• Journal of Korean Dental Science
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• 제16권1호
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• pp.35-46
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• 2023

Purpose: Culture-based methods for microbiological diagnosis and antibiotic susceptibility tests have limitations in the management of orofacial infections. We aimed to profile pus microbiota and identify antibiotic resistance genes (ARGs) using a culture-independent approach. Materials and Methods: Genomic DNA samples extracted from the pus specimens of two patients with orofacial abscesses were subjected to shotgun sequencing on the NovaSeq system. Taxonomic profiling and prediction of ARGs were performed directly from the metagenomic raw reads. Result: Taxonomic profiling revealed obligate anaerobic polymicrobial communities associated with infections of odontogenic origins: the microbial community of Patient 1 consisted of one predominant species (Prevotella oris 74.6%) with 27 minor species, while the sample from Patient 2 contained 3 abundant species (Porphyromonas endodontalis 33.0%; P. oris 31.6%; and Prevotella koreensis 13.4%) with five minor species. A total of 150 and 136 putative ARGs were predicted in the metagenome of each pus sample. The coverage of most predicted ARGs was less than 10%, and only the CfxA2 gene identified in Patient 1 was covered 100%. ARG analysis of the seven assembled genome/metagenome datasets of P. oris revealed that strain C735 carried the CfxA2 gene. Conclusion: A metagenomics-based approach is useful to profile predominantly anaerobic polymicrobial communities but needs further verification for reliable ARG detection.

• 대한소아치과학회지
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• 제38권2호
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• pp.155-160
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• 2011

최근 들어, 수복 치료 등을 이용한 질병의 직접적인 치료보다는 예방 치료에 대한 중요성이 강조되면서, 그 동안 사용되었던 화학적인 약물을 통한 예방 치료 이외에도 유산균등을 이용한 probiotics에 대한관심이 높아지고 있다. 여러 논문에서 Lactobacillus와 Bifidobateria들이 DMFS와 S. mutans를 감소한다고 보고하고 있다. 하지만, 이러한 미생물들의 접종 시기와 접종 농도에 대한 언급은 부족하다. 따라서 본 실험에서는 probiotics의 대표적인 균인, L. rhamnosus GG를 이용하여 예방 효과를 보기 위한 적정 농도를 재정립하고, 접종시기를 고찰하였다. S. mutans 배지에 $1{\times}10^6$ CFU이상 농도의 L. rhamnosus를 접종하였을 때 S. mutans count가 현저하게 감소하는 것을 볼 수 있었다. 접종 순서는 L. rhamnosus와 S. mutans를 동시에 접종하거나 L. rhamnosus를 S. mutans 보다 선행하여 접종하였을 때가, S. mutans를 L. rhamnosus 보다 선행하여 접종하였을 때에 비교하여 S. mutans count를 더 감소시켰다. 이 실험의 결과로 보아 probiotics의 접종 시기는 probiotics을 임상에 적용할 때 반드시 고려되어야 하겠다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제28권4호
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• pp.645-651
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• 2018

The carcinogenicity of chemicals in the environment is a major concern. Recently, numerous studies have attempted to develop methods for predicting carcinogenicity, including rodent and cell-based approaches. However, rodent carcinogenicity tests for evaluating the carcinogenic potential of a chemical to humans are time-consuming and costly. This study focused on the development of an alternative method for predicting carcinogenicity using quantitative PCR (qPCR) and colon cancer stem cells. A toxicogenomic method, mRNA profiling, is useful for predicting carcinogenicity. Using microarray analysis, we optimized 16 predictive gene sets from five carcinogens (azoxymethane, 3,2'-dimethyl-4-aminobiphenyl, N-ethyl-n-nitrosourea, metronidazole, 4-(n-methyl-n-nitrosamino)-1-(3-pyridyl)-1-butanone) used to treat colon cancer stem cell samples. The 16 genes were evaluated by qPCR using 23 positive and negative carcinogens in colon cancer stem cells. Among them, six genes could differentiate between positive and negative carcinogens with a p-value of ${\leq}0.05$. Our qPCR-based prediction system for colon carcinogenesis using colon cancer stem cells is cost- and time-efficient. Thus, this qPCR-based prediction system is an alternative to in vivo carcinogenicity screening assays.

