• 한국식품과학회지
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• 제45권4호
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• pp.515-520
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• 2013

전통적인 방법으로 제조한 청국장과 볏짚시료로부터 배양방법과 비배양방법인 DGGE를 이용한 청국장의 발효미생물 군집을 분석하였다. 배양방법에서는 미륵산농원의 볏짚과 청국장 시료에서 P. agglomerans (65%)와 B. subtilis (60%)가 우점미생물로 나타내었고, 흥업토속 청국장의 볏짚과 청국장 시료에서는 B. amyloliquefaciens (57%와 52%)가 우점미생물로 확인하였다. DGGE 분석에서는 미륵산농원의 볏짚과 청국장 시료에서 P. agglomerans (Band intensity 20.6%)와 B. subtilis (Band intensity 25.7%)가 우점미생물로 나타내었고 흥업토속 청국장의 볏짚과 청국장 시료에서는 B. amyloliquefaciens (Band intensity 27.3%, 26.4%)가 우점미생물로 확인하였다. 그 외에도 볏짚에서는 Pantoea sp. Enterococcus durans, Enterobacter sp, P. ananatis, Bacillus sp., Rhodococcus sp. Pseudomonas fulva, Acinetobacter sp., B. licheniformis, B. amyloliquefaciens 등의 미생물을 확인하였고 청국장에서는 B. licheniformis, B. subtilis, Bacillus sp., B. circulans, Acinetobacter sp. 등의 미생물을 확인이 되었으며, 비배양 방법을 이용한 청국장 발효미생물 균총 조사는 배양이 불가능한 미생물을 확인할 수 있었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제11권5호
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• pp.763-771
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• 2001

Biphenyl dioxygenase (BPDO), which catalyzes the first step in the bacterial degradation of biphenyl and polychlorinated biphenyls, was characterized in Pseudomonas sp. B4. The bphA locus containing the four structural genes encoding BPDO were cloned and sequenced. A regulatory gene as well as a putative regulatory sequence were identified upstream of this locus. A transposase-like gene was found within a 1-kb region further upstream, thereby suggesting that the bphA locus may be carried on a transposable element. The three components of the BPDO enzyme have been separately overexpressed and purified from E. coli. The ferredoxin and terminal dioxygenase components showed biochemical properties comparable to those of two previously characterized BPDOs, whereas the ferredoxin reductase exhibited an unusually high lability. The substrate selectivity of BPDO was examined in vivo using resting cell assays performed with mixtures of selected polychlorinated biphenyls. The results indicated that para-substituted congeners were the preferred substrates. In vitro studies were carried out on a BPDO complex where the reductase from strain B4 we replaced by the more stable isoform from Comamonas testosteroni B-356. The BPDO enzyme had a specific activity of $0.26{\pm}0.02 {\mu}mol {min^-1}{mg^-1}\;of\;ISP_{BPH}$ with biphenyl as the substrate. The 2,3-, 4,4'-, and 2,4,4'-chlorobiphenyls were converted to single dihydrodiols, while 2,4'-dichlorobiphenyl gave rise to two dihydrodiols. The current data also indicated that 2,4,4'-trichlorobiphenyl was a better substrate than the 4,4'-dichlorinated congener.

• 생명과학회지
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• 제20권5호
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• pp.662-669
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• 2010

폐식용유에서 지방분해효소를 생산하는 세균을 분리하였고, PIBWIN 세균동정 방법으로 생리 생화학적 특성을 조사하여 확인한 결과 Pseudomonas sp. OME로 동정하였다. 여러 기질로 지방분해효소 생산을 조사한 결과 올리브유에서 6.1 U/ml의 생산력을 나타내었다. 물리적 인자인 배양시간, 온도. pH 및 올리브유와 효모 추출액의 영양인자에 의한 지방분해효소 생산 조건을 조사 하였다. 효소의 분비는 배양시간. 올리브유 와 효모 추출액의 농도에 강한 영향을 받았으며, RSM을 이용한 최적화는 이들 인자를 가지고 조사하였다. RSM을 이용한 지방분해효소 생산은 배양시간. 올리브유와 효모 추출액의 농도가 48 hr, 0.3 g, 및 0.9 ml에서 최적 생산조건을 나타냈다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제12권5호
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• pp.729-734
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• 2002

