The present study was conducted to investigate different gene expression profile between treated poMSTNpro and non-treated in rainbow trout and to identify those genes that are specifically or predominantly expressed in treated poMSTNpro by employing annealing control primer (ACP)-based GeneFishing polymerase chain reaction (PCR). We isolated total RNAs in muscle tissues from the treated poMSTNpro fish by immersion bath technique with fish myostatin prodomain (Paralichthys olivaceus, poMSTNpro) for one month and the other was non-treated poMSTNpro, and synthesized cDNA using annealing control primers (ACP, Seegene, Korea). Using 20 different ACPs for PCR, were cloned sequenced, and analyzed identities of 2 differentially expressed genes (DEGs). According to BLAST analysis, sequences of 2 clones significantly matched database entries and confirmed by semi-quantitative RT-PCR. The functional roles of one up-regulated gene, cytochrome P450 mono-oxygenases 2K1v2 (CYP2K1v2), and one down-regulated gene was Profilin-1 were identified. We identified distinctive gene expression profiles in improved rainbow trout growth by treatment with a fish myostatin prodomain using ACP-based GeneFishing.
상동유전자 재조합기술을 myostatin 유전자에 적용하기 위해 돼지 골격에 붙어 있는 근육으로부터 RNA를 추출하였고 돼지 Myostain Exon 3 부위의 specific primer를 제작하여 RT-PCR 을 수행 한 후 증폭된 342bp DNA 를 추출하여 T vector 에 ligation한 후 sequencing을 실시하여 돼지 genomic DNA 에서 Myostatin gene 의 Exon 3 부위와 100% match 되는 것을 확인하였다. (omitted)
A complete cDNA, which encodes for a myostatin-like protein (Es-MSTN), was isolated from the Chinese mitten crab, Eriocheir sinensis. Es-MSTN was composed of 2,397 nucleotides and the open reading frame (ORF) specified a protein containing 468 amino acids. Es-MSTN exhibited 32% amino acid sequence identity and 52% similarity to human myostatin. Multiple sequence alignment analysis indicated that Es-MSTN possessed the conserved proteolytic cleavage site (RXXR) for maturation of the protein and nine cysteine residues for disulfide bridges. Besides the conserved structural features, Es-MSTN also exhibits its unique characters; a longer N-terminal domain which is involved in protein folding and latent form of myostatin and absence of the cleavage site for BMP-1/tolloid family of metalloproteinase to activate mature myostatin. Phylogenetic analysis suggests that Es-MSTN showed the closely related to both vertebrate myostatin and GDF11. Es-MSTN is expressed highly in the claw muscle, leg muscle, thoracic muscle and heart, and moderately in the hindgut suggesting that Es-MSTN may play important roles in the muscle tissues. As homolog of mammalian myostatin and GDF11, Es-MSTN may be involved in development of muscular tissue and further study will help to produce high-quality seafood.
Myostatin, which is also known as growth and differentiation factor 8 (GDF8), has been reported to act as a negative regulator of skeletal muscle development. Variation in the myostatin gene (MSTN) has been associated with variation in muscularity in certain "meaty" sheep breeds. Polymerase Chain Reaction-Single Strand Conformational Polymorphism (PCR-SSCP) analysis was used to investigate allelic variation in the previously described g+6223G>A single-nucleotide polymorphism (SNP) in the 3' untranslated region (3' UTR) of MSTN. The sheep studied were 79 New Zealand (NZ) Romney lambs derived from a single sire heterozyous for g+6223G>A, which is in itself notable as this polymorphism has not been described previously in this breed. Allelic variation was observed to be associated with an abnormal gender ratio (p = 0.046) in the progeny. The presence of allele A was observed to have an effect (p<0.05) on birth weight, mean loin yield, proportion yield loin and total muscle yield. Allelic variation did not significantly affect mean shoulder yield, leg yield, proportion yield shoulder and proportion yield leg. This preliminary result suggests that while the A allele at MSTN g+6223 appears to improve some valuable traits in NZ Romney sheep, further research is required to understand if and how it may affect other traits.
Objective: Based on rapid advancement of genetic modification techniques, genomic editing is expected to become the most efficient tool for improvement of economic traits in livestock as well as poultry. In this study, we examined and verified the nickase of mutated CRISPR-associated protein 9 (Cas9) to modulate the specific target gene in chicken DF1 cells. Methods: Chicken myostatin which inhibits muscle cell growth and differentiation during myogenesis was targeted to be deleted and mutated by the Cas9-D10A nickase. After co-transfection of the nickase expression vector with green fluorescent gene (GFP) gene and targeted multiplex guide RNAs (gRNAs), the GFP-positive cells were sorted out by fluorescence-activated cell sorting procedure. Results: Through the genotyping analysis of the knockout cells, the mutant induction efficiency was 100% in the targeted site. Number of the deleted nucleotides ranged from 2 to 39 nucleotide deletion. There was no phenotypic difference between regular cells and knockout cells. However, myostatin protein was not apparently detected in the knockout cells by Western blotting. Additionally, six off-target sites were predicted and analyzed but any non-specific mutation in the off-target sites was not observed. Conclusion: The knockout technical platform with the nickase and multiplex gRNAs can be efficiently and stablely applied to functional genomics study in poultry and finally adapted to generate the knockout poultry for agribio industry.
