• 한국수정란이식학회지
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• 제30권2호
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• pp.91-97
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• 2015

Amphiregulin (AREG), a glycoprotein that is a member of the epidermal growth factor (EGF) family, is expressed by the porcine conceptus and endometrium. AREG genotypes were determined based on an SNP in the intron 3 of the gene. Contradictory effects of AREG genotypes on reproductive traits in different pig breeds were reported previously. G allele had undesirable effect on reproductive trait in Meishan breed, while it had favorable effects in Polish Landrace and Large White. We determined AREG genotypes of 179 pigs including the Duroc, Landrace, Yorkshire, Korean native pig (KNP), and Meishan breeds. Two new SNPs were identified near the previously reported SNP in the intron 3 of AREG. Frequencies of AREG alleles among the Duroc, Landrace, Yorkshire, and KNP sows were significantly different (p<0.001), indicating association between AREG genotypes and pig breeds. The first parity litter size was significantly affected by the breeds (p=0.014), but not by AREG genotypes (p=0.148). However, there were breed and AREG genotype associated trends in the first parity litter size. The first parity litter size appeared to be higher in Duroc and KNP sows with G allele, while it appeared to be lower in Landrace sows with G allele. Significant variability of AREG alleles among pig breeds, for the first time in Duroc and KNP sows, was identified. AREG genotypes may influence reproductive traits differentially for each breed and thus, AREG genotypes may need to be considered when sows are bred to increase litter size.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제47권2호
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• pp.167-176
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• 2005

PIGK(phosphatidylinositol glycan, class K) is a subunit of GPI transamidase that cleaves the signal peptide in proproteins and replaces it with GPI. In addition, the structure and synthesis of GPI are critically involved in some of the cellular actions of insulin. Therefore, PIGK would be essential for mammalian development and many specific cellular functions as well as for metabolic activity of insulin associated with GPI. Two types of" full-length cDNAs of porcine PIGK were cloned through RT-PCR and RACE experiments. One is thought to be a normal form(consist of 395 amino acids) and the other is considered as an alternative spliced form(consist of 371 amino acids) which contains additional 63 bps in intron 7. Since a stop codon was contained within the insertion, the spliced form has a shorter coding sequence than that of normal form. A missense mutation (T314I) in exon 6 was detected and used for genotyping to estimate association with the growth and fat deposition traits for 545 $F_2$ animals(Korean native boars ${\times}$ Landrace). From the PCR-RFLP analysis using HpyCH4III, CT genotype showed highly significant relationship(P< 0.01) with carcass fat contents.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제65권3호
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• pp.511-518
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• 2023

This study examined the association between functional sequence variants (FSVs) of myosin heavy chain 3 (MYH3) genotypes and collagen content in a Landrace and Jeju native pig (JNP) crossbred population. Four muscles (Musculus longissimus dorsi, Musculus semimembranosus, Musculus triceps brachii, and Musculus biceps femoris) were used for the analysis of meat collagen content, and the same animals were genotyped for the FSVs of the MYH3 gene by using PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism). Three FSVs of MYH3 genotypes were identified and had genotype frequencies of 0.358, 0.551, and 0.091 for QQ, Qq, and qq, respectively. QQ animals for the FSVs of the MYH3 genotypes showed higher collagen content in their M. longissimus dorsi (p < 0.001), M. semimembranosus (p < 0.001), M. triceps brachii (p < 0.001), and M. biceps femoris (p < 0.001) than qq homozygous animals. After the validation of this result in other independent populations, the FSVs of MYH3 genotypes can be a valuable genetic marker for improving collagen content in porcine muscles and can also be applied to increase the amount of collagen for biomedical purposes.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제46권4호
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• pp.537-546
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• 2004

