• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제12권2호
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• pp.306-311
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• 2002

O-linked N-acetylglucosamine (O-GlcNAc) is an abundant posttranslationally modified compound in eukaryotic cells. Human O-GlcNAc transferase (OGT) was produced as a maltose binding protein (MBP) fusion protein, which showed significant catalytic activity to modify recombinant Sp1, transcription factor. To facilitate the production of O-GlcNAc modified proteins, instead of using the tedious in vitro glycosylation reaction or expression in eukaryotic cells, a MBP-fusion OGT expression vector (pACYC184-MBPOGT) was constructed using pACYC184 plasmid, which could coexist with general prokaryotic expression vectors containing ColE1 origin. By cotransforming pACYC184-MBPOGT and pGEX-2T vectors into Escherichia coli BL21, intracellular O- GlcNAcylated proteins could be obtained by a simple purification procedure. It is expected that this may be a useful tool for production of O-GlcNAc modified proteins.

• 정보와 통신
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• 제24권3호
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• pp.87-96
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• 2007

HSPA는 HSDPA 및 HSUPA를 통합하여 일컫는 3GPP 기술로 하향 링크에서는 HSDPA를 상향 링크에서는 HSUPA를 사용하여 기존 DCH만을 사용하는 3GPP Release 99 시스템 대비 더 효율적인 고속 멀티미디어 서비스를 제공하는 기술이다. HSDPA는 3GPP Release 5 기술로서 2002년 3월 첫 표준이 승인되었으며 단말의 무선 환경에 따라 변조 및 코딩기법을 변화시키는 AMC, 물리 계층을 통해 빠른 재전송을 지원하는 HARQ,단축된 2ms TTI 그리고 Node-B 기반의 고속 스케줄링을 통해 무선망 성능을 획기적으로 향상시켜 하향 링크에서 최대 14.4Mbps를 제공한다. HSUPA는 3GPP Release 6 기술로서 2004년 6월 첫 표준이 승인되었으며 HSDPA에 도입한 기술들 중에서 AMC를 제외한 모든 기술을 적용하여 상향 링크에서 최대 5.76Mbps를 제공한다. HSPA Evolution(eHSPA 또는 HSPA+)은 HSPA의 성능 개선을 통해 3GPP Release 8 기술인 LTE로의 자연스러운 진화를 보장하기 위한 3GPP Release 7 기술로 2006년 3월 TSG RAN #31 회의에서 승인되었다. 본 고에서는 최근 표준화가 활발히 진행되고 있는 HSPA Evolution에서 최근까지 승인된 각 계층별 요소 기술에 대해 소개하고자 한다.

• 정보처리학회논문지C
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• 제8C권3호
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• pp.277-286
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• 2001

본 논문에서는 미국 국립표준기술연구소 차세대 표준 암호 알고리듬으로 선정한 Rijndael 암호 알고리듬과 안정성과 성능에서 인정을 받은 Twofish 암호 알고리듬을 ALTERA FPGA를 사용하여 하드웨어로 구현한다. 두가지 알고리듬에 대해 키스케쥴링과 인터페이스를 하드웨어에 포함시켜 구현한다. 알고리듬의 효율적인 동작을 위해 키스케쥴링을 포함하면서도 구현된 회로의 크기가 크게 증가하지 않으며, 데이터의 암호/복호화 처리 속도가 향상됨을 알 수 있다. 주어진 128-비트 대칭키에 대하여, 구현된 Rijndael 암호 알고리듬은 11개의 클럭 만에 키스케쥴링을 완료하며, 구현된 Twofish 암호 알고리듬은 21개의 클럭 만에 키스케쥴링을 완료한다. 128-비트 입력 데이터가 주어졌을 때, Rijndael의 경우, 10개의 클럭 만에 주어진 데이터의 암호/복호화를 수행하고, Twofish는 16개의 클럭 만에 암호/복호화를 수행한다. 또한, Rijndael은 336.8Mbps의 데이터 처리속도를 보이고, Twofish는 121.2Mbps의 성능을 보임을 알 수 있다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제18권4호
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• pp.428-432
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• 1997