• 대한소아치과학회지
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• 제34권2호
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• pp.299-308
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• 2007

Streptococcus mutans Ingbritt의 비수용성 글루칸을 합성하는 효소인 glucosyltransferase B 및 C의 mRNA 발현에 대한 각 당의 영향을 fluorescent in situ hybridization(FISH) 방법으로 관찰하여 다음의 결과를 얻었다. 1. 1% 설탕이 함유된 BHI 배지에서 S. mutans Ingbritt를 접종하여 배양할 때 배양 9시간 째 gtfB 및 gtfC유전자의 mRNA가 발현이 급격히 증가하였다. 2 BHI 액체배지에 설탕을 첨가한 경우 gtfB및 gtfC유전자의 mRNA가 발현되었으며, 10% 설탕을 첨가한 경우 1%와 5%보다 gtfB 및 gtfC 유전자의 발현이 감소되었다. 3. 1% 설탕이 첨가된 BHI 액체 배지에 당을 첨가한 경우 포도당은 10% 첨가하였을 때 gtfB 및 gtfC 유전자의 mRNA 발현이 감소하였고, 과당의 경우 1% 첨가한 경우 감소하여 5% 와 10%에서는 gtfB및 gtfC 유전자가 거의 발현되지 않았다. 4. 자일리톨의 경우 1%부터 gtfB및 gtfC유전자 mRNA 발현이 대조군보다 감소하였고, 5%와 10%에서는 두 유전자 모두 발현이 현저하게 감소하였다. 5. 유당의 경우 두 유전자의 발현에 거의 영향을 미치지 않는 것으로 관찰되었고, 솔비톨의 경우 각 농도에서 두 유전자의 발현이 대조군보다 감소하였다. 결론적으로 비수용성 글루칸 합성하는 gtfB및 gtfC 유전자의 mRNA 발현이 포도당, 과당 자일리톨 첨가에 의해 감소함을 알 수 있었다.

• 대한소아치과학회지
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• 제31권2호
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• pp.314-322
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• 2004

글루캔 형성은 이온, 완충액 및 영양물질 등과 같은 구강 내 존재하는 물질과 이들의 변화에 영향을 받는다. 본 연구에서는 치아 우식증의 중요한 원인균인 Streptococcus mutans를 실험균으로 하여 수용성 글루캔 합성 효소인 GTFD 유전자의 발현에 대한 이온 및 완충액의 영향을 Fluorescent in situ hybridization 방법으로 관찰하여 다음의 결과를 얻었다. 1. $CaCl_2$ 농도가 1.0mM, KCl 농도가 2.5mM, $MgCl_2$의 농도가 0.4mM일 때 생균수가 가장 많았다. 2. 완충액의 경우 sodium bicarbonate 10mM, sodium phosphate 1mM, potassium phosphate 0.1mM에서 생균수가 가장 많았고, 3가지 완충액 모두 100mM 농도에서 생균수가 가장 적었다. 3. 자당이 함유되지 않은 BHI 배지에 비해 1%자당을 첨가한 경우 gtfD 유전자의 mRNA 발현에 따른 녹색형광이 관찰되었다. 4. $CaCl_2$ 0.25mM일 때 gtfD 유전자의 mRNA 발현에 따른 녹색형광이 대조군보다 강하였고, KCl의 경우 10mM일 때 대조군과 유사한 녹색형광을 나타냈으나, 다른 농도에서는 거의 관찰되지 않았다. $MgCl_2$의 경우 각 농도에서 대조군보다 녹색형광이 약하게 나타났다. 5. Sodium bicarbonate, sodium phosphate 완충액의 경우 mRNA 발현에 따른 녹색형광이 각 농도에서 대조군과 유사하게 나타났으며, potassium phosphate 완충액의 경우 100mM에서 녹색형광을 거의 관찰할 수 없었다.