APM1(adipose most abundant gene transcript 1)은 지방세포에서 분비된는 단백질로서 Adiponectin을 암호화하며 GBP-28, AdipoQ, Acrp30으로 불리워졌다. 이 유전자는 쥐의 16번 염색체 및 인간의 3번 염색체 q27 부위에 존재하며 지방의 대사 및 호르몬의 여러 과정에 중요하게 작용하는 것으로 알려져 왔다. 돼지에서 APM1과 양적형질과의 연관성을 알아보기 위하여 somatic cell hybrid panel과 radiation hybrid panel을 이용하여 염색체상의 위치를 밝혀냈다. 분석결과 이 유전자는 돼지 13번 염색체의 q41이나 q46-49에 존재하는 것으로 밝혀졌다. RH pnael의 분석 결과, 이 APM1과 가장 연관이 된 marker는 SIAT1(LOD score 20.29)로 밝혀졌으며 이미 보고된 지방과 관련된 양적형질 유전자 좌위와 일치하였다. 8개의 다른 품종을 이용한 SSCP 분석으로, 한국재래돼지와 한국야생돼지에서 두 개의 특이한 SSCP 타입이 발견되었으며 sequence 분석결과 두 개의 염기가 치환(T672C and C705G)되어 있음을 알 수 있었다. 이 유전자는 사람, 마우스, 소의 염기서열과 약 79-87%의 상동성을 가지고 있으며 다른 포유동물에서 밝혀진 signal sequence, hypervariable region, collagenous region, globular domain과 유사한 구조로 되어 있음을 알 수 있었다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제21권2호
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• pp.155-160
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• 2008

Several studies have reported quantitative trait loci (QTL) for meat quality on porcine chromosome 2 (http://www.animalgenome.org/QTLdb/pig.html). For application of the molecular genetic information to the pig industry through marker-assisted selection, single nucleotide polymorphism (SNP) markers were analyzed by comparative re-sequencing of polymerase chain reaction (PCR) products of 13 candidate genes with DNA from commercial pig breeds such as Berkshire, Yorkshire, Landrace, Duroc and Korean Native pig. A total of 34 SNPs were identified in 15 PCR products producing an average of one SNP in every 253 bp. PCR restriction fragment length polymorphism (RFLP) assays were developed for 11 SNPs and used to investigate allele frequencies in five commercial pig breeds in Korea. Eight of the SNPs appear to be fixed in at least one of the five pig breeds, which indicates that different selection among pig breeds might be applied to these SNPs. Polymorphisms detected in the PTH, CSF2 and FOLR genes were chosen to genotype a Berkshire-Yorkshire pig breed reference family for linkage and association analyses. Using linkage analysis, PTH and CSF2 loci were mapped to pig chromosome 2, while FOLR was mapped to pig chromosome 9. Association analyses between SNPs in the PTH, CSF2 and FOLR suggested that the CSF2 MboII polymorphism was significantly associated with several pork quality traits in the Berkshire and Yorkshire crossed F2 pigs. Our current findings provide useful SNP marker information to fine map QTL regions on pig chromosome 2 and to clarify the relevance of SNP and quantitative traits in commercial pig populations.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제16권8호
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• pp.1087-1092
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• 2003

As an experimental reference population, crosses between Korean native pig and Landraces were established and information on growth traits was recorded. Animals were genotyped for 24 microsatellite markers covering chromosomes 2, 6, and 7 for partial-genome scan to identify chromosomal regions that have effects on growth traits. quantitative trait loci (QTL) effects were estimated using interval mapping by the regression method under the line cross models with a test for imprinting effects. For test of presence of QTL, chromosome-wide and single position significance thresholds were estimated by permutation test and normal significance threshold for the imprinting test were derived. For tests against the Mendelian model, additive and dominance coefficients were permuted within individuals. Thresholds (5% chromosome-wide) against the no-QTL model for the analyzed traits ranged from 4.57 to 4.99 for the Mendelian model and from 4.14 to 4.67 for the imprinting model, respectively. Partial-genome scan revealed significant evidence for 4 QTL affecting growth traits, and 2 out of the 4 QTLs were imprinted. This study demonstrated that testing for imprinting should become a standard procedure to unravel the genetic control of multi-factorial traits. The models and tests developed in this study allowed the detection and evaluation of imprinted QTL.

