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유전알고리즘을 이용한 WASP7 모형의 보정과 상수원 저수지에 대한 적용 (Calibration of WASP7 Model using a Genetic Algorithm and Application to a Drinking Water Resource Reservoir)

  • 배상목;조재현
    • 환경영향평가
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    • 제23권6호
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    • pp.432-444
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    • 2014
  • 수동보정으로 수질모델링을 수행할 때는 연구자의 주관이 개입되어 해당 연구의 객관성에 영향을 줄 소지가 있기 때문에 자동보정에 관심을 갖게 된다. 본 연구에서는 WASP7 모형의 수질 매개변수 보정을 위해서 유전알고리즘과 영향계수법을 적용하였다. 이 방법에서는 대상 호수의 BOD, DO, 인, 질소, 식물성플랑크톤에 큰 영향을 미치는 매개변수를 대상으로 최적 수질 매개변수를 산정한다. 성층현상이 일어나는 대상 호수의 수온과 수리적 특성을 정확하게 계산하기 위해 3차원 수리모형인 EFDC를 적용하였고, 이 모형의 결과는 본 연구에서 이용한 호수수질모형인 WASP7 모형과 연동해서 적용되었다. EFDC와 WASP7의 적용을 위해 동일한 격자망을 구성하였다. WASP7의 보정결과 5개 보정 대상 수질변수 중에서 DO, TN, CBOD에 대한 실측치와 계산치의 상대오차제곱합은 비교적 적었다. 따라서 이 세가지 수질에 대한 보정은 적절히 수행되었으나, TP와 Chl-a에 대한 보정결과는 비교적 정확도가 낮았다.

재실자의 수면-각성 주기에 따른 스마트폰 기반 파장제어 LED 조명시스템 (Smartphone-based Wavelength Control LED Lighting System according to the Sleep-Wake Cycle of Occupants)

  • 김양수;권숙연;황준;임재현
    • 인터넷정보학회논문지
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    • 제17권1호
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    • pp.35-45
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    • 2016
  • 인간의 생체리듬 조절에 관여하는 멜라토닌 호르몬은 빛의 특정 단파장 비율에 따라 민감하게 반응한다. 단파장 비율이 고정된 기존 조명 빛은 재실자 생체리듬 교란 및 수면장애 현상을 초래한다. 특히 교대근무자의 경우, 일정치 않은 근무시간과 항시 동일한 빛 환경으로 인해 생활패턴이 불규칙적으로 변화하여 집중력 저하로 사고 발생의 위험도가 높아지거나 퇴근 이후 숙면을 취하지 못하는 등 건강한 일상생활을 유지하는 데 부정적 영향을 초래한다. 본 논문에서는 교대근무자를 대상으로 근무 또는 퇴근 시점에 따라 각성 및 수면에 적합한 조명 빛을 손쉽게 계측 및 제어할 수 있는 스마트폰 기반의 파장 제어 가능한 LED 조명시스템을 제안한다. 먼저, LED 조명을 대상으로 조광제어비율에 따라 변화하는 조명 빛 특성을 스마트폰에 내장된 컬러센서 및 외부에 연동된 소형 스펙트로미터(Mini-Spectrometer)를 통해 계측한 후 데이터베이스에 저장하고, 저장된 광 특성 데이터를 기반으로 계측 모듈과 조명제어모듈을 구현한다. 교대근무자를 대상으로 시스템 처리 절차에 따라 '근무' 시간대에는 각성이 필요한 시점으로 파악하여 작업유형에 따라 분류한 목표조도를 고려하여 단파장 비율이 최대치인 제어비율로 서비스하고, '퇴근' 무렵에는 자연스럽게 수면 상태에 진입할 수 있도록 단파장 비율이 최소치인 제어비율로 조명 빛을 가변화한다.

