• 한국균학회지
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• 제43권4호
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• pp.286-289
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• 2015

순활물기생체인 Plasmodiophora brassicae는 병원성 검정을 위해서 반드시 뿌리혹을 장기적으로 보관하는 것이 매우 중요하기 때문에 그동안 병원성을 유지하는 것이 관건이다. 특히 기존의 방법은 100년 이상 사용되어온 저장법으로 개선이 필요하여 그 효율적인 방법을 밝히고자 하였다. 이 결과 장기적으로 병원성의 저하를 최소화하며 장기간 뿌리혹을 저장할 수 있는 방법은 $-70^{\circ}C$ 냉동고에 보관하는 것으로 확인되었고, 저장 조건은 뿌리혹을 그대로 보관하거나 뿌리혹을 갈아 균질화한 후 여러 겹의 거즈에 거른 것이 6가지 저장조건 중에 가장 효과적인 저장법으로 밝혀졌다.

• Molecules and Cells
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• 제39권4호
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• pp.286-291
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• 2016

Epstein-Barr virus (EBV) is the prototypical ${\gamma}$-herpesvirus and an obligate human pathogen that infects mainly epithelial cells and B cells, which can result in malignancies. EBV infects these target cells by fusing with the viral and cellular lipid bilayer membranes using multiple viral factors and host receptor(s) thus exhibiting a unique complexity in its entry machinery. To enter epithelial cells, EBV requires minimally the conserved core fusion machinery comprised of the glycoproteins gH/gL acting as the receptor-binding complex and gB as the fusogen. EBV can enter B cells using gp42, which binds tightly to gH/gL and interacts with host HLA class II, activating fusion. Previously, we published the individual crystal structures of EBV entry factors, such as gH/gL and gp42, the EBV/host receptor complex, gp42/HLA-DR1, and the fusion protein EBV gB in a postfusion conformation, which allowed us to identify structural determinants and regions critical for receptor-binding and membrane fusion. Recently, we reported different low resolution models of the EBV B cell entry triggering complex (gHgL/gp42/HLA class II) in "open" and "closed" states based on negative-stain single particle electron microscopy, which provide further mechanistic insights. This review summarizes the current knowledge of these key players in EBV entry and how their structures impact receptor-binding and the triggering of gB-mediated fusion.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제23권1호
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• pp.1-6
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• 2013

Tetanus is a specific infectious disease, which is often associated with catastrophic events such as earthquakes, traumas, and war wounds. The obligate anaerobe Clostridium tetani is the pathogen that causes tetanus. Once the infection of tetanus progresses to an advanced stage within the wounds of limbs, the rates of amputation and mortality increase manifold. Therefore, it is necessary to devise a rapid and sensitive point-of-care detection method for C. tetani so as to ensure an early diagnosis and clinical treatment of tetanus. In this study, we developed a detection method for C. tetani using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay, wherein the C. tetani tetanus toxin gene was used as the target gene. The method was highly specific and sensitive, with a detection limit of 10 colony forming units (CFU)/ml, and allowed quantitative analysis. While detecting C. tetani in clinical samples, it was found that the LAMP results completely agreed with those of the traditional API 20A anaerobic bacteria identification test. As compared with the traditional API test and PCR assay, LAMP detection of C. tetani is simple and rapid, and the results can be identified through naked-eye observation. Therefore, it is an ideal and rapid point-of-care testing method for tetanus.

• 농약과학회지
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• 제17권4호
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• pp.468-472
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• 2013

국화는 한국을 비롯한 여러나라에서 중요한 화훼작물이며 국화흰녹병은 절대기생성 진균인 Puccinia horiana에 의하여 유발되는 병으로 국화에 가장 심한 피해를 초래하는 병해 중의 하나이다. 이 병의 방제는 주로 약제 방제에 의존하고 있는데 국내에서는 26개 농약품목이 등록되어 있으며 그 중 10개 품목의 주성분은 트리아졸계 화합물이다. 트리아졸 화합물에 대한 약물표적의 유전자 존재를 확인하고 그 정보를 얻기 위하여 국화흰녹병균 유전체 염기서열 분석의 중간결과로서 병원균의 세포막 구성의 중요성분인 에르고스테롤 생합성에 관여하며 트리아졸계 화합물의 표적이 되는 sterol 14-demethylase 유전자의 염기서열을 확인하고 그 아미노산 서열과 삼차구조를 예측하였다. 이 단백질은 Puccinia속내에서는 84% 이상의 상동성을 보였으나 다른 속에서는 68% 이하의 상동성을 보였다.

• Weed & Turfgrass Science
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• 제5권4호
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• pp.256-259
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• 2016

활물기생 병원성 진균류인 Puccinia zoysiae는 한국에서 한국잔디류(Zoysia spp.)에 녹병을 일으켜 피해를 준다. 그 곰팡이는 감수성 한국잔디의 잎과 줄기에 병을 일으키는 병원균들 중 하나이다. 한국잔디 녹병이 2014년과 2015년 경남 합천, 충북 음성, 경기 양주에서 발견되었다. 포장에서 한국잔디 녹병은 잎에 작은 하얀 반점으로 나타나고 갈색으로 변한 후 여름 포자가 형성되는 전형적인 증상을 나타냈다. 여름포자는 연한 갈색으로 원형 또는 타원형으로 크기는 $22.0{\sim}25.0{\times}15.0{\sim}17.5{\mu}m$의 범위였다. 채집한 여름포자로부터 들잔디에 대한 병원성이 확인되었고, 형태적인 특성을 기초로 병원균은 P. zoysiae로 동정되었다. 우리나라에서 한국잔디 녹병은 6월 중순부터 10월 중순까지 관찰되었다. 포장에서 금잔디는 들잔디에 비해 지역에 관계없이 상대적으로 저항성을 보였고, 금잔디와 들잔디 모두 계통 간에 병 반응에서 차이를 나타냈다.