Radiorespirometric analysis revealed that Pseudomonas sp. strain KKI isolated from a soil contaminated with petroleum hydrocarbons was able to catabolize polycyclic aromatic hydrocarbons such as phenanthrene and naphthalene. The rate and extent of phenanthrene mineralization was markedly enhanced when the cells were pregrown on either naphthalene or phenanthrene, compared to the cells grown on universal carbon sources (i.e., TSA medium). Deduced amino acid sequence of the Rieske-type iron-sulfur center of a putative phenanthrene dioxygenase (PhnAl) obtained from the strain KKI shared significant homology with DxnAl (dioxin dioxygenase) from Spingomonas sp. RW1, BphA1b (biphenyl dioxygenase) from Spingomonas aromaticivorans F199, and PhnAc (phenanthrene diokygenase) from Burkholderia sp. RP007 or Alcaligenes faecalis AFK2. Northern hybridization using the dioxygenase gene fragment cloned from KKI showed that the expression of the putative phn dioxygenase gene reached the highest level in cells grown in the minimal medium containing phenanthrene and $KNO_3$, and the expression of the phn gene was repressed in cells grown with glucose. In addition to the metabolic change, phospholipid ester-linked fatty acids (PLFA) analysis revealed that the total cellular fatty acid composition of KKI was significantly changed in response to phenanthrene. Fatty acids such as 14:0, 16:0 3OH, 17:0 cyclo, 18:1$\omega$7c, 19:0 cyclo increased in phenanthrene-exposed cells, while fatty acids such as 10:0 3OH, 12:0, 12:0 2OH, 12:0 3OH, 16:1$\omega$7c, 15:0 iso 2OH, 16:0, 18:1$\omega$6c, 18:0 decreased.

• 농약과학회지
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• 제19권1호
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• pp.71-79
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• 2015

국내에서 서식하는 10종의 곤충에서 분리한 49균주의 장내세균으로 7종의 주요한 식물병원성 곰팡이에 대하여 항균활성을 검토하였다. 49개의 균주들은 담배장님노린재(Nesidiocoris tenuis)에서 Cedecea sp. 포함 4균주, 사슴벌레붙이(Odontotaenius disjunctus)에서 Enterobacter sp. 포함 3균주, 흰개미(Reticulitermes speratus)에서 Acinetobacter sp. 포함 4균주, 톱다리개미허리노린재(Riptortus clavatus)에서 Clavibacter sp. 포함 4균주, 열점박이잎벌레(Lema decempunctata)에서 Bacillus sp. 포함 11균주, 이십팔점박이무당벌레(Henosepilachna vigintioctopunctata)에서 Enterococcus sp. 포함 3균주, 무당벌레(Harmonia axyridis)에서 Staphylococccus sp. 포함 2균주, 콩풍뎅이(Popillia mutans)에서 Enterobacter asburiae 균을 포함한 5균주, 물땡땡이(Hydrophilus acuminatus)에서는 Aeromonas sp. 포함 7균주가 팔맥풍뎅이(Anomala octiescostata)에서는 Brucella sp. 를 포함한 7균주 등이 분리, 동정되었다. 이 49균주를 항균활성을 측정하기 위해 7종의 식물병원성 곰팡이인 토마토겹둥근무늬병(A. solani), 고추탄저병(C. gloeosporioides), 잿빛곰팡이병(B. cinerea), 시들음병(F. oxysporum), 고추역병(P. capsici), 벼문고병(R. solani), 상추균핵병(S. sclerotiorum)과 함께 PDA배지에서 대치 배양한 결과, A. solani에 대하여 항균활성을 갖는 26균주, B. cinerea에 항균활성을 갖는 6균주, C. gloeosporioides에 항균활성을 갖는 13균주, F. oxysporum에 항균활성을 갖는 11균주, P. capsici에 항균활성을 갖는 17균주, R. solani에 항균활성을 갖는 2균주와 S. sclerotiorum에 대하여 항균활성을 갖는 2균주로 나타났다. 항균활성의 결과 7종의 모든 식물병원성 곰팡이에 항균활성을 갖는 Pseudomonas aeruginosa를 선발하였다. 생물활성은 고추에 직접 분무 및 접종 처리하였을 때 고추 탄저병균(C. gloeosporioides)에 대하여 항균효과가 뚜렷하게 나타나는 것으로 확인되었다.