• Reproductive and Developmental Biology
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• 제37권4호
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• pp.205-211
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• 2013

The swine is one of the most widespread mammalian throughout the whole world. Presently, many studies concerning microsatellites in swine, especially domestic pigs, have been carried out in order to investigate general diversity patterns among either populations or breeds. Until now, a lot of time and effort spend into a single PCR method. But simple and more rapid multiplex PCR methods have been developed. The purpose of this study is to develop a robust set of microsatellites markers (MS marker) for traceability and individual identification. Using multiplex-PCR method with 23 MS marker divided 2 set, various alleles occurring to 5 swine breed (Berkshire, Landrace, Yorkshire, Duroc and Korea native pig) used markers to determine allele frequency and heterozygosity. MS marker found 4 alleles at SW403, S0227, SWR414, SW1041 and SW1377. The most were found 10 alleles at SW1920. Heterozygosity represented the lowest value of 0.102 at SWR414 and highest value of 0.861 at SW1920. So, it was recognized appropriate allele frequency for individual identification in swine. Using multiplex-PCR method, MS markers used to determine individual identification biomarker and breed-specific marker for faster, more accurate and lower analysis cost. Based on this result, a scientific basis was established to the existing pedigree data by applying genetics additionally. Swine traceability is expected to be very useful system and be conducted nationwide in future.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제49권1호
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• pp.99-108
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• 2007

시중에 유통 중인 브랜드 돈육의 품질 특성을 조사하기 위해 3개 브랜드[대조구(LY×D), 브랜드 A(LY×D, 생균제 급여, 무항생제), 브랜드 B(재래돼지×멧돼지, 맥강과 한약재 급여)] 등심육을 구매하여 물리화학적 및 관능적 특성을 분석하였다. 조지방 함량은 브랜드 A가 브랜드 B에 비해 유의적으로 낮게 나타났다(P<0.05). 조회분 함량은 대조구>브랜드 A>B 순이었으며(P<0.05), 조단백질 함량은 브랜드 A>B>대조구 순으로 나타났다(P<0.05). 등심의 pH는 브랜드 B가 대조구와 브랜드 A에 비해 높았다(P<0.05). 가열감량은 브랜드 A가 대조구에 비해 낮았으며(P<0.05), 반면에 육의 명도는 브랜드 B가 대조구와 브랜드 A에 비해 낮았다(P<0.05). 조직적 특성 중 육의 탄력성은 브랜드 A가 가장 높게 나타났다(P<0.05). 포화지방산 함량은 브랜드 A가 가장 높았고(P<0.05), 반면에 불포화지방산, 필수지방산, 불포화지방산/포화지방산, 필수지방산/포화지방산 및 필수지방산/불포화지방산 비율은 브랜드 B가 가장 높았다(P<0.05). Glutamic acid, valine 및 Iosleucine 함량은 브랜드 B가 브랜드 A에 비해 높게 나타났다(P<0.05). 필수아미노산 함량의 경우 브랜드 B>대조구>브랜드 A 순이었다(P<0.05). Aspartic acid, alanine, tyrosine, phenylalanine, serine 및 glycine 함량은 브랜드 A가 대조구와 브랜드 B에 비해 높게 나타났다(P<0.05). Lysine, histidine 및 arginine 함량은 브랜드 B가 대조구와 브랜드 A에 비해 높게 나타났다(P<0.05). 관능검사 결과, 육의 풍미, 색 및 기호성은 재래돼지×멧돼지 교잡하여 맥강과 한약재를 급여한 브랜드 B가 가장 좋은 것으로 평가되었다(P<0.05). 이상의 결과를 종합해 볼 때 재래돼지×멧돼지 교잡하여 맥강과 한약재를 급여한 브랜드 B가 대조구와 브랜드 A에 비해 육의 명도 및 탄력성을 제외한 대부분의 분석 항목에서 우수한 것으로 나타났다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제45권5호
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• pp.703-710
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• 2003

