• 한국가금학회지
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• 제28권2호
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• pp.143-153
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• 2001

Using bioinformatic tools for searching the massive genome databases, it is possible to Identify new genes in few minutes for initial discoveries based on evolutionary conservation, domain homology, and tissue expression patterns, followed by further verification and characterization using the bench-top works. The development of high-density two-dimensional arrays has allowed the analysis of the expression of thousands of genes simultaneously in the humans, mice, rats, yeast, and bacteria to elucidate the genes and pathways involved in physiological processes. In addition, rapid and automated protein identification is being achieved by searching protein and nucleotide sequence databases directly with data generated from mass spectrometry. Recently, analysis at the bio-chemical level such as biochemical screening and metabolic profiling (Biochemical genomics) has been introduced as an additional approach for categorical assignment of gene function. To make advantage of recent achievements in computational approaches for facilitated gene discoveries in the avian model, chicken expression sequence tags (ESTs) have been reported and deposited in the international databases. By searching EST databases, a chicken heparanase gene was identified and functionally confirmed by subsequent experiments. Using combination of sub-tractive hybridization assay and Genbank database searches, a chicken heme -binding protein family (cSOUL/HBP) was isolated in the retina and pineal gland of domestic chicken and verified by Northern blot analysis. Microarrays have identified several host genes whose expression levels are elevated following infection of chicken embryo fibroblasts (CEF) with Marek's disease virus (MDV). The ongoing process of chicken genome projects and new discoveries and breakthroughs in genomics and proteomics will no doubt reveal new and exciting information and advances in the avian research.

• 대한수의학회지
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• 제39권3호
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• pp.489-500
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• 1999

The fatty acid composition of muscle were investigated to compare muscle composition among the 9 domestic animals including cattle. In major domestic animals, analyzed the effects of age, part and sex of the animal on their fatty acid composition. The content of 4 types of major fatty acids of muscle was determined and calculated their ratio. Myristic acid and palmitic acid levels were high in chicken and sheep. Besides dog muscle contained a lot of stearic acid. Linoleic acid content showed evident difference in the content depending on the animal species. The ratios of linoleic acid/palmitic acid (L/P ratio) and linoleic acid/stearic acid(L/S ratio) were characteristically high in horse and pig, whereas the ratio of palmitic acid/stearic acid(P/S ratio) was $0.71{\pm}0.17$, showing very low level in dog. As for the content of stearic acid, in cattle and chicken it was higher in young animal than adults. In duck, the contents of all fatty acids and ratio were increased by the age. As for the content of fatty acids according to the part of chicken, high level was shown in thigh than in breast and wing, while there was no remarkable variation by the part in other animal. The differences in the content of myristic acid, palmitic acid and linoleic acid among some animal could be verified in muscle lipid composition. The L/P ratio which maintained certain level regardless of age, part, sex shown distinctive pattern between the species.

• 한국동물생명공학회지
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• 제36권3호
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• pp.154-161
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• 2021

A number of Korean Chicken breeds were registered in Domestic Animal Diversity Information System (DAD-IS, http://dad.fao.org/) of the Food and Agriculture Organization (FAO). Evaluation of genetic diversity and relationship of local breeds is an important factor towards the identification of unique and valuable genetic resources. Therefore, this study aimed to analysis the genetic diversity and relationship of 22 Korean Chicken breeds using 12 microsatellite (MS) markers. The mean number of alleles for each variety was 5.52, ranging from a 3.75 (Leghorn F; NF) to a 7.0 (Ross). The most diverse breed was the Hanhyup3 (HCC), which had the highest expected heterozygosity (H_Exp) (0.754) and polymorphic information content (PIC) (0.711). The NF was the least diverse population, having the lowest H_Exp (0.467) and PIC (0.413). As a result of the principal coordinates analysis (PCoA) and factorial correspondence analysis (FCA) confirmed that Hy-line Brown (HL) and Lohmann Brown (LO) are very close to each other and that Leghorn and Rhode Island Red (RIR) are clearly distinguished from other groups. Thus, the reliability and power of identification using 12 types of MS markers were improved, and the genetic diversity and probability of individual discrimination were confirmed through statistical analysis. This study is expected to be used as basic data for the identification of Korean chicken breeds, and our results indicated that these multiplex PCR marker sets will have considerable applications in population genetic structure analysis.