• 미생물학회지
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• 제35권2호
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• pp.153-157
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• 1999

Pseudomonas sp. K-52 유래의 levanase 에 의해 생산되는 levanoctaose 가 growth factor로서 각종 장내미생물에 미치는 영향을 조사하였다. In vitro 실험에서 0.5% levanoctaose를 탄소원으로 하여 glucose 일 경우와 상호 비교하여 분석한 결과 levanoctaose 는 Escherichia coli, Clostridium perfringens, Eubacterium limosum, Staphylococcus aureus 보다 Bifidobacterium adolescentis, Lactobacillius acidophilus, Bacteroid fragilis 등에 의해 효율적으로 이용되었다. 쥐를 이용한 in vivo 실험에서 탄소원의일부로 levanotaose를 제공한 경우, 장내 Bifidobacteria 수는 약 10배, butyrate 양은 2.3배, $\beta$-fructosidase 활성은 약 1.5배 증가하였다. 따라서 분리균주 Pseudomonas sp. K-2의 levanase로부터 생성되는 levanoctaose는 Bifidobacteria, Lactobacillus 와 같은 장내 유익균주에 선별적으로 이용되는 것이 확인되었다.

• 농약과학회지
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• 제10권2호
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• pp.138-148
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• 2006

농약분해에 관여하는 세균을 분리하기 위하여 연작지 시설하우스 토양 및 밭토양시료에서 procymidone, parathion, alachlor에 대해 생육저해를 받지 않는 12개의 균주를 분리한 후, 이들을 표준사용농도 및 그 1/10의 농도가 함유된 배지 상에서 가장 생육이 왕성한 2균주, B52 및 B71을 선발하여 농약 분해능을 조사하였다. 선발된 분리균을 6종의 농약(procymidone, chlorothalonil, ethoprophos parathion, alachlor, pendimethalin)이 40 mg a.i. $L^{-1}$의 농도로 함유된 TSB배지에서 분해율을 조사한 바, 대조구에 비해 분리균 B52는 최고 53.2%, 분리균 B71은 25.0%의 차이를 보여 분리균이 농약을 분해하는 것으로 나타났고 특히 procymidone, parathion, alachlor에 대한 분해율이 높았다. 이들 3종 농약의 농도에 따른 분해율의 변화를 조사한 결과 $5{\sim}40$ mg a.i. $L^{-1}$까지는 균의 생육이 왕성하였고 농약의 분해율도 높았으나 그 이상에서는 농약의 종류에 따라 차이가 있었으나 대체로 균의 생육과 분해율이 낮아지는 경향이 있었다. 배양일수별 분해율의 변화는 농약의 종류 및 균주에 따라 다양한 양상을 나타내었는데, B59는 parathion을 6일간의 배양으로 거의 분해하였고 procymidone과 alachlor는 배양 21일까지 거의 비슷한 속도로 분해되었다. 배양액의 pH는 농약의 분해와는 거의 상관이 없어 pH 5 이상에서는 거의 차이가 없었고 pH 4에서는 균이 거의 생육하지 못했으므로 분해율 또한 매우 낮았다. 선발균은 형태적, 생리생화학적 특성 및 미생물 동정장치를 이용하여, B59는 Acinetobacter sp. B71은 Pseudomonas sp.로 동정되었다.

