• 제목/요약/키워드: Pure sciences

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대한민국내 주요 돼지 품종의 순종 식별을 위한 품종특이 DNA marker의 활용 (Application of Breed-specific DNA Markers for the use of Identifying Major Pure Pig Breeds Maintained in Korea)

  • 서보영;김재환;박응우;임현태;조인철;김병우;오성종;정일정;이정규;전진태
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제46권5호
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    • pp.735-742
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    • 2004
  • 본 연구는 돼지의 품종특이 DNA marker를 이용하여 Large White, Landrace, Duroc의 순종 판별을 가능하게 하기 위해서 실시하였다 순종 판별을 위해 현재 알려져 있는 KIT과 돼지내의 모색과 밀접한 연관성이 있는 MCIR 그리고 mitrochondrial DNA상에서 종 특이적인 현상을 보이는 D-loop 지역의 11-bp 중복과 ND2 유전자의 개시 codon 변이를 이용하였다 품종간의 판별을 위해 KIT 유전자 exon17의 splicing 지역 변이를 활용하여 백색종과 유색종을 분류 하였다. MCIR 유전자의 (N121D)변이를 이용하여 유색종들로부터 Duroc 종이 분류되었다. 그러나 Duroc 이외의 유색종들 간에는 특이한 변이가 발견되지 않아 이 이상의 분류는 불가능 하였다 D-loop 지역의 11-bp 중복현상과 ND2 개시 codon의 변이에 의해 백색종인 Landrace(11-bp비중복과 ATT)종과 Large White(llbp 중복과 ATA) 종을 분류할 수 있었다. 결론적으로 본 연구에서 설정된 판별방법을 통하여 Landrace, Large White와 Duroc 종의 순종 판별이 완벽히 가능함을 입증하였다.

Mass Spectrometer를 바탕으로 한 전자코를 이용한 식물성 유지가 혼합된 참기름의 판별 분석 (Identification of Vegetable Oil-added Sesame Oil by a Mass Spectrometer-based Electronic Nose)

  • 손희진;홍은정;고상훈;최진영;노봉수
    • 산업식품공학
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    • 제13권4호
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    • pp.275-281
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    • 2009
  • 참기름은 높은 항산화활성 및 항암작용 등의 우수한 영양학적 가치를 지니는 반면 비싼 가격으로 인하여 가짜 참기름의 유통이 범람하여 이를 판별할 수 있는 분석 방법의 확립이 요구되는 실정이다. 따라서 본 연구에서는 질량분석기를 바탕으로 한 전자코를 이용하여 대두유가 혼합된 참기름을 제조하여 진위 판별을 시도하기위하여 각각의 유지를 전자코를 이용하여 분석, 통계처리하였다. 혼합 참기름의 휘발성 향기성분으로부터 생성되는 ion fragment 중 40-160 amu에서 각 시료 간에 차별성이 높은 fragment (m/z)를 선택하여 해당 intensity값을 판별 분석한 결과, 참기름 및 대두유는 뚜렷하게 구분되었다. 참기름 및 대두유, 옥수수유, 들기름을 각각의 순수한 상태로 향기성분 분석을 한 결과 서로 다른 위치에서 정확하게 분리됨을 알 수 있었고, 대두유와 옥수수유의 경우 타 기름과는 달리 순수한 공기 성분과 비슷한 위치에서 확인되는 것으로 휘발성향기성분의 감응도가 상대적으로 낮은 것으로 판단된다. 미량의 대두유가 혼합된 참기름은 첨가된 대두유의 농도에 비례하여 제1판별함수값(DF1)과 높은 상관관계를 나타내었다. 참향후 참기름의 위조 여부를 검증하는 방법에 하나로 활용될 수 있을 것이다.

