• 제목/요약/키워드: RNase S1

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박테리오파지 T4 tRNA의 프로세싱에 관여하는 몇가지 RNase들 (Some RNases Involved in the Processing of Bacteriophage T4 RNA)

  • 고동성
    • 대한화학회지
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    • 제26권6호
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    • pp.396-402
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    • 1982
  • RNase Ⅲ, RNase E, 및 RNase P가 각각 홀로 또는 복합적으로 결핍되는 E. coli 돌연변이 균주들 내에서의 박테리오파지 T4 tRNA의 전구 RNA로 부터의 합성을 연구하였다. RNase E$^-$균주에서는 9S RNA로 볼 수 있는 한 RNA 띠가 축적되었으며 RNase$ P^-$균주에서는 6S 이중띠의 하부띠가 축적되었다. RNase Ⅲ$^-$균주에서는 T4 tRNA 유전인자 떼(cluster)에 의하여 코드되는 (coded) tRNA$^{Gln}$의 생성이 심하게 억제되며 T4 DNA에 의하여는 코드되지만 T4 tRNA 유전인자 떼에 의하여 코드 되는 6S 이중 띠의 상부 띠는 RNase Ⅲ$^+$균주의 경우에 비하여 더 크게 축적된다. 그러나 6S 이중 띠의 상부 띠 RNA와 tRNA$^{Gln}$ 사이에는 precursor-product 관계가 없다고 판단되며 RNase Ⅲ이 precursor RNA을 가수분해 절단 한다고 생각하는 개념을 지지할만한 근거가 없음을 지적할 수 있다.

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Streptomyces coelicolor RraAS1의 Eschechia coli RNase E의 RNA 분해작용에 대한 활성제로서 기능 암시 (Implications of Streptomyces coelicolor RraAS1 as an activator of ribonuclease activity of Escherichia coli RNase E)

  • 허지훈;서소진;이보은;염지현;이강석
    • 미생물학회지
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    • 제52권3호
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    • pp.243-248
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    • 2016
  • RNase E는 대장균(Escherichia coli)에서 수많은 RNA의 가공 및 분해에 관여하는 필수적인 효소이다. RNase E의 효소 활성은 RraA와 RraB에 의해 조절된다. 그람양성균인 Streptomyces coelicolor는 RNase ES, RraAS1, RraAS2라고 명명되는 RNase E와 RraA의 동족체를 가지고 있다. 이 연구에서는 S. coelicolor 유래의 RraAS1이 E. coli에서 RNase E의 효소활성을 저해하는지 연구하였다. 대장균에서 RraAS1의 발현은 RNase E의 과발현에 의해 감소된 세포생장을 더욱 저하시켰으며, RNase E의 기질인 rpsO, ftsZ, rnhB mRNA의 양을 감소시키는 것을 확인 하였다. 이러한 RraAS1의 효과는 공동면역침전실험을 수행한 결과에서 유추할 수 있듯이, Rne 단백질과 RraAS1의 결합으로 유도되는 것으로 보인다. 이러한 결과는 RraAS1이 대장균에서 RNase E의 리보핵산 가수분해 활성을 유도함을 시사한다.

Identification and characterization of S-RNase genes in apple rootstock and the diversity of S-RNases in Malus species

  • Kim, Hoy-Taek;Moriya, Shigeki;Okada, Kazuma;Abe, Kazuyuki;Park, Jong-In;Yamamoto, Toshiya;Nou, Ill-Sup
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제43권1호
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    • pp.49-57
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    • 2016
  • We isolated and confirmed two S-RNases, denoted as mpS1 and mpS2, from apple rootstock 'Marubakaido' (Malus prunifolia Borkh. Var. ringo Asami). These S-RNases contained and conserved five cysteine residues and two histidine residues, which are essential for RNase activity. The mpS1 showed high similarity to S5 (99.1%) of Malus spectabilis, whereas the mpS2 showed 99.5% nucleotide sequence similarity to S26 of (Malus ${\times}$ domestica) and 99.6% to S35 of (Malus sieversii) when compared with reported S-RNases. In amino acid sequences, the mpS1-RNase was almost similar to the S5-RNase of Malus spectabilis, and the mpS2-RNase was similar to the S35 of Malus sieversii, with only one bp being different from the S26-RNase of Malus ${\times}$ domestica. The 57 S-RNases of Malus species were renamed and rearranged containing the new S-RNases, as mprpS35 (mpS2) and mprpS57 (mpS1), for determining S-genotypes and identifying new alleles from apple species (Malus spp.).

