• 제목/요약/키워드: Identification characters

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들소(Bos javanicus)로 밝혀진 호랑이 기념품: DNA 염기서열 분석에 의한 종 확인 (Souvenir made of tiger part revealed to be Banteng (Bos javanicus): species identification using DNA sequence analysis)

  • 이서진;현지연;민미숙;이무영;이항
    • 대한수의학회지
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    • 제53권4호
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    • pp.239-243
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    • 2013
  • Tigers are one of the most endangered species over the world and protected internationally or locally. However, they are still traded illegally for the Traditional East Asia Medicine or souvenirs / mementos as well as fake products. In the present study, to identify the species of the specimen known as the tiger's genitalia that was sold for mementos in China, two approaches of genetic tools and morphological comparisons were applied. On the basis of the entire sequences of mitochondrial cytochrome b gene (1,140 bp), the result of nucleotide comparisons showed that the specimen examined here is matched with banteng, Bos javanicus (Identities = 1,138/1,140; 99%). In addition, the examination of external morphological characters revealed that the genitalia of the specimen is much more similar to the one of cows, not to tigers. The outcomes highlighted that there are still some fake products of tigers traded in market and molecular genetic tools could help identifying species of wildlife products.

Systematic Relationships of Korean Freshwater Snails of Semisulcospira, Koreanomelania, and Koreoleptoxis (Cerithiodiea; Pleuroceridae) revealed byMitochondrial Cytochrome Oxidase I Sequences

  • Kim, Woo-Jin;Kim, Dae-Hee;Lee, Jun-Sang;Bang, In-Chul;Lee, Wan-Ok;Jung, Hyung-Taek
    • 한국패류학회지
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    • 제26권4호
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    • pp.275-283
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    • 2010
  • Many freshwater snail taxa are difficult to identify using morphological traits due to phenotypic plasticity. However, using of molecular DNA marker in combination with morphological traits can provide a reliable means for discriminating among freshwater snail taxa including cryptic species. To discriminate among Korean freshwater snail taxa and resolve their systematic relationships, wesequenced a fragment of mtDNA cytochrome oxidase I (COI) gene from 82 specimens collected from ten different sites distributed along the Korean peninsula. We identified more than seven freshwater snail taxa including cryptic species in Korea. Whereas traditional shell morphology of freshwater snails offers only weak discriminatory power for recognizing 'good' taxa, DNA sequence data provided positive and reliable identification. In addition, a major Semisulcospira clade was clearly separated from the remaining lineages observed including cryptic species. However, a phylogenetic tree inferred from the COI gene data did not fully resolve systematic relationships among pleurocerid taxa in Korea. Establishing more robust shell characteristics for identifying taxa unambiguously and hence improving traditional key shell morphology characters for freshwater snail species is an urgent requirement and will require more rigorous examination of all nominal taxa. While molecular data generated here will be useful for species identification and for describing the systematic relationships among Korean freshwater snails, further analysis will be required.

Morphology and Molecular Phylogeny of Raillietina spp. (Cestoda: Cyclophyllidea: Davaineidae) from Domestic Chickens in Thailand

  • Butboonchoo, Preeyaporn;Wongsawad, Chalobol;Rojanapaibul, Amnat;Chai, Jong-Yil
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제54권6호
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    • pp.777-786
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    • 2016
  • Raillietina species are prevalent in domestic chickens (Gallus gallus domesticus) in Phayao province, northern Thailand. Their infection may cause disease and death, which affects the public health and economic situation in chicken farms. The identification of Raillietina has been based on morphology and molecular analysis. In this study, morphological observations using light (LM) and scanning electron microscopies (SEM) coupled with molecular analysis of the internal transcribed spacer 2 (ITS2) region and the nicotinamide adenine dinucleotide dehydrogenase subunit 1 (ND1) gene were employed for precise identification and phylogenetic relationship studies of Raillietina spp. Four Raillietina species, including R. echinobothrida, R. tetragona, R. cesticillus, and Raillietina sp., were recovered in domestic chickens from 4 districts in Phayao province, Thailand. LM and SEM observations revealed differences in the morphology of the scolex, position of the genital pore, number of eggs per egg capsule, and rostellar opening surface structures in all 4 species. Phylogenetic relationships were found among the phylogenetic trees obtained by the maximum likelihood and distance-based neighbor-joining methods. ITS2 and ND1 sequence data recorded from Raillietina sp. appeared to be monophyletic. The query sequences of R. echinobothrida, R. tetragona, R. cesticillus, and Raillietina sp. were separated according to the different morphological characters. This study confirmed that morphological studies combined with molecular analyses can differentiate related species within the genus Raillietina in Thailand.

