• Title/Summary/Keyword: SLC

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Gapfill 함수에 의한 SLC off 영상 보정 및 활용성 평가 (SLC-off Image Correlation and Usability Evaluation by Gapfill Function)

  • 박준규;김민규
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제13권8호
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    • pp.3692-3697
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    • 2012
  • Landsat 7은 SLC의 기계적 결함으로 인해 2003년 5월 31일 이후로 SLC-off 상태에서 영상을 취득하고 있으며, 이로 인해 Landsat 7 영상을 활용하기 위해서는 추가적인 보정작업이 필요하다. 본 연구에서는 SLC-off 영상을 보정할 수 있는 Gapfill 함수를 이용하여 Landsat 7 SLC-off 영상을 보정하고, 비슷한 시기의 Landsat 5 영상과 비교하였다. 기준영상 없이 SLC-off 영상을 복원하여 보정영상을 제작함으로써 SLC-off로 인한 누락 영역의 화소가 대부분 복원되었으며, 부자연스러운 노이즈가 없는 영상을 얻을 수 있었다. 또한 보정영상의 토지피복분류를 수행하고, 기준영상을 이용한 분류결과와 비교를 통해 기준영상 없이 보정된 SLC-off 영상의 활용 가능성을 제시할 수 있었다. Landsat 7 SLC-off 보정영상은 주기적인 Landsat 영상의 취득이 어려운 여건을 개선할 수 있을 것이며, 대규모 지역의 변화탐지 및 영상분류는 물론 소규모 구름 등과 같이 국지적으로 발생한 영상 손실의 복원이 가능할 것이다.

생쥐의 난소 발달과정에서 Solute carrier family 유전자들의 발현양상 (The Expression of Solute carrier family members Genes in Mouse Ovarian Developments)

  • 오이균;박창은
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제49권1호
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    • pp.40-47
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    • 2017
  • 난포 내 난자를 둘러싸고 있는 과립세포는 난자를 위한 성장상태 및 난포의 발달에 중요하다. Solute carrier family 유전자는 스테로이드 호르몬, 다양한 약물, 몇몇 다른 기질을 유입시킨다. 연구에서 획득한 서로 다르게 발현하는 유전자들 (DEGs) 중 일부를 in situ hybridization을 통해 분석하였다. 분석한 결과 SLC23A3과 SLC39A10이 난소에서 높게 발현하였다. SLC39A10 유전자는 원시난포에서 높게 발현하였고, SLC23A3은 일차, 이차 난포에서 높게 발현하였다. 특히 성장하는 난포의 과립막 세포에서 발현하였다. SLC23A3과 SLC39A10은 원시난포와 일차난포에서 다르게 발현하는 것은 각 난포의 분리를 통해 좀 더 확인해야 할 것이다. 본 연구에서는 유전자 발현 정보를 통해 원시난포의 개시와 성장을 위한 전환에 관여하는 기전을 이해하는데 기초정보와 난포발달 촉진을 위한 난소기능부전의 기전을 규명하는데 정보를 제공할 것으로 기대된다.

TLC 낸드 플래시기반 저장 장치에서 페이지 중복쓰기 기법을 이용한 SLC 버퍼 성능향상 연구 (SLC Buffer Performance Improvement using Page Overwriting Method in TLC NAND Flash-based Storage Devices)

  • 원삼규;정의영
    • 전자공학회논문지
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    • 제53권1호
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    • pp.36-42
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    • 2016
  • 다중 셀 기반의 저장장치 특히, TLC 낸드 플래시는 낮은 가격을 무기로 SSD에 채용되고 있다. 그러나 TLC는 기존의 MLC대비 느린 성능과 내구성으로 인해 일부 블록(Block)을 SLC 영역으로 할당하여, 버퍼로 사용함으로써 성능을 개선하는 구조를 발전시켜 왔다. 본 논문에서는 SLC 버퍼 성능을 보다 향상시키기 위하여 SLC 블록에 대해 페이지 덮어쓰기 기능을 도입하였다. 이를 통해, 제한된 회수 이내에서 지움 동작 없이 데이터 갱신을 가능하도록 했다. 특히, 기존의 SLC 버퍼 영역이 채워지는 경우 유효 페이지를 TLC 블록으로 이동 복사하고, 해당 블록을 지워야 하는데, 제안된 방법을 통해 유효 페이지 복사 및 지움 동작을 50% 이상 줄일 수 있었다. 시뮬레이션 평가 결과 기존의 SLC 버퍼 대비 버퍼 덮어 쓰기를 통해 2배의 쓰기 성능 개선을 달성 하였다.