• 한국축산식품학회지
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• 제21권4호
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• pp.300-306
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• 2001

본 연구는 국내시장에 수입 유통중인 수입산 및 한국산 닭고기의 가슴부위육에 대한 이화학적, 미생물학적 및 관능학적 품질특성을 비교 분석하여 이에 대한 기초적인 품질정보를 제공하고자 실시되었다. 태국산 닭고기의 가슴부위가 조단백질 함량이 가장 높게 나타났고(P<0.001), 반면 조지방과 수분의 함량은 가장 낮은 수준을 나타내었다. 수분함량이 가장 높게 나타난 국내 재래시장에서 구입한 닭고기 가슴부위육은 미생물분석 결과 총균수가 $10^{5}$으로 가장 높게 나타났고(P<0.001), 대장균의 수 또한 가장 높게 나타났다(P<0.001). 육색에서 가장 높은 L값을 나타낸 태국산 닭고기 가슴육은 pH에서는 가장 낮은 수준을 나타내었다(P<0.01). 조지방함량이 가장 높게 나타내었으며, VBN에서는 국내 A회사에서 생산된 닭고기 가슴육이 가장 높게 나타났고, P<0.05수준에서 유의적인 차이를 나타내었다. 신선육에 대한 척도묘사분석에서는 국내 재래시장에서 구입한 닭고기 가슴육의 경우 불쾌취와 육즙삼출율에서 가장 높은 점수를 얻었으며, 기호도에서 가장 낮게 나타났으나, 반면 조리육에 대한 척도묘사분서결과 가장 높은 기호도를 보였다.다.

• 농업과학연구
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• 제37권3호
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• pp.399-404
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• 2010

닭의 진화를 이해하기 위하여 변이가 많다고 알려진 LYZ 유전자의 엑손과 인트론에 존재하는 단일염기다형이 본 연구를 통해 확인되었다. 2개의 한국 재래실용계에서 총 24개체의 DNA 샘플이 본 연구에서 이용되었으며 단일염기 다형의 확인을 위하여 3개체의 샘플을 혼합하여 염기서열 분석을 실시하였다. 적색야계와의 비교를 통하여 두 한국 재래실용계는 18개의 염기서열변이를 확인할 수 있었으며 한국 재래실용계 간에는 15개의 염기서열 변이를 확인할 수 있었다. 총 33개의 변이 중 두 개의 삽입변이(21 bp와 4 bp)가 확인되었다. 한편, 2번째 엑손의 1426 bp 위치에 존재하는 단일염기 다형(p.Ala49Val)은 아미노산의 변이를 나타내는 미스센스 돌연변이로 확인되었다. 이 돌연변이는 이 lysozyme 효소의 촉매작용을 하는 위치에 놓여 있어 효소의 활성과 밀접한 관계가 있을 것으로 추정된다. 본 연구에서 밝혀진 LYZ 유전자의 변이는 이 유전자의 기능뿐 아니라 한국 재래실용계 집단의 구조를 이해하는데 기초자료로 이용될 것으로 사료된다.

• 한국임상수의학회지
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• 제29권4호
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• pp.309-314
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• 2012

