• 제목/요약/키워드: Multiplexed detection

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양자점 기반 다중 바이오마커 검출법의 연구동향 (Recent Progress in Multiplexed Detection of Biomarkers Based on Quantum Dots)

  • 김예린;최유림;김봉근;나현빈
    • 공업화학
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    • 제33권5호
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    • pp.451-458
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    • 2022
  • 반도체 양자점은 우수한 형광 특성을 가진 광학 탐침자로 생명-의학 영상화 기술 및 바이오센싱 분야에서 광범위하게 활용되고 있다. 양자점은 넓은 광흡수 에너지띠, 좁은 형광 에너지띠와 같은 광학 특성을 가지므로 서로 다른 형광 파장을 지닌 양자점을 조합해 다종의 신호를 생성할 수 있도록 구성하면 복수의 바이오마커를 동시에 검출할 수 있다. 본 총설에서는 이와 같은 다중 검출 분석법에서의 양자점 및 이에 기반한 양자점 나노비드가 가지는 장점과 활용 사례를 기술하고 다중 형광 바이오마커 검출법의 최근 개발 동향 및 개선사항을 요약 정리하였다. 특히 양자점을 활용한 형광-결합 면역흡착 분석법, 양자점 나노비드를 이용한 면역크로마토그래피 분석법 등 면역 분석법에서의 신호 전환 소재 디자인을 중심으로 최근의 연구 결과를 검토하였다. 정확성과 민감도가 우수한 다중 바이오마커 검출 기술이 확보된 데이터를 처리하고 해석하는 인공지능 알고리즘과 결합될 경우 질병의 조기 진단을 포함한 다양한 분야에 활용가능한 새로운 검출 플랫폼의 개발로 이어질 것으로 기대된다.

광 인터리버를 이용한 부반송파 다중화된 광 레이블 검출 (Detection of Subcarrier-Multiplexed Optical Label Using Optical interleave)

  • 신종덕;이문환;김부균
    • 한국통신학회논문지
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    • 제29권12A호
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    • pp.1279-1284
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    • 2004
  • 본 논문에서는 광 인터리버를 이용하여 부반송파 다중화 (subcarrier multiplexed; SCM)된 레이블을 광학적인 방법으로 검출할 수 있는 새롭고 간단한 광 레이블 검출 기술을 제안하였다. 광 레이블 검출기로 사용한 광 인터리버의 통과포트 (through-pass per)로는 부반송파가 억압되어 기저대 패킷 신호만 출력되며, 광 부반송파 추출포트 (optical SCM extaction port)에서는 기저대 패킷 신호가 억압되기 때문에 부반송파에 실린 레이블만 출력된다. 제안된 구조는 종래의 광 레이블 검출기 구조들에 반드시 필요한 광 서큘레이터를 사용하지 않기 때문에 삽입 손실이 작아 파워 페널티가 낮고 광 인터리버의 주기적인 전달함수 특성 때문에 파장 다중화된 입력 신호로부터 다수 개의 부반송파 채널들을 동시에 추출할 수 있다. 10-GHz SCM 광 레이블 검출기를 제작하여 155-Mb/s ASK변조된 9.79-GHz 부반송파 신호를 성공적으로 검출하였으며, 광 스펙트럼과 BER 측정을 통해 이를 확인하였다.

Multiplexed DNA Detection with DNA-Functionalized Silver and Silver/Gold Nanoparticle Superstructure Probes

  • Kim, Ji-Young;Lee, Jae-Seung
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제33권1호
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    • pp.221-226
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    • 2012
  • DNA-functionalized silver and silver/gold bimetallic nanoparticle superstructure probes with controllable sizes and optical properties are synthesized using monothiol DNA and dithiothreitol. The superstructures exhibit a very narrow size distribution, which can be easily controlled by balancing the ratio of dithiothreitol and DNA. These superstructures assemble reversibly in a highly cooperative manner, and are SERS active. Multiplexed colorimetric detection of DNA targets using these superstructure probes has been demonstrated to identify three different DNA target sequences that are associated with three lethal diseases, respectively.

