We have used two kinds of P element constructs, Pc[(ry+)B] and p[(ry+)$\Delta$SX9], for genetic transformation by microinjection of D. melanogaster. Pc[(ry+)B] construct carrying the rosy gene within an autonomous P element was injected into a true M strain caring the ry506. mutation. The source of transposase for microinjection and transformation was provided by a P element helper plasmid designated p-$\Delta$2-3hs$\pi$, which was co-injected with nonautonomous P[(ry+)$\Delta$SX9] construct into same ry506 M strains. A dechorination method was adopted and 35 independent transformed lines were obtained froin 1143 G0 Injected (35/1143). About 20% of the injected embryos eclosed as adults. Among G0 eclosed flies, approximately 40% exhibited eye color that was similar to wild-type (ry+), but about 60% of fertile G0 transformed lines appeared to have no G1 transformants. Therefore it is unlikely that G0 expression requires integration of the rosy transposon into chromosomes. Pc[(ry+)B] and P[(ry+)$\Delta$SX9] constructs were found to be nearly same in the frequency of element-mediated transformation. On the basis of these results, nonautonomous P elements constructs could he used as same effective vectors in P element-mediated transformation for introducing and fixing genes in insect populations.
Rani, Shilpa;Park, Chang Sik;Sreenivasaiah, Pradeep Kumar;Kim, Do Han
Molecules and Cells
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v.39
no.2
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pp.149-155
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2016
In the heart, excitation-contraction (E-C) coupling is mediated by $Ca^{2+}$ release from sarcoplasmic reticulum (SR) through the interactions of proteins forming the $Ca^{2+}$ release unit (CRU). Among them, calsequestrin (CSQ) and histidine-rich $Ca^{2+}$ binding protein (HRC) are known to bind the charged luminal region of triadin (TRN) and thus directly or indirectly regulate ryanodine receptor 2 (RyR2) activity. However, the mechanisms of CSQ and HRC mediated regulation of RyR2 activity through TRN have remained unclear. We first examined the minimal KEKE motif of TRN involved in the interactions with CSQ2, HRC and RyR2 using TRN deletion mutants and in vitro binding assays. The results showed that CSQ2, HRC and RyR2 share the same KEKE motif region on the distal part of TRN (aa 202-231). Second, in vitro binding assays were conducted to examine the $Ca^{2+}$ dependence of protein-protein interactions (PPI). The results showed that TRN-HRC interaction had a bell-shaped $Ca^{2+}$ dependence, which peaked at pCa4, whereas TRN-CSQ2 or TRN-RyR2 interaction did not show such $Ca^{2+}$ dependence pattern. Third, competitive binding was conducted to examine whether CSQ2, HRC, or RyR2 affects the TRN-HRC or TRN-CSQ2 binding at pCa4. Among them, only CSQ2 or RyR2 competitively inhibited TRN-HRC binding, suggesting that HRC can confer functional refractoriness to CRU, which could be beneficial for reloading of $Ca^{2+}$ into SR at intermediate $Ca^{2+}$ concentrations.
To investigate properties of Ca-release channel in the reptile skeletal muscle, electrophoretical analysis, purification of RyR, $[^3H]ryanodine$binding study, and $^{45}Ca-release$ were carried out in the SR vesicles prepared from the snake skeletal muscle. The snake SR vesicle has the single high molecular weight protein band on SDS-PAGE, and its mobility was similar with that of rat skeletal SR vesicles. The high molecular weight band on SDS-PACE was found in the $[^3H]ryanodine$ peak fractions $(Fr_{5-7})$ obtained from the purification step of the RyR. Maximal binding site and Kd of the snake SR RyR were 6.36 pmole/mg protein and 17.62 nM, respectively. Specific binding of $[^3H]ryanodine$ was significantly increased by calcium and AMP (P<0.05), but not or slightly inhibited by tetracaine, ruthenium red (5.4%), or $MgCl_2$ (21%). $^{45}Ca-release$ from the SR vesicles loaded passively was significantly increased by the low concentration of calcium $(1{\sim}10{\mu}M)$ and AMP (5 mM)(P<0.05), but significantly decreased by the high concentration $(300{\mu}M)$ of calcium, tetracaine (1 mM), ruthenium red $(10{\mu}M)$, and $MgCl_2$ (2 mM)(P <0.05). From the above results, it is suggested that snake SR vesicles also have the RyR showing the similar properties to those of mammalian skeletal RyR with the exceptions of no or slight inhibition of $[^3H]ryanodine-binding$ by tetracaine, ruthenium red, or $MgCl_2$.