극동산, 북미산 및 유럽산 실뱀장어의 종 구분과 성장에 따른 형태적 변화 (Species Identification of Japanese, American, and European Eel Elvers, and Changes in Morphometric Characters According to Growth)

  • 강언종;김광석;박승렬;손상규
    • 한국어류학회지
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    • 제12권4호
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    • pp.244-249
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    • 2000
  • 국내에 이식된 유럽산 및 북미산 실뱀장어와 극동산실뱀장어의 구분을 위해 계수 계측 형질을 비교한 바 다음과 같은 결과를 얻었다 A rostrata는 등지느러미 기점거리가 걸고 척추골수가 현저히 적어 A. anguilla와 A. japonica로부터 구분되었다. 한편 A. japonica는 뒷지느러미 기점거리가 다른 두 종에 비해 짧아 통계적으로 구분되었다. 성장에 따른 형태적 변화를 조사한 결과 A. rostrata는 두장, 등지느러미기점거리의 비율이 두 종과 다른 변화 경향을 보여 계통학적으로 주목되었다. 이러한 결과를 토대로 A. japonica, A. anguilla 및 A. rostrata는 등지느러미 기점거리, 뒷지느러미 기점거리, 척추골수의 특징을 조합하여 종간 구분이 가능한 것으로 나타났다.

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국내에 유입되는 열대피(Echinochloa colona) 동정: DNA 바코드 중심 (Discrimination of Echinochloa colona (L.) Link from other Echinochloa Species using DNA Barcode)

  • 이정란;김창석;이인용
    • Weed & Turfgrass Science
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    • 제4권3호
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    • pp.225-229
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    • 2015
  • 열대피와 같은 논농사지역의 악성잡초는 국내에 유입될 경우 문제 잡초로 정착될 가능성이 높기 때문에 유입되는 초기에 방제가 될수 있도록 정확한 동정이 되어야한다. 그러나 피속 잡초는 형태적으로 연속변이가 많이 존재하여 종간 구별이 매우 어려운 잡초이다. 본 연구는 미국 NPGS에서 분양받은 열대피와 국내에서 채집한 돌피와 논피를 고등식물 표준바코드 마커 rbcL과 matK를 이용하여 바코드하고, 추가적으로 핵 DNA ITS 부위를 바코드하여 표준바코드 구간과 ITS 구간의 열대피를 동정할 수 있는 능력과 바코드 활용성을 비교하였다. 바코드 결과, rbcL은 0.36%, matK는 0.29%, ITS는 3.2%의 열대피 특이 염기서열이 조사되었고 Neighbor-joining 계통수에서 종별 유집이 뚜렷하게 나타나 표준바코드 마커와 ITS 모두 쉽고 간편하게 열대피를 국내의 돌피, 논피와 동정할 수 있었다. 특히 ITS는 분석구간은 짧지만 열대피를 국내의 논피, 돌피와 정확하게 구분해낼 수 있어서 ITS 단독으로 국내에 유입되는 열대피 동정에 활용할 수 있을 것으로 생각한다.

16S rDNA 증폭에 의한 부분염기서열을 이용한 분뇨 발효 관련 고온 호기성 박테리아의 동정 (Identification by 16S rDNA Partial Sequencing of Thermophilic Bacteria with Fermentation of Pig Manure)

  • 김명길;최돈하;최인규;김병규;송재경
    • Journal of the Korean Wood Science and Technology
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    • 제34권1호
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    • pp.68-78
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    • 2006
  • 돈분뇨 분해 장치의 발효 속도를 가속화시키는 토착미생물의 확보를 위하여 우리나라 각 지역에서 수집한 균주 중 우수한 균주를 선별하고 168 rDNA 증폭에 의한 동정을 실시하여 돈분뇨 분해에 관여하는 균주의 특성을 확인하기 위해 본 연구에서는 총 23장소(서울, 충청, 강원, 전북, 전념, 경남 지역)에서 28종류의 부숙 퇴비를 수집하여 생균수를 조사한 결과 대체적으로 $1{\times}10^5{\sim}10^8$의 분포 밀도를 보였다. 분리한 균주의 효소 생산 역가결과는 $30^{\circ}C$에서 보다 $55^{\circ}C$에서 배양된 고온호기성박테리아가 상대적으로 높은 섬유소분해효소와 전분분해효소 생산력을 보였고, genomic DNA의 추출에 의한 168 primer로 증폭하여 염기서열을 결정한 결과 돈분뇨 발효에 관여하는 고온호기성박테리아는 15종으로 동정되었다. 그 중 미생물제재를 제조하기 위하여 효소 역가 면에서도 우수성을 보이고 내생 포자를 형성하는 균주는 Bacillus subtihs로 확인되었다.

