• 제목/요약/키워드: Quantitative real time RT-PCR

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항 바이러스 치료중인 B형 간염환자에서 HBeAg 및 HBV DNA 검출에 관한 분석 (Analysis of HBeAg and HBV DNA Detection in Hepatitis B Patients Treated with Antiviral Therapy)

  • 천준홍;채홍주;박미선;임수연;유선희;이선호
    • 핵의학기술
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    • 제23권1호
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    • pp.35-39
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    • 2019
  • [목적] B형 간염바이러스(hepatitis B virus, HBV)감염은 전세계적으로 중요한 공중 보건 문제이며 만성간염, 간 경변, 간암의 주요 원인으로 알려져 있으며, 이러한 질환의 진단 및 치료에 B형 간염바이러스의 혈청학적 검사는 필수적이다. 항 바이러스 치료중인 B형 간염 환자를 대상으로 면역방사계수 측정법(IRMA; Immunoradiometric assay)과 화학발광 미세입자 면역분석법(CMIA; Chemiluminescent Micropartical Immunoassay)을 이용하여 HBe-Ag 검사를 시행하였고, 실시간 중합효소 연쇄반응(RT-PCR; Realtime-Polymerase Chain Reaction)법을 이용하여 혈청 내 HBV DNA 검출율 을 비교 분석 하였다. [대상 및 방법] 항 바이러스 치료가 시행중인 B형 간염 환자 270명을 대상으로 HBeAg 혈청 검사와 HBV DNA 정량 검사를 실시하였다. HBeAg 혈청 검사는 검출 원리가 다른 두 가지 혈청학적 검사법(IRMA, CMIA)을 적용 하였고, 혈청 내 HBV DNA는 Abbott m2000 System을 사용하여 실시간 중합효소 연쇄반응(RT-PCR; Realtime-Polymerase Chain Reaction)법으로 정량 측정 하였다. [결과] HBeAg 검출율은 면역방사계수법(IRMA)의 경우 24.1% (65/205), 화학발광 미세입자 면역 분석법(CMIA)에서는 82.2% (222/48)의 결과를 보였다. 혈청학적 검사방법(IRMA, CMIA)에 따른 HBeAg 검사결과의 일치율은 33% (89/270)이다. 실시간 중합효소 연쇄반응(RT-PCR)을 이용한 혈청 내 HBV DNA의 검출율은 29.3% (79/191)를 보였고, 혈청 내 HBV-DNA 농도는 $16IU/mL{\times}1.0{\times}10^9IU/mL$ 이며 검출한계는 <15IU/mL 이다. 면역방사계수법(IRMA)으로 HBeAg 검출결과가 양성일때 55.4%, 그리고 음성일때 20.9%의 HBV DNA 검출율과 $1.1{\times}10^8IU/mL$, $5.7{\times}10^5IU/mL$의 혈청내 HBV DNA농도를 나타냈다. 이에 반해 화학발광 미세입자 면역 분석법(CMIA)의 경우 HBeAg 검출결과가 양성일때 HBV DNA 검출율은 28.4%, 음성일때 33.3%의 결과를 나타냈으며 혈청 내 HBV DNA농도는 $6.0{\times}10^7IU/mL$, $2.4{\times}10^5IU/mL$ 이었다. 면역방사계수법과 화학발광 미세입자 면역 분석법에서 동일하게 HBeAg 검출 결과가 양성인 경우 HBV DNA 검출율은 62.3%의 결과를 보였으며, 혈청 내 HBV DNA 농도는 $1.1{\times}10^8IU/mL$ 이다. [결론] 혈청학적 검사법에 따른 HeAg 검출율은 많은 차이를 보였다. 이러한 차이는 검사kit에 사용된 Ab의 특성과 epitope, HBV의 genotype등 여러 가지 원인으로 생각된다. 혈청학적 검사 결과로 분류 된 그룹별 HBV DNA의 검출율과 농도를 비교한 결과, Group II(IRMA 양성, CMIA 양성, N=53)에서 높은 검출율과 농도를 확인할 수 있었다.

쥐L6 근원세포에서 miR-128의 근육세포 분화와 인슐린신호에서의 역할 (Roles of miR-128 in Myogenic Differentiation and Insulin Signaling in Rat L6 Myoblasts)