Diffusion Tensor-Derived Properties of Benign Oligemia, True "at Risk" Penumbra, and Infarct Core during the First Three Hours of Stroke Onset: A Rat Model

  • Chiu, Fang-Ying;Kuo, Duen-Pang;Chen, Yung-Chieh;Kao, Yu-Chieh;Chung, Hsiao-Wen;Chen, Cheng-Yu
    • Korean Journal of Radiology
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    • 제19권6호
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    • pp.1161-1171
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    • 2018
  • Objective: The aim of this study was to investigate diffusion tensor (DT) imaging-derived properties of benign oligemia, true "at risk" penumbra (TP), and the infarct core (IC) during the first 3 hours of stroke onset. Materials and Methods: The study was approved by the local animal care and use committee. DT imaging data were obtained from 14 rats after permanent middle cerebral artery occlusion (pMCAO) using a 7T magnetic resonance scanner (Bruker) in room air. Relative cerebral blood flow and apparent diffusion coefficient (ADC) maps were generated to define oligemia, TP, IC, and normal tissue (NT) every 30 minutes up to 3 hours. Relative fractional anisotropy (rFA), pure anisotropy (rq), diffusion magnitude (rL), ADC (rADC), axial diffusivity (rAD), and radial diffusivity (rRD) values were derived by comparison with the contralateral normal brain. Results: The mean volume of oligemia was $24.7{\pm}14.1mm^3$, that of TP was $81.3{\pm}62.6mm^3$, and that of IC was $123.0{\pm}85.2mm^3$ at 30 minutes after pMCAO. rFA showed an initial paradoxical 10% increase in IC and TP, and declined afterward. The rq, rL, rADC, rAD, and rRD showed an initial discrepant decrease in IC (from -24% to -36%) as compared with TP (from -7% to -13%). Significant differences (p < 0.05) in metrics, except rFA, were found between tissue subtypes in the first 2.5 hours. The rq demonstrated the best overall performance in discriminating TP from IC (accuracy = 92.6%, area under curve = 0.93) and the optimal cutoff value was -33.90%. The metric values for oligemia and NT remained similar at all time points. Conclusion: Benign oligemia is small and remains microstructurally normal under pMCAO. TP and IC show a distinct evolution of DT-derived properties within the first 3 hours of stroke onset, and are thus potentially useful in predicting the fate of ischemic brain.

16S rRNA 염기서열 분석을 통한 오분자기(Sulculus diversicolor supertexta)내 미생물 군집 조사 및 인체유해 질병세균에 대한 항균활성 모니터링 (Investigation of Microbial Communities in Sulculus diversicolor supertexta Through 16S rRNA Sequencing and Antibacterial Monitoring of Harmful Strains)

  • 김민선;이승종;허문수
    • 생명과학회지
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    • 제28권12호
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    • pp.1477-1488
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    • 2018
  • 본 연구는 제주 연안에서 채집한 오분자기(Sulculus diversicolor supertexta)를 구성하는 미생물 군집의 다양성을 알아보기 위하여 근육, 장, 생식소 각 부위별로 조사하였다. 배지로 1차 순수 분리한 결과 근육은 MA, 장 1% BHIA, 생식소 1% TSA에서 각각 최대 군락 계수가 나타났다. 16S rRNA sequence로 표준 균주와 비교 유사도 분석 결과 총 190개의 순수 colony가 분리되었다. NBLAST program 분석 결과 크게 5문 25과 39속 71종으로 나타났다. 표준 균주와 상동성은 91-100%를 나타냈다. 오분자기 내 미생물 군집은 크게 Probacteria (Gamma-proteobacteria, Alpha-proteobacteria) 48%, Actinobacteria 32.5%, Firmicutes 16.9%, Bacteroide 1.3%, Deinococcus-thermus 1.3%로 나타났다. 근육, 장, 생식소 모든 부위에서 Moraxellaceae과 Psychrobacter cibarius가 우점하였다. 근육, 장, 생식소 모든 부위에서 Alteromonadaceae, Enterobacteriaceae, Pasturellaceae, Moraxellaceae, Rhodobacteraceae, Geminicoccaceae, Dietziaceae, Intrasporangiaceae, Microbacteriaceae, Micrococcaceae, Micromonosporaceae, Streptomycetaceae, Aerococcaceae, Bacillaceae, Paenibacillaceae, Planococcaceae, Staphylcoccaceae가 공통적으로 분리되었으며, 장에서 Flavobacteriaceae, Corynebacteriaceae, Yesiniaceae, Vibrionaceae, Hahellaceae, Pseudomonadaceae가 추가 분리되었다. 분리 균주로부터 인체 유해 질병 세균에 대한 항균활성 모니터링 결과 Sterptomyces albus (96%)가 4균주 모두 항균활성을 보였고 Agrococcus baldri (99%), Psychrobacter nivimaris (99%)가 E. coli, E. aerogens에 대한 항균활성을 나타냈다. 그 외 상동성이 낮은 일부 균주가 분리되어 신균주 실험을 비롯한 항균활성물질 정제 등 추가 실험이 필요한 것으로 사료된다. 본 실험은 오분자기 미생물 군집의 다양성과 유전학적 자원을 확보하는데 의의를 두며, 응용 미생물의 개발 가능성에 있어 기초 자료를 제공하고자 하였다.

