Aggregation behavior of three kinds of benzindocarbocyanine dyes in aqueous methanol solution was studied by UV-Vis absorption spectrum. The results indicated that the three dyes all existed monomer-dimer equilibrium in aqueous methanol solution (concentration range $10^{−5}\;to\;10^{−6}$ M) at 25.0$\sim$41.0 ${^{\circ}C}$ for Dye 1, 28.0$\sim$49.0 ${^{\circ}C}$ for Dye 2 and 26.0$\sim$47.0 ${^{\circ}C}$ for Dye 3. The fundamental property of the three dyes as the dimeric association constant KD, the dimeric free energy ${\Delta$}G_D, the dimeric entropy ${\Delta$}S_D, and the dimeric enthalpy ${\Delta$}H_D were determined. The ${\Delta$}H_D of three dyes: Dye 1, Dye 2 and Dye 3 was -42.5, -15.1 and -18.9 kJ/mol, respectively. The experimental observations were the subject of a theoretical study including the ground-state geometries which were fully optimized using DFT at B3LYP/6-31G level. The effect of dye molecule structure on ${\Delta$}H_D was discussed by theoretical calculations.
As a member of a subclass of immunophilins, it is controversial that FKBP38 acts an upstream regulator of mTOR signaling pathway, which control the process of cell-growth, proliferation and differentiation. In order to explore the relationship between FKBP38 and mTOR in the Cashmere goat (Capra hircus) cells, a full-length cDNA was cloned (GenBank accession number JF714970) and expression pattern was analyzed. The cloned FKBP38 gene is 1,248 bp in length, containing an open reading frame (ORF) from nucleotide 13 to 1,248 which encodes 411 amino acids, and 12 nucleotides in front of the initiation codon. The full cDNA sequence shares 98% identity with cattle, 94% with horse and 90% with human. The putative amino acid sequence shows the higher homology which is 98%, 97% and 94%, correspondingly. The bioinformatics analysis showed that FKBP38 contained a FKBP_C domain, two TPR domains and a TM domain. Psite analysis suggested that the ORF encoding protein contained a leucine-zipper pattern and a Prenyl group binding site (CAAX box). Tissue-specific expression analysis was performed by semi-quantitative RT-PCR and showed that the FKBP38 expression was detected in all the tested tissues and the highest level of mRNA accumulation was detected in testis, suggesting that FKBP38 plays an important role in goat cells.
Xiong, Qi;Deng, Chang-Yan;Chai, Jin;Jiang, Si-Wen;Xiong, Yuan-Zhu;Li, Feng-E;Zheng, Rong
BMB Reports
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v.42
no.2
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pp.119-124
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2009
PI(3,4,5)$P_3$ produced by the activated PI3-kinase is a key lipid second messenger in cell signaling downstream of insulin. Skeletal muscle and kidney-enriched inositol phosphatase (SKIP) identified as a 5'-inositol phosphatase that hydrolyzes PI(3,4,5) $P_3$ to PI(3,4)$P_2$, negatively regulates the insulin-induced glycogen synthesis in skeletal muscle. However the mechanism by which this occurs remains unclear. To elucidate the function of SKIP in glycogen synthesis, we employed RNAi techniques to knockdown the SKIP gene in differentiating C2C12 myoblasts. Insulininduced phosphorylation of Akt (protein kinase B) and GSK-3$\beta$ (Glycogen synthase kinase), subsequent dephosphorylation of glycogen synthase and glycogen synthesis were increased by inhibiting the expression of SKIP, whereas the insulin-induced glycogen synthesis was decreased by overexpression of WT-SKIP. Our results suggest that SKIP plays a negative regulatory role in Akt/ GSK-3$\beta$/GS (glycogen synthase) pathway leading to glycogen synthesis in myocytes.
The europium sorption on Tamusu clay was investigated by batch sorption experiments and spectroscopic study under the condition of strong ionic strength. The results demonstrated that europium sorption on Tamusu clay increased rapidly with pH value, but decreased with the ionic strength of solution increased. The europium sorption also increased in the presence of humic acid, especially at low pH value. The sorption could be fitted by Freundlich isotherm model and the europium sorption on clay was spontaneous and endothermic reaction. Besides, the result indicates that ion exchange was the main process at low pH value, while inner-sphere surface complexation dominated the sorption process at high pH value. The Backscatter electron scanning/Energy Dispersive Spectrometer(BSE/EDS) and the effect of Na for europium sorption results further suggested that europium sorption on Tamusu clay mainly competed with Na at low pH value. Overall, the results in this research were of significance to understand the sorption behavior of europium on the geological media under high ionic strength.
