This review summarises the biology, discovery and applications of single nucleotide polymorphisms in complex polyploid crop genomes, with a focus on the important oilseed crop $Brassica$$napus$. $Brassica$$napus$ is an allotetraploid species, and along with soybean and oil palm is one of the top three most important oilseed crops globally. Current efforts are well underway to $de$$novo$ assemble the $B.$$napus$ genome, following the release of the related $B.$$rapa$ 'A' genome last year. The next generation of genome sequencing, SNP discovery and analysis pipelines, and the associated challenges for this work in $B.$$napus$, will be addressed. The biological applications of SNP technology for both evolutionary and molecular geneticists as well as plant breeders and industry are far-reaching, and will be invaluable to our understanding and advancement of the $Brassica$ crop species.
Soriano, Francesc X.;Baxter, Paul;Murray, Lyndsay M.;Sporn, Michael B.;Gillingwater, Thomas H.;Hardingham, Giles E.
Molecules and Cells
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제27권3호
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pp.279-282
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2009
"Two-cysteine" peroxiredoxins are antioxidant enzymes that exert a cytoprotective effect in many models of oxidative stress. However, under highly oxidizing conditions they can be inactivated through hyperoxidation of their peroxidatic active site cysteine residue. Sulfiredoxin can reverse this hyperoxidation, thus reactivating peroxiredoxins. Here we review recent investigations that have shed further light on sulfiredoxin's role and regulation. Studies have revealed sulfiredoxin to be a dynamically regulated gene whose transcription is induced by a variety of signals and stimuli. Sulfiredoxin expression is regulated by the transcription factor AP-1, which mediates its up-regulation by synaptic activity in neurons, resulting in protection against oxidative stress. Furthermore, sulfiredoxin has been identified as a new member of the family of genes regulated by Nuclear factor erythroid 2-related factor (Nrf2) via a conserved cis-acting antioxidant response element (ARE). As such, sulfiredoxin is likely to contribute to the net antioxidative effect of small molecule activators of Nrf2. As discussed here, the proximal AP-1 site of the sulfiredoxin promoter is embedded within the ARE, as is common with Nrf2 target genes. Other recent studies have shown that sulfiredoxin induction via Nrf2 may form an important part of the protective response to oxidative stress in the lung, preventing peroxiredoxin hyperoxidation and, in certain cases, subsequent degradation. We illustrate here that sulfiredoxin can be rapidly induced in vivo by administration of CDDO-TFEA, a synthetic triterpenoid inducer of endogenous Nrf2, which may offer a way of reversing peroxiredoxin hyperoxidation in vivo following chronic or acute oxidative stress.
Objectives The purpose of this study is to understand the condition of the Ease-West Integrative Care system in one of Korean Medical hospital, to develop more effective system, and to collect advance information for future research. Methods We analyzed patient's status, patient's composition and the ranking of the major disease code. In addition, we investigated the operating system of how Ease-West Integrative Care in hospitals is operating in order to grasp the actual situation is being done. Results As a result of analyzing the status, there was a balanced cooperation between the Korean Medicine and Western Medicine with a ratio of 0.86:1. The disease status from Korean Medicine to Western Medicine were mostly occupied by stroke patients and from Western Medicine to Korean Medicine fragment were mostly by musculoskeletal pain patients. Conclusions The results of this study showed that the Ease-West Integrative Care system of surveyed Korean Medical hospital has more integrated medical characteristics than previous studies in terms of quality and quantitative. Future research based on detailed data collection and review for a longer period is expected in the further.
Objectives : The aim of this study was to develop a clinical pathway (CP) model for the integrative treatment of non-invasive breast cancer, with western medicine and Korean traditional medicine. Methods : The checklist model was composed in four types according to the target patients: DCIS inpatients, DCIS outpatients, LCIS inpatients, LCIS outpatients. The vertical axis of the pathway consists of 11 categories of actions applied to the patient. The horizontal axis was in accordance with the flow of time, comprising three periods during inpatient care and seven periods during outpatient care. In addition, CP was also composed in flow chart form. The pathway model was developed through a literature review of clinical practice guidelines, conference publications, papers, books, and websites. Results : The integrative CP model for non-invasive breast cancer was developed. Conclusions : The goal of the CP suggested in this study was to improve non-invasive breast cancer patients' quality of life and to supplement conventional treatment, by alleviating the side effects. The model developed through this study could serve as the basis when developing CPs in a real-world integrative medical environment. This could lead to a reduction in cost and time for CP development, thus bringing about efficiency in the clinical setting.
High value-added therapeutic proteins have been leading the biologics industry and occupied major portion of the market. More than 60% of the currently available protein therapeutics are glycoproteins attached with glycans which play crucial roles for the protein folding, therapeutic efficacy, in vivo half-life and immunogenecity. This review introduces the process of glycosylation and the impacts of glycans in the aspects of therapeutics. The important glycan structures in therapeutic performances were also summarized focusing on three representative categories of glycoproteins, cytokines, therapeutic antibody and enzyme. Currently, mammalian expression systems such as Chinese hamster ovary cells are preferred for the production of therapeutic glycoproteins due to their ability to synthesize glycans having similar structures with human type glycans. However, recent advances of plant glycoengineering to overcome the limitation originating from different glycan structures will soon allow to develop more efficient and economic plant-based production systems for therapeutic glycoproteins.