필발(Piper longum Linn.)로부터 전립선암 세포사멸물질 pipernonaline의 분리 및 동정 (Purification and Identification of Apoptosis Modulator Pipernonaline from Piper longum Linn. against Prostate Cancer Cells)

  • 김광연;김윤진;이완;유선녕;조효진;이선이;이한승;손재학;오현철;안순철
    • 생명과학회지
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    • 제19권5호
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    • pp.671-675
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    • 2009
  • Prostate cancer has been a critical health problem due to an increase of prostate cancer-related deaths worldwide. Also, a frequent treatment option for prostate cancer is androgen ablation, but this treatment has a limited scope, especially for hormone-refractory cancer. There is an urgent need for the identification of alternative therapeutic strategies for prostate cancer. Previously, over one hundred species of dried-plant methanol extracts were tested for inhibitory effects on proliferation. One of them, Piper longum Linn. was selected based on its potent anti-proliferation effect. The dried root of P. longum Linn. was extracted with 100% methanol for 2-3 days and its extract was fractionated using chloroform. The chloroform layer was then subjected to column chromatography on silica gel, reverse phase-18 (RP-18) and Sephadex LH-20, in turn. Finally, the pure compound was obtained and identified as pipernonaline by NMR spectroscopic and physico-chemical analysis. In this study, anti-proliferation and cell cycle arrest effects of pipernonaline on human prostate cancer PC-3 cells were investigated using the MTT and PI staining, respectively. Our findings suggest that pipernonaline represents a dose-dependent growth inhibition pattern on PC-3 cells and, moreover, its growth inhibition is associated with sub-G1 and G0/G1 cell cycle accumulation in PC-3 cells. Also, these results provide an anticancer candidate for human prostate cancer.

도로변 및 배경농도 측정망 PM10 자료를 이용한 노후 운행경유차 배출가스 저감사업 효과 해석 (Evaluation of Emission Reduction Program for In-use Diesel Vehicles Using PM10 Concentrations of Road-side and Background Monitoring Network)

  • 김철희;조현영;이승원;오창석
    • 한국환경과학회지
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    • 제20권12호
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    • pp.1585-1598
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    • 2011
  • Emission reduction program for in-use diesel vehicles (ERPDV) has been enacted since 2004 over the Seoul metropolitan area, and diesel emission reduction is forced to fulfill this regulation. This study was performed to evaluate the ERPDV using $PM_{10}$ concentrations of both road-side monitoring and national background network during the period of 2004-2010. In order to assess the pure road emission, we first eliminated the long range transport effect by deducting the trend of annual national background concentrations from the road-side $PM_{10}$ concentrations, and then analyzed the time series of the resultant $PM_{10}$ concentrations over Seoul metropolitan area. The annual rates of variations of road-side $PM_{10}$ with the deduction of trend of background level show -3.2, +0.4, and -2.4 ${\mu}g/m^3$/year, in Seoul, Incheon, and Gyonggi province, respectively. There are steadily decreasing trend in Seoul with all of statistic parameters such as mean, mediam, 5%ile, 10%ile, 25%ile, 75%ile, 90%ile, and 95%ile concentrations. Incheon shows some fluctuations with positive with no significant trend, and Gyonggi province shows overall decreasing but not consistent. Student-t test shows 95% significant level of ERPDV effect in Seoul, but there exists no significant level greater than 90% in both Incheon, and Kyonggi province. Total annual averaged trend over the whole Seoul metropolitan area is estimated to lie in approximately $-2.9{\mu}g/m^3$/year in this study, implying the intimate involvement of ERPDV to a large extent. This is also suggesting that the further research cost-effectiveness of ERPDV with consideration of the long range transport process would be needed over the Seoul metropolitan area.

