• 미생물학회지
• /
• 제30권6호
• /
• pp.524-527
• /
• 1992

경기도 의왕시에 위치한 백운 저수지에서 분리된 cyanobacteria 인 Synechococcus sp. 로부터 한 종의 cyanophage 를 분리하여 ultrafiltration, differential centrifugation 과 sucrose density gradient centrifugation 을 이용하여 정제하였다. 분리된 cynophage 는 transmission electron microscope (TEM) 를 이용하여 100,000 배로 관찰한 결과 직경이 89 nm인 isometric head 와 tail 의 전체 길이가 111 nm 의 contractile tail 을 가진 phage 로서 Myoviridae 에 속함을 알 수 있었다. 생화학적 특징으로는 20~$40^{\circ}C$ 와 pH 5-10에서 50% 이상의 안정성을 유지하며 $30^{\circ}C$ 와 pH 9 에서 최고의 infectivity 를 나타내었다.

• 미생물학회지
• /
• 제51권3호
• /
• pp.194-198
• /
• 2015

Enterococcus faecalis는 그람 양성의 조건 혐기성 세균으로 원내감염의 주요 원인균 중의 하나이다. E. faecalis에 특이적인 신규 박테리오파지 ECP3를 환경에서 분리하여 형태와 유전적 특성을 규명하였다. ECP3 파지는 형태적으로 수축성 꼬리를 갖는 미오비리대 과에 속하며 E. faecalis를 특이적으로 사멸하지만 Enterococcus faecium를 포함한 다른 세균은 사멸시키지 않았다. ECP3 파지의 게놈은 이중 선형 DNA로 GC 함량이 35.9%이었으며 크기가 145,518 bp이며 220개의 구조유전자로 구성되어 있었다. ECP3 게놈과 가장 유사한 염기서열은 미오비리대 PhiEF24C 파지이었으며 전체 게놈 90%의 영역에서 97%의 유사도를 보였다. ECP3 파지는 한국에서 처음 분리된 E. faecalis 미오비리대 파지이며 E. faecalis 감염에 대한 신규 항균제로서 유망하다.

• The Plant Pathology Journal
• /
• 제34권1호
• /
• pp.59-64
• /
• 2018

Bacteriophages of Acidovorax citrulli, the causal agent of bacterial fruit blotch, were isolated from 39 watermelon, pumpkin, and cucumber leaf samples collected from various regions of Korea and tested against 18 A. citrulli strains. Among the six phages isolated, ACP17 forms the largest plaque, and exhibits the morphology of phages in the Myoviridae family with a head diameter of $100{\pm}5nm$ and tail length of $150{\pm}5nm$. ACP17 has eclipse and latent periods of $25{\pm}5min$ and $50{\pm}5min$, respectively, and a burst size of 120. The genome of ACP17 is 156,281 base pairs with a G + C content of 58.7%, 263 open reading frames, and 4 transfer RNA genes. Blast search and phylogenetic analysis of the major capsid protein showed that ACP17 has limited homology to two Stentrophomonas phages, suggesting that ACP17 is a new type of Myoviridae isolated from A. citrulli.

• The Plant Pathology Journal
• /
• 제32권6호
• /
• pp.584-588
• /
• 2016

Several Bacillus species were isolated from rice field soils, and 16S rRNA gene sequence analysis showed that Bacillus cereus was the most abundant. A strain named BC1 showed antifungal activity against Rhizoctonia solani. Bacteriophages infecting strain BC1 were isolated from the same soil sample. The isolated phage PK16 had an icosahedral head of $100{\pm}5nm$ and tail of $200{\pm}5nm$, indicating that it belonged to the family Myoviridae. Analysis of the complete linear dsDNA genome revealed a 158,127-bp genome with G + C content of 39.9% comprising 235 open reading frames as well as 19 tRNA genes (including 1 pseudogene). Blastp analysis showed that the proteins encoded by the PK16 genome had the closest hits to proteins of seven different bacteriophages. A neighbor-joining phylogenetic tree based on the major capsid protein showed a robust clustering of phage PK16 with phage JBP901 and BCP8-2 isolated from Korean fermented food.