The dephosphorylation specificity of protein phosphatase 2A (PP2A), calcineurin (PP2B) and protein phosphatase 2C (PP2C) were studied in vitro using myelin basic protein (MBP) as a model substrate which was fully phosphorylated at multiple sites by protein kinase C (PKC) or cyclic AMP-dependent protein kinase (PKA). In order to determine the site specificity of phosphates in myelin basic protein, the protein was digested with trypsin and the radioactive phosphopeptide fragments were isolated by high performance liquid chromatography (HPLC) on reversed-phase column. Subsequent analysis and/or sequential manual Edman degradation of the purified phosphopeptides revealed that Thr-65 and Ser-115 were most extensively phophorylated by PKA and Ser-55 by PKC. For the dephosphorylation kinetics, the phosphorylated MBP was treated with calcineurin or PP2C with various time intervals and the reaction was terminated by direct tryptic digest. Both Thr-65 and Ser-115 residues were dephosphorylated more rapidly than any other ones by phosphatases. However it can be differentiated further by first-order kinetics that the PP2B dephosphorylated both Thr-65 and Ser-115 with almost same manner, whereas PP2C dephosphorylated somewhat preferentially the Ser-115.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제34권9호
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• pp.1926-1932
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• 2024

Human papillomavirus (HPV) L1 capsid protein were produced in several host systems, but few studies have focused on enhancing the properties of the L1 protein. In this study, we aimed to produce recombinant Human papillomavirus (HPV) L1 capsid protein containing para-azido-L-phenylalanine (pAzF) in Escherichia coli. First, we expressed the maltose-binding protein (MBP)-fused HPV16 L1, and 5 residues in HPV16 L1 protein were selected by the in silico modeling for amber codon substitution. Among the variants of the five locations, we identified a candidate that exhibited significant differences in expression with and without pAzF via genetic code expansion (GCE). The expressed recombinant MBP-HPV16L1 protein was confirmed for incorporation of pAzF and the formation of VLPs was tested in vitro.

• 한국동물학회:학술대회논문집
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• 한국동물학회 1995년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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• pp.296.2-296
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• 1995

• BMB Reports
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• 제29권2호
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• pp.175-179
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• 1996

Viral surface proteins are known to play an essential role in attachment of the virus particle to the host cell membrane. In case of the hepatitis B virus (HBV) several reports have described potential receptors on the target cell side, but no definite receptor protein has been isolated yet. As for the viral side, it has been suggested that the preS region of the envelope protein, especially the preS1 region, is involved in binding of HBV to the host cell. In this study, preS1 region was recombinantly expressed in the form of a maltose binding protein (MBP) fusion protein and used to identify and visualize the expression of putative HBV receptor(s) on the host cell. Using laser scanned confocal microscopy and by FACS analysis, MBP-preS1 proteins were shown to bind to the human hepatoma cell line HepG2 in a receptor-ligand specific manner. The binding kinetic of MBP-preS1 to its cellular receptor was shown to be temperature and time dependent. In cells permeabilized with Triton X-100 and treated with the fusion protein, a specific staining of the nuclear membrane could be observed. To determine the precise location of the receptor binding site within the preS1 region, several short overlapping peptides from this region were synthesized and used in a competition assay. In this way the receptor binding epitope in preS1 was revealed to be amino acid residues 27 to 51, which is in agreement with previous reports. These results confirm the significance of the preS1 region in virus attachment in general, and suggest an internalization pathway mediated by direct attachment of the viral particle to the target cell membrane.

