• 제목/요약/키워드: OPA1

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RAPD를 이용한 한국 김 집단의 유전적 다양성과 표현형 관계 (Studying the Genetic Diversity and Phenetic Relationships of Porphyra yezoensis Populations in Korea Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD))

  • 김영목;엄성환;허만규
    • 생명과학회지
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    • 제29권2호
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    • pp.152-157
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    • 2019
  • 김(Porphyra yezoensis)은 김속의 홍조류이다. RAPD (random amplified polymorphic DNA) 마커를 이용하여 한국 내 네 집단의 표현형과 유전적 다양성을 조사하였다. 전체적으로 20 시발체로 김에서 55분절이 관찰되었다. 이들 밴드 중 30개(54.5%)는 다형성을 나타내었다. OPA-18-02 밴드는 낙동 김 집단에서만 증폭되었다. OPA-20-02 밴드는 서천 김 집단에서만 증폭되었다. 이 두 밴드는 특별한 집단을 구별해주는 특이밴드로 판정되었다. 대립유전자좌위의 수(Ae)는 1.161에서 1.293로 평균은 1.366였다. 서천 김 집단이 가장 높은 다형성을 나타내었다(0.163). 다른 집단과 격리되고 조간대에 위치한 낙동 김 집단은 가장 낮은 다형성을 나타내었다(0.092). 샤논의 표현형 다양성(I)은 서천 김 집단이 가장 높았다(0.238). 전체 유전적 다양도($H_T$)는 0.132(OPA-02)에서 0.420(OPA-19)로 나타났다. 대립유전자좌위에서 유전적 다양성($H_S$)은 0.059(OPA-18)에서 0.339(OPA-19)였다. 대립유전자좌위에 근거에서 전체 유전적 다양도에서 집단 간 차이($G_{ST}$)는 0.012(OPA-11)에서 0.762(OPA-18)이였으며 평균은 0.415였다. 이는 전체 변이의 약 42%는 집단 간에서 발견된다는 것을 의미한다. 종 내 다양도의 58.5%는 집단 내에 있었다. 유전자 흐름(Nm)은 0.705로 낮았다.

Reproductive Disrupting Effect of Organotin Compound in the Ark Shell, Scapharca broughtonii (Bivalvia: Arcidae)

  • Lee, Jung-Sick;Cho, Hyeon-Seo;Jin, Young-Guk;Park, Jung-Jun;Shin, Yun-Kyung
    • Animal cells and systems
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    • 제13권2호
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    • pp.223-227
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    • 2009
  • This study was carried out on the ark shell Scapharca broughtonii in order to examine if organotin compounds, which are known to induce reproductive abnormalities in gastropods, have the same affect on bivalves. The research was conducted during seven weeks in spring season through a field transplantation experiment in one reference area (Ra) and two organotin-polluted areas (Opa) near a shipyard complex. Sex ratio in the Ra was 1:1.6 (female:male). Sex ratio in Opa I and Opa II were 1:0.49 and 1:1.03, respectively, illustrating slightly higher proportion of females. Gonad activity exhibited a sequence of Opa II>Ra>Opa I. Intersex individuals of 3.33% (n=4/120) were confirmed in Opa. Intersex gonads were observed only in females. The results show that organotin compounds caused reproductive disruption in Scapharca broughtonii.

아이디어의 창의성과 고객만족의 측정에 관한 연구 (Measuring Creativity of Ideas and the Corresponding Customer Satisfaction)

  • 강익선;송해근;박영택
    • 품질경영학회지
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    • 제44권1호
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    • pp.139-152
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    • 2016
  • Purpose: This study is aimed to introduce the OPA-Kano method, an integrated version of OPA(Originality Practicality Analysis) and Kano's customer satisfaction method, and to examine its applicability. Methods: 30 ideas for smart phone accessories are generated using brainstorming and SIT(Systematic Inventive Thinking) and they are analyzed through the OPA-Kano method. For analysis, correlation method between OPA and Kano's results is applied for the ideas. Results: The results show that there is significant correlation between the OPA and Kano's approach, and the effectiveness of the proposed method is verified through the case of smart phone accessories. Conclusion: From the result of this study, we conclude that the proposed OPA-Kano method can be used for the evaluation of ideas and customer satisfaction.