• 식물병연구
• /
• 제18권3호
• /
• pp.225-230
• /
• 2012

국내 주요 배추재배단지 6곳을 정하여 토양 샘플에서 무름병균을 용균할 수 있는 bacteriophage를 분리하였다. 여름배추를 재배하는 평창과 태백의 토양 샘플에서 국내에서 분리한 15개의 다른 무름병균을 기주로 파지를 분리한 결과 태백의 토양은 다양한 병원균을 기주로 증폭하는 반면 평창의 파지는 두 종류의 균에서만 증폭이 되어 매우 좁은 기주 범위를 가졌다. 무름병균 P. carotovorum subsp. carotovorum Pcc3의 균주는 거의 모든 토양 샘플에서 파지를 증폭할 수 있어 앞으로 파지를 이용한 무름병균 예찰 균주로 사용될 수 있는 가능성을 보여 주었다. 국내 무름병균을 용균할 수 있는 파지는 Myoviridae, Podoviridae, Siphoviridae 세 종류로 밝혀 졌으며 국내 거의 전 지역에서 Siphoviridae가 분리되었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제24권6호
• /
• pp.740-747
• /
• 2014

Bacterial leaf blight (BLB) caused by Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) is a very serious disease in rice-growing regions of the world. In spite of their economic importance, there are no effective ways of protecting rice plants from this disease. Bacteriophages infecting Xoo affect the population dynamics of the pathogen and consequently the occurrence of the disease. In this study, we investigated the diversity, host range, and infectivity of Xoo phages, and their use as a bicontrol agent on BLB was tested. Among the 34 phages that were isolated from floodwater in paddy fields, 29 belonged to the Myoviridae family, which suggests that the dominant phage in the ecosystem was Myoviridae. The isolated phages were classified into two groups based on plaque size produced on the lawn of Xoo. In general, there was a negative relationship between plaque size and host range, and interestingly the phages having a narrow host range had low efficiency of infectivity. The deduced protein sequence analysis of htf genes indicated that the gene was not a determinant of host specificity. Although the difference in host range and infectivity depending on morphotype needs to be addressed, the results revealed deeper understanding of the interaction between the phages and Xoo strains in floodwater and damp soil environments. The phage mixtures reduced the occurrence of BLB when they were treated with skim milk. The results indicate that the Xoo phages could be used as an alternative control method to increase the control efficacy and reduce the use of agrochemicals.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제29권5호
• /
• pp.696-703
• /
• 2019

Cronobacter sakazakii is an opportunistic pathogen causing serious infections in neonates. In this study, a bacteriophage ${\Phi}CS01$, which infects C. sakazakii, was isolated from swine feces and its morphology, growth parameters, and genomic analysis were investigated. Transmission electron microscopy revealed that ${\Phi}CS01$ has a spherical head and is 65.74 nm in diameter with a 98.75 nm contracted tail, suggesting that it belongs to the family Myoviridae. The major viral proteins are approximately 71 kDa and 64 kDa in size. The latent period of ${\Phi}CS01$ was shown to be 60 min, and the burst size was 90.7 pfu (plaque-forming units)/infected cell. Bacteriophage ${\Phi}CS01$ was stable at $4-60^{\circ}C$ for 1 h and lost infectivity after 1 h of heating at $70^{\circ}C$. Infectivity remained unaffected at pH 4-9 for 2 h, while the bacteriophage was inactivated at pH <3 or >10. The double-stranded ${\Phi}CS01$ DNA genome consists of 48,195 base pairs, with 75 predicted open reading frames. Phylogenetic analysis is closely related to that of the previously reported C. sakazakii phage ESP2949-1. The newly isolated ${\Phi}CS01$ shows infectivity in the host bacterium C. sakazakii, indicating that it may be a promising alternative to antibacterial agents for the removal of C. sakazakii from powdered infant formulas.

