Based on first-principles LCAO method, we study the electronic and atomic structures of DNA nucleobases adenine (A), thymine (T), guanine (G), and cytosine (C) adsorbed on graphene surfaces. The ${\pi}-{\pi}$ stacking interactions between graphene and nucleobases lead to the bilayer geometries similar to the Bernal stacked graphite. Through the density of states and charge density analyses, it is found that nucleobases are physisorbed on graphene by dispersive interactions with negligible charge exchange. Our calculations reproduce the atomic structures obtained in previous plane wave calculations accurately with much less computation, and well describe the delocalized ${\pi}-{\pi}$ interactions in graphene-nucleobases system, indicating that the LCAO method is very efficient for investigating graphene-bio systems.
인삼(人蔘)과 오가피중(五加皮中)의 핵산계(核酸系) 성분(成分)을 HPLC로 분리(分離) 정량(定量)하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. 동일한 원료수삼에서 제조한 백삼(白蔘)과 홍삼(紅蔘)의 핵산유리염기(核酸遊離鹽基)와 nucleoside의 조성이 거의 같았다. 2. 인삼(人蔘)과 오가피(五加皮)중의 nucleosides 함량에서 adenosine, guanosine, cytidine 등이 특징적(特徵的)인 차이(差異)를 나타냈으며 인삼속(人蔘屬)이 약(約) 3배(倍)이상 많게 나타났다. 그러나 tymidine과 inosine은 오가피속(五加皮屬)이 다소 많았다. 3. nucleobase 함량면에서는 인삼(人蔘)이나 오가피간(五加皮間)에 비슷한 함량으로 1~2mg/100g를 함유했다.
A rapid and accurate method is described for the determination of nucleo-bases in rumen micro-organisms. A procedure to satisfactorily hydrolyse the micro-organisms involving reaction with a mixture of readily volatile organic acids (acetic and formic acids) under high pressure, is proposed, and optimal conditions for an analytical procedure with reversed phase HPLC is described. The following nucleobases contents (mmol/kg DM) of rumen micro-organisms were found: Adenine (Ade), 82.62; Guanine (Gua), 61.34; Cytosine (Cyt), 84.61; Thymine (Thy), 35.74; Uracil (Ura), 68.62; Hypoxanthine (Hxn), 13.06; Xanthine (Xn), 8.35. Total purine-N content (g/kg N) of rumen micro-organisms were 99.60. The nucleic acid N content (g/kg N) of microbial isolates were: RNA-N, 109.9; DNA-N, 50.9.
A fluorescent nucleoside analogue, $^AC$, featuring two non-complementary nucleobases linked through an ethynyl group, was synthesized. The extended ${\pi}$-conjugation imparts $^AC$ with red-shifted absorbance (relative to adenine and cytosine) and pale-blue fluorescence. It spontaneously forms nanoparticles, which exhibit considerably enhanced fluorescence, without the help of any additional stabilizing agent. The DMSO/water ratio was an important factor influencing the construction of the NPs. X-ray crystallography confirmed the structure of $^AC$; dynamic light scattering and scanning electron microscopy confirmed the existence of the nanoparticles.
표면강화 라만분광학을 이용하여 단일전자 산화반응으로 형성된 발암성 벤조피렌 유도체가 nucleobase와 반응하여 생성된 첨가 생성물을 분석하였다. 표면강화 라만분광학을 이용하여 아데닌 또는 구아닌과 같이 각기 다른 종류의 nucleobase와 결합하여 형성된 첨가생성물을 구분하여 분석할 수 있었고 또한 nucleobase 분자의 다른 부분에 결합하여 형성된 이성길체를 라만분광스펙트럼을 통하여 구분하여 분석이 가능하였다. N7Ade-BP에 대한 검정곡선의 선형도 범위는 20 picogram/${\mu}l$에서 800 nanogram/${\mu}l$였고, 본 실험 조건하에서의 검출한계는 $20{\mu}l$의 샘플을 이용하고 20 picogram/${\mu}l$였다.
A new bis-Ru(II) complex, in which two [Ru(1,10-phenanthroline)$_2$dipyrido[3,2-a:2',3'-c]phenazine]$^{2+}$ were tethered by a 1,3-bis(4-pyridyl)propane linker, was synthesized and its binding mode and stoichiometry to DNA was investigated by optical spectroscopy including linear dichroism (LD) and fluorescence intensity measurement. The magnitude of the negatively reduced LD signal of the bis-Ru(II) complex in the dipyrido[3,2-a:2',3'-c]phenazine (DPPZ) ligand absorption region appeared to be similar compared to that in the DNA absorption region, which is considered to be a diagnostic for DPPZ ligand intercalation. The binding stoichiometry measured from its LD magnitude and enhanced fluorescence intensity corresponds to one ligand per three DNA bases, effectively violating the nearest neighbouring site exclusion model for classical DNA intercalation. This observation is in contrast with monomer analogue [Ru(1,10-phenanthroline)$_2$dipyrido[3,2-a:2',3'-c]phenazine]$^{2+}$, which is saturated at the DPPZ ligand to DNA base ratio of 0.25, or one DPPZ ligand per four nucleobases.
cis-diamminedichloroplatinum (II)에서 아민리간드가 변화할 때, 항암성과 백금원자의 전자구조 사이의 관계를 연구하였고, 또 이러한 착물과 DNA base인 1-methylcytosine의 상호작용에 대한 메카니즘을 알기 위해서 백금(II)착물들을 분자궤도함수론적으로 연구하였다. 그 결과, 백금착물에서 중심금속의 atomic charge가 항암성에 영향을 미치고 있음을 알았다. 또한 백금착물과 1-methylcytosine의 결합은 리간드에서 금속원자로 전하이동을 하였고, 이 때 Pt(II)의 6p-orbital이 중요한 하고 있음을 발견한다. Pt-N3결합성은 $\alpha$ 와 $\pi$ 성분을 포함하고 있으며, 실험한 값과 비교할 때 비교할 때 항암성이 큰 백금착물일수록 Pt-N3 결합이 강하게 형성하고 있었다.
The behavior of peptide or protein solutes in saline aqueous solution is a fundamental topic in physical chemistry. Addition of ions can strongly alter the thermodynamic and physical properties of peptide molecules in solution. In order to study the effects of added ionic salts on protein conformation and dynamics, we have used the molecular dynamics (MD) simulations to investigate the behavior of Staphylococcus aureus Hfq protein under two different ionic concentrations: 0.1 M NaCl and 1.0 M NaCl in presence and absence of RNA (a hepta-oligoribonucleotide AU5G). Hfq, a global regulator of gene expression is highly conserved and abundant RNA-binding protein. It is already reported that in vivo the increase of ionic strength results in a drastic reduction of Hfq affinity for $Q{\beta}$ RNA and reduces the tendency of aggregation of Escherichia coli host factor hexamers. Our results revealed the crucial role of 0.1 M NaCl Hfq system on the bases with strong hydrogen bonding interactions and by stabilizing the aromatic stacking of Tyr42 residue of the adjacent subunits/monomers with the adenine and uridine nucleobases. An increase in RNA pore diameter and weakened compactness of the Hfq-RNA complex was clearly observed in 1.0 M NaCl Hfq system with bound RNA. Aggregation of monomers in Hfq and the interaction of Hfq with RNA are greatly affected due to the presence of high ionic strength. Higher the ionic concentration, weaker is the aggregation and interaction. Our results were compatible with the experimental data and this is the first theoretical report for the experimental study done in 1980 by Uhlenbeck group for the present system.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.