• 미생물학회지
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• 제55권1호
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• pp.39-45
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• 2019

생명공학산업의 주요한 자원인 미생물의 가치는 날로 증대하고 있으며, 이로 인해 생물자원을 확보하기 위한 국가간의 경쟁은 심화되고 있다. 이에 다양한 환경에서 미생물자원을 발굴하고 특성을 확인하는 것은 미래의 잠재적 생물자원을 확보하는데 큰 의미가 있다. 본 연구에서는 Pseudomonas속에 속하는 6종의 미생물들을 일반 토양에서 분리하여 분자계통학적 분석을 통해 국내 미기록종임을 확인하였다. 본 연구로 확보된 미생물들은 자생 생물자원의 다양성을 늘리고, 산업계에 생물자원의 선택의 폭을 늘리는데 도움이 될 것으로 기대된다.

• 한국동물위생학회지
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• 제44권3호
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• pp.133-140
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• 2021

This study was aimed to investigate the prevalence and antimicrobial resistance of Pseudomonas spp. isolated from bovine mastitis milk samples. A total of 50 (4.9%) Pseudomonas spp. was isolated from 1,023 samples, those collected between 2018 and 2021, derived from 110 dairy farms. The prevalence of the identified species of Pseudomonas isolates was as follows; P. aeruginosa (70.0%), P. fluorescens (14.0%), P. putida (10.0%), P. fragi (4.0%), and P. chlororaphis (2.0%). Most of somatic cell counts in the quarter milk carrying Pseudomonas spp. were less than 3,000,000 cell/ml (90.0%). The isolates of Pseudomonas spp. showed high susceptibility to cefepime (98.0%), ciprofloxacin (98.0%), ceftazidime (96.0%), and colistin (96.0%). The rate of antibiotic resistance in the isolates was highest to ceftiofur (92.0%), followed by the resistance rate to chloramphenicol (86.0%) and trimethoprim/sulphamethoxazole (80.0%). In addition, there is a remarkable difference in antimicrobial resistance pattern among Pseudomonas species. P. aeruginosa and P. putida showed a similar resistance pattern, whereas P. fluorescens showed exceptionally lower resistance to trimethoprim/sulphamethoxazole and chloramphenicol than that of the other species. This study showed that prevalence of Pseudomonas spp. other than P. aeruginosa were 30.0% in bovine mastitis milk, and the occurrence rate of antibiotic resistance were similar or higher level, compared with the previous reports on the mastitisderived Pseudomonas spp. isolated in Korea.

• 환경생물
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• 제29권1호
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• pp.52-60
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• 2011

식물과 그 식물의 근권미생물과의 협력관계는 이미 오래전부터 관심을 받아왔고 지구 기후변화에 따라 식물과 그 근권미생물의 생태 및 지구환경에 대한 적응성은 막대한 지장을 받을 것으로 생각되어 왔다. 따라서 지구온난화에 따라 식물뿌리에 서식하는 근권미생물인 토양미 생물의 우점종이 어떻게 변화하는지에 대해 규명하고자 본 실험을 실시하였다. 우선 한국 식물생태계의 대표종인 소나무 (A), 잣나무 (B), 상수리나무 (C), 오리나무 (D) 를 선발하여 각각 실온인 $27^{\circ}C$와 $29^{\circ}C$(실온$+2^{\circ}C$), $31^{\circ}C$(실온$+4^{\circ}C$), $33^{\circ}C$(실온$+6^{\circ}C$)에서 1년 이상 성장시킨 후 이들의 뿌리토양을 무균적으로 채취하여 미생물 screening법과 colony counting을 통하여 각각의 군에서 우점종을 선별한 뒤 16S rRNA 분석에 의해 이들 각각의 우점종을 동정하였다. 그 결과 소나무 $27^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus와 Enterobacter sp. CCBAU 15492, 소나무 $29^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. 210_64와 Enterobacter sp. CCBAU 15492, 소나무 $31^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. 210_64와 Enterobacter ludwigii, 소나무 $33^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. 210_64와 Enterobacter sp. CCBAU 15492, Bacillus marisflavistrain DS6이 검출되었고, 잣나무 $27^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus Q1, Pseudomonas sp. PR1-3, Arthrobacter woluwensisstrain CBU05/5295, 잣나무 $29^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. G3, Pseudomonas sp. PR1-3, Bacillus sp. 210_24, 잣나무 $31^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus Q1, Pseudomonas sp. PR1-3, 잣나무 $33^{\circ}C$에서는 Bacillus coagulans strain, Pseudomo-Dominant-species Change of Soil Microbes 59 nas sp. PR1-3, Chryseobacterium sp. COLI2, 상수리나무 $27^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus strain B1, Pseudomonas putida strain W30, Arthrobacter woluwensis strain CBU05/5295, 상수리나무 $29^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus strain CICC10185, Pseudomonas putida strain W30, 상수리나무 $31^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus strain CG-T2, Pseudomonas sp. W15Feb9B, 상수리나무 $33^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. CCBAU 51490, Arthrobacter woluwensis strain CBU05/5295, 오리나무 $27^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. B18, Pseudomonas sp. PD 16, Enterobacter sp. CCBAU 15492, 오리나무 $29^{\circ}C$에서는 Rhodococcus erythropolis PR4, 오리나무 $31^{\circ}C$에서는 Enterobacter cloacae, Pseudomonas sp. PD 16, 오리나무 $33^{\circ}C$에서는 Bacillus subtilis strain SYH15, Pseudomonas sp. PD16을 우점종으로 동정하였다. 이 중 소나무는 $33^{\circ}C$에서 Bacillus marisflavi strain DS6가 $27{\sim}31^{\circ}C$에서는 발견되지 않다가 온도가 상승함에 따라 출현한 새로운 우점종으로 나타났고 잣나무에서는 $27^{\circ}C$에서 Bacillus cereus Q1, $29^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. G3, $31^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus Q1 등의 Bacillus속이 주요 우점종으로 나타났으나 온도가 가장 많이 상승한 $33^{\circ}C$에서는 Chryseobacterium sp. COLI2으로 우점종이 변한 것을 확인하였다. 본 실험은 차후 더 다양한 온도에서의 토양미생물 우점종 변화에 대한 연구가 진행되어야 할 것으로 사료되며 이들 연구결과들이 연계되어 지구온난화와 미생물의 관계, 그리고 새롭게 출현한 토양미생물과 식물간의 관계를 규명하는데 도움이 되는 데이터가 도출 될 것으로 기대된다.