연구는 방글라데시에서 조류인플루엔자와 뉴캐슬 질병 바이러스가 국내의 현장 샘플에서 혼합항원키트의 민감도와 특이성을 평가하기 위하여 육계 및 산란계와 토종 닭 그리고 사육 야생오리, 거위, 비둘기와 메추라기로부터 야외 샘플을 수집하였다. 샘플은 방글라데시의 5 지역에서 발생한 조류인플루엔자 자연감염된 것으로 의심되는 닭과 야생사육조수로부터 수집되었다. 각 지역으로부터 2마리씩 선택적으로 샘플을 수집하였으며, 각 조류에서는 면봉을 이용하여 기도, 총배설강, 구-비강으로부터 3가지 유형의 샘플을 채취하였다. 70 마리의 조류에서 총210개의 야외 샘플이 수집되었으며, 조류인플레인자와 뉴캣슬병 바이러스 혼합항원신속진단키트를 검사하였다. 210개 샘플 중에서 15개(5 마리)가 조류인플루엔자 바이러스, 63개(21 마리)가 뉴캣슬병 바이러스, 27개(9 마리)에서 두 가지의 혼합감염이 나 타났으며, 그 외에서는 모두 음성으로 나타났다. 5 곳의 조류인플루엔자 양성 중에서 Mymensingh, Netrokona, Gibandha와 Kurigram의 마켓으로부터 산란계에서, Kurigram의 마켓에서 토종닭에서 양성이 나타났다. 야생사육조수는 뉴캣슬병에 양성이거나 또는 조류인플루엔자와 뉴캣슬병 바이러스에는 감염되지 않았다. 조류인플루엔자 및 뉴캣슬병 바이러스 신속진단키트로 기도, 총배설강, 구-비강으로부터 채집한 샘플에서 동시에 검출할 수 있는 것으로서 효과적으로 사용될 것으로 평가되었다. 조류인플레인자와 뉴캣슬병 바이러스 혼합 항원 검사 결과는 명확히 두 개의 바이러스 검출을 위한 테스트 키트로서 적은 노력과 대규모의 필드 샘플로부터 이들 바이러스의 검출에 효과적으로 사용될 수 있는 최신의 과학적 방법이며, 신속하게 질병을 진단할 수 있었다.

• 한국축산식품학회지
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• 제40권3호
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• pp.444-460
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• 2020

This study was conducted to investigate the effects of freezing and storage temperature (-18℃, -50℃, and -60℃) on the physicochemical properties of pork neck and chicken leg meat in home-scale deep freezers. Pork neck was cut into a thickness of 3 cm (9×9×3 cm, 150 g), individually packed in air-containing packages, and stored at different temperature (-18℃, -50℃, and -60℃) for 6 months. Chicken leg meats were prepared (10 cm long, weighing 70 g) and packed in the same manner. Frozen samples were thawed at 2℃. Physicochemical properties such as thawing loss, cooking loss, water-holding capacity, color, volatile basic nitrogen (VBN), and thiobarbituric acid reactive substances (TBARS) were evaluated. The samples frozen by deep freezing (-60℃) was favorable with respect to thawing loss, color, and VBN. Samples frozen at -60℃ had lower values of thawing loss and VBN than those frozen at -18℃ for all storage periods (p<0.05). Color parameters were more similar to those of fresh meat than to those of samples frozen at -18℃ for 6 months. The TBARS of all samples were below 0.3 mg malondialdehyde/kg, thereby indicating oxidative stability of lipids. Consequently, deep freezing at -60℃ may be acceptable for maintaining the quality of fresh pork neck and chicken leg meat for 6 months without deterioration.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제65권4호
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• pp.838-855
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• 2023

The highly pathogenic avian influenza (HPAI) virus triggers infectious diseases, resulting in pulmonary damage and high mortality in domestic poultry worldwide. This study aimed to analyze miRNA expression profiles after infection with the HPAI H5N1 virus in resistant and susceptible lines of Ri chickens.For this purpose, resistant and susceptible lines of Vietnamese Ri chicken were used based on the A/G allele of Mx and BF2 genes. These genes are responsible for innate antiviral activity and were selected to determine differentially expressed (DE) miRNAs in HPAI-infected chicken lines using small RNA sequencing. A total of 44 miRNAs were DE after 3 days of infection with the H5N1 virus. Computational program analysis indicated the candidate target genes for DE miRNAs to possess significant functions related to cytokines, chemokines, MAPK signaling pathway, ErBb signaling pathway, and Wnt signaling pathway. Several DE miRNA-mRNA matches were suggested to play crucial roles in mediating immune functions against viral evasion. These results revealed the potential regulatory roles of miRNAs in the immune response of the two Ri chicken lines against HPAI H5N1 virus infection in the lungs.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제54권6호
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• pp.777-786
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• 2016