추출 용매와 분석 기법에 따른 된장의 유리아미노산 비교 (Comparison of Free Amino Acids in Soybean Paste (Doenjang) by Different Extraction Solvents and Analytical Methods)

  • 강옥주
    • 한국식품조리과학회지
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    • 제23권1호통권97호
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    • pp.150-155
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    • 2007
  • This work was conducted to obtain a rapid, accurate, and precise procedure for free amino acids analysis in Doenjang with HPLC-OPA (high performance liquid chromatography using-phthalaldehyde) and AAA (automatic amino acid analyzer) methods. Different sample extraction procedures among water, 0.1 M perchloric acid, and 0.1% meta-phosphoric acid were also compared. The optimal extraction solvent was 0.1% meta-phosphoric acid for both the HPLC-OPA and AAA methods. Good recoveries for glycine and methionine were observed using the 0.1% meta-phosphoric acid extraction with HPLC-OPA method. Method precisions (% relative standard deviation) for the free amino acids ranged for 1.62% to 8.27%, in which the HPLC-OPA method with water extraction showed the lowest value at 1.62%. Inhibition rates of the free amino acids in Doenjang were greatest with an addition of NaCI at a 1% concentration.

분자표지자에 의한 지황 유전집단의 유전적 다양성 (Genetic Diversity of Rehmannia glutinosa Genotypes Assessed by Molecular Markers)

  • 방경환;정종욱;김영창;이제완;김홍식;김동휘
    • 생명과학회지
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    • 제18권4호
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    • pp.435-440
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    • 2008
  • RAPD 분석을 이용하여 지황 육성 계통과 지역 수집종 들을 구분할 수 있는 분자표지자를 선발하고, 집단 간, 집단 내 유전적 다양성을 평가하기 위하여 본 실험을 수행하였다. 총 20개의 임의 primer를 이용하여 PCR 한결과, 육성 계통과 수집종 들을 구별할 수 있는 OPA-1 등 10개의 재현성과 다형성이 좋은 프라이머 들을 선발하였다. 특히 OPA-10, OPA-11 및 OPA-19는 고려지황과 지황1호를 다른 계통 및 수집종 들과 구별할 수 있었으며, 이들 프라이머를 이용하여 0.9 kb, 1.2 kb, 1.3 kb 및 1.4 kb등의 육성계통 특이적인 DNA 밴드들을 확보할 수 있었다. 한편 이들의 결과를 토대로 통계처리에 의한 유전분석 결과, 고려지황, 지황1호 및 일본지황은 집단 내 유사도가 높아 다른 집단들과 구별되었다. 결론적으로, RAPD 분석을 통한 결과는 지황의 유전적 다양성 이해와 특정 계통을 다른 계통 및 수집종 들과 구분할 수 있는 방법으로 이용될 수 있다.

비주기적 광위상배열에서 Side-lobe Level이 최소화된 구조 설계를 위한 최적화 알고리즘의 비교 연구 (Comparative Study of Optimization Algorithms for Designing Optimal Aperiodic Optical Phased Arrays for Minimal Side-lobe Levels)