Application of Engineered Zinc Finger Proteins Immobilized on Paramagnetic Beads for Multiplexed Detection of Pathogenic DNA

  • Shim, Jiyoung;Williams, Langley;Kim, Dohyun;Ko, Kisung;Kim, Moon-Soo
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제31권9호
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    • pp.1323-1329
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    • 2021
  • Micro-scale magnetic beads are widely used for isolation of proteins, DNA, and cells, leading to the development of in vitro diagnostics. Efficient isolation of target biomolecules is one of the keys to developing a simple and rapid point-of-care diagnostic. A zinc finger protein (ZFP) is a double-stranded (ds) DNA-binding domain, providing a useful scaffold for direct reading of the sequence information. Here, we utilized two engineered ZFPs (Stx2-268 and SEB-435) to detect the Shiga toxin (stx2) gene and the staphylococcal enterotoxin B (seb) gene present in foodborne pathogens, Escherichia coli O157 and Staphylococcus aureus, respectively. Engineered ZFPs are immobilized on a paramagnetic bead as a detection platform to efficiently isolate the target dsDNA-ZFP bound complex. The small paramagnetic beads provide a high surface area to volume ratio, allowing more ZFPs to be immobilized on the beads, which leads to increased target DNA detection. The fluorescence signal was measured upon ZFP binding to fluorophore-labeled target dsDNA. In this study, our system provided a detection limit of ≤ 60 fmol and demonstrated high specificity with multiplexing capability, suggesting a potential for development into a simple and reliable diagnostic for detecting multiple pathogens without target amplification.

Detection of Rifampicin- and Isoniazid-Resistant Mycobacterium tuberculosis Using the Quantamatrix Multiplexed Assay Platform System

  • Wang, Hye-young;Uh, Young;Kim, Seoyong;Cho, Eunjin;Lee, Jong Seok;Lee, Hyeyoung
    • Annals of Laboratory Medicine
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    • 제38권6호
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    • pp.569-577
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    • 2018
  • Background: The increasing prevalence of drug-resistant tuberculosis (TB) infection represents a global public health emergency. We evaluated the usefulness of a newly developed multiplexed, bead-based bioassay (Quantamatrix Multiplexed Assay Platform [QMAP], QuantaMatrix, Seoul, Korea) to rapidly identify the Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) and detect rifampicin (RIF) and isoniazid (INH) resistance-associated mutations. Methods: A total of 200 clinical isolates from respiratory samples were used. Phenotypic anti-TB drug susceptibility testing (DST) results were compared with those of the QMAP system, reverse blot hybridization (REBA) MTB-MDR assay, and gene sequencing analysis. Results: Compared with the phenotypic DST results, the sensitivity and specificity of the QMAP system were 96.4% (106/110; 95% confidence interval [CI] 0.9072-0.9888) and 80.0% (72/90; 95% CI 0.7052-0.8705), respectively, for RIF resistance and 75.0% (108/144; 95% CI 0.6731-0.8139) and 96.4% (54/56; 95% CI 0.8718-0.9972), respectively, for INH resistance. The agreement rates between the QMAP system and REBA MTB-MDR assay for RIF and INH resistance detection were 97.6% (121/124; 95% CI 0.9282-0.9949) and 99.1% (109/110; 95% CI 0.9453-1.0000), respectively. Comparison between the QMAP system and gene sequencing analysis showed an overall agreement of 100% for RIF resistance (110/110; 95% CI 0.9711-1.0000) and INH resistance (124/124; 95% CI 0.9743-1.0000). Conclusions: The QMAP system may serve as a useful screening method for identifying and accurately discriminating MTBC from non-tuberculous mycobacteria, as well as determining RIF- and INH-resistant MTB strains.

공간다중화 MIMO 시스템을 위한 Soft Output 성능향상 기법 (A Soft Output Enhancement Technique for Spatially Multiplexed MIMO Systems)

  • 김진민;임태호;김재권;이주현;조용수
    • 한국통신학회논문지
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    • 제33권9C호
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    • pp.734-742
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    • 2008
  • 무선통신 채널에서 높은 전송 속도를 가능하게 하는 공간다중화 MIMO 시스템에서 다중화된 신호를 검출하는 것은 어려운 작업이며, 최근 다양한 신호검출 기법들이 개발되었다. 다양한 신호검출기법 중 maximum likelihood detection with QR decomposition and M-algorithm (QRM-MLD), sphere decoding (SD), QOC, MOC와 같은 기법들은 maximum liklihood (ha)기법과 유사한 경판정 달성한다. 그러나 일반적으로 이러한 기법들은 soft output의 신뢰도가 저하되는 문제점을 가진다. 본 논문에서는 기존 신호검출기법들의 soft output 신뢰도를 향상시키는 기법을 제안한다. 모의실험을 통하여 기존의 기법들과 결합시 제안된 방법에 의해 개선된 성능을 얻을 수 있음을 보인다.