• 구강회복응용과학지
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• 제31권3호
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• pp.212-220
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• 2015

목적: Candida albicans는 면역력이 약한 환자에게서 점액질환을 야기하며, 의치성 구내염과 밀접하게 관련되어 있다. 전기 분해 수소수는 금속 전극을 통해서 전기를 흘려 전기분해 한 물이며, 구강세균에 대해서 항균효과를 보였다. 본 연구에서는 칸디다 바이오필름에 대한 전기 분해 수소수의 항진균효과를 조사하였다. 연구 재료 및 방법: C. albicans는 발아세포 및 균사형태를 형성시키기 위해서 사부로포도당 액체배지 및 F-12 영양 배지를 이용하여 호기상태 및 5% 이산화탄소 환경에서 각각 배양하였다. 여러 금속 전극을 이용하여 수돗물을 전기분해 한후에 발아세포 형태와 균사형태의 칸디다를 전기분해 수소수로 처리하였다. 결과: 사부로포도당배지와 F-12 영양배지를 이용하여 칸디다를 배양하였을 때, 각각 발아세포 형태와 균사 형태를 보였다. 전기 분해 수소수는 발아세포 형태의 C. albicans에 대해서 항진균 효과를 보였다. 또한 칸디다 바이오필름에 대해서도 항진균 효과를 보였다. 여러 종류의 금속 전극을 이용한 전기분해 수소수중에 백금전극을 이용한 전기분해 수소수만 항진균 활성이 있는 것으로 나타났다. 결론: 백금 전기분해 수소수는 구강 칸디다증과 의치관련 구내염을 예방하기 위한 구강 청결제로 사용 가능 할 것이다.

• 구강회복응용과학지
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• 제32권1호
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• pp.16-23
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• 2016

목적: 이번 연구는 다양한 pH의 불소 제재들이 티타늄 표면 거칠기에 미치는 영향을 평가하는 것이었다. 연구 재료 및 방법: 기계절삭형 티타늄 디스크를 시중에서 유통되는 세 가지 불소겔로 처리하였다. 불소겔의 종류와 처리 시간에 따라, 대조군, 1군(pH 3.5의 APF로 1분간 처리), 2군(pH 3.5의 APF로 30분간 처리), 3군(pH 4.0의 APF로 1분간 처리), 4군(pH 4.0의 APF로 30분간 처리), 5군(pH 7.0의 NaF로 1분간 처리), 6군(pH 7.0의 NaF로 30분간 처리)의 7군으로 분류하였다. 디스크의 표면 거칠기를 측정한 후, Porphyromonas gingivalis, Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Fusobacterium nucleatum을 배양하여 디스크에 부착하는 세균의 양을 측정하였다. 결과: 표면 거칠기는 그룹2에서만 유의하게 증가하였다(P < 0.0001). 세균의 부착량은 실험군과 대조군 사이에 유의한 차이를 보이지 않았다. 결론: pH 3.5의 APF를 30분간 처리한 그룹에서 표면 거칠기가 유의하게 증가하였지만, 세균의 부착에 대해서는 유의한 차이를 보이지 않았다.

• 대한소아치과학회지
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• 제44권2호
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• pp.170-179
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• 2017

본 연구의 목적은 국내 상품화된 일반 우유와 저지방 우유의 우식원성을 CDC Biofilm Reactor를 사용한 세균막 모델을 통해 비교하는 것이다. 소의 법랑질 시편에 Streptococcus mutans ATCC 25175 세균막을 형성하였다. 하루에 3번 일반 우유, 저지방 우유와 0.9% 생리식염수를 세균막에 노출시켰다. 시간의 흐름에 따른 배지의 pH 변화를 측정하였다. 실험 5일째 시편에서 세균막을 분리하여 세균의 집락 형성단위를 측정하였다. 세균막의 두께는 공초점현미경으로 관찰하였다. 실험 전, 후의 표면미세경도를 측정하여 시편의 미세경도변화율을 평가하였다. 세 군 간의 pH 변화 양상과 세균막 두께는 유사하였으며 미세경도변화율과 세균의 집락형성단위는 유의한 차이를 보이지 않았다(p > 0.05). 본 연구 결과, 일반 우유와 저지방 우유의 우식원성은 차이를 보이지 않았으며, 우유는 우식에 대해 안전한 식품임을 확인하였다.