• 대한임상검사과학회지
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• 제39권3호
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• pp.167-177
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• 2007

From the total 121,294 clinical materials submitted to the Department of Laboratory Medicine of "C" hospital from December 1, 2004 to November 30, 2006, 3,408 Pseudomonas spp. were isolated. The isolation frequencies of Pseudomonas spp. were as follows, P. aeruginosa 95.5%, P. putida 2.5%, P. fluorescens 0.8%, along with low frequencies of P. luteola, P. alcaligenes, P. stutzeri, P. oryzihabitants, P. mendocina and unidentified Pseudomonas species. The isolation rates of Pseudomonas spp. according to season and sex were evenly distributed. The isolated frequency of Pseudomonas spp. in male was two times higher than that of in female showing significantly more male patients in surgical areas and more female patients in internal areas (p<0.001). In monthly analysis, Pseudomonas spp. were the most frequently isolated in July (10.4%), but lowest in February (5.6%). Half of Pseudomonas spp. were isolated from sputum (48.2%). In the susceptibility analysis of Pseudomonas spp. by VITEK II AST cards, the Pseudomonas spp showing higher susceptibility against antimicrobial agents were piperacillin/tazobactam (82.7%) in P. aeruginosa; amikacin (84.7%), colistin (83.3%) in P. putida; and amikacin (96.3%), cefepime (87.5%), ceftazidime (87.5%) ciprofloxacin (92.3%), colistin (88.5%) gentamicin (96.2%), isepamicin (96,1%), meropenem (92.3%), netilmicin (96.0%), piperacillin/ tazobactam (95.4%) and tobramycin (92.6%) in P. fluorescens.

• 한국해양학회지
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• 제28권3호
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• pp.186-191
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• 1993

우리 나라 남해 연안수역 특히 마산만에서 초봄인 3~4월에 와편모조류로서는 가장 빨리 적조를 일으키는 종인 Xcrippsiella trochoidea와 해양생태계에서 분해와 물 질순환에 중요한 역할을 하고 있는 해양세균과의 상호관계를 규명하기 위해서 마산만의 저니에서 분리한 X. trochidea의 cyst를 발아시켜 배양하고 배양액에서 공존하는 세균을 분리하였다. 분리된 세균 중 우점종인 Pseudomonas spp.를 S. trochoide과 함께 천연멸균해수에 투여한 후 지방산 조성의 변화를 분석하여 비교하였다. 그 결과 C_{16:1},{\;}C_{16:0}$의 조성이 상대적으로 증가하였다. 특히 S. trochoidea 와 Pseudomonas spp.의 동시 배양이 $C_{20:5}과{\;}C_{18:0}$의 두 지방산은 S. trochoidea 에서는 오히려 증가하였으나 Pseudomonas spp.에서는 오히려 감소되어, 이 두종의 지방산 대사과정이 서로 연관된다고 추정하였다.