Estimation of Pork Quality Traits Using Exsanguination Blood and Postmortem Muscle Metabolites

  • Choe, J.H.;Choi, M.H.;Ryu, Y.C.;Go, G.W.;Choi, Y.M.;Lee, S.H.;Lim, K.S.;Lee, E.A.;Kang, J.H.;Hong, K.C.;Kim, B.C.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제28권6호
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    • pp.862-869
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    • 2015
  • The current study was designed to estimate the pork quality traits using metabolites from exsanguination blood and postmortem muscle simultaneously under the Korean standard pre- and post-slaughter conditions. A total of 111 Yorkshire (pure breed and castrated male) pigs were evaluated under the Korean standard conditions. Measurements were taken of the levels of blood glucose and lactate at exsanguination, and muscle glycogen and lactate content at 45 min and 24 h postmortem. Certain pork quality traits were also evaluated. Correlation analysis and multiple regression analysis including stepwise regression were performed. Exsanguination blood glucose and lactate levels were positively correlated with each other, negatively related to postmortem muscle glycogen content and positively associated with postmortem muscle lactate content. A rapid and extended postmortem glycolysis was associated with high levels of blood glucose and lactate, with high muscle lactate content, and with low muscle glycogen content during postmortem. In addition, these were also correlated with paler meat color and reduced water holding capacity. The results of multiple regression analyses also showed that metabolites in exsanguination blood and postmortem muscle explained variations in pork quality traits. Especially, levels of blood glucose and lactate and content of muscle glycogen at early postmortem were significantly associated with an elevated early glycolytic rate. Furthermore, muscle lactate content at 24 h postmortem alone accounted for a considerable portion of the variation in pork quality traits. Based on these results, the current study confirmed that the main factor influencing pork quality traits is the ultimate lactate content in muscle via postmortem glycolysis, and that levels of blood glucose and lactate at exsanguination and contents of muscle glycogen and lactate at postmortem can explain a large portion of the variation in pork quality even under the standard slaughter conditions.

Cryparin 유전자의 promoter 분석을 위한 cryparin 유전자 치환체의 순수 제조 (Construction of a Pure Cryparin-null Mutant for the Promoter Analysis of Cryparin Gene)

  • 김명주;양문식;김대혁
    • 한국균학회지
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    • 제26권4호통권87호
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    • pp.450-457
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    • 1998
  • Cryparin은 Cryphonectria parasitica의 세포벽에 풍부한 소수성 단백질에 속한다. cryparin은 비록 하나의 유전자에 의해 발현되지만 액체배양 후 48시간이 지나면 발현된 전체 유전자중에서 22%를 차지할 정도의 높은 발현 양상을 나타낸다. 또한 cryparin은 RNA mycovirus인 Cryphonectria hypovirus 1의 감염에 의해 발현이 현저히 억제되는 유전자로 알려졌다. 이미 지난 실험(Kim et al., 1999)에서 상동염색체간의 재조합을 이용하여 cryparin 유전자를 항생제 hygromycin B 저항성 유전자로 치환한 치환체를 제조하였다. 발현율이 매우 높으면서도 virus에 의해 밀접하게 영향받는 cryparin 유전자의 promoter 분석을 위하여서는 대상이 되는 유전자 치환을 위한 vector만을 포함하며, 분석에 이용될 여러 유전자 운반체들이 어느 한곳에만 삽입되도록 하는 성질을 가진 균주의 개발이 필요하다. 그러나 지난번 실험의 결과 얻어진 cryparin 치환체는 치환용 vector외에도 무작위로 삽입된 vector가 존재하고 나아가 새로운 vector들이 어느 한곳에만 삽입되도록 하는 성질을 갖지 못하였다. 따라서 본 실험에서는 cryparin 유전자 치환체와 영양요구성 돌연변이체인 균주간의 교잡을 이용하여 분석 대상이 되는 유전자의 치환에 이용된 vector만을 포함하며, 분석에 이용될 여러 유전자 운반체들이 genome내의 어느 한곳에만 삽입되도록 하는 성질을 가진 균주를 제조하였다.