본 연구는 재래돼지와 랜드레이스를 기초축으로 이용한 F$_2$ 241두에 대해 Heart Fatty Acid- Binding Protein 유전자와 연관되어 있는 PCR- RFLP를 이용하여 그 다형성을 조사하고 돼지의 성장형질, 도체형질, 육질형질과 그 유전자형간의 연관성을 구명코자 실시하였다. H-FABP PCR-RFLP는 두 쌍의 primer에 의한 850bp와 700bp의 증폭산물을 HaeⅢ와 HinfⅠ제한효소를 사용하여 실시되었다. HaeⅢ을 이용한 PCR-RFLP 유전자형은 DD형/700+150bp, Dd형/700+400+300+ 150bp 그리고 dd형/400+300+150bp의 DNA 단편을 보였으며, Hinf1에 의한 유전자형은 HH형은 350+180+130bp, Hh형은 350+220+180+130bp, hh형/350+220+130bp의 절단된 DNA 단편을 보였다. H-FABP/HaeⅢ 유전자형 중에서 12주령 체중은 DD형에 비해 Dd와 dd형에서 유의적으로 높은 값을 보였으며(p〈0.001), 3주령 체중 (p〈0.01)과 5주령, 30주령 체중 (p〈0.05)에 경우도 Dd와 dd형에서 유의적으로 높게 관찰되었고(Table 3), 특히 ‘d’ 대립유전자가 체중과 연관성이 있음이 관찰되었다. H-FABP/HinfⅠ의 유전자형과 표현형질의 연관성을 보면 12주령, 30주령 체중 및 도체지방 과 등지방 두께에서는 hh형에 비해 HH와 Hh형에서 유의적으로 높게 나타났으며(p〈0.001), 5주령 체중과 근내지방 함량에서도 HH형에서 유의적으로 높게 관찰되었고(p〈0.05), 특히 ‘H’ 대립유전자가 체중과 도체지방, 등지방 두께 및 근내지방 함량과 연관성이 있음이 관찰되었다. 따라서 돼지성장 및 지방축적과 관련한 선발력을 높이기 위해 H- FABP PCR-RFLP(HaeⅢ & HinfⅠ)를 분자생물학적 marker로 사용할 수 있을 것으로 사료된다.

• Journal of Chest Surgery
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• 제34권9호
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• pp.662-671
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• 2001

배경: 최근 레이저를 이용한 경심근 혈류 재건술(TMR)이 말기 협심증 환자에게 협심증이 개선에 효과가 있는 치료 방법으로 보고되고 있으나 여러 동물 실험 연구들에서는 상반되는 결과들이 발표되어 왔다. 본 연구에서는 돼지의 만성 심근 허혈 모델에서 국소 심근 혈류량의 측정을 통하여 TMR 후 심근 관류 개선 여부를 검증하고자 하였다. 대상 및 방법: 14마리의 돼지에서 좌회선지 관상동맥에 ameroid ring을 거치하여 만성 심근 허혈을 조성한 후 4주 경과시 각 7마리씩 대조군과 실험군으로 나누어 대조군에서는 개흉과 심낭내 유착 박리만을 시행하였고 실험군에서는 Ho:YAG 레이저를 이용하여 좌회선지 영역에 TMR을 시행하였다. 이후 다시 4주가 지난후 동물을 희생시키고 심장을 적출하여 각 수술 시마다 주사된 각각 다른 색의 착색 미세구를 이용, 국소 심근 혈류량을 측정하였다. 심근 절편 내의 미세구 함유량을 측정하여 회선지 영역과 심실 중격간의 혈류량 비를 비교함으로써 대주군과 실험군 사이의 혈류량 변화의 차이를 분석하였다. 결과: Ameroid ring 거치 4주 후 좌회선지 영역의 심근 혈류량은 심실 중격 혈류량의 46∼89%로 감소되었다. 8주 경과시의 좌회선지 영역 심근 혈류량은 대조군 4마리 중 3마리에서 4주 경과 시에 비해 유의하게 증가되었으며 증가 폭은 14∼18%였다. 실험군 6마리 중에서는 2마리에서만 유의한 증가가 관찰되었으며 증가 폭은 7∼34%였다. 결론: 돼지 만성 심근 허혈 모델에서 Ho:YAG 레이저를 이용한 TMR 시행 4주후 허혈 영역의 국소 심근 혈류량 증가는 대조군과 비교하여 큰 차이가 나지 않는 것으로 판단되었다. 그러나 통계적 유의성을 검증하기 위해서는 더 많은 수의 동물을 대상으로 한 연구가 후속되어야 할 것으로 사료된다.