RraB의 발현에 따른 대장균의 성장 저해의 원인 규명 (Implications of Growth Arrest Induced by Overproduction of RraB in Escherichia coli)

  • 류상미;염지현;고하영;신은경;이강석
    • 미생물학회지
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    • 제46권2호
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    • pp.223-227
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    • 2010
  • RNase E는 대장균 내에 있는 수많은 RNA의 분해와 가공에 관여하며, 또한 RNA 대사 작용에 관련된 거대한 단백질 복합체인 데그라도좀을 구성하는 중요한 효소로 알려져 있다. RraA와 RraB는 최근에 밝혀진 RNase E의 단백질 저해제이며, 진화적으로 잘 보존되어 있다. 이 연구에서는 RraA를 발현 시킬 때와는 달리 세포 내에서 RraB를 발현 시키면, RNase E의 과발현에 따른 세포의 성장 저해를 회복시키지 못하고 더 저해하는 것을 확인하였다. 이 현상이 RraA와 RraB가 세포내 RNase E의 기질들에 대해 특이적으로 영향을 미치기 때문인지를 알아보기 위해 세 개의 RNase E 기질을 분석하였다. 그 결과, ColE1-타입 플라스미드의 복제수를 조절하는 RNA I과 라이보좀 단백질 S15를 코딩하는 rpsO mRNA의 경우 RraA가 RraB 보다 효과적으로 RNase E의 활성을 저해하며, RNase P의 RNA 구성요소의 전구체인 pM1 RNA에 대한 RNase E의 효소 활성은 RraB가 저해하지 못하는 것을 관찰하였다. 이 결과는 RraB가 RraA보다는 높은 기질 특이적으로 RNase E의 효소활성을 저해하며, 이러한 이유로 RNase E의 과발현에 의한 세포의 성장 저해를 RraB의 과발현으로 극복할 수 없었다고 추론할 수 있다.

Streptomyces coelicolor의 RraA 동족체인 RraAS2에 의한 Escherichia coli RNase E 활성조절 (Modulation of Escherichia coli RNase E. Action by RraAS2, a Streptomyces coelicolor Ortholog of RraA)

  • 안상미;신은경;염지현;이강석
    • 미생물학회지
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    • 제44권2호
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    • pp.93-97
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    • 2008
  • 최근 Escherichia coli에서 RNA의 분해와 가공과정에 중추적인 역할을 하는 리보핵산 내부분해효소인 RNase E의 효소활성을 조절하는 단백질 조절자인 RraA가 밝혀졌으며, 이 단백질은 E. coli RNase E의 효소활성 부위와 36%의 유사성을 가지는, Streptomyces coelicolor RNase ES의 효소활성을 조절하는 것으로 알려져 있다. S. coelicolor의 유전체에는 RraA와 아미노산 서열이 35.4% 이상 유사한 단백질을 코딩하는 유전자가 두 개 존재하는데, 그 중 하나인 rraAS2를 클로닝하여 E. coli RNase E의 효소활성을 조절하는지를 알아보았다. 그 결과 세포내에서 RraAS2를 발현시키면 RNase E의 과발현에 의해 저해된 세포의 생장을 RraA와 같이 효과적으로는 아니지만, 어느 정도 복원시키는 것을 확인하였다. 또한 RraAS2가 발현됨으로서 RNase E의 과발현에 의해 증가된 ColE1-타입 플라스미드의 복제 수를 14% 감소시키는 것을 관찰하였다. 이러한 결과는 RraAS2가 RNase E의 RNA I분자에 대한 효소 활성을 저해하는 능력을 가지고 있음을 시사한다. 동일한 배양조건에서 E. coli 세포내에서의 RNase E에 대한 RraAS2의 상대적인 발현양이 RraA에 비해 6.2배 낮은 것을 확인하였고, 이로 인해 RraAS2가 RNase E의 과발현에 의한 세포 생장의 저해를 복원하는데 필요한 모든 RNA의 가공과 분해속도를 효과적으로 조절하지는 못한다는 것을 추론할 수 있다.