• 전기전자학회논문지
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• 제22권2호
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• pp.233-241
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• 2018

블록암호 알고리듬 ARIA, AES를 기반으로 GCM (Galois/Counter Mode) 인증암호를 지원하는 암호 프로세서를 경량화 구현하였다. 설계된 암호 프로세서는 블록암호를 위한 128 비트, 256 비트의 두 가지 키 길이와 5가지의 기밀성 운영모드 (ECB, CBC, OFB, CFB, CTR)도 지원한다. 알고리듬 특성을 기반으로 ARIA와 AES를 단일 하드웨어로 통합하여 구현하였으며, CTR 암호연산과 GHASH 연산의 효율적인 동시 처리를 위해 $128{\times}12$ 비트의 부분 병렬 GF (Galois field) 곱셈기를 적용하여 전체적인 성능 최적화를 이루었다. ARIA/AES-GCM 인증암호 프로세서를 FPGA로 구현하여 하드웨어 동작을 확인하였으며, 180 nm CMOS 셀 라이브러리로 합성한 결과 60,800 GE로 구현되었다. 최대 동작 주파수 95 MHz에서 키 길이에 따라 AES 블록암호는 1,105 Mbps와 810 Mbps, ARIA 블록암호는 935 Mbps와 715 Mbps, 그리고 GCM 인증암호는 138~184 Mbps의 성능을 갖는 것으로 평가되었다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제37권2호
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• pp.153-165
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• 2010

Brassica rapa is considered an ideal candidate to act as a reference species for Brassica genomic studies. Among the three basic Brassica species, B. rapa (AA genome) has the smallest genome (529 Mbp), compared to B. nigra (BB genome, 632 Mbp) and B. oleracea (CC genome, 696 Mbp). There is also a large collection of available cultivars of B. rapa, as well as a broad array of B. rapa genomic resources available. Under international consensus, various genomic studies on B. rapa have been conducted, including the construction of a physical map based on 22.5X genome coverage, end sequencing of 146,000 BACs, sequencing of >150,000 expressed sequence tags, and successful phase 2 shotgun sequencing of 589 euchromatic region-tiling BACs based on comparative positioning with the Arabidopsis genome. These sequenced BACs mapped onto the B. rapa genome provide beginning points for genome sequencing of each chromosome. Applying this strategy, all of the 10 chromosomes of B. rapa have been assigned to the sequencing centers in seven countries, Korea, UK, China, India, Canada, Australia, and Japan. The two longest chromosomes, A3 and A9, have been sequenced except for several gaps, by NAAS in Korea. Meanwhile a China group, including IVF and BGI, performed whole genome sequencing with Illumina system. These Sanger and NGS sequence data will be integrated to assemble a draft sequence of B. rapa. The imminent B. rapa genome sequence offers novel insights into the organization and evolution of the Brassica genome. In parallel, the transfer of knowledge from B. rapa to other Brassica crops would be expected.

• 한국컴퓨터정보학회논문지
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• 제8권2호
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• pp.112-121
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• 2003

정보보호 및 암호기술은 If산업과 더불어 매우 많은 발전을 이룩하였지만 실시간 처리 및 비화성 유지 등은 아직도 해결해야 하는 문제점이다. 그러므로 본 논문에서는 표준화된 AES인 Rijndael에 대하여 비도 증가 및 처리율 증가를 위한 새로운 PRN-SEED 암호알고리즘을 제안하였으며 Rijndael 및 다른 AES와 비교하여 성능분석을 수행하였다. PRN-SEED 암호알고리즘의 구현은 Synopsys Design Analyser Ver. 1999. 10과 삼성 KG75 library 그리고 Synopsys VHDL Debegger를 사용하였다. 모의실험 결과, 대칭형 암호시스템인 DES는 동작주파수가 4MHz일 경우 416Mbps의 처리율을 가지며 Rijndael 암호시스템은 동작주파수가 50MHz일 경우 612Mbps의 처리율을 가진다. PRN-SEED 암호시스템의 전체 게이트 수는 10K이며 동작주파수가 40MHz일 때 128 비트에 대한 처리율은 430Mbps, 50MHz일 때 128비트에 대한 처리율은 630Mbps였다.