파킨슨병 동물 모델에서 도파민세포의 감소와 관련된 Slc6a4 발현의 증가 (Increased Slc6a4 Expression Associated with Decreased Dopaminergic Neurons in an MPTP Induced Parkinsonism Mouse Model)

  • 여수정
    • Korean Journal of Acupuncture
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    • 제38권3호
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    • pp.133-139
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    • 2021
  • Objectives : Parkinson's disease is a neurodegenerative disease caused by a decrease in the dopaminergic neurons in the substantia nigra. The abnormal expression of solute carrier family 6 member 4 (Slc6a4) has been reported in patients with Parkinson's disease. Methods : In this study, we used MPTP to examine the changes in the expression of Slc6a4 in the brain of mice with Parkinson's disease and investigate its effect on dopaminergic neuronal cell death. Results : In the examination of the Slc6a4 expression in the substantia nigra of MPTP-treated mice for 4 weeks. The gene expression was increased compared to the normal group. To investigate the relationship between Slc6a4 and dopaminergic neurons, we performed a study using siRNA of Slc6a4 in the dopaminergic neuronal cell line SH-SY5Y. Using the siRNA of Slc6a4 to evaluate gene expression, it revealed that the tyrosine hydroxylase (TH) expression increases when Slc6a4 decreases. Moreover, this confirms its effects on the dopaminergic neurons. Additionally, through the evaluation of factors related to apoptosis, in particular, it was established that the value of bax/bcl2 decreased and was affected. These results suggest that a decreased Slc6a4 expression induces an increase in TH expression, providing a mechanism of action for dopaminergic neurons regulated by Slc6a4 expression. Conclusions : Slc6a4 is deemed to be involved in the regulation of dopaminergic neurons, suggesting that an increased Slc6a4 expression induced by MPTP may influence a reduction of dopaminergic neurons.

Transcriptional regulation of genetic variants in the SLC40A1 promoter

  • Seung Yeon Ha;Jin-Young Kim;Ji Ha Choi
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제28권2호
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    • pp.113-120
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    • 2024
  • Solute carrier 40A1 (SLC40A1) encodes ferroportin, which is the only known transmembrane protein that exports elemental iron from mammalian cells and is essential for iron homeostasis. Mutations in SLC40A1 are associated with iron-overload disorders. In addition to ferroportin diseases, SLC40A1 expression is downregulated in various cancer types. Despite the clinical significance of the SLC40A1 transporter, only a few studies have investigated genetic variants in SLC40A1. The present study was performed to identify genetic variations in the SLC40A1 promoter and functionally characterize each variant using in vitro assays. We investigated four haplotypes and five variants in the SLC40A1 promoter. We observed that haplotype 3 (H3) had significantly lower promoter activity than H1, whereas the activity of H4 was significantly higher than that of H1. Luciferase activity of H2 was comparable to that of H1. In addition, four variants of SLC40A1, c.-1355G>C, c.-662C>T, c.-98G>C, and c.-8C>G, showed significantly increased luciferase activity compared to the wild type (WT), whereas c.-750G>A showed significantly decreased luciferase activity compared to the WT. Three transcription factors, cAMP response element-binding protein-1 (CREB-1), chicken ovalbumin upstream promoter transcription factor 1, and hepatic leukemia factor (HLF), were predicted to bind to the promoter regions of SLC40A1 near c.-662C>T, c.-98G>C, and c.-8C>G, respectively. Among these, CREB1 and HLF bound more strongly to the variant sequences than to the WT and functioned as activators of SLC40A1 transcription. Collectively, our findings indicate that the two SLC40A1 promoter haplotypes affect SLC40A1 transcription, which is regulated by CREB-1 and HLF.