  • 오명주;김소현;김지현;전병학
    • 생명과학회지
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    • 제30권9호
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    • pp.772-782
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    • 2020
  • 골격근의 분화 또는 근육 분화는 근육량과 신진대사 항상성을 유지하기 위해 중요하다. 근육 특이적 microRNAs (miRNAs)는 골격근 분화에 중요한 역할을 한다. 본 연구에서는 rat miRNAs 마이크로어레이를 사용하여 rat L6 근아세포의 근육 분화 과정에서의 miRNAs 발현 양상을 조사했다. 우리는 miR-128의 발현 증가를 발견했고, 동시에 이미 알려진 근육 분화 조절 miRNAs인 miR-1, miR-133b와 mi-206의 발현 증가를 확인했다. 이 microarray 결과를 확인하기위해 우리는 Quantitative RT-PCR 기술을 사용하였고, microarray 결과와 유사하게 발현 초기 mRNAs와 발현 후 성숙 miRNAs에서 모두 miR-128의 발현 증가를 확인했다. 또한 Rat L6 근아세포로의 miR-128 발현 향상은 muscle creatine kinase (MCK), myogenin, myosin heavy chain (MHC)와 같은 근육분화 표지 유전자 발현을 유발했고, 또한 MHC의 단백질 발현을 증가시켰다. 억제 PNAs를 사용한 miR-128의 작용 억제는 이러한 근육 분화 표지 유전자들의 발현을 차단했다. 또한, miR-128 발현 향상은 Erk와 Akt 단백질의 인슐린 자극에 의한 인산화를 증가시켰고, 고인슐린혈증과 고혈당증으로 인해 유도된 인슐린 저항성으로 인한 Erk와 Akt의 억제된 인산화를 회복했다. 이러한 발견은 miR-128이 근육분화와 인슐린 작용에 중요한 역할을 할 수 있다는 것을 시사한다.

콩 발아기간 중 isoflavone 생합성 유전자 발현 변이 (Differential Expression of Isoflavone Biosynthetic Genes in Soybean During Germination)

  • 임진수;김서영;김용호
    • 한국작물학회지
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    • 제66권4호
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    • pp.365-374
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    • 2021
  • 이소플라본 함량이 높으며 장류콩인 대풍2호와 이소플라본 함량이 낮으며 나물콩인 풍산나물콩을 재료로 하여 콩 발아기간 동안 이소플라본 생합성 관련 유전자 6종(CHS6, HID, IF7GT, IF7MaT, GmIMaT1 및 GmIMaT3)의 발현량을 qRT-PCR로 분석하였다. 1. 공시재료 모두 발아기간 경과에 따라 이소플라본 함량이 높아졌으며, 총 이소플라본 함량 중 malonyl-glucosides 함량이 80% 이상을 차지하여 제일 높았으며 acetyl-glucosides는 거의 분석되지 않았다. 한편, 자엽과 배축에서 이소플라본 축적 정도가 각각 다르게 나타났으며 개별 이소플라본 함량에서도 차이가 있었다. 2. 이소플라본 생합성 관련 유전자들은 콩 발아시기 경과에 따라 발현량이 높아져 이소플라본 축적 정도와 상관이 있는 것으로 판단되나 유전자들의 발현량이 시기별로 각각 달라 개별 이소플라본 함량과 유전자간 뚜렷한 상관은 찾을 수 없었다. 3. HID 유전자는 대풍2호와 풍산나물콩 모두 발아 3일차를 제외하고는 발아시간 경과에 따라 유전자의 발현량이 높아졌으나 다른 유전자들의 상대적 발현량은 품종 간 차이가 있었으며, 또한 발아시간 경과에 따른 유전자의 발현 양상은 유전자별로 각각 달랐다. 4. 발아시간 별로 유전자들의 상대적 발현량을 비교한 결과 품종 간 차이가 있었으며 자엽과 배축에서도 상대적 발현량이 다르게 나타났다. 자엽에서는 GmIMaT1을 제외한 다른 유전자들의 발현량이 대풍2호와 풍산나물콩에서 비슷하게 나타난 반면, 배축에서는 HID 발현량이 2품종 모두 높게 나타났으나 다른 유전자들은 유전자 발현량에 일정한 경향이 없었다.

비스페놀 A에 대한 기수산 물벼룩의 항산화 시스템의 변화 (Modulation of antioxidant defense system in the brackish water flea Diaphanosoma celebensis exposed to bisphenol A)