Stenotrophomonas maltophilia KJ-2 균주로부터 얻은 PolyMG-specific 알긴산분해효소의 상동성 모델링 및 활성자리 연구 (Homology Modeling and Active Sites of PolyMG-specific Alginate Lyase from Stenotrophomonas maltophilia KJ-2)

  • 김희숙
    • 생명과학회지
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    • 제24권2호
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    • pp.128-136
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    • 2014
  • 알긴산은 ${\alpha}$-L-guluronic acid와 ${\beta}$-D-mannuronic acid가 (1-4) 결합한 선형 산성다당류이다. 알긴산은 다양한 알긴산 분해효소들에 의하여 분해되는데 ${\beta}$-제거반응으로 비환원 말단에 이중결합이 있는 불포화 우론산 올리고머가 생산된다. 본 연구실에서는 이전에 Stenotrophomonas maltophilia KJ-2로부터 새로운 구조를 가진 polyMG lyase를 재조합하였다. KJ-2 polyMG lyase의 단백질구조를 예측하기 위하여 상동성 모델링을 한 결과 Azotobacter vinelandii가 생산하는 세 종류의 polyMG lyase들이 모두 PL7 family에 속하는 반면 KJ-2 polyMG lyase는 PL6 family에 속하였다. 또한 $^1H$-NMR spectra를 분석한 결과 polyMG lyase는 M-${\beta}$(1-4)-G 당쇄결합을 분해하고 G-${\alpha}$(1-4)-M 결합은 거의 분해하지 못하는 것으로 나타났다. 예측된 polyMG lyase 모델을 기초로 하여 14군데 아미노산 잔기를 선택하였으며 17개의 돌연변이체를 만들어 알긴산 분해효소의 활성을 측정하였다. Lys220Ala, Arg241Ala, Arg241Lys및 Arg265Ala 돌연변이체들은 완전히 알긴산 분해효소의 활성을 잃었으며 Arg155Ala, Gly303Glu 및 Tyr304Phe 돌연변이체들의 분해활성은 19.1-39.3%까지 감소하였다. 이러한 결과들로부터 Arg155, Lys220, Arg241, Arg265, Gly303 및 Tyr304 들은 알긴산 분해효소의 촉매활성과 기질결합에 중요한 잔기들임을 알 수 있다.

순열 조합 이해 과제에서의 안구 운동 추적 연구 (Eye Movements in Understanding Combinatorial Problems)

  • 최인용;조한혁
    • 대한수학교육학회지:수학교육학연구
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    • 제26권4호
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    • pp.635-662
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    • 2016
  • 조합(combinatorics)은 확률적 사고의 기초가 되며 정보, 과학 등 타교과와 연계성이 높은 중요한 영역이지만, 학교 수학에서 학생들이 가장 어려워하는 단원 중 하나이다. 본 연구는 순열 조합 문제의 구조를 나타낼 수 있는 표현식을 도입하여, 문제를 표현식으로 변환하는 대학원생의 안구 운동을 분석함으로써 순열 조합 문장제의 이해 과정과 의미 구조에 따른 난이도 차이를 조사하였다. 연구 결과, 연구참여자들의 순열 조합 문장제 이해 전략은 문제에 대한 수학적 모델을 내적으로 직접 표상하는 전략과 보기에 주어진 표현식과 문제를 비교하여 답을 찾는 전략으로 분류할 수 있었다. 전문가 집단인 연구참여자들은 대상들의 구별성, 중복가능성, 의미 구조에 관한 단어나 수치 정보 등 문제의 핵심정보를 빠르게 파악하고 주의를 기울였다. 의미 구조의 변환이 필요한 문제를 풀 때 학생들은 문제의 핵심정보를 더 많이 보고, 보기의 표현식을 더 오래 응시하며, 문제와 보기 사이의 비교를 더 많이 하는 등 복잡한 인지 처리와 연관된 안구운동 지표가 나타났다. 안구 운동 데이터는 문제 이해 과정에서 연구참여자의 수학적 인지를 분석하는데 유의미한 정보를 제공하였다.

연령과 성별에 따른 정상 혈청 Gamma-glutamyltransferase와 관상동맥질환 위험인자와의 관계 (Relations between Normal Serum Gamma-glutamyltransferase and Risk Factors of Coronary Heart Diseases according to Age and Gender)

