• 제목/요약/키워드: HisRS

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Polymorphisms in DNA Repair Genes and Risk of Glioma and Meningioma

  • Luo, Ke-Qin;Mu, Shi-Qing;Wu, Zhong-Xue;Shi, Yi-Ni;Peng, Ji-Cai
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권1호
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    • pp.449-452
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    • 2013
  • Polymorphisms in DNA repair genes have been shown to influence DNA repair processes and to modify cancer susceptibility. Here we conducted a case-control study to assess the role of potential SNPs of DNA repair genes on the risk of glioma and meningioma. We included 297 cases and 458 cancer-free controls. Genotyping of XRCC1 Gln399Arg, XRCC1 Arg194Trp, XRCC2 Arg188His, XRCC3 Thr241Met, XRCC4 Ala247Ser, ERCC1 Asn118Asp, ERCC2 Lys751Gln and ERCC5 Asp1558His were performed in a 384-well plate format on the Sequenom MassARRAY platform. XRCC1 Arg194Trp (rs1799782) and ERCC2 Asp312Asn rs1799793 did not follow the HWE in control group, and genotype distributions of XRCC1 Gln399Arg rs25487, XRCC2 Arg188His rs3218536 and ERCC2 Asp312Asn rs1799793 were significantly different between cases and controls (P<0.05). We found XRCC1 399G/G, XRCC1 194 T/T and XRCC3 241T/T were associated with a higher risk when compared with the wild-type genotype. For ERCC5 Asp1558His, we found G/G genotype was associated with elevated susceptibility. In conclusion, our study has shown that XRCC1 Gln399Arg, XRCC1 Arg194Trp, XRCC3 Thr241Met and ERCC5 Asp1558His are associated with risk of gliomas and meningiomas. This finding could be useful in identifying the susceptibility genes for these cancers.

개선된 변환영역 RS 복호기의 VLSI 설계 (A VLSI Design of Modified Transform RS Decoder)

  • 박혁찬;박종진국일호조원경
    • 대한전자공학회:학술대회논문집
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    • 대한전자공학회 1998년도 하계종합학술대회논문집
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    • pp.281-284
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    • 1998
  • In this paper, a RS(Reed-Solomon) docoder is designed in the transform domain instead of most time domain. The transform RS decoder have simpler structure for error-correction procedure but because of his larger chip area, the time domain RS decoder is popular currently. To solve this proplem, the nomal basis representation and the conjugate property is utilized. Therefore the chip area can be reduced for the stucture of syndrome delay, nomalization and inverse transform circuit. These modified structures have been implemented using VHDL and synthesized on 0.8${\mu}{\textrm}{m}$ CMOS technology. The results have been compared with other structure for chip area and performance.

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Structural Basis for the Antibiotic Resistance of Eukaryotic Isoleucyl-tRNA Synthetase

  • Chung, Scisung;Kim, Sulhee;Ryu, Sung Ho;Hwang, Kwang Yeon;Cho, Yunje
    • Molecules and Cells
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    • 제43권4호
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    • pp.350-359
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    • 2020
  • Pathogenic aminoacyl-tRNA synthetases (ARSs) are attractive targets for anti-infective agents because their catalytic active sites are different from those of human ARSs. Mupirocin is a topical antibiotic that specifically inhibits bacterial isoleucyl-tRNA synthetase (IleRS), resulting in a block to protein synthesis. Previous studies on Thermus thermophilus IleRS indicated that mupirocin-resistance of eukaryotic IleRS is primarily due to differences in two amino acids, His581 and Leu583, in the active site. However, without a eukaryotic IleRS structure, the structural basis for mupirocin-resistance of eukaryotic IleRS remains elusive. Herein, we determined the crystal structure of Candida albicans IleRS complexed with Ile-AMP at 2.9 A resolution. The largest difference between eukaryotic and prokaryotic IleRS enzymes is closure of the active site pocket by Phe55 in the HIGH loop; Arg410 in the CP core loop; and the second Lys in the KMSKR loop. The Ile-AMP product is lodged in a closed active site, which may restrict its release and thereby enhance catalytic efficiency. The compact active site also prevents the optimal positioning of the 9-hydroxynonanoic acid of mupirocin and plays a critical role in resistance of eukaryotic IleRS to anti-infective agents.