• 대한소아치과학회지
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• 제45권1호
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• pp.32-40
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• 2018

본 연구는 치태의 성숙도에 따라 치태를 서로 다른 색상으로 염색하는 GC Tri Plaque ID $Gel^{TM}$(GC corporation, Tokyo, Japan)을 이용하여 치아 우식 위험도를 평가하고자 하였다. 치아 우식의 발생 및 진행과 연관된 균인 Streptococcus mutans, Streptococcus sobrinus, Lactobacillus spp.의 수를 Quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR)로 측정하여 치아 우식 위험도를 보았다. 본 실험은 강릉원주대학교 치과병원 임상시험 심사위원회의 심의를 받고 진행하였다. 강릉원주대학교 치과병원 소아치과에 내원한 전신질환이 없는 건강한 9 - 12세의 초등학생 15명의 치면을 착색제로 염색하였다. 치태의 성숙도에 따라 서로 다른 세가지 색상으로 염색되었으며 색상별로 3개의 실험군인 I군(pink/red), II군(blue/purple), III군(light blue)으로 나누었다. 3개의 실험군에서 각각 DNA를 추출한 후, qRT-PCR을 이용하여 S. mutans, S. sobrinus, Lactobacillus spp.의 수를 측정하였다. 3개의 실험군 사이에 S. mutans, S. sobrinus와 Lactobacillus spp. 균 수의 유의한 차이가 관찰되었으며 3종류의 균 모두 III군에서 가장 많이 관찰되었다(p < 0.05). GC Tri Plaque ID $Gel^{TM}$는 기존 착색제와는 달리 치태의 성숙도에 따라 서로 다른 세가지 색상으로 염색되며, 치태 염색 색상의 차이는 치아 우식 관련 균 수의 차이를 보여주었다. GC Tri Plaque ID $Gel^{TM}$이 치아 우식 위험도를 평가하는 하나의 지표로서 사용될 수 있는 가능성을 확인하였다.

• 대한소아치과학회지
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• 제47권2호
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• pp.188-195
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• 2020

이 연구는 새롭게 개발된 알카자이트 재료인 Cention N에 finishing처리를 한뒤에 표면 거칠기와 박테리아 부착에 대하여 조사하고자 함이다. 레진강화형 글래스아이오노머와 컴포짓트 레진, 알카자이트 재료를 원통형의 디스크 형태로 제작하였다(n = 48). 이 후 대조군과 3가지 카바이드버, 미세다이아몬드 버, 화이트스톤버의 피니싱 버에 따른 4가지 하위군으로 분류하였다. 표면 거칠기는 atomic force microscope으로 조사하였으며 표면관찰은 scanning electron microscope을 이용하여 진행하였다. 우식원성 미생물인 streptococcus mutans의 시편 부착을 위하여 CDC biofilm reactor를 사용하여 바이오필름을 배양한후 집락형성단위를 측정하였다. 레진과 Cention N의 아무처리 하지 않은 컨트롤 군의 표면 거칠기는 통계적으로 유의하게 피니싱 처리된 시편들보다 거칠었다. 하지만 표면 거칠기와 미생물 부착사이의 상관관계는 매우 약했다(PCC = 0.13). RMGI와 Cention N은 레진시편에 비해 미생물 부착이 적게 일어났다. Cention N은 피니싱만으로도 임상적으로 허용되는 수준인 0.2 ㎛ 이하의 거칠기를 보였으며 이온 방출 성질로 미생물 부착이 레진과 비교시 적은 것을 확인할수 있었다.