• 생명과학회지
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• 제24권2호
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• pp.161-166
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• 2014

신규 프로바이오틱스 균주로서 사용하기 위하여 한국의 염장 발효 생선가공품인 젖갈로부터 Paenibacillus sp. 균주들을 탐색하였다. 이들 균주들 중에서 BCNU 5016은 그람양성균으로 gelatinase와 urease를 생산하지 않는 전형적인 Paenibacillus sp. 균주로 확인되었다. 이 균주는 16S rDNA 염기서열 분석을 바탕으로 계통적으로 Paenibacillus polymyxa의 근연종임이 확인되었다. Paenibacillus sp. BCNU 5016은 내산성 실험을 통해 pH 2.5에서 3h 배양 후에도 91.89%까지 생존함이 확인되었고, 담즙산에도 뛰어난 내성이 있음이 확인되었다. 또한 BCNU 5016은 자가응집능, 공동응집능 및 소수성 능력으로 볼 때 우수한 장점막 부착능력을 가지고 있는 것으로 판단된다. 그러므로 Paenibacillus sp. BCNU 5016은 프로바이오틱스 균주로서 우수한 잠재력을 가지고 있음을 확인할 수 있었다.

• 한국균학회지
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• 제40권4호
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• pp.258-265
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• 2012

국내 고추 재배지에서 고추탄저병균인 C. gloeosporioides에 대해 균사생장이나 포자발아 억제력이 우수한 균주를 선발하였다. 선발된 균주의 생리 생화학적특성과 MicroLog 방법을 이용하여 동정한 균주는 Paenibacillus sp. IUB225-08로 명명되었다. 항진균물질의 최적 생산을 위한 배양 조건은 pH 7.0, $25^{\circ}C$에서 60시간인 것으로 나타났다. Paenibacillus sp. IUB225-08를 배양한 액체배지에 부탄올을 첨가하여 분획한 물질과 시판 농약의 C. gloeosporioides에 대한 균사생장과 포자 발아억제 효과를 조사한 결과 부탄올 분획물이 시판 농약에 비해 고추탄저병균의 균사생장과 포자발아를 크게 억제하는 것으로 나타났다. 또한 고추열매와 고추종자에 C. gloeosporioides 포자와 부탄올로 분획한 물질을 동시에 접종한 결과 부탄올 분획물이 고추와 고추종자의 병 발생을 억제하는 것으로 나타났다. 따라서 본 연구를 통해 Paenibacillus sp. IUB225-08가 생산하는 항진균 물질은 고추탄저병의 생물적 방제제로 사용될 수 있는 잠재력이 있다고 판단되었다.

• Journal of Species Research
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• 제7권3호
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• pp.210-221
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• 2018

Eight bacterial strains assigned to the phylum Firmicutes were isolated from the soil samples in Korea. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences showed that strains 18JY14-16, 18JY14-35, 18JY42-5, 18JY12-20, 18JY35-8, 18JY76-9, 18JY39-1 and 18JY54-12 were most closely related to Paenibacillus lupini (MH497638; 99.4%), Paenibacillus illinoisensis (MH497643; 99.8%), Paenibacillus tundrae (MH497658; 99.7%), Paenibacillus selenitireducens (MH497639; 99.4%), Paenibacillus eucommiae (MH 497640; 99.9%), Paenibacillus vini (MH497654; 99.4%), Paenibacillus gorillae (MH497647; 99.5%), and Paenibacillus macquariensis (MH497649; 99.9%) respectively. These Paenibacillus species were Gram-stain-positive, rod-shaped and radiation resistant bacteria. This is the first report of these nine bacterial species in Korea.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제33권6호
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• pp.753-759
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• 2023

The genus Paenibacillus contains a variety of biologically active compounds that have potential applications in a range of fields, including medicine, agriculture, and livestock, playing an important role in the health and economy of society. Our study focused on the bacterium SS4^T (KCTC 43402^T = GDMCC 1.3498^T), which was characterized using a polyphasic taxonomic approach. This strain was analyzed using antiSMASH, BAGEL4, and PRISM to predict the secondary metabolites. Lassopeptide clusters were found using all three analysis methods, with the possibility of secretion. Additionally, PRISM found three biosynthetic gene clusters (BGC) and predicted the structure of the product. Genome analysis indicated that glucoamylase is present in SS4^T. 16S rRNA sequence analysis showed that strain SS4^T most closely resembled Paenibacillus marchantiophytorum DSM 29850^T (98.22%), Paenibacillus nebraskensis JJ-59^T (98.19%), and Paenibacillus aceris KCTC 13870^T (98.08%). Analysis of the 16S rRNA gene sequences and Type Strain Genome Server (TYGS) analysis revealed that SS4^T belongs to the genus Paenibacillus based on the results of the phylogenetic analysis. As a result of the matrix-assisted laser desorption/ionization-time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF/MS) results, SS4^T was determined to belong to the genus Paenibacillus. Comparing P. marchantiophytorum DSM 29850^T with average nucleotide identity (ANI 78.97%) and digital DNA-DNA hybridization (dDDH 23%) revealed values that were all less than the threshold for bacterial species differentiation. The results of this study suggest that strain SS4^T can be classified as a Paenibacillus andongensis species and is a novel member of the genus Paenibacillus.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제15권6호
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• pp.1286-1298
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• 2005