SLC/MLC 혼합 플래시 메모리를 이용한 하이브리드 하드디스크 설계 (Designing Hybrid HDD using SLC/MLC combined Flash Memory)

  • 홍성철;신동군
    • 한국정보과학회논문지:컴퓨팅의 실제 및 레터
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    • 제16권7호
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    • pp.789-793
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    • 2010
  • 최근 플래시 메모리 기반 비휘발성 캐시가 저장장치의 성능과 전력 소모 측면에서 효과적인 해법으로 떠오르고 있다. 비휘발성 캐시로 저장장치의 성능을 향상시키고 전력 소모를 줄이기 위해, 가격이 싸고 용량이 큰 multi-level-cell (MLC) 플래시 메모리를 사용하는 것이 좋다. 그러나 MLC 플래시 메모리의 수명은 single-level-cell (SLC) 플래시 메모리보다 훨씬 짧기 때문에 전체 저장장치의 수명이 짧아질 수 있다. 이러한 약점을 최소화하기 위해 SLC 플래시 메모리와 MLC플래시 메모리를 결합한 형태의 비휘발성 캐시를 고려해볼 수 있다. 본 논문에서는 SLC와 MLC를 결합한 플래시 메모리를 버퍼로 사용하는 새로운 하이브리드 하드디스크 구조를 제안한다.

The Candidate Tumor Suppressor Gene SLC8A2 Inhibits Invasion, Angiogenesis and Growth of Glioblastoma

  • Qu, Mingqi;Yu, Ju;Liu, Hongyuan;Ren, Ying;Ma, Chunxiao;Bu, Xingyao;Lan, Qing
    • Molecules and Cells
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    • 제40권10호
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    • pp.761-772
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    • 2017
  • Glioblastoma is the most frequent and most aggressive brain tumor in adults. Solute carrier family 8 member 2 (SLC8A2) is only expressed in normal brain, but not present in other human normal tissues or in gliomas. Therefore, we hypothesized that SLC8A2 might be a glioma tumor suppressor gene and detected the role of SLC8A2 in glioblastoma and explored the underlying molecular mechanism. The glioblastoma U87MG cells stably transfected with the lentivirus plasmid containg SLC8A2 (U87MG-SLC8A2) and negative control (U87MG-NC) were constructed. In the present study, we found that the tumorigenicity of U87MG in nude mice was totally inhibited by SLC8A2. Overexpression of SLC8A2 had no effect on cell proliferation or cell cycle, but impaired the invasion and migration of U87MG cells, most likely through inactivating the extracellular signal-related kinases (ERK)1/2 signaling pathway, inhibiting the nuclear translocation and DNA binding activity of nuclear factor kappa B ($NF-{\kappa}B$), reducing the level of matrix metalloproteinases (MMPs) and urokinase-type plasminogen activator (uPA)-its receptor (uPAR) system (ERK1/2-$NF-{\kappa}B$-MMPs/uPA-uPAR), and altering the protein levels of epithelial to mesenchymal transitions (EMT)-associated proteins E-cardherin, vimentin and Snail. In addition, SLC8A2 inhibited the angiogenesis of U87MG cells, probably through combined inhibition of endothelium-dependent and endothelium-nondependent angiogenesis (vascular mimicry pattern). Totally, SLC8A2 serves as a tumor suppressor gene and inhibits invasion, angiogenesis and growth of glioblastoma.

하이브리드 플래시 메모리를 위한 적응적 가비지 컬렉션 기법 (Adaptive Garbage Collection Technique for Hybrid Flash Memory)

  • 임수준;신동군
    • 정보처리학회논문지A
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    • 제15A권6호
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    • pp.335-344
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    • 2008
  • 본 논문에서는 SLC와 MLC를 모두 가진 하이브리드 플래시 메모리를 효율적으로 사용하기 위한 적응적 가비지 컬렉션 기법을 제안한다. 하이브리드 플래시 메모리는 속도가 빠른 SLC 영역과 용량대비가격이 저렴한 MLC 영역으로 이루어져 있기 때문에 SLC 영역을 로그 버퍼로, MLC 영역을 데이터 블록으로 사용하는 것이 효율적이다. 제안하는 가비지 컬렉션 기법은 MLC 영역의 쓰기 속도가 매우 느리다는 점을 고려하여 SLC 로그버퍼에 기록된 데이터 중에서 더 이상 갱신되지 않으며 MLC 영역으로의 이동 비용이 적은 데이터를 MLC 영역의 데이터 블록으로 이동시키고, 자주 갱신될 데이터는 SLC 내부에서 이동시킴으로써 SLC 영역의 빈 공간을 확보한다. 또한 적응적 기법을 사용하여 입출력의 패턴을 관찰하여 가비지 컬렉션의 기준 값을 변화시킨다. 실험 결과, 본 논문에서 제안한 기법은 기존에 소개된 플래시 메모리 관리 기법에 비하여 하이브리드 플래시 메모리의 특징을 효율적으로 사용하여 성능을 향상시켰으며 워크로드에 따라서 최적에 가까운 가비지 컬렉션 기준 값을 찾아내는 것을 확인할 수 있었다.