Myostatin (MSTN) can negatively regulate the growth and development of skeletal muscle, and natural mutations can cause "double-muscling" trait in animals. In order to block the inhibiting effect of MSTN on muscle growth, we transferred zinc-finger nucleases (ZFN) which targeted sheep MSTN gene into cultured fibroblasts. Gene targeted colonies were isolated from transfected fibroblasts by serial dilution culture and screened by sequencing. Two colonies were identified with mono-allele mutation and one colony with bi-allelic deletion. Further, we introduced the MSTN-ZFN mRNA into sheep embryos by microinjection. Thirteen of thirty-seven parthenogenetic embryos were targeted by ZFN, with the efficiency of 35%. Our work established the technical foundation for generation of MSTN gene editing sheep by somatic cloning and microinjection ZFN into embryos.
To generate expressed sequence tags for genomics research involving genetic linkage analysis, to examine gene expression profiles in muscles of channel catfish in a non-normalized muscle cDNA library, to compare gene expression in young and mature channel catfish muscles using the EST reagents and gene filters to demonstrate the feasibility of functional genomics research in small laboratories. 102 randomly picked cDNA clones were analyzed from the catfish muscle cDNA library. Of the sequences generated, 90.2% of ESTs was identified as known genes by identity comparisons. These 92 clones of known gene products represent transcriptional products of 24 genes. The 10 clones of unknown gene products represent 8 genes. The major transcripts (70.1% of the analyzed ESTs) in the catfish muscle are from many major genes involved in muscle contraction, relaxation, energy metabolism and calcium binding such as alpha actin, creatine kinase, parvalbumin, myosin, troponins, and tropomyosins. Gene expression of the unique ESTs was comparatively studied in the young and adult catfish muscles. Significant differences were observed for aldolase, myostatin, myosin light chain, parvalbumin, and an unknown gene. While myosin light chain and an unknown gene (CM 192) are down-regulated in the mature fish muscle, the aldolase, myostatin, and parvalbumin are significantly up-regulated in the mature fish muscle. Although the physiological significance of the changes in expression levels needs to be further addressed, this research demonstrates the feasibility and power of functional genomics in channel catfish. Channel catfish muscle gene expression profiles provide a valuable molecular muscle physiology blueprint for functional comparative genomics.
Lee, Sang Beum;Kim, Yong Soo;Yoon, Moongeun;Kim, Su-Kyoung;Jang, In Kwon;Lim, Hyun Jeong;Jin, Hyung-Joo
Journal of Marine Bioscience and Biotechnology
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v.2
no.4
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pp.224-229
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2007
Muscle tissue expresses many muscle-specific genes, including myostatin (also known as GDF8) that is a member of the transforming growth factor-beta superfamily. Myostatin (MSTN) negatively regulates mammalian skeletal muscle growth and development by inhibiting myoblast proliferation. Mice and cattle possessing mutant MSTN alleles display a 'double muscling' phenotype characterized by extreme skeletal muscle hypertrophy and/or hyperplasia. In this study, we first have characterized partial cDNA of a MSTN gene from the muscle tissue in the F. chinensis and examined its expression pattern in various tissues. The partial MSTN gene (GenBank accession number EU 131093) in the F. chinensis was 1134 bp, encoding for 377 amino acids that showed 63-93% amino acid similarity to other vertebrate MSTNs, containing a conserved proteolytic cleavage site (RXRR) and conserved cysteine residues in the C-terminus. Based on a RT-PCR, the MSTN gene was expressed in the all tissues of F. chinensis used in this study.
Porcine myostatin(MS1N) gene plays a key role in the differentiation of myoblast and muscle development. Genetic polymorphism was screened by single stranded conformation polymorphism(SSCP) analysis and subsequent DNA sequencing detected a nucleotide substitution(C2150T) in exon 3 of MSIN gene. Phenotypic association of the polymorphism was tested in a Landrace population and positive effects of the allele T for lean growth traits were found in the population. Even though it is not significant, the pigs have IT and TC genotypes were heavier for the body weight at birth and at twenty weeks of age than those containing genotype. Cc. However, the allele T was significantly associated with higher eye muscle area(P < 0.05). As a result of this study, we suggested that the allele T in exon 3 of MSTN gene comes a significant effect for increasing the eye muscle area without decreasing backfat thickness. This polymorphism did not change the amino acid but Taq I -RFLP matched to SSCP band patterns in exon 3 of MSTN gene, which will be an useful molecular marker for breeding of Landrace pigs.
Castration of male pig produces significant negative effects on skeletal muscle development. The androgen receptor (AR), two splice variants of insulin-like growth factor-I (IGF-I Ea and MGF) and the myostatin gene may play important roles in this process. In the present study, the expression of AR, IGF-I Ea, MGF and myostatin genes in three skeletal muscles, the brachialis, longissimus and semitendinosus, were studied using real-time quantitative RT-PCR. Our experimental design used 14 pairs of male Landrace sire${\times}$Yorkshire dam piglets. The two piglets in each pair were full sibs, one of which was castrated at 21 d of age; the other remained intact. The study group was divided into subgroups of equal size. Animals in the first subgroup were slaughtered at 147 d and those of the second at 210 d of age. Carcass weight and lean meat yield were similar between boars and barrows at 147 d of age (p>0.05), whereas barrows had lower carcass weight and less lean meat yield at 210 d of age (p<0.05). Castration caused down-regulation of AR gene expression at both 147 and 210 d of age (p<0.05). The two splice variants of the IGF-I gene from porcine skeletal muscle were cloned using RT-PCR, and it was found that MGF differs from IGF-I Ea in having a 52-base insert in the last coding exon of the mRNA. Both splice variants were down-regulated by castration only at 210 d of age (p<0.05). No differences in expression of the myostatin gene were observed between boars and barrows at either 147 or 210 d of age (p>0.05). These results suggest that the downregulation of AR, IGF-I Ea and MGF gene expression following castration helps to explain the negative effect of castration on skeletal muscle development.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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