• KSBB Journal
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• 제11권5호
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• pp.586-592
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• 1996

본 연구에서는 단일 탄소원인 포도당으로부터 P PHA를 생산하는 콩시균 Pseudomonas sp. HJ를 보다 정확하게 동정하기 위하여 수치분류를 실시하 였으며, 또한 보조기질을 첨가하였을때의 PHB/HV 합성 양상을 검토하였다. Pseudomonas sp. HJ는 각 대조균주들중에서 Pseudomonas picketti와 가장 유 사도가 높은 것으로 나타났다(78.8%). 그러나 수치 분류에 서 통일 균종에 포함될 수 있는 유샤도는 85 % 정도인 것으로 얄려져 있으므로, 본 공시균 P Pseudomonas sp. HJ는 Pseudomonas 속의 다른 종 (species)이거나 새로운 종(species)일 가능성이 높 았다. 보조기 질로 hexadecane과 propionic acid를 각각 0.4%씩 첨가했을 경우, 농도증가에 비례하여 H HV 함량은 점차 증가하여 각각 60.8 mol%, 44.9 mol%까지 축적되었다. PHB/HV내의 HV 함량은 p propionic acid냐 hexadecane의 농도를 달리하여 첨가함으로써 조절할 수 있었다. 보조기질로 propl- onic acid 0.2 %를 대수기 중기 인 배양 18시간에 첨 가하였을때 균체 생육이 가장 우수하였으나, HV monomer의 비율은 대수기 말기인 배양 24시간대에 첨가하였을때 49.6 mol%로 가장 높았다.

• Journal of Species Research
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• 제8권2호
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• pp.191-196
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• 2019

In 2015 and 2017, the National Institute of Biological Resources has isolated four unrecorded prokaryotic species designated as R-1-5, R-2-13, R-2-1, and R-1-8 from the peatland soil of Yongneup. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequence similarity determined the four strains (R-1-5, R-2-13, R-2-1, R-1-8) were most closely related to Curvibacter lanceolatus (99.93%), Massilia brevitalea (98.7%), Pseudomonas lini (99.54%), and Pseudomonas vancouverensis (99.93%), respectively. The four unrecorded strains belong to the phylum Proteobacteria, in which the genera Curvibacter and Massilia are assigned to the class Betaproteobacteria, and the genus Pseudomonas to the class Gammaproteobacteria. Since there are no publications or official reports on these four strains, these four species are new records to Korea. The strains were further characterized by Gram reaction, colony and cell morphology, basic biochemical properties, and phylogenetic position. Descriptive information of the four unrecorded species is provided.

• Journal of Species Research
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• 제13권1호
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• pp.61-66
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• 2024

During an investigation of unrecorded prokaryotic species in Korea, six unrecorded bacterial strains were isolated from soil samples collected from Uljin-gun. Based on a similarity search using the 16S rRNA gene sequence of the isolated strains and the construction of the neighbor-joining phylogenetic tree, five strains were identified to the genus Pseudomonas of the family Pseudomonadaceae, while one strain was identified as a species belonging to the genus Paenibacillus of the family Paenibacillaceae. The details of these unreported species, including gram staining reaction, colony and cell morphology, basic biochemical characteristics, strain ID, and isolation source, are described in the description of the strains.

• 한국어병학회지
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• 제30권1호
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• pp.67-70
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• 2017

Pseudomonas is currently causing increasing mortality in farmed olive flounder in Jeju Island. It was previously reported that P. anguilliseptica is the pathogen causing the mortality. It is not known whether other sub-species are involved or not. In this study, P. fluorescens was identified from diseased olive flounder by a PCR-based diagnosis. Based on genomic sequencing and BLAST analysis, 5 out of 6 samples were closer with P. fluorescens than P. anguilliseptica. Our finding suggests that P. fluorescens may be the dominant species causing the disease in farmed olive flounder in Jeju Island, South Korea.

• 한국환경과학회지
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• 제10권2호
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• pp.105-111
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• 2001

Improvement of water quality and Investigation of bacterial characteristics have been conducted in a pilot plant using biological activated carbon (BAC) in water treatment process at the downstream of the Nakdong River. Most of water control parameters were highly improved after passing through BAC. Approximately 54% of dissolved organic carbon was removed in coal-based BAC process. Bacterial biomass and bacterial production appeared $9.8{\times}10^8 CFU/g and 7.1mg-C/m^3$.hr in coal-based BAC, respectively. Predominant bacteria species grown in BAC were identified as Pseudomonas, Flavobacterium, Alcaligenes, Acinetobacter and Aeromonas species. Particularly Pseudomonas vesicularis was dominant in both coal-based and coconut-based BACs, while Pseudomonas cepacia was dominant in wood-based BAC.