분은 245 bp이고 ITS 2는 308 bp였으며, LSU에 해당되는 염기서열은 3,402 bp, IGS 1은 1,400 bp, 5S는 83 bp, IGS 2는 3,571 bp임을 확인하였다.

• 환경생물
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• 제38권1호
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• pp.21-29
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• 2020

Skeletonema pseudocostatum의 세포는 규산질 성분의 돌기에 의한 사슬 형태로, 길이는 6~17.3 ㎛였고, 엽록체는 세포 당 1~2개를 포함하고 있었다. 주사전자현미경 관찰결과 Skeletonema 종을 구분할 수 있는 가장자리 받침돌기끝(terminal fultoportula process)은 끝이 갈라지거나, 갈고리 모양이었고, 길이가 1.67±0.5 ㎛이고, 개각의 가장자리에 위치해 있으며, 개수는 8.10±1.1개로 개각의 크기에 따라 다양하게 나타났다. 말단세포 입술돌기(terminal rimoportula process)는 두꺼운 원통형의 나팔관 모양으로, 개각의 중앙 근처에 위치하였고, 길이는 1.1±0.6 ㎛였으며, 개수는 1개였다. 연결세포 받침돌기(intercalary fultoportula process)는 대부분 1 : 1 결합으로 서로 맞물려 있는 형태였고, 1 : 2 결합도 종종 발견되었다. 계통분석 결과는 형태적 특징이 유사한 종 간의 유전학적 거리가 가깝다는 것을 나타냈고, 지리적 기원이 다른 동일 종의 경우, 유전적 차이를 보이지 않았다. 이는 S. pseudocostatum은 지리적 위치와 상관없이 유전적 차이가 나타나지 않는 단일계통(monophyly)이라는 것을 의미한다.