Preservation of fresh algae plays an important role in algae seed subculture and aquaculture. The determination and examination of the changes of cell viability, composition, and bacterial species during storage would help to take suitable preservation methods to prolong the preservation time of fresh algae. Nostoc flagelliforme is a kind of edible cyanobacterium with important herbal and dietary values. This article investigated the changes of bacterial species and biochemical characteristics of fresh N. flagelliforme concentrate during natural storage. It was found that the viability of cells decreased along with the storage time. Fourteen bacteria strains in the algae concentrate were identified by PCR-DGGE and were grouped into four phyla, including Cyanobacteria, Firmicutes, Proteobacteria, and Bacteroidetes. Among them, Enterococcus viikkiensis may be a concern in the preservation. Eleven volatile organic compounds were identified from N. flagelliforme cells, in which geosmin could be treated as an indicator of the freshness of N. flagelliforme. The occurrence of indole compound may be an indicator of the degradation of cells.
Novel soluble triazoleimide oligomers terminated with arylacetylene terminated were synthesized by the Cu(I)-catalysed 1,3-dipolar cycloaddition polymerization of diazides and imide-containing dialkyne. Several molecular weight triazoleimide oligomers were prepared from diazide and dialkyne monomers with different stoichiometric combinations. The curing behaviors of the oligomers were tested by differential scanning calorimetry (DSC). The thermal properties of the cured products were evaluated by DSC and thermogravimetric analysis (TGA). These cured oligomers showed the glass transition temperature of about $225-235^{\circ}C$ and the decomposition temperature (at 5% weight loss) of about $385-393^{\circ}C$ in nitrogen.
The reliability of reinforced concrete structures is frequently compromised by the deterioration caused by reinforcement corrosion. Evaluating the effect caused by reinforcement corrosion on structural behaviour of corrosion damaged concrete structures is essential for effective and reliable infrastructure management. In lifecycle management of corrosion affected reinforced concrete structures, it is difficult to correctly assess the lifecycle performance due to the uncertainties associated with structural resistance deterioration. This paper presents a stochastic deterioration modelling approach to evaluate the performance deterioration of corroded concrete structures during their service life. The flexural strength deterioration is analytically predicted on the basis of bond strength evolution caused by reinforcement corrosion, which is examined by the experimental and field data available. An assessment criterion is defined to evaluate the flexural strength deterioration for the time-dependent reliability analysis. The results from the worked examples show that the proposed approach is capable of evaluating the structural reliability of corrosion damaged concrete structures.
In this paper, we propose a new implementation of a failure detector. The implementation uses a dual model of heartbeat and interaction. First, the heartbeat model is adopted to shorten the detection time, if the detection process does not receive the heartbeat message in the expected time. The interaction model is then used to check the process further. The expected time is calculated using the exponential smoothing method. Exponential smoothing can be used to estimate the next arrival time not only in the random data, but also in the data of linear trends. It is proven that the new detector in the paper can eventually be a perfect detector.
Four-and-a-half LIM-only protein 3 (FHL3) is a member of the LIM protein superfamily and can participate in mediating protein-protein interaction by binding one another through their LIM domains. In this study, the 5'- and 3'- cDNA ends were characterized by RACE (Rapid Amplification of the cDNA Ends) methodology in combination with in silico cloning based on the partial cDNA sequence obtained. Bioinformatics analysis showed FHL3 protein contained four LIM domains and four LIM zinc-binding domains. In silico mapping assigned this gene to the gene cluster MTF1-INPP5B-SF3A3-FHL3-CGI-94 on pig chromosome 6 where several QTL affecting intramuscular fat and eye muscle area had previously been identified. Transcription of the FHL3 gene was detected in spleen, liver, kidney, small intestine, skeletal muscle, fat and stomach, with the greatest expression in skeletal muscle. The A/G polymorphism in exon II was significantly associated with birth weight, average daily gain before weaning, drip loss rate, water holding capacity and intramuscular fat in a Landrace-derived pig population. Together, the present study provided the useful information for further studies to determine the roles of FHL3 gene in the regulation of skeletal muscle cell growth and differentiation in pigs.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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