  • 권세영;나영악
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제48권1호
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    • pp.22-29
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    • 2016
  • 혈중 gamma-glutamyltransferase (GGT)는 지금까지 간기능장애와 대표적인 알코올 섭취 관련 지표로서 폭넓게 사용되어 왔다. 현재 다양한 질환과의 관련성이 밝혀지면서 그 관심이 커지고 있다. 본 연구에서는 고도의 음주군에 해당하는 대상자를 제외하고 GGT 수치가 정상 범위에 속하는 대상자들에서 GGT 수치에 따른 관상동맥 질환 위험 요인과의 관련성을 살펴보고, 연령과 성별에 따른 특성을 비교 검토 하였다. 분석 자료는 2011 국민건강영양조사 데이터를 이용하였다(N=3,619). GGT(IU/L) 수준에 따라 사분위수(quartile) 네 군으로 나누었을 때 GGT기준은 남성의 경우 순서대로 10~20, 21~27, 28~38, 39~71 IU/L 이었고, 여성의 경우 각각 6~12, 13~16, 17~22, 23~42 IU/L 였다. 대부분의 변수에서 평균치는 GGT 4분위수로 갈수록 수치가 높게 나타났으나, 남성에서 연령과 저밀도콜레스테롤은 GGT 2분위수에서 수치가 가장 높았다. FRS와 10년 관상동맥 질환 위험도는 남성에서 GGT 2분위수에서 유의하게 높았고, 여성의 경우 GGT 4분위수에서 유의하게 높았다. 여성의 경우 GGT 수준이 높아질수록 연령이 증가하였으나, 남성의 경우 GGT 2분위수에서 가장 높았다. 연령 70대에서 남성의 경우 1,2분위수 분포가 가장 많고, 여성의 경우 3,4분위수 분포가 많아 그 차이가 뚜렷하게 나타났다. GGT 수치가 정상 범위에 속하더라도 GGT 수치가 증가함에 따라 여러 위험인자와 관련성이 있음을 증명하였다. 그러나 GGT 수치 증가와 함께 관상동맥질환 관련 수치와 10년 위험도 관련 예측치 증가에 대한 부분은 연령과 성별에 따라 서로 다른 양상을 보였다.

A gene expression database for the molecular pharmacology of cancer

  • Scherf, Uwe;Ross, Douglas-T.;Waltham, Mark;Smith, Lawrence-H.;Lee, Jae-K.;Tanbe, Lorraine;Kohn, Kurt-W.;Reinhold, William-C.;Mayers, Timothy-G.;Andrews, Darren-T.;Scudiero, Dominic-A.;Eisen, Michael-B.;Sausville, Edward-A.;Pommier, Yves;Botstein, David;Brown, Patrick-O.;Weinstein, John-N.
    • 한국생물정보학회:학술대회논문집
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    • 한국생물정보시스템생물학회 2001년도 제2회 생물정보학 국제심포지엄
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    • pp.129-137
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    • 2001
  • We used cDNA microarrays to assess gene expression profiles in 60 human cancer used in a drug discovery screen by the National Cancer Institute. Using these data, we linked bioinformatics and chemoinformatics by correlating gene expression and drug activity pattens in the NCI60 lines. Clustering the cell lines on the basis of gene expression yielded relationships very different from those obtained by clustering the cell lines on the basis of their response to drugs. Gene-drug relationships for the clinical agents 5-fluorouracil and L-asparaginase exemplify how variations in the transcript levels of particular genes relate to mechanisms of drug sensitivity and resistance. This is the first study to intergrate large databases on gene expression and molecular pharmacology.

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Rheology of concentrated xanthan gum solutions: Oscillatory shear flow behavior

