• 생약학회지
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• 제50권3호
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• pp.191-197
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• 2019

Sepsis, an infectious disease, is a life-threatening condition that arises when the response to infection causes injury to tissues and organs. The purpose of this study was to demonstrate whether ABHC-1 and ABHC-2, two functional extracts from herbal complex, have an anti-bacterial effect against Escherchia coli in vivo, in vitro experimental model. ABHC-1 and ABHC-2 showed the antibacterial activity against the bacteria by paper disc method. The minimum inhibitory concentration (MIC) was measured using alamar blue reagent. The MIC was shown at $60{\mu}g/ml$ from ABHC-1 and $500{\mu}g/ml$ from ABHC-2 against E. coli. We next examined the effect of ABHCs on the production of inflammatory cytokine, such as tumor necrosis $factor-{\alpha}$ ($TNF-{\alpha}$), which is related to the induction of inflammation, in RAW 264.7 cell. ABHC-1 and ABHC-2 increased $TNF-{\alpha}$ production of RAW 264.7 cell in a dose-dependent manner while two extract decreased $TNF-{\alpha}$ production in lipopolysaccharide (LPS)-stimulated RAW 264.7 cell in a dose-dependent manner. At a dose of $1{\times}10^8$ E. coli. i.p., non-treated mice were succumbed, while most of mice treated with ABHC-1 were survived. Therefore, our results suggest that ABHC-1 has anti-bacterial activity and can be a novel therapeutic agent against infectious diseases.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제49권4호
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• pp.510-518
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• 2021

Bacteriophages are considered excellent sensing elements for platforms detecting bacteria. However, their lytic cycle has restricted their efficacy. Here, we used the minor coat protein pIII domain (N1N2) of phage CTXφ to construct a novel surface plasmon resonance (SPR) biosensor that could detect Vibrio cholerae. N1N2 harboring the domains required for phage adsorption and entry was obtained from Escherichia coli using recombinant protein expression and purification. SDS-PAGE revealed an approximate size of 30 kDa for N1N2. Dot blot and transmission electron microscopy analyses revealed that the protein bound to the host V. cholerae but not to non-host E. coli K-12 cells. Next, we used amine-coupling to develop a novel recombinant N1N2 (rN1N2)-functionalized SPR biosensor by immobilizing rN1N2 proteins on gold substrates and using SPR to monitor the binding kinetics of the proteins with target bacteria. We observed rapid detection of V. cholerae in the range of approximately 10³ to 10⁹ CFU/ml but not of E. coli at any tested concentration, thereby confirming that the biosensor exhibited differential recognition and binding. The results indicate that the novel biosensor can rapidly monitor a target pathogenic microorganism in the environment and is very useful for monitoring food safety and facilitating early disease prevention.

• 한국축산식품학회지
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• 제43권1호
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• pp.73-84
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• 2023

Campylobacteriosis is a common cause of gastrointestinal disease. In this study, we suggest a general strategy of applying gold nanoparticles (AuNPs) in colorimetric biosensors to detect Campylobacter in chicken carcass. Polymerase chain reaction (PCR) was utilized for the amplification of the target genes, and the thiolated PCR products were collected. Following the blending of colloid AuNPs with PCR products, the thiol bound to the surface of AuNPs, forming AuNP-PCR products. The PCR products had a sufficient negative charge, which enabled AuNPs to maintain a dispersed formation under electrostatic repulsion. This platform presented a color change as AuNPs aggregate. It did not need additional time and optimization of pH for PCR amplicons to adhere to the AuNPs. The specificity of AuNPs of modified primer pairs for mapA from Campylobacter jejuni and ceuE from Campylobacter coli was activated perfectly (C. jejuni, p-value: 0.0085; C. coli, p-value: 0.0239) when compared to Salmonella Enteritidis and Escherichia coli as non-Campylobacter species. Likewise, C. jejuni was successfully detected from artificially contaminated chicken carcass samples. According to the sensitivity test, at least 15 ng/μL of Campylobacter PCR products or 1×10³ CFU/mL of cells in the broth was needed for the detection using the optical method.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제39권2호
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• pp.104-110
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• 2011