The genus Paenibacillus is a new group of bacilli separated from the genus Bacillus, and most of species have been isolated from soil. In the present study, we collected 450 spore-forming bacilli from the roots of winter crops, such as barley, wheat, onion, green onion, and Chinese cabbage, which were cultivated in the southern part of Korea. Among these 450 isolates, 104 Paenibacillus-like isolates were selected, based on their colony shape, odor, color, and endospore morphology, and 41 isolates were then finally identified as Paenibacillus spp. by 16S rDNA sequencing. Among the 41 Paenibacillus isolates, 23 were classified as P. polymyxa, a type species of the genus Paenibacillus, based on comparison of the 16S rDNA sequences with those of 32 type strains of the genus Paenibacillus from the GenBank database. Thirty-five isolates among the 41 Paenibacillus isolates exhibited antagonistic activity towards plant fungal and bacterial pathogens, whereas 24 isolates had a significant growth-enhancing effect on cucumber seedlings, when applied to the seeds. An assessment of the root-colonization capacity under gnotobiotic conditions revealed that all 41 isolates were able to colonize cucumber roots without any significant difference. Twenty-one of the Paenibacillus isolates were shown to contain the nifH gene, which is an indicator of $N_{2}$ fixation. However, the other 20 isolates, including the reference strain E681, did not incorporate the nifH gene. To investigate the diversity of the isolates, a BOX-PCR was performed, and the resulting electrophoresis patterns allowed the 41 Paenibacillus isolates to be divided into three groups (Groups A, B, and C). One group included Paenibacillus strains isolated mainly from barley or wheat, whereas the other two groups contained strains isolated from diverse plant samples. Accordingly, the present results showed that the Paenibacillus isolates collected from the rhizosphere of winter crops were diverse in their biological and genetic characteristics, and they are good candidates for further application studies.

• 농약과학회지
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• 제9권3호
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• pp.262-267
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• 2005

유기합성농약의 부작용을 최소화하고, 미생물 농약의 실용화를 목적으로 Paenibacillus sp. AC-1 건조 분말 그리고 여러 가지 보조제 및 증량제를 이용하여 입제를 제조하였으며, 이들 제제에 대한 물리화학적 특성을 연구하였다. 시제품은 Paenibacillus sp. AC-1 건조분말을 사용하여 고추역병 방제용 입제 4종을 제조하였다. 증량제 종류별 원제에 대한 영향은 talc가 가장 안정하였으며, 시제품 제조시 균주 생존성은 시제품 모두 제조 후에 안정하였다. Paenibacillus sp. AC-1 건조분말을 사용한 시제품의 물리화학적 특성 중 시제품 모두 입제의 품질규격에 적합하였다. Paenibacillus sp. AC-1 건조분말을 사용한 입제의 저장온도별 균주 안정성은 $4{\sim}50^{\circ}C$의 온도 범위에서 12주후까지도 안정하였다. 입제의 균 수중용출은 처리 7시간 후에 Paenibacillus sp. AC-1 균이 90% 이상 용출되었으며, 입자붕괴성은 처리 1일 후에 완전히 붕괴되었다. 이상의 결과를 종합할 때, Paenibacillus sp. AC-1를 이용한 고추역병 방제용 미생물 살균제의 실용화를 위한 제조처방은 원제로서 AC-1 건조분말 20%, 보조제로서 sodium polyacrylate 1.0%, 계면활성제로서 polycarboxylate를 주제로한 제제 7%, 증량제로서 나머지를 talc로 사용하는 것이 Paenibacillus sp. AC-1의 입제 제조에 최적 조건이었다.

