Among the desirable properties of a piecewise linear parameterization, guaranteeing a one-to-one mapping (i.e., no triangle flips in the parameter plane) is often sought. A one-to-one mapping is accomplished by non-negative coefficients in the affine transformation. In the Floater's method, the coefficients were computed after the 3D mesh was flattened by geodesic polar-mapping. But using this geodesic polar map introduces unnecessary local distortion. In this paper, a simple variant of the original shape-preserving mapping technique by Floater is introduced. A new simple method for calculating barycentric coordinates by using straightest geodesics is proposed. With this method, the non-negative coefficients are computed directly on the mesh, reducing the shape distortion introduced by the previously-used polar mapping. The parameterization is then found by solving a sparse linear system, and it provides a simple and visually-smooth piecewise linear mapping, without foldovers.
Kaplan, Ozan;Oncul, Selin;Ercan, Ayse;Celebier, Mustafa
Mass Spectrometry Letters
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v.11
no.2
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pp.36-40
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2020
Untargeted metabolomics is a useful tool for drug development focusing on novel chemotherapeutic and chemopreventative agents against cancer cells. In recent years, quadrupole time of flight liquid chromatography-mass spectrometry (Q-TOF LC/MS)-based untargeted metabolomic approaches have gained importance to evaluate the effect of these agents at the molecular level. The researchers working on cell culture studies still do not apply standardized methodologies on sample preparation for untargeted metabolomics approaches. In this study, the rough and wet lysis techniques performed on MCF-7 breast cancer cells were compared with each other via the Q-TOF LC/MS-based metabolomic approach. The C18 and hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC) columns were used for the separation of the metabolites in MCF-7 cell lysates. 505 peaks were detected through the HILIC column and 551 peaks were found through the C18 column for the wet lysis technique. This situation supported by the base peak chromatograms showed that the wet lysis technique allowed us to extract higher number of non-polar metabolites. Almost equal number of metabolites was found for the C18 and HILIC columns (697 peaks for the HILIC column and 695 peaks for the C18 column) when the rough lysis technique was used. However, the intensities of polar metabolites were higher for the rough lysis technique on base peak chromatograms for both the HILIC and C18 columns. Although cell lysis technique, which is the first step in the sample preparation for cell culture studies, does not cause dramatic differences in the number of the detected metabolite peaks, it affects the polar and non-polar metabolite ratio significantly. Therefore, it must be considered carefully especially for in vitro drug development studies.
In this study, the relationship between the pore size distribution and the adsorption amount of adsorbates is investigated in detail. Adsorption amounts of non-polar adsorbates were greater than those of polar adsorbates because of slight negative charge on surfaces of adsorbents. The adsorption of benzene on the surface of absorbents was largely influenced by the specific pore size of $2{\sim}4$ times of benzene diameter. But in case of toluene, the adsorption of toluene was affected by pore sizes of $2{\sim}4$ times as well as $4{\sim}6$ times of the diameter of toluene. Both acetone and MEK were examined by the same method. The adsorption of acetone was influenced by pore sizes of $2{\sim}4$ times of the diameter of acetone. But acetone does not look to be built up multi-layer on those pore sizes. Since acetone molecule is small and its mobility is so fast, it is assumed that the adsorption and desorption of acetone is simultaneously occurred at the same time even at room temperature. In case of MEK, MEK was effected by pore sizes of $2{\sim}4$ times of the diameter of MEK.