공간다중화 방식을 사용하는 다중 안테나 시스템을 위한 감소된 계산량의 QRM-MLD 신호검출기법 (A Reduced Complexity QRM-MLD for Spatially Multiplexed MIMO Systems)

  • 임태호;김재권;조용수
    • 한국통신학회논문지
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    • 제32권1C호
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    • pp.43-50
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    • 2007
  • 본 논문에서는 공간다중화 방식을 사용하는 MIMO(Multiple Input Multiple Output)시스템을 위한 수신부 신호 검출기법인 QRM-MLD (Maximum Likelihood Detection with QR Decomposition and M-algorithm)를 다룬다. 최근 산업현장에서는 차세대 이동통신에서 요구되는 보행자 속도로 움직이는 환경에서 1Gbps를 달성하기 위해 $4{\times}4$ MIMO 시스템에 QRM-MLD기법을 사용하여 1Gbps 전송속도의 testbed를 구현하였다. 본 논문에서는 QRM-MLB기법과 동일한 오류성능을 가지지만 계산량을 현격하게 줄이는 새로운 reduced complexity QRM-MLD기법을 제안한다. 두 가지 방식의 계산량을 엄밀하게 비교하여 계산량 감소정도를 정량적으로 표현하고 모의실험을 통해 제안된 방식이 기존의 방식과 동일한 오류성능을 보임을 확인한다.

공간다중화 MIMO 시스템을 위한 효율적 계산량의 신호검출 기법 (A Computationally Efficient Signal Detection Method for Spatially Multiplexed MIMO Systems)

  • 임태호;김재권;이주현;윤상보;조용수
    • 한국통신학회논문지
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    • 제32권7C호
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    • pp.616-626
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    • 2007
  • 무선통신 채널에서 높은 전송 속도를 가능하게 하는 공간다중화 MIMO 시스템 수신부에서 다중화된 신호를 검출하는 것은 어려운 작업이며, 최근 다양한 신호검출 기법들이 개발되어졌다. 다양한 신호검출 기법 중 maximum likelihood detection with QR decomposition and M-algorithm (QRM-MLD), sphere decoding (SD)과 같은 기존 기법들은 maximum likelihood (ML)기법과 유사한 성능을 가진 것으로 보고되었다. 본 논문에서는 ML 기법과 거의 동일한 성능을 가지면서 낮은 연산복잡도를 보이는 새로운 신호검출 기법을 제안한다. 모의실험을 통하여 제안된 기법은 ML 기법과 거의 동일한 성능을 보이면서 MMSE-OSIC와 유사한 연산복잡도를 가지는 것을 보인다. 또한 기존의 QRM-MLD, SD 기법들의 경우 hard decision 후 추가적인 연산을 통해 soft decision을 위한 log likelihood ratio(LLR) 값을 생성하는 반면, 제안된 기법에서는 추가적인 연산 없이 LLR 값을 성공적으로 생성할 수 있음을 보인다.

공간다중화 MIMO 시스템을 위한 높은 신뢰도의 연판정 값 발생방법 (A Novel Soft Output Generation Method for Spatially Multiplexed MIMO Systems)

  • 허훈;우현명;방승재;박윤옥;김재권
    • 한국통신학회논문지
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    • 제33권4A호
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    • pp.394-402
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    • 2008
  • 본 논문에서는 공간다중화 방식을 사용하는 다중 안테나 시스템의 수신부를 위한 연판정 값 발생방식을 제안한다. 공간 다중화 MIMO 시스템의 수신기술의 복잡도는 일반적으로 생성하는 후보벡터의 수에 비례하여 증가한다. 모든 송신 가능한 벡터를 후보벡터로 하는 ML 신호검출 기법은 신뢰도가 높은 연판정 값을 발생하여 우수한 성능을 달성하나 연산복잡도가 매우 높다. 반면 적은 수의 후보벡터를 발생하여 낮은 복잡도를 갖는 검출기법은 연판정 값의 신뢰도가 저하되는 단점을 갖는다. 본 논문에서는 적은 수의 후보벡터만 가용할 때, 연판정 값의 신뢰도를 향상시키는 방법을 제안한다.