Streptomyces coelicolor 리보핵산내부분해효소 RNase ES의 결합단백질 규명 및 기능분석 (Identification and Functional Analysis of Proteins Interacting with Streptomyces coelicolor RNase ES)

  • 김종명;송우석;김현리;고하영;이강석
    • 미생물학회지
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    • 제43권1호
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    • pp.72-75
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    • 2007
  • Escherichia coli에서 RNA 분해와 가공에 있어서 중심적인 역할을 하는 RNase E의 동족체 단백질인 Streptomyces coelicolor RNase ES의 결합 단백질을 항체침전을 이용하여 탐색하였다. 무기인산을 이용하는 polyphosphate kinase와 리보핵산외부분해효소인 polynucleotide phophorylase의 동족체인 GPSI가 RNase ES와 함께 침전되는 것을 확인하였으며, 이는S. coelicolor에도 E. coli RNase E를 매개로 구성되는 다단백질복합체인 degradosome이 RNase ES에 의해 형성될 수 있음을 암시한다. 계통적으로 멀리 떨어진 이 두 세균에서 정제된 polynucleotide phosphorylase 동족체는 시험관에서의 RNA 분해 특성이 서로 유사함을 보였다. 이러한 실험 결과는 RNase ES가 E. coli degradosome과 유사한 기능과 구조를 가진 단백질 복합체를 형성함을 시사한다.

Gibbrellic Acid와 Abscisic Acid가 보리 초엽(?葉)의 핵산(核酸) 및 핵산분해효소(核酸分解酵素)에 미치는 영향(影響) (The Effect of Gibbrellic Acid and Abscisic Acid on Ribonucleic Acid and Ribonuclease in Barley Coleoptiles)

  • 서용택
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제20권2호
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    • pp.242-246
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    • 1977
  • 보리(Hordeum vulgare cultivar Sedohadaka)초엽에 $1{\times}10^{-5}M$ Gibbrellic acid 및 $1{\times}10^{-5}M$ Abscisic acid를 처리(處理)하여 RNase활성(活性)의 경시적(經時的) 소장(消長)을 무처리구(無處理區)와 비교(比較)하고, 핵산(核酸)의 형태(形態)를 관찰하였으며 그 결과(結果)를 요약(要約)하면 다음과 같다. 1) GA는 RNase의 활성(活性)을 억제(抑制)시키는 반면(反面)ABA는 촉진(促進)시켰다. 2) 무처리구(無處理區)에서 정상적인 식물(植物)에 비(比)하여 r-RNA의 비(比)가 낮고 r-RNA의 비(比)가 높았는데 이것은 배양(培養)중 RNase의 작용(作用)에 의한 것 같다. 3) GA는 r-RNA의 분해(分解)를 완화시켰으나 ABA는 촉진(促進)시켰는데 이것은 RNase의 활성(活性)과 관계된 것 같다. 4) GA는 DNA-RNA 복합체(複合體)의 합성(合成)을 촉진(促進)시켰으나 ABA는 이를 억제시켰다. 5) ABA에 의한 s-RNA의 증가(增加)는 r-RNA의 분해산물(分解産物) 때문이라 생각된다.

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A study of ribonuclease activity in venom of vietnam cobra

  • Nguyen, Thiet Van;Osipov, A.V.
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제59권9호
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    • pp.20.1-20.9
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    • 2017
  • Background: Ribonuclease (RNase) is one of the few toxic proteins that are present constantly in snake venoms of all types. However, to date this RNase is still poorly studied in comparison not only with other toxic proteins of snake venom, but also with the enzymes of RNase group. The objective of this paper was to investigate some properties of RNase from venom of Vietnam cobra Naja atra. Methods: Kinetic methods and gel filtration chromatography were used to investigate RNase from venom of Vietnam cobra. Results: RNase from venom of Vietnam cobra Naja atra has some characteristic properties. This RNase is a thermostable enzyme and has high conformational stability. This is the only acidic enzyme of the RNase A superfamily exhibiting a high catalytic activity in the pH range of 1-4, with $pH_{opt}=2.58{\pm}0.35$. Its activity is considerably reduced with increasing ionic strength of reaction mixture. Venom proteins are separated by gel filtration into four peaks with ribonucleolytic activity, which is abnormally distributed among the isoforms: only a small part of the RNase activity is present in fractions of proteins with molecular weights of 12-15 kDa and more than 30 kDa, but most of the enzyme activity is detected in fractions of polypeptides, having molecular weights of less than 9 kDa, that is unexpected. Conclusions: RNase from the venom of Vietnam cobra is a unique member of RNase A superfamily according to its acidic optimum pH ($pH_{opt}=2.58{\pm}0.35$) and extremely low molecular weights of its major isoforms (approximately 8.95 kDa for RNase III and 5.93 kDa for RNase IV).