  • Song Ki-Won;Kuk Hoa-Youn;Chang Gap-Shik
    • Korea-Australia Rheology Journal
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    • 제18권2호
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    • pp.67-81
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    • 2006
  • Using a strain-controlled rheometer, the dynamic viscoelastic properties of aqueous xanthan gum solutions with different concentrations were measured over a wide range of strain amplitudes and then the linear viscoelastic behavior in small amplitude oscillatory shear flow fields was investigated over a broad range of angular frequencies. In this article, both the strain amplitude and concentration dependencies of dynamic viscoelastic behavior were reported at full length from the experimental data obtained from strain-sweep tests. In addition, the linear viscoelastic behavior was explained in detail and the effects of angular frequency and concentration on this behavior were discussed using the well-known power-law type equations. Finally, a fractional derivative model originally developed by Ma and Barbosa-Canovas (1996) was employed to make a quantitative description of a linear viscoelastic behavior and then the applicability of this model was examined with a brief comment on its limitations. Main findings obtained from this study can be summarized as follows: (1) At strain amplitude range larger than 10%, the storage modulus shows a nonlinear strain-thinning behavior, indicating a decrease in storage modulus as an increase in strain amplitude. (2) At strain amplitude range larger than 80%, the loss modulus exhibits an exceptional nonlinear strain-overshoot behavior, indicating that the loss modulus is first increased up to a certain strain amplitude(${\gamma}_0{\approx}150%$) beyond which followed by a decrease in loss modulus with an increase in strain amplitude. (3) At sufficiently large strain amplitude range (${\gamma}_0>200%$), a viscous behavior becomes superior to an elastic behavior. (4) An ability to flow without fracture at large strain amplitudes is one of the most important differences between typical strong gel systems and concentrated xanthan gum solutions. (5) The linear viscoelastic behavior of concentrated xanthan gum solutions is dominated by an elastic nature rather than a viscous nature and a gel-like structure is present in these systems. (6) As the polymer concentration is increased, xanthan gum solutions become more elastic and can be characterized by a slower relaxation mechanism. (7) Concentrated xanthan gum solutions do not form a chemically cross-linked stable (strong) gel but exhibit a weak gel-like behavior. (8) A fractional derivative model may be an attractive means for predicting a linear viscoelastic behavior of concentrated xanthan gum solutions but classified as a semi-empirical relationship because there exists no real physical meaning for the model parameters.

체외순환기 인터루킨-6의 생성과 염증반응간의 상관관계에 관한 연구 (Relationship Between Interleukin-6 Production and Inflammatory Response during Cardiopulmonary Bypass)

  • 박광훈;최석철;한일용;최국렬;최강주;조광현
    • Journal of Chest Surgery
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    • 제33권5호
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    • pp.407-418
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    • 2000
  • Background: With open heart surgery(OHS), it has been recognized that many postoperative complications and postperfusion syndrome are associated with the activations of complements and leulocytes. Recently, some investigators also demonstrated that interlukin-6(IL-6) linked highly with postperfusion syndrome. The puropose of this study was to investigate the sequential changes of the IL-6 and to clarify each IL-6 relationship to the complements(C3, C4) and inflammatory response following cardiopulmonary bypass(CPB). Material and Method: To determine serum levels of IL-6, complements, leukocytes, and biochemistric markers of liver and renal function, blood samples were taken from th radial artery in 30 adult patients undergoing OHS with CPB. Result: Serum IL-6 levels incrased significantly at 10 minutes after CPB-on(CPB-10) in comparison with the control levels and reached the peak at CPB-off(p<0.05). Serum complement levels declined rapidly at CPB-10 and remained at the lower levels during CPB(p<0.01). Sequential changes of IL-6 levels had positive correlations with the changes of total leukocytes and neutrophil fractions(p<0.05), but had negative correlations with lymphocyte fractions(p<0.05). Changes of C3 related postively to monocyte fractions(p<0.05). Postoperative levels of total protein and albumin, decreased significantly in comparison with the control levels(p<0.01), while the postoperative levels of AST(aspartate transaminase) and bilirubin increased (p<0.01). At CPB-off, IL-6 levels had negative correlations with total protein and albumin levels(r=-0.60, -0.47 respectively, p<0.05), whereas C3 levels had positive correlations with albumin levels(r=0.40, p<0.05). IL-6 levels, as well as neutrophil fractions, had positive correlations with aortic clamp time(ACT) and total bypass time(TBT) (IL-6; r=0.82, 0.79 respectively, neutrophil fractions; r=0.50, 0.56 respectively, p<0.05), wheres lymphocyte frations and albumin levels had negative correlations whith ACT and TBT(lymphocyte fractions; r=-0.52, -0.58 respectively, albumin; r=-0.58, -0.55 respectively, p<0.05). Conclusion: These data showed that elevated production of serum IL-6 during CPB may play a pivotal role in systemic inflammatory responses and prologed CPB period may be assosiated with more sever postperfusion syndromes.