  • 유제원;차주선;김혜리;표진우;이영미
    • 환경생물
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    • 제37권1호
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    • pp.72-81
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    • 2019
  • Bisphenol A (BPA)는 대표적인 내분비계장애물질로 수서생물의 성장, 발생, 그리고 생식에 유해한 영향을 주는 것으로 알려져 있다. 본 연구는 기수산 물벼룩(Diaphanosoma celebensis)에서 48시간 BPA 노출 후 산화적 스트레스 반응을 조사하기 위하여 qRT-PCR을 이용한 항산화 유전자 발현 변화, 항산화 효소 활성, 총 단백질 함량 분석을 수행하였다. $3mg\;L^{-1}$의 BPA에 48시간 노출된 D. celebensis에서 모든 항산화 유전자(Cu/Zn-SOD, Mn-SOD, CAT)의 발현량이 유의하게 증가하였다. 특히 세 종류의 GST isoforms (GST-kappa, GST-mu, GST-theta)는 가장 낮은 농도인 $0.12mg\;L^{-1}$ BPA에 48시간 노출된 실험군에서도 유의하게 증가하였으며, GST-mu의 발현양이 상대적으로 가장 높게 나타났다. SOD 활성은 BPA 농도에 의존적으로 유의하게 증가하였으며, 총 단백질 함량은 BPA 노출에 대해 감소되는 양상을 보였다. 이러한 결과는 BPA가 D. celebensis에서 산화적 스트레스를 유발하였고, 이 과정에서 이들 항산화 유전자가 생물방어기전으로 참여한다는 것을 의미한다. 본 연구는 BPA가 해양생물에 미치는 영향에 대한 분자적 기전을 이해하는 데 도움이 될 것이다.

Prognostic Relevance of Human Telomerase Reverse Transcriptase (hTERT) Expression in Patients with Gall Bladder Disease and Carcinoma

  • Deblakshmi, Raj Kumari;Deka, Manab;Saikia, Anjan Kumar;Sharma, Bir Kumar;Singh, Nidhi;Das, NN;Bose, Sujoy
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제16권7호
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    • pp.2923-2928
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    • 2015
  • Background: Gallbladder carcinoma (GBC) has been stated as an Indian disease, with the highest number of cases being reported from certain districts of northeast India, which has an ethnically distinct population. Unfortunately there are no scientific reports on the underlying molecular mechanisms associated with the pathogenesis of the disease from this region. Aim: The present study evaluated the role of differential expression of human telomerase reverse transcriptase (hTERT) in the development of gall bladder anomalies. Materials and Methods: Blood and tissue samples were collected from patients undergoing routine surgical resection for clinically proven cases of gallbladder disease {cholelithiasis (CL, n=50), cholecystitis (CS, n=40) and GBC (n=30) along with adjacent histopathologically proved non-neoplastic controls (n=15)} with informed consent. Whole blood was also collected from age and sex matched healthy controls (n=25) for comparative analysis. Differential hTERT mRNA expression was evaluated by semi-quantitative rt-PCR and real-time PCR based analysis using ${\beta}$-actin as an internal control. Evaluation of differential hTERT protein expression was studied by Western blot analysis and immunoflourescence. Statistical analysis for differential expression and co-relation was performed by SPSSv13.0 software. Results: Gallbladder anomalies were mostly prevalent in females. The hTERT mRNA and protein expression increased gradiently from normal

Serum miRNA Panel in Egyptian Patients with Chronic Hepatitis C Related Hepatocellular Carcinoma

  • Khairy, Ahmed;Hamza, Iman;Shaker, Olfat;Yosry, Ayman
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제17권5호
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    • pp.2699-2703
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    • 2016
  • Background: Primary hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the most common malignancies worldwide. MicroRNAs (miRNAs) have great HCC diagnostic potential and circulating miRNAs have been reported as promising biomarkers for various pathologic conditions. Aim: To explore the potential benefit of serum miR-126, miR-129, miR-155, miR-203 and miR-223 as non-invasive diagnostic markers of hepatitis C virus (HCV)-related HCC. Materials and Methods: The expression of miRNA was evaluated using real-time quantitative RT-PCR in 78 serum samples (30 $treatment-na{\ddot{i}}ve$ chronic HCV, 25 post-HCV compensated cirrhosis and 23 $treatment-na{\ddot{i}}ve$ HCC cases). Results: Comparing miRNA fold changes in the HCC group vs the non HCC groups, there was significant fold decrease in miR-126 (P= 0.034), miR-129 (P= 0.006), miR-155 (P= 0.011), miR-203 (P<0.001) and miR-223 (P= 0.013). The highest AUC to differentiate HCC patients from non-HCC was 0.76 for miR-203. Conclusions: Among studied miRNAs, serum miR-203 has the highest potential as a non-invasive biomarker of HCC.

자외선 조사에 의해 노화된 섬유아세포에서 Cycloheterophyllin의 항노화 효능 (Anti-aging Effect of Cycloheterophyllin in UVA-irradiated Dermal Fibroblasts)