• 식물병연구
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• 제26권3호
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• pp.183-189
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• 2020

흰가루병(powdery mildew)은 오이(Cucumis sativus)를 포함하는 박과(Cucurbitaceae) 작물에서 전 세계적으로 가장 심각한 피해를 일으키는 주요한 병 중 하나이다. 오이 흰가루병의 지속적인 발병과 방제의 어려움 때문에 그 원인 병원균을 밝히고 race를 규명하는 것이 필수적이다. 국내에서 발병하는 오이 흰가루병균의 조사를 위하여 경기도 광주(Gwangju), 경기도 이천(Icheon), 전라북도 김제(Gimje), 서울특별시(Seoul), 경상남도 밀양(Miryang) 지역에서 흰가루병이 발생한 오이 잎을 채집하였다. 형태학적, 분자생물학적 특성 조사 결과 분리된 오이 흰가루병균들은 절대 활물기생균인 Podosphaera xanthii로 동정되었다. P. xanthii의 race 규명에 사용되고 있는 멜론(C. melo) 판별 품종을 이용하여 밀양, 이천 서울에서 분리된 MI180427, IC190611, SE180328의 레이스를 각각 조사하였다. 분리균주 MI180427과 IC190611는 국내에서 가장 광범위하게 발병되고 있는 것으로 보고된 race 1으로 규명되었다. 반면, 분리균주 SE180328는 국내에서 아직까지 보고된 예가 없는 race 2로 판별되었다. SE180328의 정확한 race 판별을 위해서 추가적인 멜론 판별 품종에 접종한 결과, 흰가루병 race 2 중에서 중국 베이징의 주요 race로 알려진 race 2F로 동정되었다. 따라서 새로운 race 2F의 국내 발병을 보고하는 본 연구 결과는 향후 오이 흰가루병 저항성 품종 육성에 고려 되어야 할 기초자료가 될 것으로 생각된다.

• Journal of Biosystems Engineering
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• 제37권6호
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• pp.420-428
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• 2012

Purpose: Porcine proliferative enteropathy(PPE), caused by the obligate intracellular bacterium Lawsonia intracellularis, is a widely distributed disease throughout the world causing substantial economic loss. The bacterial pathogen invades the intestinal epithelial cells which causes hyperplasia of the infected cells and leads to the process of disease pathogenesis. For diagnosing PPE in a pig farm in earlier stage, a rapid diagnosing test equipment is needed for farmers. To test the equipment appropriately, we prepare the samples and antibodies for rapid detecting the Lawsonia intracellularis in pig feces. Methods : To prepare the PPE infected samples, we sampled PPE suspected pig feces in a pig farm. To manufacture a anti-Lawsonia intracellularis antibody for capturing the Lawsonia intracellularis, the rabbit-anti LsaA synthetic peptide polyclonal antibody was inoculated to rabbits. To select the couple of antibodies which is most well sandwiched with the bacteria, ELISA test was done with PPE infected ileum samples. Finally, to verify the PPE infected feces which would be used to test the rapid kit, PCR test was done on the sampled PPE suspected feces Results : The rabbit-anti LsaA synthetic peptide polyclonal antibody is developed, and is verified to capture the bacterial well through the fluorescence antibody test. Also, we found that the monoclonal antibody and the polyclonal antibody could be used as couples for sandwiching the bacteria. Finally, through the PCR test for samples of pig feces, we could prepare the 150 PPE positive samples and 50 PPE negative samples. Conclusions : The manufactured polyclonal antibody and the imported monoclonal antibody could be used to capture the bacteria using the sandwich techniques. Also, the prepared PPE infected negative and positive samples could be used to test the performance of the rapid kit to capture the bacterium Lawsonia intracellularis.

• 생명과학회지
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• 제26권6호
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• pp.711-720
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• 2016

게놈분석이 완료된 680개의 세균의 공통 유전자 보유 정도와 유연관계를 파악하기 위해 4,631개의 COG (Clusters of Orthologous Groups of protein) 보유 유사도와 COG 보유 계통수를 작성하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 균주별 COG 보유개수는 103~2,199개 사이였고 평균 1377.1개 였다. 곤충과 절대공생성인 Candidatus Nasuia deltocephalinicola str. NAS-ALF가 최저였고 기회성병원균인 Pseudomonas aeruginosa PAO1가 최대였다. 2개의 세균들 사이에 나타내는 COG 보유 유무의 유사도는 49.30~99.78% 사이였고 평균 72.65%였다. 초고온성이며 자가영양생활을 하는 Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661과 중온성이며 공생생활을 하는 Mesorhizobium loti MAFF303099 사이가 최소였다. 유전자 보유 정도가 생물이 각 서식지에 적응하는 정도를 나타내므로 이 결과는 원핵생물 진화의 역사 혹은 현재 지구의 원핵생물 서식지 범위를 나타내는 것일 수도 있다. COG 보유계통수를 통하여 첫째 진정세균인 Chloroflexi문의 일부는 진정세균보다 고세균과 유연관계가 높았고, 둘째 16S rRNA유전자에서 동일한 문(phylum)이나 강(class)으로 분류되지만 COG 보유 계통수에서는 일치하지 않는 경우가 많았으며, 셋째 delta-와 epsilon-Proteobacteria는 다른 Proteobacteria와 다른 분계(lineage)를 이루었다. 본 연구결과는 생물의 기원 파악과 기능적 연관성 파악 그리고 유용유전자 탐색 등에 이용할 수 있을 것이다.