프라이버시 보호를 위한 개선된 RFID 인증 프로토콜 (Improved Authentication Protocol for Privacy Protection in RFID Systems)

  • 오세진;이창희;윤태진;정경호;안광선
    • 한국통신학회논문지
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    • 제38C권1호
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    • pp.12-18
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    • 2013
  • 2012년 태그의 고유 식별 정보를 안전하게 숨기고, 매 세션 다른 값을 생성하기 위해서 해시함수와 AES 알고리즘을 모두 사용하는 DAP3-RS(Design of Authentication Protocol for Privacy Protection in RFID Systems)을 제안하였다. DAP3-RS 논문에서 Hash-Lock 프로토콜의 metaID가 고정되는 문제점을 AES(Advanced Encryption Standard) 알고리즘으로 해결하였고, 리더, 태그의 난수로 인증 과정을 거치기 때문에 스푸핑 공격, 재전송 공격, 트래픽 분석 등 다양한 공격에 안전하다고 주장하였다. 그러나 그의 주장과는 달리 고정된 해시 값으로 트래픽 분석이 가능하며, 리더와 태그사이의 동일한 데이터 값으로 인해 공격자임에도 불구하고 인증과정을 통과할 수 있다. 본 논문에서는 DAP3-RS가 공격자의 공격에 취약함을 증명한다. 그리고 AES 알고리즘 기반의 인증 프로토콜을 제안하고, 제안 프로토콜이 DAP3-RS에 비해 안전하고 효율적임을 증명한다.

Molecular Docking Study of Aminoacyl-tRNA Synthetases with Ligand Molecules from Four Different Scaffolds

  • Bharatham, Nagakumar;Bharatham, Kavitha;Lee, Yu-No;Kim, Song-Mi;Lazar, Prettina;Baek, A-Young;Park, Chan-In;Eum, Hee-Sung;Ha, Hyun-Joon;Yun, Sae-Young;Lee, Won-Koo;Kim, Sung-Hoon;Lee, Keun-Woo
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제31권3호
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    • pp.606-610
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    • 2010
  • Aminoacyl-tRNA synthetases (aaRSs) play vital roles in protein biosynthesis of living organisms and are interesting antibacterial drug targets. In order to find out new inhibitor candidate molecules as antibacterial agent, the binding modes of the candidate molecules were investigated at the active sites of aaRSs by molecular docking study. The docking simulations were performed with 48 compounds from four different scaffolds into the eight different aaRSs. The results show that scaffolds 3 and 4 compounds have consistently better binding capabilities, specifically for HisRS (E. coli) and IleRS (S. aureus). The binding modes of the best compounds with the proteins were well compatible with those of two ligands in crystal structures. Therefore, we expect that the final compounds we present may have reasonable aaRS inhibitory activity.

아미노-말단 리보플라빈 생성효소 단백질의 형광 특성 (Spectrofluorometric Characteristics of the N-Terminal Domain of Riboflavin Synthase)

  • 김류련;이정환;남기석;고경원;이찬용
    • 미생물학회지
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    • 제47권1호
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    • pp.14-21
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    • 2011
  • 리보플라빈 생성효소(riboflavin synthase)는 기질인 두 분자의 6,7-dimetyl-8-ribityllumazine과 결합 후, 4-탄소 단위(4-carbon unit)의 자리 옮김 반응을 거쳐 한 분자의 리보플라빈과 한 분자의 pyrimidine 유도체를 형성하는 반응을 촉매한다. 대장균(Escherichia coli) 리보플라빈 생성효소의 아미노-말단 도메인 절반(N-terminal domain half)과 카복시-말단 도메인 절반(C-terminal domain half)은 매우 유사한 내부 자체 아미노산 서열(intra-molecular amino acid sequence)을 갖는다. 아미노-말단 영역 리보플라빈 생성효소(N-RS) 단백질의 구조와 형광 특성을 알아보기 위하여 중합효소 연쇄 반응과 위치지정 돌연변이를 통하여 10개 이상의 돌연변이 아미노-말단 리보플라빈 생성효소 단백질을 코드 하는 유전자를 증폭시켜 pQE30 벡터에 삽입한 재조합 플라스미드를 제조하여, 과발현시킨 후 분리 정제하였다. 대부분의 아미노-말단 도메인 리보플라빈 생성효소의 돌연변이 단백질들은 야생형과 같이 형광성 리간드인 6,7-dimetyl-8-ribityllumazine 혹은 리보플라빈과 결합할 수 있는 능력을 지니고 있었으나, N-RS C47D, N-RS ET66,67DQ 돌연변이 단백질의 경우는 리간드와의 결합능력이 현저히 떨어져 형광을 띠지 않았다. 대부분의 돌연변이 단백질들의 형광 세기는 야생형 단백질(N-RS wt)보다 낮았으나, N-RS C48S는 예외적으로 야생형 단백질에 비해 2배 이상의 형광세기를 가졌다. 이와 같은 결과를 바탕으로 리보플라빈 생성효소와 형광성 리간드 사이의 상호작용을 예측 할 수 있으며, N-RS C48S 돌연변이 단백질의 형광성을 활용하여 효과적으로 효소 저해제를 발굴할 수 있는 고속다중 스크리닝 법(high-throughput screening system)으로써 활용될 수 있을 것이다.