Aquea, Gisela;Bresky, Gustavo;Lancellotti, Domingo;Madariaga, Juan Andres;Zaffiri, Vittorio;Urzua, Ulises;Haberle, Sergio;Bernal, Giuliano
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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v.15
no.5
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pp.1931-1936
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2014
Background: Gastric cancer (GC) ranks as one of the major causes of mortality due to cancer worldwide. In Chile, it is currently the leading cause of cancer death. Identification of novel molecular markers that may help to improve disease diagnosis at early stages is imperative. Materials and Methods: Using whole-genome DNA microarrays we determined differential mRNA levels in fresh human GC samples compared to adjacent healthy mucosa from the same patients. Genes significantly overexpressed in GC were validated by RT-PCR in a group of 14 GC cases. Results: The genes CD248, NSD1, RAB17, ABCG8, Ephb1 and P2RY2 were detected as the top overexpressed in GC biopsies. P2RY2, Ephb1 and CD248 showed the best sensitivity for GC detection with values of 92.9%, 85.7% and 64.3% (p<0.05), respectively. Specificity was 85.7%, 71.4% and 71.4% (p<0.05), for each respectively.
Journal of Korean Society of Environmental Engineers
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v.28
no.3
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pp.257-264
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2006
This study investigated the effects of hybrid process(chemical coagulation, Fenton oxidation and ceramic UF(ultrafiltration)) on COD and color removals of commercial reactive dyestuffs. In the case of chemical coagulation, the optimal concentrations of $Fe^{3+}$ coagulant for COD and color removals of RB49(reactive blue 49) and RY84(reactive yellow 84) were determined according to the different coagulant dose at the optimal pH. They were 2.78 mM(pH 7) in RB49 and 1.85 mM(pH 6) in RY84, respectively. In the case of Fenton oxidation, the optimal concentrations of $Fe^{3+}\;and\;H_2O_2$ were obtained. Optimal $[Fe^{2+}]:[H_2O_2]$ molar ratio of COD and color removals of RB49 and RY84 were 4.41:5.73 mM and 1.15:0.81 mM, respectively. In the case of ceramic UF, the flux and rejection of supernatant after Fenton oxidation were investigated. After ceramic UF for 9 hr, the average flux of RB49 and RY84 solutions were $53.4L/m^2hr\;and\;67.4L/m^2hr$ at 1 bar, respectively. In addition, the permeate flux increased and the average flux recovery were 98.5-99.9%(RB49) and 91.0-97.3%(RY84) according to adopting off-line cleaning(5% $H_2SO_4$). Finally, COD and color removals were 91.6-95.7% and 99.8% by hybrid process, respectively.
Purpose: Intracorporeal anastomosis is the most difficult procedure during pure single-incision distal gastrectomy (SIDG) that affects its generalization. We introduced unaided delta-shaped anastomosis (uDelta), a novel anastomosis technique, for gastroduodenostomy after pure SIDG, and compared the results with those of previously reported Roux-en-Y anastomosis (RY). Materials and Methods: Between March 2014 and March 2015, SIDG with D1+ lymph node dissection was performed for early gastric cancer through a 2.5-cm transumbilical incision without any additional port. uDelta was performed by the operator alone, without any intracorporeal assistance. Results: uDelta was performed on 11 patents, and uncut RY was performed on 5-patients without open or multiport conversion. R0 resection was performed in all cases. No significant differences were observed in mean age and body mass index between patients who underwent uDelta or RY. Mean operation times were $214.5{\pm}36.2$ minutes for uDelta and $240.8{\pm}65.9$ minutes for RY, which was not significantly different. Reconstruction time for uDelta was shorter than that for RY, with marginal statistical significance ($26.1{\pm}8.3$ minutes vs. $38.0{\pm}9.1$ minutes, P=0.05). There were no intraoperative transfusions, 30-day mortality, or anastomosis-related complications in either group. Average length of hospital stay was $8.2{\pm}1.9$ days in the uDelta group and $7.2{\pm}0.8$ days in the RY group (P=0.320). Conclusions: After carefully considering indications, uDelta can be a feasible and can be a reproducible reconstruction method after SIDG in early gastric cancer.