• 생명과학회지
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• 제23권2호
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• pp.299-305
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• 2013

Paenibacillus는 호기성의 내생포자를 형성하는 그람양성균으로써 이전에는 Bacillus로 분류되었다. Paenibacillus sp. CK214 균주는 LB agar 평판배지에서 높은 swarming 운동 능력을 가지고 Paenibacillus 특유의 집락 형태를 나타내었지만 glucose가 첨가된 평판배지에서는 운동 능력을 상실하였다. 투과전자현미경(TEM)을 이용하여 glucose 조건에 따른 CK214 균주의 편모를 관찰하면 LB agar 평판배지에서 배양한 CK214 균주는 주모성의 편모를 가지는 반면 glucose를 첨가한 평판배지에서 배양한 CK214 균주의 경우 주모성 편모가 나타나지 않는 것을 확인할 수 있었다. 물리적 충격과 원심분리를 통해 분리한 CK214 균주의 filament 구성 단백질을 SDS-PAGE를 통해 확인하였으며, 약 29 kDa 크기의 단일 단백질 밴드가 나타났다. Edwardsiella tarda 균주의 flagellin 단백질에 특이적인 항체를 이용한 immunoblotting 수행 결과, 이 단일 단백질 밴드는 flagellin 단백질임이 확인되었다. Glucose조건에 따른 CK214 균주의 flagellin 단백질의 발현을 단백질 수준에서 관찰한 결과, glucose가 첨가된 조건에서 생장한 CK214 균주에서의 flagellin 단백질 발현이 glucose가 없는 조건일 때에 비해 감소하는 것을 확인할 수 있었다.

• 한국균학회지
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• 제37권2호
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• pp.181-188
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• 2009

A Gram-positive, rod-shaped bacteria named DY5 was isolated from a peat sample collected from Daeam mountain in Korea. The culture filtrate of the bacterial isolate DY5 showed a broad spectrum of antifungal activity on various crop pathogenic fungi such as Trichoderma koningii, Fusarium oxysporum, Colletotrichum gloeosporioides, Sclerotinia sclerotiorum, Rhizoctonia solani AG-1(IA) For the identification of the DY5, morphological, biochemical, API 50 CHB test, analysis of fatty acid and molecular phylogenetic approaches were performed. The DY5 was found to be a member of the genus Paenibacillus on the basis of morphological and biochemical analysis. The 16S rRNA of DY5 showed high similarity(98%) with Paenibacillus polymyxa. On the basis of these results, the DY5 was identified as Paenibacillus polymyxa. Antifungal substance of the DY5 would be mild alkaline proteine molecule. The DY5 seems to have a great potential to be a biocontrol agent against various crop pathogens.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제34권8호
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• pp.1636-1641
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• 2024

A Gram-stain-positive, aerobic, white-coloured, rod-shaped bacteria, designated as a strain dW9^T, was isolated from soil. Strain dW9^T was catalase-positive and oxidase-negative. Strain dW9^T grew at temperature of 20-37℃ and at pH of 5.0-7.0. Phylogenetic and 16S rRNA gene analysis indicated that strain dW9^T belonged to the genus Paenibacillus with its closest relative being Paenibacillus filicis S4^T (97.4% sequence similarity). The genome size of dW9^T was 7,787,916 bp with DNA G+C G+C content of 51.3%. The digital DNA-DNA hybridization (dDDH) and average nucleotide identity (ANI) values of dW9^T with its closest relatives were found to be <22.0% and <74.0%, respectively. The only respiratory quinone was MK-7, and the major fatty acids were antiso-C_15:0 and iso-C_16:0. Overall, the comprehensive taxonomic analysis revealed that strain dW9^T met all the fundamental criteria to be classified as a novel species within the genus Paenibacillus. Accordingly, we propose the name Paenibacillus gyeongsangnamensis sp. nov., with the type strain dW9^T (=KCTC 43431^T =NBRC 116022^T).

• 한국응용곤충학회지
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• 제46권2호
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• pp.303-311
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• 2007

Xylan이 풍부한 식물체를 먹이로 하는 하늘소의 장내에 존재하는 xylanase 생산 미생물의 탐색 과정에서 털두꺼비하늘소 (Moechotypa diphysis) 성충의 장으로부터 우수한 xylanase 생산균주 Paenibacillus sp. HY-8을 분리하였다. 생화학적, 계통학적 분석결과를 바탕으로 이 분리균은 Paenibacillus 속에 속하는 종으로 분석되었다. HY-8 균주에서 xylanase 생산은 제한배지에 xylan을 첨가함으로써 유도되는 특성을 나타내었고 1% 의 yeast extract와 0.5%의 birchwood xylan이 포함된 M9 배지에서 $25^{\circ}C$, 24시간의 배양에 의해 xylanase의 생산이 최대치에 도달하였다. HY-8 균주가 생산하는 xylanase는 pH6.0에서 여러 가지 식물성 사료의 원료에 대하여 대조구로 사용된 Tricoderma sp. 유래의 xylanase에 비해 우수한 분해능을 나타내었다.