• 한국식품과학회지
• /
• 제43권2호
• /
• pp.176-181
• /
• 2011

즉석 편이식품에서 위해도가 가장 큰 C. sakazakii와 S. enterica Typhimurium을 박테리오파지로 제어하기 위하여 용균성 박테리오파지를 분리, 동정하였고 조제분유와 채소 주스에 이들 세균에 적용하여 그의 효과를 분석하였다. 박테리오 파지는 돼지 분변에서 C. sakazakii와 S. enterica Typhimurium균을 용해시키는 박테리오파지를 분리하였고 현미경과 그의 특성을 분석, 동정하였다. Cronobacter에 작용하는 ES2 파지와 Salmonella의 ST2 파지는 형태학적 특성이 각각 Myoviridae와 Siphoviridae로 각각 동정되었으며 제한효소지도와 SDS-PAGE 분석에 의하여 서로 다른 파지임을 확인하였다. ES2 파지의 경우 latent period는 약 40분 정도였으며, ST2 파지는 약 30분 정도를 나타냈으며, burst size는 ES2 파지는 약 $52{\pm}5PFU/cell$, ST2 파지는 약 $21{\pm}3PFU/cell$로 나타났다. 열안정성은 $60^{\circ}C$에서 ST2 파지의 경우 100분 동안 안정한 것으로 나타났으나, ES2 파지는 30분 이후부터는 확인되지 않았다. 따라서 ST2 파지가 ES2 파지에 비해 열안정성이 높은 것을 알 수 있었다. 이 분리 파지를 조제분유와 채소 주스에 직접 적용한 효과는 ES2에 의한 Cronobacter 제어는 접종 후 6시간까지는 균수가 일정하게 유지하였고 균의 증식을 일어나지 않는 것으로 나타났다. ST2 파지에 의한 Salmonella는 생육저해가 잘 일어나 접종시간이 지남에 따라 균수가 감소하는 것을 확인하였다. 그러므로 C. sakazakii와 S. enterica Typhimurium의 생육저해는 이들 용균성 박테리오파지를 활용하여 가능한 것으로 보인다.

• 한국가금학회지
• /
• 제44권3호
• /
• pp.181-188
• /
• 2017

박테리오파지는 세균에 특이적으로 감염하는 바이러스로 용해 능력이 있는 박테리오파지는 동물질병을 치료하는 항생제 대체제로 사용할 수 있다. 본 연구는 닭에서 가금티푸스를 유발하는 Salmonella enterica serovar Gallinarum(Salmonella Gallinarum)에 대한 박테리오파지를 분리하고, 그 특성을 구명하고자 하였다. 7개의 닭 도축장 하수 처리장 물로부터 10주의 박테리오파지를 분리하였다. 이중 $SG{\Phi}-YS$ SP로 명명된 파지는 전자현미경 관찰 결과, Myoviridae family로 분류되었다. 분리한 박테리오파지의 숙주 범위를 확인하기 위하여 Salmonella Gallinarum 7주와 Salmonella Enteritidis 5주에 대한 용해 유발능력을 조사한 결과, $SG{\Phi}-YS$ SP는 Salmonella Gallinarum만 용해하는 특징을 보였다. $SG{\Phi}-YS$ SP는 Salmonella Gallinarum에 접종하였을 경우 6시간과 9시간 뒤 각각 2.21 log cfu/mL 및 2.13 log cfu/mL를 감소시키는 것으로 확인되어 닭에서 Salmonella Gallinarum 감염을 예방하거나 치료하는 파지 제제 개발에 이용될 수 있을 것으로 판단되었다.

• 한국식품과학회지
• /
• 제50권6호
• /
• pp.594-600
• /
• 2018

본 연구는 시가독소 생성 대장균(STEC)를 제어하기 위하여 하천수 시료로부터 넓은 숙주저해범위를 갖는 ECP33 파지와 NOECP91 파지를 분리, 선별하였다. 총 44주의 STEC균주에 대해 ECP33 파지는 약 45.5%와 NOECP91 파지는 약 65.9%로 숙주저해특성을 가지는 것으로 나타났다. 형태학적 특성을 확인한 결과 모두 Myoviridae family에 속하였다. 환경에 대한 안정성 분석을 진행한 결과, 두 파지 모두 50 ppm 농도의 차아염소산 및 pH 4-10의 pH환경에 대해서는 최소 30분까지 비교적 안정한 것으로 나타났다. 반면, $70^{\circ}C$의 고온에서는 NOECP91 파지는 15분 내에, ECP33 파지는 30분 처리 시에 대부분 사멸하고, 유기용매(EtOH) 환경에서 NOECP91 파지는 30% 에탄올 1시간 처리에 모두 사멸하였으나, ECP33파지의 경우 70% EtOH/에탄올 1시간 처리에도 2 log PFU/mL 미만의 감소율을 보여 온도와 유기용매(EtOH) 환경에 대해 ECP33 파지가 NOECP91 파지보다 안정적인 것으로 나타났다. 아울러 분리된 ECP33 파지와 NOECP91 파지를 MOI 0.1 조건에 따른 STEC 균주 생육억제 정도를 분석한 결과, 배양 10시간대까지 생육억제가 이루어지는 것을 확인하였다. 따라서 본 연구를 통해 분리된 ECP33 파지와 NOECP91 파지는 시가독소 생성 대장균의 생물학적 제어제로서 적용이 가능할 것으로 사료된다.