To investigate the effects of incorporation of green manures (GM) into a sandy loam soil on growth, yield, and nutrient uptake of tomato (Lycoperiscon esculentum Mill.) and nutrient balances (input minus offtake of nutrients), five tomato production systems were compared under the condition of plastic film house: 1) a no input system (no additional amendment or inputs, 0-To-0-To); 2) a conventional system (application of N-P-K chemical fertilizers, Cf-To-Cf-To); 3) a leguminous GM-containing system (hairy vetch-tomato-soybean-tomato, Hv-To-Sb-To); 4) a graminaceous GM-containing system (rye-tomato-sudan grass-tomato, Ry-To-Sd-To); and 5) system mixed with leguminous and graminaceous GMs (rye-tomatosoybean- tomato, Ry-To-Sb-To). Here, hairy vetch and rye were cultivated as winter cover crops during late $Dec{\sim}late$ Feb and soybean and sudan grass were cultivated as summer cover crops during late $Jun{\sim}mid$ Aug. All of them cut before tomato planting and then incorporated into soil. Biomass of GMs was greater in summer season than that of winter season. Nitrogen amount fixed by a leguminous plants was about $126\;kg\;ha^{-1}$ per a cropping season, corresponding to 60% N level needed for tomato production, which was comparable to 50 and $96\;kg\;ha^{-1}$ fixed by rye and sudan grass. As a result, tomato yield of Hv-To-Sb-To system (legume GM treatment) was similar to Cf-To-Cf-To (conventional), but that in Ry-To-Sd-To system (graminaceous GM treatment) was not attained to a half level of conventional treatment. Nutrient budgets for N, P and K on the conventional farm were balanced or somewhat positive exception for minus-balanced K. Ry-To-Sd-To system showed a positive N, P and K budgets due to the depressed growth of tomato which is caused by high C/N ratio and low N-fixing capacity of the GMs. Inversely, those of Hv-To-Sb-To system were negative in all of N, P and K budgets because of increased growth and yield of tomato with high nitrogen-supplying capacity as well as low C/N ratio of leguminous GM. In conclusion, although conventional cultivation has an advantage in relation to N, P and K nutrient budgets rather than GM-incorporated systems, a leguminous GMs could be recommended as nitrogen reservoir and soil amendment because the yield of tomato between use of leguminous GM and conventional cultivation was not only significantly difference, but also GMs commonly reduce nutrient loss and improve microbial communities.
Cropland is a major source of atmospheric nitrous oxide (N2O) and we need technologies in the field of agriculture that can reduce the presence of N2O. In this study, a field experiment encompassing six treatments was conducted to determine the efflux of N2O in cropland during the growing season. An experimental plot was composed of two main sectors, no-tillage (NT) and conventional tillage (CT), which were subdivided into three plots according to types of nitrogen (N) sources: CF, chemical fertilizer; HV, hairy vetch+chemical fertilizer; and RY, rye+chemical fertilizer. The cumulative N2O emissions were 179.8 mg N2O m-2 for CF-CT, 108.1 mg N2O m-2 for HV-CT, 303.5 mg N2O m-2 for RY-CT, 86.7 mg N2O m-2 for CF-NT, 73.8 mg N2O m-2 for HV-NT, and 122.7 mg N2O m-2 for RY-NT during the fallow season. The CT, HV, and RY of no-tilled soils were reduced by 51.8, 31.7 and 59.6%, respectively (p<0.001). Our results indicate that the use of no-tillage and hairy vetch practice rather than conventional tillage and chemical fertilizer practice can decrease N2O emission.
Manoochehri, Mahboobeh;Rattan, V.K.;Khorsand, Ameneh;Panahi, Homayon Ahmad
Carbon letters
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v.11
no.3
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pp.169-175
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2010
The study describes the results of batch experiments on the removal of Reactive Yellow 15 (RY15) and Reactive Black 5 (RB5) from synthetic textile wastewater onto Activated Carbon from Walnut shell (ACW). The experimental data were analyzed by the Langmuir, Freundlish, Temkin and Dubinin-Radushkevich (D-R) models of adsorption. The experiments were carried out as function of initial concentrations, pH, temperature (303-333), adsorbent dose and kinetics. The surface area and pore volumes of adsorbent were measured by BET and BJH methods. The findings confirm the surface area (BET) is 248.99 $m^2/g$. The data fitted well with the Temkin and D-R isotherms for RY15 and RB5, respectively. The most favorable adsorption occurred in acidic pH. Pseudo-second order kinetic model were best in agreement with adsorption of RY15 and RB5 on ACW. The results indicate that walnut shell could be an alternative to more costly adsorbent currently being used for dyes removal.
Journal of Dental Rehabilitation and Applied Science
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v.40
no.3
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pp.149-158
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2024
Purpose: This study aims to investigate the effects of provisional restoration fabrication methods and surface polishing on surface roughness and microbial adhesion through in vitro experiments. Materials and Methods: 120 cylindrical provisional restoration resin blocks (10 × 10 × 2.5 mm) were manufactured according to four fabrication methods, and 30 specimens were assigned to each group. Afterwards, they were divided into non-polishing group, #400 grit SiC polishing group, and #800 grit SiC polishing group and polished to a 10 × 10 × 2 mm specimen size (n = 10). The surface roughness Ra and Ry of the specimen was measured using a Surface Roughness Tester. Three specimens were extracted from each group and were coated with artificial saliva, and then Streptococcus mutans were cultured on the specimens at 37℃ for 4 hours. The cultured specimens were fixed to fixatives and photographed using a scanning electron microscope. For statistical analysis, the two way of ANOVA was performed for surface roughness Ra and Ry, respectively, and the surface roughness was tested post-mortem with a Scheffe test. Results: The fabrication method and the degree of surface polishing of the provisional restorations had a significant effect on both surface roughness Ra and Ry, and had an interaction effect. There was no significant difference in Ra and Ry values in all polishing groups in DLP and LCD groups. Conclusion: The fabrication method and surface polishing of the provisional restoration had a significant effect on surface roughness and showed different adhesion patterns for S. mutans adhesion.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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