Heterologous Expression of Human SLC1A5v2 as a Functional Glutamine Transporter in Escherichia coli

  • E Young Kim;Ji Won Park;Ok Bin Kim
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제51권1호
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    • pp.37-42
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    • 2023
  • Neutral and non-essential amino acid, glutamine (Gln), plays an essential role in supplying nitrogen to all the amino acids and nucleotides in the mammalian body. Gln is also the most important carbon source that provides intermediates for gluconeogenesis and fatty acid synthesis and supplements the tricarboxylic acid cycle in fast-growing cancer cells. Among the known 14 Gln transporter genes, soluted carrier family 1 member 5 (SLC1A5) has been reported to be closely associated with cancer cell growth. Three variants (v1, v2, and v3) have been derived from SLC1A5. Here, we established a heterologous gene expression system for the active form of human SLC1A5 variant-2 (hSLC1A5v2) in Escherichia coli. v2 is the smallest variant that has not yet been studied. Four expression systems were investigated: pBAD, pCold, pET, and pQE. We also addressed the problem of codon usage bias. Although pCold and pET overexpressed hSLC1A5v2 in E. coli, they were functionally inactive. hSLC1A5v2 using the pBAD system was able to catalyze the successful transport of Gln, even if it was not highly expressed. Initial activity of hSLC1A5v2 for [14C] Gln uptake in E. coli reached up to 6.73 μmole·min-1·gDW-1 when the cell was induced with 80 mM L-arabinose. In this study, we demonstrated a heterologous expression system for the human membrane protein, SLC1A5, in E. coli. Our results can be used for the functional comparison of SLC1A5 variants (v1, v2, and v3) in future studies, to facilitae the developement of SLC1A5 inhibitors as effective anticancer drugs.

Effect of spatial variability of concrete materials on the uncertain thermodynamic properties of shaft lining structure

  • Wang, Tao;Li, Shuai;Pei, Xiangjun;Yang, Yafan;Zhu, Bin;Zhou, Guoqing
    • Structural Engineering and Mechanics
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    • 제81권2호
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    • pp.205-217
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    • 2022
  • The thermodynamic properties of shaft lining concrete (SLC) are important evidence for the design and construction, and the spatial variability of concrete materials can directly affect the stochastic thermal analysis of the concrete structures. In this work, an array of field experiments of the concrete materials are carried out, and the statistical characteristics of thermophysical parameters of SLC are obtained. The coefficient of variation (COV) and scale of fluctuation (SOF) of uncertain thermophysical parameters are estimated. A three-dimensional (3-D) stochastic thermal model of concrete materials with heat conduction and hydration heat is proposed, and the uncertain thermodynamic properties of SLC are computed by the self-compiled program. Model validation with the experimental and numerical temperatures is also presented. According to the relationship between autocorrelation functions distance (ACD) and SOF for the five theoretical autocorrelation functions (ACFs), the effects of the ACF, COV and ACD of concrete materials on the uncertain thermodynamic properties of SLC are analyzed. The results show that the spatial variability of concrete materials is subsistent. The average temperatures and standard deviation (SD) of inner SLC are the lowest while the outer SLC is the highest. The effects of five 3-D ACFs of concrete materials on uncertain thermodynamic properties of SLC are insignificant. The larger the COV of concrete materials is, the larger the SD of SLC will be. On the contrary, the longer the ACD of concrete materials is, the smaller the SD of SLC will be. The SD of temperature of SLC increases first and then decreases. This study can provide a reliable reference for the thermodynamic properties of SLC considering spatial variability of concrete materials.