• 미생물학회지
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• 제30권5호
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• pp.410-414
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• 1992

난분해계 물질을 분해할 수 있는 균주 개발에 유용한 클로닝백터를 개발하기 위하여, Pseudomonas putida 로부터 유래한 R 플라스미드 pKU10 을 HindIII 로부터 부분소화하여 약 8.5 kb 의 새로운 플라스미드 pKU11 을 조립하고, 여러 숙주세포에서의 안정성 및 catechol 2, 3-dioxygenase 유전자의 클로닝 을 통해 난분해계 유전자클로닝 백터로의 유용성을 조사하였다. pKU11 은 높은 농도의 ampicilin 과 tetracyclin 에 대해서 내성을 나타내었고, P. putida TN1307 에 도입되었을 때 수세대 동안 안정되게 발현되었지만, Pseudomonas 이외의 숙주세포로서 E. coli 와 Achromobacter gr. D. V. 에 도입되었을 낮은 형질전환빈도와 불안정성을 나타내었다. pKU11 의 copy 수는 8 개로 조사되었고, pKU11 에 xylene 분해에 관련된 catechol 2, 3-dioxygenase 유전자를 클로닝 하였을 때 P. putida TN 1307 에서 잘 발현하였다. 따라서 pkU11 은 난 분해계 유전자를 클로닝하는에 Pseudomonas 에서 유용한 벡터로서 쓰일 수 있을 것으로 사료된다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제13권1호
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• pp.29-34
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• 2003

A Pseudomonas sp. strain NGK1 (NCIM 5120) capable of utilizing salicylate was immobilized in alginate and polyurethane foam (PUF). The degradation rate of salicylate by freely suspended cells was compared with the degradation rate by immobilized cells. In an initial 20 and 40 mM salicylate, free cells ($2{\times}10^{11}\;cfu\;ml^{-1}$) degraded to 16 and 14 mM, alginate-entrapped cells degraded to 18 and 26 mM, and PUF-entrapped cells degraded to 20 and 32 mM salicylate, respectively, in batch cultures. The alginate-and PUF-entrapped cells were used in repeated batch and continuous culture systems. The efficiency of both the immobilized systems f3r the degradation of salicylate was compared. It has been observed that the PUF-entrapped cells could be reused for more than 20 cycles whereas alginate-entrapped cells could be reused for a maximum of only 12 cycles, after which a decrease in degradation rat was observed with the initial 20 and 40 mM salicylate. The continuous degradation of sallcylate by freely suspended cells showed a negligible degradation rate of salicylate when compared with immobilized cells. With the immobilized cells in both alginate and polyurethane foam, the degradation rate increased with an increase in the dilution rate up to $2\;h^{-1}$ for 20 mM, and $1.5\;h^{-1}$ for 40 mM salicylate. The results revealed that PUF-entrapped cells were more efficient for the degradation of salicylate than alginate-entrapped cells and freely suspended cells.

• 한국균학회지
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• 제20권2호
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• pp.109-117
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• 1992

운동성을 띠는 5가지 부생균과 1종류의 식물병원세균으로 Agrobacterium radiobacter, Bacillus subtilis, B. polymyxa, Pseudomonas aeruginosa, P. fluorescens 및 Xanthomonas malvacearum을 공시하여 이들 세균이 Cochliobolus sativus 분생포자, Fusarium oxysporum f. sp. ciceri의 후막포자, Macrophomina phaseolina의 균핵 및 Phytophthora drechsleri f. sp. cajani 난포자의 분비물에 미치는 화학주성을 서로 다른 무생물적 조건하에서 실험하였다. 균의 분비물의 농도와 세균세포의 끌리는 유인사이에는 정상관$(r=0.76{\sim}0.89)$이 있었다. 유사한 결과로서 화학주성반응과 배양간격에서도 통계적인 정상관이 있다$(r=0.82{\sim}0.95)$. 세균의 화학주성반응은 온도와 pH에 크게 영향을 받는다. 최적 화학주성을 나타내는 온도로서 A. radiobacter는 $25^{\circ}C$, B. polymyxa, P. aerugionosa, p. fluorescens and X. madracearum은 $30^{\circ}C$이었고, B. subtilis는 $35^{\circ}C$가 최적이었다. 최대 화학주성을 나타내는 분비물의 주성은 pH7이고 pH3과 11에서는 buffer와 같았다. 시험용 모세관에 유인물질이나 buffer 중 어느 종류가 채워져도 유인물질이 있는 시험관에 연결되면 세균은 주성이 나타난다는 것이 증명되었다.