  • 심중현
    • 생약학회지
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    • 제50권4호
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    • pp.285-290
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    • 2019
  • This study was carried out to identify the skin anti-aging effect of cycloheterophyllin on dermal fibroblasts. To elucidate anti-aging effects of cycloheterophyllin on dermal fibroblasts, I measured cell viability, mRNA expressions, and Collagen, type I/matrix metallopeptidase 1(MMP1)-ELISA assay. In this study, I investigated the effects of cycloheterophyllin on Collagen, type I, alpha 1(COL1A1)/Collagen, type III, alpha 1(COL3A1)/MMP1/Superoxide dismutases/Catalase(CAT) mRNA expressions and Collagen, type I/MMP1 protein production. Quantitative Real-time RT-PCR showed that cycloheterophyllin increased mRNA level of COL1A1/COL3A1/CAT genes and collagen, type I protein by ELISA assay compared to UVA-treated dermal fibroblasts. Furthermore MMP1 mRNA and protein expressions were decreased by cycloheterophyllin treatment. These observations revealed that cycloheterophyllin increased anti-aging effects in dermal fibroblasts. Therefore, I identified the anti-aging effects of cycloheterophyllin, and these results showed that the cycloheterophyllin can be a considerable potent ingredient for skin anti-aging. Based on this, I anticipated further researches about cycloheterophyllin for mechanism to develop not only cosmetics but for healthcare food or medicine.

Inhibition of Melanogenesis by Abietatriene from Vitex Trifolia Leaf Oil

  • Lee, Hong Gu;Kim, Tae Yoon;Jeon, Jung Hoon;Lee, Sang Hwa;Hong, Yoon Ki;Jin, Mu Hyun
    • Natural Product Sciences
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    • 제22권4호
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    • pp.252-258
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    • 2016
  • Vitex trifolia L. has been used traditionally to treat various illnesses, such as inflammation, headache, migraine, and gastrointestinal infections. We analyzed and evaluated the composition of V. trifolia leaf oil. Based on the results, we isolated abietatriene from V. trifolia leaf oil and investigated the effect of V. trifolia leaf oil and its active compound abietatriene on melanogenesis in B16F10 melanoma cells. They significantly decreased melanin contents and melanogenic factors, such as tyrosinase, TRP-1, TRP-2, and MITF dose-dependently in both protein and mRNA levels. Protein and mRNA expressions were determined by Western blot analysis and quantitative real time RT-PCR. Findings indicate that V. trifolia leaf oil and abietatriene reduce melanogenesis by regulating the expression of melanogenic factors. These results suggest that V. trifolia leaf oil and abietatriene could comprise a useful therapeutic agent for treating hyperpigmentation and used as effective skin-whitening agents.

Deregulation of MTDH Gene Expression in Gastric Cancer

  • Baygi, Modjtaba Emadi;Nikpour, Parvaneh
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제13권6호
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    • pp.2833-2836
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    • 2012
  • Aim: Gastric cancer is the third most frequent cause of cancer mortality worldwide. In Iran, it is one of the leading causes at the national level. Localized at chromosome 8q22, the human MTDH gene has been reported to be over-expressed in a spectrum of malignancies. However, since there is a lack of data concerning with expression in gastric cancer at the transcriptional level, in this study we evaluated MTDH expression in Iranian cases. Methods: Totally, thirty paired gastric samples were examined by quantitative real-time RT-PCR. Results: Although the mRNA expression was significantly elevated in 46.6% of the examined tumor tissues; its expression was low in others (36.6%). Moreover, there was only a marginal statistical difference between the MTDH gene expression of all tumor specimens compared to their paired non-tumor ones and no statistically significant association with the grades and types of the tumors. Conclusion: Taken together, our results demonstrated that expression of MTDH at the transcriptional level may be increased in gastric cancer tissue samples but with considerable heterogeneity. Due to this, it may have the potential to be used as a target for diagnostic/therapeutic purposes only in a subset of patients.

Modification of Pluripotency and Neural Crest-Related Genes' expression in Murine Skin-Derived Precursor Cells by Leukemia Inhibitory Factor (LIF)

  • 박상규
    • International Journal of Oral Biology
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    • 제37권4호
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    • pp.175-180
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    • 2012
  • Skin-derived precursor cells (SKPs) are multipotent, sphere-forming and embryonic neural crest-related precursor cells that can be isolated from dermis. It is known that the properties of porcine SKPs can be enhanced by leukemia inhibitory factor (LIF) which is an essential factor for the generation of embryonic stem cells in mice. In our present study, to enhance or maintain the properties of murine SKPs, LIF was added to the culture medium. SKPs were treated with 1,000 IU LIF for 72 hours after passage 3. Quantitative real time RT-PCR was then performed to quantify the expression of the pluripotent stem cell specific genes Oct4, Nanog, Klf4 and c-Myc, and the neural crest specific genes Snai2 and Ngfr. The results show that the expression of Oct4 is increased in murine SKPs by LIF treatment whereas the level of Ngfr is decreased under these conditions. Interestingly, LIF treatment reduced Nanog expression which is also important for cell proliferation in adult stem cells and for osteogenic induction in mesenchymal stem cells. These findings implicate LIF in the maintenance of stemness in SKPs through the suppression of lineage differentiation and in part through the control of cell proliferation.