A novel mutation in XLRS1 gene in X-linked juvenile retinoschisis

  • Kim, Da Hyun;Heo, Sun Hee;Seo, Go Hun;Oh, Arum;Kim, Taeho;Kim, Gu-Hwan;Yoon, Young Hee;Yoo, Han-Wook;Lee, Beom Hee
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제15권1호
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    • pp.13-16
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    • 2018
  • X-linked juvenile retinoschisis (XLRS) is characterized by the progressive loss of visual acuity and vitreous hemorrhage. XLRS is caused by a mutation of retinoschisin 1 (RS1) gene at Xp22.13. In the current report, a 2-year-old Korean patient with XLRS was described. The germline deletion of exon 1 was identified in the RS1 gene. Considering X-linked inheritance pattern, validation of a carrier state of a patient's mother is important for the genetic counseling of other family members and for the future reproductive plan. To confirm the carrier state of his mother, the multiplex ligation-dependent probe amplification analysis was done using peripheral leukocytes and found the heterozygous deletion of exon 1 in his mother.

임베디드 리눅스 환경에서 RFID 기반의 Mobile Telemedicine System 구현 (Design of Mobile Telemedicine System using RFID based on Embedded Linux)

  • 윤찬영
    • 한국콘텐츠학회:학술대회논문집
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    • 한국콘텐츠학회 2006년도 춘계 종합학술대회 논문집
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    • pp.479-482
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    • 2006
  • Mobile Telemedicine은 의료진과 환자간의 정보교환을 제공하기위한 일반적인 기술로 사용되어지고 있다. 또한 유비쿼터스 센서 네트워크의 기술을 활용하여 의료진은 원격지 환자의 다양한 생체데이터를 획득하고자 한다. 본 논문은 임베디드 리눅스 운영체제를 기반으로 Intel X-Hyper PXA255 ARM CPU를 이용하여 구현한 RFID 리더 시스템에서 RFID 리더에서 수신되어진 환자의 태그 정보를 무선 LAN을 통하여 인터넷에 연결되어진 병원의 MySQL서버에 전달하는 기능을 수행하는 RFID 리더 플랫폼의 설계 및 구현을 위한 것이다. 구현되어진 임베디드 리눅스 기반의 RFID 리더는 크게 RFID 모듈, ARM 프로세서, RS-232 인터페이스, 무선 LAN 등으로 구성되고, 제안된 논문은 RFID의 개념 및 리더의 동작원리를 소개하고 임베디드 리눅스기반에서 QT 및 MySQL을 사용하여 구현되어진 리더플랫폼을 제안하고 구현한다.

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고려의 관학과 효경

  • 전준우
    • 한국도서관정보학회지
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    • 제3권
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    • pp.79-88
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    • 1976
  • In Ecorea Lrynasty, the authority all officers a compulsary obligatic.~ to learn the Nyo-I~.'z~\ulcorneruzngd er the custody of a super1 iscr o; Letters wino -1 a\ulcorner the ~ejponsible officer to train ci~ril senants. The Nyo-Kjli ilg was possible to interpret the pious love of ci I illans to the~re lders as a mutual ethics between the parental ber~ec;~lc nce and the filial piety of inferiors which n-as far superior to the traditional cthic; that was laid on an firm obligation of inieri~rs to tEei:- elders. The filial piety as a lovc for elders mean2 a mutual harrn~n:a~n d show\ulcorner a berieiolent conduct as an influence of a political morality. Thc heaer-o!erLt conduct was developed as a political morality of Confucius originated from the filial piety of Confucius based on a moral policj . Such a kenerolent conduct is to become a main spring to effect a mutual tie betn-een the king and his people as a national system of the Confucian theory. In i*

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클라우드 마켓 컴퓨팅을 위한 효율적인 리소스 추천시스템 (Efficient Resource Recommendation System for Cloud Market Computing)

  • 한승민;허의남;윤장우
    • 인터넷정보학회논문지
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    • 제11권3호
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    • pp.121-129
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    • 2010
  • 최근 그린IT의 이슈와 더불어 컴퓨터 자원을 효율적으로 운용할 수 있는 클라우드 컴퓨팅 기반의 서비스들이 거대한 시장을 형성하고 있다. 다양한 서비스의 수가 급격하게 증가하고 있는 상황에서 클라우드 컴퓨팅에 존재하는 리소스들을 조합하여 여러 영역에서 필요로 하는 서비스를 제공해주는 추천시스템을 이용한 클라우드 마켓 시스템을 구성해보고자 한다. 기존의 클라우드 컴퓨팅은 제한된 리소스들을 바탕으로 가격과 성능에 맞는 추천 시스템을 구성하였다. 그러나 클라우드 마켓을 이용한 추천 시스템에 관한 연구는 미비한 상황이다. 본 논문에서는 거대한 클라우드 마켓 내의 리소스들을 관리하기 위한 클라우드 마켓 시스템과 마켓 내의 제공되는 클라우드 컴퓨팅 서비스를 평가하고 평가된 서비스들을 이용하여 클라우드 리소스 추천 시스템을 구성한다. 제안된 시스템은 실험을 통해 효율적인 리소스 분배와 리소스 관리 서비스를 활용한 클라우드 마켓 모델을 제공해 준다.