  • 이보해;류한열
    • 한국광학회지
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    • 제33권1호
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    • pp.11-21
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    • 2022
  • 본 연구에서는 자율주행차의 라이다 센서용 광위상배열(optical phased array, OPA)에서 우수한 신호 품질을 얻을 수 있는 방법에 대해 조사하였다. OPA를 구성하는 광 안테나가 주기적으로 배치되어 있는 경우에는 grating lobe의 형성으로 인해 빔 조향의 범위가 제한된다. 광 안테나가 비주기적으로 배치된 OPA에서는 한 개의 main lobe만 형성되어 넓은 조향 범위가 가능하지만 side lobe에 의한 잡음의 영향으로 신호 품질이 저하된다. 본 논문에서는 이러한 비주기적인 OPA에서 발생하는 잡음을 최소화하고 신호 품질을 향상시키기 위한 최적화 연구를 수행한 결과를 보고한다. 최적화를 위한 목적 함수로는 side-lobe level (SLL)을 이용하였고, SLL이 가장 낮은 안테나 배열을 구하기 위한 최적화 기법으로는 입자 군집 최적화(particle-swarm optimization, PSO), 유전 알고리즘(genetic algorithm, GA), 패턴 검색 알고리즘(pattern-search algorithm, PSA) 등을 적용하였다. 128 채널의 광 안테나 배치로 이루어진 비주기적 OPA에서 위 3가지 최적화 기법을 적용하여 결과를 비교하였다. 전반적으로 PSO와 GA는 서로 유사한 최적화 결과를 보였고, PSA는 이와는 약간 차별적인 특성을 보였다. 최적화가 이루어진 각도가 45도보다 작을 때에는 최적화 각도가 작을수록 모든 조향 각도에서의 평균적인 SLL 값이 증가하는 경향을 보였지만, 최적화가 이루어진 각도가 45도 이상일 경우에는 최적화 알고리즘에 관계없이 -13 dB 이하의 평균 SLL 값을 얻을 수 있었다. 본 연구를 통해 비주기적인 OPA에서 고품질의 신호를 얻기 위한 최적의 안테나 배열을 구하는 데 있어서 PSO, GA, PSA의 최적화 알고리즘이 유용하게 활용될 수 있음을 보였다.

The Mitochondrial Fusion-Related Proteins Mfn2 and OPA1 are Transcriptionally Induced during Differentiation of Bone Marrow Progenitors to Immature Dendritic Cells

  • Ryu, Seung-Wook;Han, Eun Chun;Yoon, Jonghee;Choi, Chulhee
    • Molecules and Cells
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    • 제38권1호
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    • pp.89-94
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    • 2015
  • The shape and activity of mitochondria are tightly regulated by fusion and fission processes that are essential for maintaining normal cellular function. However, little is known about the involvement of mitochondrial dynamics in the development of the immune system. In this study, we demonstrate that mitochondrial dynamics play a role in the differentiation and migration of immature dendritic cells (imDCs). We show that mitochondrial elongation is induced during GM-CSF-stimulated differentiation of bone marrow progenitors to imDCs accompanied by upregulation of mitochondrial fusion proteins. These processes precede the changes in mitochondrial morphology and connectivity that occur during differentiation. Mfn2 and OPA1, but not Mfn1, are transcriptionally upregulated during differentiation; however, knockdown of Mfn2 and OPA1 does not induce any change in expression of CD11c, CDC80, or CD86. Notably, knockdown of Mfn2 or OPA1 by siRNA in imDCs significantly reduces CCR7 expression and CCL19-mediated migration. These results suggest that the mitochondrial fusion-related proteins Mfn2 and OPA1 are upregulated during bone marrow progenitor differentiation and promote the migration of imDCs by regulating the expression of CCR7.