Kim, Kyung-Min;Park, Sung-Hyun;Lee, Won-Jae;Shin, Byoung-Chul
Journal of the Korean Institute of Electrical and Electronic Material Engineers
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v.23
no.8
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pp.587-592
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2010
We have fabricated schottky barrier diode (SBDs) using polar (c-plane) and non polar (a-, m-plane) n-type 6H-SiC wafers. Ni/SiC ohmic contact was accomplished on the backside of the SiC wafers by thermal evaporation and annealed for 20minutes at $950^{\circ}C$ in mixture gas ($N_2$ 90% + $H_2$ balanced). The specific contact resistance was $3.6{\times}10^{-4}{\Omega}cm^2$ after annealing at $950^{\circ}C$. The XRD results of the alloyed contact layer show that formation of $NiSi_2$ layer might be responsible for the ohmic contact. The active rectifying electrode was formed by the same thermal evaporation of Ni thin film on topside of the SiC wafers and annealed for 5 minutes at $500^{\circ}C$ in mixture gas ($N_2$ 90% + $H_2$ balanced). The electrical properties of SBDs have been characterized by means of I-V and C-V curves. The forward voltage drop is about 0.95 V, 0.8 V and 0.8 V for c-, a- and m-plane SiC SBDs respectively. The ideality factor (${\eta}$) of all SBDs have been calculated from log(I)-V plot. The values of ideality factor were 1.46, 1.46 and 1.61 for c-, a- and m-plane SiC SBDs, respectively. The schottky barrier height (SBH) of all SBDs have been calculated from C-V curve. The values of SBH were 1.37 eV, 1.09 eV and 1.02 eV for c-, a- and m-plane SiC SBDs, respectively.
Objectives: Selaginella bryopteris L. (family: Selaginaceae), is often used in traditional Indian systems of medicine for the prevention and cure of several disorders and for the treatment of patient with spermatorrhoea, venereal disease, constipation, colitis, urinary tract infections, fever, epilepsy, leucorrhoea, beri-beri and cancer. It is also used as a strength tonic. This study aimed to evaluate the mechanisms underlying the anti-inflammatory effects of topically administered aqueous, polar and non-polar methanolic fractions ($10mg/20{\mu}L$) of Selaginella bryopteris. Methods: An acute oral toxicity study of Selaginella bryopteris at doses from 250 to 2,000 mg/kg body weight (bw) was performed. Aqueous, polar and non-polar methanolic extracts ($10mg/20{\mu}L$) applied topically for 5 days were evaluated for their anti-inflammatory effects against 12-tetra-O-decanoyl phorbol acetate (TPA)- induced inflammation by using the redness in the ear, the ear's weight (edema), oxidative stress parameters, such as lipid-peroxide (LPO) and nitric oxide (NO), and the pro-inflammatory cytokines involved in inflammation, such as tumour necrosis factor $(TNF)-{\alpha}$, interleukin $(IL)-1{\beta}$ and IL-6. Indomethacine ($0.5mg/20{\mu}L$) was used for the positive control. Results: Selaginella bryopteris produced no mortalities when administered orally at doses from 250 to 2,000 mg/kg bw. Topical treatment with the non-polar methanolic fraction ($10mg/20{\mu}L$) significantly suppressed redness ($2.4{\pm}0.5$) and edema ($30.4{\pm}1$) and effectively reduced the LPO level ($32.3{\pm}3.3$). The NO level was ($8.07{\pm}0.55$), and the $TNF-{\alpha}$, $IL-1{\beta}$, and IL-6 levels were decreased to $69.6{\pm}15.5$, $7.7{\pm}4.8$ and $82.6{\pm}5.9$, respectively. Conclusion: This study demonstrated for the first time the mechanisms underlying the anti-inflammatory effect of medicinal plants like Selaginella bryopteris and quantified the pharmacological interactions between them. The present study showed this herbal product to be a promising anti-inflammatory phytomedicine for the treatment of patients with inflammatory skin diseases.
The Journal of Korea Institute of Information, Electronics, and Communication Technology
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v.6
no.1
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pp.37-44
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2013
In this paper, we propose the pulmonary nodule detection system based on voxel classification. The proposed system consists of three main steps. In the first step, we segment lung volume. In the second step, the lung structures are initially segmented. In the last step, we classify the nodules using voxel classification. To describe characteristics of each voxel, we extract the log-polar sampling based features. Support Vector Machine is applied to the extracted features to classify into nodules and non-nodules.
Journal of the Korean Applied Science and Technology
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v.30
no.1
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pp.152-159
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2013
Experiments of emulsion particles state of using polyglycerol ester emulsifier and the stability in accordance with the change of time were conducted using several oil. Experimental results confirmed that there is little difference in the stability and particle size depending on the type of oil. Most stable oil with polyglycerol ester is polar oil of silicon series and fatty acid ester oil, hydrocarbon oil of the nonpolar oil (Mineral oil, squalane, polydecene) was the most unstable state. And vegetable oils showed the stable form of particles with polyglycerol ester emulsifier.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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