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악관절질환에서 MRI 상 관절원판 후조직의 상대적 신호강도와 관절액의 Interleukin-6, MMP-2 및 MMP-9 농도 (RELATIVE SIGNAL INTENSITY OF RETRODISCAL TISSUE IN MRI, AND SYNOVIAL FLUID CONCENTRATION OF INTERLEUKIN-6, MMP-2 AND MMP-9 IN TEMPOROMANDIBULAR JOINT DISORDER)

  • 이상화;최목균
    • Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
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    • 제31권5호
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    • pp.399-408
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    • 2005
  • In the progression of the Temporomandibular Joint Disorder(TMD), not only deformation and perforation of disc occur. But also fibrotic adhesion and inflammatory changes to the retrodiscal tissue can be seen in addition to the condylar degenerative change (e.g. osteoarthritis). However, the correct diagnosis,?planning for appropriate treatment, and prediction of prognosis are limited, because there are no means to stage the progression of the disorder. In this study relative signal intensity of retrodiscal tissue in MRI and the synovial fluid concentration of matrix metalloproteinase-2 (MMP-2), MMP-9, and Interleukin-6(IL-6) in the 23 temporomandibular joints(TMJ), from 17 patients with TMD were evaluated as a possible diagnostic marker. The relative signal intensity of retrodiscal tissue was referenced to brain gray matter with same region of interest(ROI) size. The concentrations of MMP-2, MMP-9, and IL-6 were evaluated by Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA). The collected data were compared with condylar degenerative change, joint effusion and disc position observed in MRI. The relative signal intensity of the retrodiscal tissue was increased significantly when degenerative changes were present. In addition, there was significantly high signal intensity in the presence of a disc displaced without reduction. The concentration of IL-6 was significantly increased when condylar degenerative change was no observed. And there were no changes in the levels of IL-6 according to disc position and joint effusion measurement. Moreover, there were no significant relevance between the concentration of total MMP-2 and active MMP-9 in synovial fluid, relative to degenerative changes in the mandibular condyle, to joint effusion, and to disc position observed on MRI images. In conclusion, the relative signal intensity of the retrodiscal tissue can be regarded as a mean of diagnosing the procession of TMD in a non-invasive manner. But more additional studies are required for the levels of MMP-2. MMP-9, and IL-6 to determine their potentials as a diagnostic marker for TMD.

CRM의 기능 분류를 위한 통계적 학습에 관한 연구 (A Study of Statistical Learning as a CRM s Classifier Functions)

  • 장근;이정배;이병수
    • 정보처리학회논문지B
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    • 제11B권1호
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    • pp.71-76
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    • 2004
  • 현재 ERP와 CRM은 대부분 전통적인 기능적 수행에만 초점이 맞추어져 있다. 그러나 최근의 경영환경은 인터넷(Internet)과 이를 기반으로 하는 전자상거래의 비약적 발전에 기인하여 시장의 변화를 가져왔으며, 이는 대부분 e-비즈니스화 되어 가고 있으며, 이를 추진하면서 제휴기관과의 관계증진, 고객관계의 혁신적 개선은 물론 조직내부의 업무프로세스의 획기적 개선을 통한 경쟁력 강화를 적극적으로 전개하고 있다. CRM(Customer Relationship Management)은 기업이 획득한 고객을 지속적으로 유지하고, 기업에 대한 고객의 가치를 증진시키기 위해 기업과 고객간의 상호 이익적 관계를 형성 유지 강화하려는 기업의 일련의 마케팅과정으로 다양하고도 수많은 고객들의 정보를 기반으로 수행되기 때문에 고객 정보를 파악할 수 있는 시스템 기반을 필요로 하며, 생산과 상품의 전달경로, 마케팅, 그리고 의사결정 등의 경영 카테고리와 연관되어 있다. 한편 ERP는 SCM과 CRM 및 SEM(Strategic Enterprise Management)등으로 기능을 확대해감에 따라 21세기의 ERP는 e-비즈니스의 전략적 도구로 발전해 갈 것이다. 본 논문에서는 이를 위한 중재 도구를 제시함으로써 고객에게 더욱 더 효율적이고 고 부가가치 있는 의미 있는 데이터들의 통계적 기계 학습법을 통해 CRM의 기능들을 효율적으로 분류할 수 있도록 한다. 또한 시스템 특징으로는 기존에 수작업으로 이루어지던 파일의 분류 작업을 기계 학습법을 통한 에이전트가 자동으로 수행함으로써 사용자가 좀 더 효율적으로 작업을 수행 할 수 있도록 한 것이다.