Improved Fluorescent Determination Method of Cellular Sphingoid Bases in High-performance Liquid Chromatography

  • Yoon, Hong-Tak;Yoo, Hwan-Soo;Shin, Bum-Kyu;Lee, Woo-Jin;Kim, Hwan-Mook;Hong, Seon-Pyo;Moon, Dong-Cheul;Lee, Yong-Moon
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제22권3호
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    • pp.294-299
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    • 1999
  • Precolumn orthophthaldehyde (OPA) labeling method of sphingoid bases, sphingosine and sphinganine, was investigated to obtain high fluorescent detectability. In order to improve the fluorescent yield, we investigated the optimal solubility of sphingoid bases for five pre-incubation solvents by incorporating the heating procedure before OPA derivatization. The pre-incubation in ethanol prominently increased the fluorescent peak height of OPA derivative for each sphingoid bases in high performance liquid chromatography. About tenfold increase of detectability was archived by pre-incubating lipid extracts pellets in ethanol at $60^{\circ}C$ for 30 min. Optimal derivatization was performed in 30 min at ambient temperature and the fluorescent intensity of OPA derivative was stable for two weeks at $4^{\circ}C$. The detection limit of sphingosine was 0.1 pmol as injected amount. This method was applied to the determination of cellular sphingosine and sphinganine in various human lung cancer cells. This OPA procedure was prospective to be useful for quantitating the amount of sphingoid bases in other cancer cells.

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RAPD 표지인자를 이용한 흑오미자의 자웅동주 및 자웅이주 식물의 동정 (Identification of Monoecious and Dioecious Plants of. Schisandra nigra Using the RAPD Markers)

  • 이효연;한효심;이갑연;한상섭;정재성
    • 식물조직배양학회지
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    • 제25권5호
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    • pp.309-313
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    • 1998
  • 본 연구는 국내의 경우 제주도의 일부지역에서만 자생하는 흑오미자(Schisandra nigra)를 RAPD법을 이용하여 자웅동주 및 자웅이주 식물의 특이적 Marker를 탐색하고저 실시 하였다. 10-mer로 구성된 80종류의 random primer를 사용하여 흑오미자를 분석한 결과 기존의 재배되고 있는 오미자(Schisandra chinensis) 또는 남오미자(Kadsura japonica)와는 다른 band pattern을 보여 주었다. 흑오미자의 자웅동주. 암그루, 숫그루의 3품종을 상기와 동일하게 80개의 primer를 사용하여 RAPD를 분석한 결과, 5종류의 random primer(OPA-17, OPA-19, OPB-3, OPB-9, OPB-16)에 대해서는 각 품종에 대한 특이적인 band가 검출되었다. 숫그루, 암그루 식물과는 다르게 자웅동주 식물은 3개체(1호 2호, 3호)간에도 서로 다른 band pattern을 보이는 특징을 갖고있다. 숫그루 특이적인 band pattern은 OPB-3 primer을 이용할 경우 750bp에서 검출되었고, 암그루는 OPA-19 primer에서 950bp, 1690bp와 OPB-3 primer의 경우 700bp에서 자웅동주 및 숫그루에서 나타나지 않는 band가 검출되었다. 이러한 결과는 흑오미자의 숫그루 및 암그루에서 나타난 특이적인 band가 유묘시기에 암ㆍ수 개체를 조기에 구별하는 genetic marker로 사용할 수 있으리라 기대된다.

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고온적응성 목이버섯 「현유」 육성 및 특성 (Characteristics and breeding of a thermotolerant ear mushroom, Auricularia auricula-judae 'Hyeonyu')

  • 이기권;유영진
    • 한국버섯학회지
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    • 제15권2호
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    • pp.84-87
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    • 2017
  • 목이버섯의 고온적응성이 우수한 '현유'의 주요특성을 요약하면 다음과 같다. 균사생장적온은 $25^{\circ}C$이고 버섯발생 및 생육온도역시 $26{\sim}36^{\circ}C$로 고온성을 나타내었다. 배양기간은 40~42일, 초발이소요일수는 27일, 생육기간은 15일로 총재배기간은 82~84일이 소요되었다. 갓크기는 56.8 mm이며, 수량은 1 kg배지에서 350 g을 나타내었다. DNA다형성을 분석한 결과 OPA1, OPA7등의 primer에서 개발품종과 중국유래품종 그리고 대조구와 뚜렷한 품종간 밴드차이를 보였다.