방선균은 그램양성 토양 박테리아로서 항생제, 항암제, 항구충제, 면역억제제 등 유용한 2차 대사산물을 생산하는 유용 산업미생물이다. 비록 대부분의 방선균이 속해있는 스트렙토마이세스는 지난 수 십 년간 분자수준에서의 연구가 집중적으로 진행되어 왔으나, 최근에 분리된 잠재적 유용성을 갖는 스트렙토마이세스 이외의 희소방선균들은 유전자 조작시스템의 부재로 그 특성이 잘 규명되지 않고 있다. 본 연구에서는 독립적으로 분리된 180 여 방선균주들 중에서 희소방선균만을 선별하기 위하여 중합효소연쇄반응을 이용한 유전체 스크리닝 전략을 시도하였으며, 이 전략을 통하여 7종의 희소방선균을 성공적으로 분리하였다. 특히 여러 생리활성 테스트를 통하여, 항진균 및 항생제 활성을 띄는 잠재적 유용성이 높은 노카이디옵시스 균주 MMBL010을 선별하였다. 또한 전통적인 방선균 유전자 조작기법이 작동하지 않는 본 MMBL010 균주를 대장균 접합을 통한 유전자 전달 시스템도 최적화시킴으로써, 유전체 스크리닝을 통한 유용희소방선균의 선별 및 유전자 조작시스템 구축은 궁극적으로 희소방선균의 잠재적 유용성을 극대화시킬 수 있는 효율적인 전략으로 사료된다.

• KSBB Journal
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• 제23권5호
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• pp.375-380
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• 2008

생 및 반건참가자미의 저장성 향상을 위하여 아가미를 제거하지 않은 것 (WG)과 제거한 것 (OG), 건조도에 따라 생것(0 D), 20%건조한 것 (20 D), 40%건조한 것 (40 D), 0.1% chitosan-ascorbate (CA)의 처리와 무처리로 구분, 진공 포장하여 $5{\sim}10^{\circ}C$에서 10일간 저장하면서 미생물의 증식정도를조사하였다. $10^{\circ}C$에서 저장 중 생 참가자미의 WG와 OG를 비교한 결과, OG가 WG에 비하여 total aerobacter는 $0.3{\sim}0.5$ log cycle이 감소되었으며, coliform과 E. coli의 수도 낮았다. $10^{\circ}C$에서 저장 중 0 D, 20 D 및 40 D를 비교한 결과, total aerobacter, coliform 및 E. coli 모두 20 D에서 가장 낮았으며 total aerobacter의 경우는 생것에 비하여 $0.42{\sim}1.20$ log cycle이 낮았다. 진공포장한 생 참가자미를 $5^{\circ}C$와 $10^{\circ}C$에서 10일간 저장한 결과, $5^{\circ}C$의 경우는 total aerobacter가 log 4.17 CFU/g로 $10^{\circ}C$보다 $0.6{\sim}1.3$ log cycle이 낮았다. 가자미로부터 분리한 3종의 미생물 [aerobacter (A1), coliform (C12), E-coli (E7)]에 대한 CA의 항균효과를 조사한 결과 0.1%에서 3종 모두 생육이 완전히 억제되었다. 생 참가자미에 0.1% CA를 처리한 후 진공 포장하여 $10^{\circ}C$에서 10일간 저장한 결과 CA 비처리에 비하여 total aerobacter는 1.5 log cycle이 감소되었으며, coliform 및 E. coli도 감소되었으며, CA처리 반건참가자미 (20 D)에서도 유사한 경향을 나타내었다. 0 D 및 20 D를 CA처리한 후 진공 포장하여 $10^{\circ}C$에서 10일간 저장한 생시료 또는 조리하여 관능검사를 행한 결과, 0 D와 20 D 모두 CA 처리군에서 외관, 신선도, 조직감 및 종합적기호도 값이 비처리군의 "보통"에 비하여 우수한 것 (좋다$\sim$매우좋다)으로 평가되었다.

• 한국방사선학회논문지
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• 제14권5호
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• pp.537-543
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• 2020

현대사회의 노인 인구는 첨단 의료기술과 최소 침습 수술로 인해 빠르게 성장하고 있다. 따라서 의료기기를 사용하는 경향이 증가하기 때문에 병원성 감염이 우려된다. 따라서 현대 의학의 최우선 목표는 감염예방이다. 최근 3D 프린팅을 이용하여 환자 맞춤형 임플란트 이식술이 늘고 있다. 대표적 재료로 이용되는 것이 수산화인회석이다. 현재 HA 디스크 멸균을 위한 흡수선량 기준이 없으므로, HA 디스크 표면에 오염된 대장균과 충치균을 감마선 코발트와 선형 가속기를 이용하여 각 흡수선량 0, 0.5, 1.0, 3.0, 5.0 kGy로 조사 후, 십진 희석법으로 검체에서 균 수를 측정하였다. 멸균 후 대장균, 충치균의 생존 비교분석을 위해 비모수 검정법을 시행하였으며, 그 결과 대장균은 1 kGy 이상, 충치균은 3 kGy 이상에서 멸균되었다. 방사선 멸균 흡수선량 권고사항보다 낮은 수치에서 멸균을 시행하는 것도 가능할 것으로 생각된다.