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Hydroxyapatite와 금(Au)이 혼합된 흡수성 고정판의 방사선비투과성; 예비 실험 (Radioopacity of Absorbable Plate containing Hydroxyapatite and Gold(Au); A Preliminary Report)

  • 김용하;남현재;이준호;김갑중;김연정;최식영
    • Archives of Plastic Surgery
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    • 제35권4호
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    • pp.419-422
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    • 2008
  • Purpose: Absorbable bone fixation materials for operation of facial bone fracture are composed of poly- lactic acid(PLA) & poly-glycolic acid(PGA). These materials are absorbed after facial bone healing period. Therefore, these materials are harmless in human body. But because of it's radioopacity, the number and the location of the materials are not checked in follow-up X-ray examination. We studied absorbable bone fixation materials checked radiological examination. So, we made the absorbable plate composed of PLA, Hydroxyapatite (HA) and Gold(Au). Methods: Plate 1 was consisted of pure PLA. Plate 2 was consisted of PLA(50%) and HA(50%). Plate 3 - 7 were consisted of PLA(50%), and variable composition of HA & Au. The ratio of Au was as following. From the plate 3 to plate 7, the Au ratio was 1%, 5%, 10%, 17%, and 25%, respectively. Total 3 examinations were used-naked eye examination, simple X-ray examination, and Haunsfield unit of plate in CT examination. Results: Naked eye examination found out that the color of plate 1 was most white. As the Au ratio increases, the color of plate was getting close to khaki color. the radioopacity of plate 2 was similar cortical bone of face in simple X-ray. The Haunsfield unit of cortical bone of face was 1000 HU. Haunsfield unit of titanium plate was 2900 HU. Haunsfield unit of plate 1 through plate 7 were -242, 1489, 1776, 3052, 3092, 3095, and 3095, respectively. Conclusion: Radioopacity of plate 2 was similar to cortical bone of face. In CT examination, Hanusfield unit of plate 2 was similar to Hanusfield unit of cortical bone of face. Hanusfield unit of plate 4 - 7 were similar to Hanusfield unit of titanium plate. So to trace bone fixation materials after facial bone surgery, the best ratio of Au is about 1 - 5%. If this study is applied to facial bone surgery, radiologic follow up would be easy after facial bone surgery.

난배양성 토양세균의 배양법 평가 및 신 분류군의 순수분리 (Evaluation of Various Oligotrophic Media for Cultivation of Previously Uncultured Soil Bacteria)

  • 김도형;이상훈;조재창
    • 미생물학회지
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    • 제44권4호
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    • pp.352-357
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    • 2008
  • 난배양성 세균의 배양효율을 증진시킬 수 있다고 보고된 배지 첨가물들이 포함된 다양한 종류의 빈영양 배지들을 대상으로 배양효율을 비교평가하고 최적의 배양조건을 모색하였으며, 평가된 배지를 사용하여 토양시료로부터 순수 분리된 난배양성 세균들의 계통분류학적 위치를 분석하였다. 배지 첨가물로는 토양의 화학적 조성을 반영하기 위한 토양추출액(soil extract), 부식질산의 유사체(humic acid analogue)인 anthraquinone disulfonate, 정족수인식 신호물질(quorum-signaling compounds)인 acyl homoserine lactones, 과산화물(exogenous peroxide)로부터 세균을 보호하기 위한 catalase가 사용되었다. $CO_2$ 과분압(5%, v/v) 조건에서 60일간 배양하였을 때, catalase가 첨가된 배지가 가장 높은 세균집락수(CFU)를 보였다. 이 배지로부터 147개의 균주를 무작위적으로 선택하여 순수분리하고 16S rRNA 유전자의 염기서열을 이용한 계통학적 분석을 실시한 결과, 순수분리된 균주의 약30%가 이전에 배양 또는 발견된 적이 없는 새로운 종(species)에 속하며, 이 중 약 25%는 새로운 과(family)에 속하는 세균일 가능성이 있는 것으로 나타났다. 또한 난배양성 토양세균으로 알려진 phylum Acidobacteria에 속하는 세균들이 성공적으로 배양되었다는 결과를 고려하면, 본 연구에서 사용된 배지 및 배양조건은 난배양성 토양세균의 배양은 물론 신 분류군의 발굴에도 큰 기여를 할 것으로 기대된다.