삼백초와 약모밀의 내부형태 비교 연구 (A Comparative Anatomical Study of Saururus chinensis (Lour.) Baill. and Houttuynia cordata Thunb. (Saururaceae))

  • 양선규;최고야
    • 대한본초학회지
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    • 제33권3호
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    • pp.11-18
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    • 2018
  • Objectives : Saururus chinensis and Houttuynia cordata (Saururaceae) are perennial herbs using for medicinal purposes in Korea. The objectives of this study are to compare anatomical key characters between two medicinal plants and to provide fundamental information for the identification of two herbal medicines by using anatomical features. Methods : Cross-sections of root, rhizome, stem, petiole, and leaf for each species were observed in this study. Materials were analyzed through dehydration, paraffin embedding and micro-sectioning, and double staining with Safranin O and Fast-Green FCF. Observations of permanent preparation were conducted using light microscope. Results : S. chinensis and H. cordata were distinguished with anatomical differentiations; Idioblasts with essential oil were scattered in the parenchyma cell of cortex, pith, and phloem of S. chinensis, on the other hand, in H. cordata, idioblasts were distributed ring-shaped in the cortex of the root. S. chinensis had two cycles of vascular bundles in the stem while H. cordata had one cycle. Hypodermis layer was conspicuous in a stem of H. cordata, crystals were observed the only parenchyma in a stem of S. chinensis, and epidermal oil cells were developed in the epidermis of H. cordata. S. chinensis had air cavity at the cortex and pith of the stem. The shape of cross-section was polygonal in the stem of S. chinensis and was circular in the stem of H. cordata. Conclusions : We investigated anatomical study of Korean S. chinensis and H. cordata. To identify two herbal medicines, we considered main anatomical features and provided identification key here.

영화치유 수업사례 연구 - 영화 <라이프 오브 파이>(2013)를 중심으로- (A Case Study on the Cinema Therapy Class - Focusing on the movie Life of Pi(2013)-)

  • 박해랑
    • 문화기술의 융합
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    • 제9권4호
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    • pp.105-112
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    • 2023
  • 본 연구는 영화 <라이프 오브 파이>(2013)을 통한 영화치유의 수업사례이다. 영화치유는 영화를 통한 동일시, 공감, 감정이입, 투사, 관찰학습 과정을 거쳐 진행된다. 연구를 통해 학생들은 영화 속 인물의 상황을 객관적으로 살펴보고, 이를 자신에게 동일시하고, 공감하게 된다. 학생들은 영화 속 인물의 상황을 평가하고, '내가 만약 주인공이라면 어떻게 할 것인지'에 대한 답을 통해 영화 속 인물이 당면한 고난을 간접 경험하고, 자신은 어떻게 할 것인가를 고민해본다. 주인공의 뛰어난 점을 동경하고, 자신의 삶을 성찰해본다. 이러한 과정을 통해 학생들은 자신의 감정과 문제의 상황을 살펴보고 해결할 수 있는 방법을 구체적으로 제시하게 된다. 결국 영화를 통해 학생들의 감정은 충분히 치유될 수 있는 것이다. 영화를 통한 치유는 치료자가 내담자를 고려한 영화선정에서 출발해야 한다. 이를 적용한 구체적인 방법도 충분히 제시할 필요가 있다. 영화치유의 방안은 앞으로 다양한 치유 방법의 제시로 더욱 발전할 수 있으리라 기대한다.

Redescription of Two Species of Triconia (Copepoda, Cyclopoida, Oncaeidae) Based on Their First Records in the Tropical Pacific

  • Cho, Kyuhee;Kim, Woong-Seo;Lee, Wonchoel
    • 환경생물
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    • 제35권1호
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    • pp.64-82
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    • 2017
  • Two species of the minuta-subgroup within the oncaeid copepod genus Triconia $B{\ddot{o}}ttger$-Schnack, 1999 collected in the equatorial Pacific Ocean are newly recorded. A female T. minuta (Giesbrecht, 1893 ["1892"]) and both male and female T. umerus ($B{\ddot{o}}ttger$-Schnack and Boxshall, 1990) from the northeast equatorial Pacific are redescribed with the comparison of its morphological details, which differs from previous studies, in terms of the larger body size, the length to width ratio of the genital double-somite, the relative length of the outer basal seta on P5, and the ornamentation of the appendages. The characters, which are used for identification, such as the length ratio of the outer subdistal and outer spine versus the distal spine on P3-P4, and the outer spine length of the middle exopodal segment on P3 and P4 are reported for the first time. Information on the variations in the endopodal spine lengths of swimming legs 2-4 is also provided for T. minuta and T. umerus, with the summary of the wide zoogeographical distribution of these two species.

울릉도의 자생란과 공생하는 난균근균의 분자생물학적 동정 (Molecular Identification of Orchid Mycorrhizal Fungi of Native Orchids in Ulleung Island)

  • 염재영;정재민;이병천;엄안흠
    • 한국균학회지
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    • 제39권1호
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    • pp.7-10
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    • 2011
  • 울릉도에서 채집된 6종의 지생란의 뿌리에서 난균근균을 확인하였다. 난균근균의 감염이 확인되었다. 각 종의 뿌리로 부터 분리된 난균근균이 분자적인 분석을 통하여 확인되였다. 뿌리로부터 분리된 균에서 DNA를 추출하여, 담자균류에 특이적인 프라이머인 ITS1-OF와 ITS4-OF를 사용하여 ITS 지역을 증폭한 후 염기서열을 분석하여 두 식물의 뿌리에 공생하는 난균근균을 동정하였다. 분자적인 분석을 통해 Tulasnellaceae 와 Ceratobasidaceae에 속하는 난균근균이 확인되었다.