Raillietina species are prevalent in domestic chickens (Gallus gallus domesticus) in Phayao province, northern Thailand. Their infection may cause disease and death, which affects the public health and economic situation in chicken farms. The identification of Raillietina has been based on morphology and molecular analysis. In this study, morphological observations using light (LM) and scanning electron microscopies (SEM) coupled with molecular analysis of the internal transcribed spacer 2 (ITS2) region and the nicotinamide adenine dinucleotide dehydrogenase subunit 1 (ND1) gene were employed for precise identification and phylogenetic relationship studies of Raillietina spp. Four Raillietina species, including R. echinobothrida, R. tetragona, R. cesticillus, and Raillietina sp., were recovered in domestic chickens from 4 districts in Phayao province, Thailand. LM and SEM observations revealed differences in the morphology of the scolex, position of the genital pore, number of eggs per egg capsule, and rostellar opening surface structures in all 4 species. Phylogenetic relationships were found among the phylogenetic trees obtained by the maximum likelihood and distance-based neighbor-joining methods. ITS2 and ND1 sequence data recorded from Raillietina sp. appeared to be monophyletic. The query sequences of R. echinobothrida, R. tetragona, R. cesticillus, and Raillietina sp. were separated according to the different morphological characters. This study confirmed that morphological studies combined with molecular analyses can differentiate related species within the genus Raillietina in Thailand.

• 한국가금학회지
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• 제43권2호
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• pp.77-88
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• 2016

본 연구에서는 국산종계 개발을 위하여 5계통의 토종닭 순계를 이용하여 $5{\times}5$ 이면교배조합 시험을 수행하고, 공시된 25계통에 대한 스트레스 반응 정도를 비교 분석하였다. 스트레스 반응정도 표지로 텔로미어 함량 및 감축율, 열 스트레스 단백질 유전자(HSPs)로 HSP-70, $HSP-90{\alpha}$, $HSP-90{\beta}$의 발현율 및 DNA 손상율을 이용하여 분석하였다. 텔로미어 함량은 양적 형광접합보인법을 이용하고, HSPs 발현율은 quantitative real-time PCR 기법으로, DNA 손상율은 Comet assay법을 적용하였다. 분석 결과, 교배조합 25계통 간 텔로미어 함량과 감축율, HSPs 유전자 발현율 및 DNA 손상율 모두에서 유의한 차이를 보였고, 더불어 계통 간 체중 및 생존율에도 유의한 차이가 나타났다. 텔로미어 감축율, HSPs 유전자 발현율 및 DNA 손상율 모든 분석 값에서 W 및 Y 계통과의 교잡구가 다른 교잡구에 비해 유의하게 낮은 값을 보였고, 반면 G계통의 순계구가 가장 높은 값을 나타내었다. 생존율과 스트레스 표지 값들 간의 상관계수를 추정한 결과, 텔로미어 함량과는 저도의 정(+)의 상관, HSP-70, $HSP-90{\alpha}$, $HSP-90{\beta}$ 및 DNA 손상율과는 중도 및 저도의 부(-)의 상관을 나타내었다. 또한 폐사 개체와 생존 개체 간 HSP-70, $HSP-90{\alpha}$ 및 $HSP-90{\beta}$의 발현율을 비교 분석한 결과, 폐사 개체의 HSPs 발현율이 생존 개체에 비해 유의하게 높은 발현율을 보였다. 이상 스트레스 표지 값의 분석 결과를 종합할 때, 교잡계들이 순계에 비해 스트레스 저항성이 높은 것으로 판단되고, 더불어 W, Y와 같은 경량종 계통의 교잡계들이 외적 스트레스에 강한 반면, G, H, F와 같은 고체중 계통의 교잡계들은 스트레스에 민감한 것으로 사료된다.