For better predictions and classifications in customer recommendation, this study proposes an integrative model that efficiently combines the currently-in-use statistical and artificial intelligence models. In particular, by integrating the models such as Association Rule, Frequency Matrix, and Rule Induction, this study suggests an integrative prediction model. Integrated models consist of four models: ASFM model which combines Association Rule(A) and Frequency Matrix(B), ASRI model which combines Association Rule(A) and Rule Induction(C), FMRI model which combines Frequency Matrix(B) and Rule Induction(C), and ASFMRI model which combines Association Rule(A), Frequency Matrix(B), and Rule Induction(C). The data set for the tests is collected from a convenience store G, which is the number one in its brand in S. Korea. This data set contains sales information on customer transactions from September 1, 2005 to December 7, 2005. About 1,000 transactions are selected for a specific item. Using this data set. it suggests an integrated model predicting whether a customer buys or not buys a specific product for target marketing strategy. The performance of integrated model is compared with that of other models. The results from the experiments show that the performance of integrated model is superior to that of all other models such as Association Rule, Frequency Matrix, and Rule Induction.
The gastrointestinal tract forms the largest surface in our body with constantly being exposed to various antigens, which provides unique microenvironment for the immune system in the intestine. Accordingly, the gut epithelium harbors the most T lymphocytes in the body as intraepithelial lymphocytes (IELs), which are phenotypically and functionally heterogeneous populations, distinct from the conventional mature T cells in the periphery. IELs arise either from pre-committed thymic precursors (natural IELs) or from conventional CD4 or CD8αβ T cells in response to peripheral antigens (induced IELs), both of which commonly express CD8α homodimers (CD8αα). Although lineage commitment to either conventional CD4 T helper (Th) or cytotoxic CD8αβ T cells as well as their respective co-receptor expression are mutually exclusive and irreversible process, CD4 T cells can be redirected to the CD8 IELs with high cytolytic activity upon migration to the gut epithelium. Recent reports show that master transcription factors for CD4 and CD8 T cells, ThPOK (Th-inducing BTB/POZ-Kruppel-like factor) and Runx3 (Runt related transcription factor 3), respectively, are the key regulators for re-programming of CD4 T cells to CD8 lineage in the intestinal epithelium. This review will focus on the unique differentiation process of IELs, particularly lineage re-commitment of CD4 IELs. [BMB Reports 2016; 49(1): 11-17]
Objectives: To compare the effects of Eastern-Western integrative medical care (EWIM) and Western single rehabilitation therapy (WSRT) on the functional recovery of stroke patients.Methods: Seventy-six stroke patients were recruited retrospectively. The participants were divided into two groups: EWIM and WSRT. Data on age, sex, stroke-related risk factors, stroke type, neurological deficits according to the National Institutes of Health Stroke Scale (NIHSS), elapsed time to the initiation of rehabilitation, duration from the onset to follow up, initial functional status, and function after therapy for 3 mon were obtained from a review of the patients’ medical records. Between-group differences in functional outcomes were analyzed before and after treatment using the functional ambulation category (FAC), Fugl-Meyer assessment (FMA), modified Barthel Index-Korean version (K-MBI), and Euro-Quality of Life-5 Dimension (EQ-5D).Results: At 3-mon poststroke, all the functional outcome measures had improved in both groups (P<0.05). However, the improvements were greater in the EWIM group, and the improvement was statistically significant in the K-MBI (P=0.048) and EQ-5D (P=0.042).Conclusions: With respect to activities of daily living and health-related quality of life, EWIM is a more effective stroke therapy than WSRT.
This study aims to construct the integrative performance evaluation model of informatization programs. In order to achieve the purpose of research, first of all, the three major theoretical paradigms (technical/functional, economic/financial, and interpretive/alternative paradigms) are comparatively analyzed concerning their philosophical and methodological perspectives. Also, a number of important studies and research model in the area of IS (Information Systems) evaluation are critically reviewed. And then actual problems and limitations on the process of implementing IS performance evaluation are sought through investigating domestic and foreign practices. Based upon theoretical and practical review of informatization evaluation and logical reasoning, the components of ideal performance evaluation scheme for informatization program are derived, and the integrative performance evaluation model which can comprehensively represent the relationship among the components is conceptually proposed. For researchers, this study provides the theoretical basis for reasonably deriving the performance variables of informatization programs and empirically validating the performance of managing informatization programs. And in real world, the results of this study are very likely to contribute to presenting the practical guideline for desirably implementing performance evaluation of informatization programs.
An, Kyungeh;Starkweather, Angela;Sturgill, Jamie;Kao, Hsueh-Fen S.;Salyer, Jeanne
Perspectives in Nursing Science
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제11권2호
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pp.87-93
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2014
Purpose: The use of salivary biomarkers for stress research is increasing based on the convenience of collection, affordability and scientific merit. This short review provides an overview of the state of the science of salivary biomarkers utilized in research related to stress. Methods: An integrative review was conducted. Results: The trend of utilizing salivary biomarkers in stress research was reviewed, specifically, focusing on the use of endocrine and inflammatory biomarkers incorporated in previous stress research. Then, a review of sampling procedures for salivary biomarkers and the analytic methods is provided. Finally, a discussion on the strengths and areas for improvement in the use of salivary biomarkers in stress research is included. Conclusion: Salivary biomarkers as an alternative to blood biomarkers are increasingly being recognized as a legitimate source for analyzing the stress response in humans.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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