• 대한약침학회지
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• 제22권1호
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• pp.49-54
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• 2019

Objective: Antibiotic resistance is a global health problem and threatens health of societies. These problems have led to a search for alternative approaches such as combination therapy. The aim of the present study was to investigate the effect of caffeine and omeprazole in combination with gentamicin or ciprofloxacin against standard and clinically resistant isolates of Staphylococcus aureus and Escherichia coli. Methods: The minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum bactericidal concentration (MBC) values of different agents against bacterial strains were determined. The interaction of non- antibiotic drugs with gentamicin and ciprofloxacin was studied in vitro using a checkerboard method and calculating fraction inhibitory concentration index (FICI). Verapamil as efflux pump inhibitor was used to evaluate the possible mechanism of bacterial resistance to antibiotics. Results: The MIC and MBC values of gentamicin against bacterial strains were in the range of $20-80{\mu}g/ml$ and $40-200{\mu}g/ml$, respectively. Caffeine and omeprazole had no intrinsic inhibitory activity against tested microorganisms. However, upon combination of caffeine with antibiotics, the synergistic effects were observed. Verapamil was able to reduce the MIC values of gentamicin (4 folds) only in some bacterial strains. Conclusion: These findings indicated that caffeine was effective in removing bacterial infection caused by S. aureus and E. coli. The relevant mechanisms of antibiotic resistance were not related to the drug efflux.

• BMB Reports
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• 제30권1호
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• pp.66-72
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• 1997

A mammalian DNA repair enzyme, UV endonuclease III which also functions as a ribosomal protein S3 (rpS3), was purified from mouse cells and characterized. UV endonuclease III was previously cloned and known to yield a peptide of 32 kDa upon expression in E. coli [Kim et al., (1995) J. Bioi. Chem. 270, 13620-13629]. However, biochemically purified UV endonuclease III, which has a sedimentation coefficient of 3.25, appears to have an additional peptide of 28 kDa. It appears that two bands were derived from one complex, judging from the comparison of the nuclease activity on the native and SDS-gel electrophoreses. UV endonuclease III becomes non-specific upon purification and this phenomenon is more significant in the case of pure fractions of the enzyme. Non-specific activity was not influenced by pH or any salt conditions.

• 한국물환경학회지
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• 제22권6호
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• pp.1075-1081
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• 2006

In this research, mortality rates of pathogen indicator microorganisms discharged from various point sources and diffuse sources in urban area were measured. Water samples were taken at domestic sewer, combined sewer overflow, effluent from a wastewater treatment plant, urban river, and sediment of an urban river. Mortality rates of indicator microorganisms in domestic sewer estimated by assuming the first order kinetics at $20^{\circ}C$ were as follows: total coliform = 0.092/day, fecal coliform = 0.185/day, E. coli = 0.252/day, and fecal streptococci = 0.281/day. Sensitivity of mortality rates of total coliform on temperature was estimated as $K_{temp}=K_{20}{\times}1.162^{(temp-20)}$ for the range of $10-20^{\circ}C$. Mortality rates due to sunlight were measured as 1.22-1.59/day while mortality rate due to settling for 40 min were estimated as $9.21{\times}10^3-20.0{\times}10^3/day$.

• 대한임상검사과학회지
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• 제52권2호
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• pp.136-142
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• 2020

세균의 항균제 내성율은 지난 몇십년 동안 지속적으로 상승하였으며 mobile genetic elements를 통한 항균제내성인자들의 전파는 다제내성세균의 출현 및 확산을 가중시켰다. 본연구에서는 임상검체에서 분리된 aminoglycoside에 비감수성 대장균 33주를 대상으로 mobile genetic elements를 통해 전파될 수 있는 aminoglycoside 내성인자를 조사하였다. 16S ribosomal RNA methyltransferases (RMTases)와 aminoglycoside-modifying enzyme (AME)유전자가 PCR과 DNA 염기서열분석을 통해 검출되었다. 그 결과 aac(3')-II 유전자(54.5%)를 포함하고 있는 균주가 제일 많았으며 그 다음으로 aph(3')-Ia 유전자(18.2%)가 많았고 aac(6')-Ib 유전자(15.2%)를 포함하는 균주도 있었다. RMTase 유전자는 본 연구에서는 검출되지 않았다. aac(3')-II 유전자를 포함하고 있는 18균주 중 17균주가 gentamicin에 내성을 보였으며 이중 16균주는 tobramycin에도 내성을 보였다. aac(6')-Ib 유전자를 포함하고 있는 5균주는 모두 tobramycin에 내성을 보였다. 본 연구에서 AME 유전자를 획득하는 것은 사람에서 분리된 대장균이 aminoglycoside에 내성을 나타내는 중요한 기전 중 하나임이 확인되었다. 사람으로부터 분리된 세균을 대상으로 지속적으로 항균제 내성인자를 조사하는 것은 내성세균의 확산을 막는데 필요할 것으로 사료된다.