• 제목/요약/키워드: Hierarchical Likelihood

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Identifying Copy Number Variants under Selection in Geographically Structured Populations Based on F-statistics

  • Song, Hae-Hiang;Hu, Hae-Jin;Seok, In-Hae;Chung, Yeun-Jun
    • Genomics & Informatics
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    • 제10권2호
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    • pp.81-87
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    • 2012
  • Large-scale copy number variants (CNVs) in the human provide the raw material for delineating population differences, as natural selection may have affected at least some of the CNVs thus far discovered. Although the examination of relatively large numbers of specific ethnic groups has recently started in regard to inter-ethnic group differences in CNVs, identifying and understanding particular instances of natural selection have not been performed. The traditional $F_{ST}$ measure, obtained from differences in allele frequencies between populations, has been used to identify CNVs loci subject to geographically varying selection. Here, we review advances and the application of multinomial-Dirichlet likelihood methods of inference for identifying genome regions that have been subject to natural selection with the $F_{ST}$ estimates. The contents of presentation are not new; however, this review clarifies how the application of the methods to CNV data, which remains largely unexplored, is possible. A hierarchical Bayesian method, which is implemented via Markov Chain Monte Carlo, estimates locus-specific $F_{ST}$ and can identify outlying CNVs loci with large values of FST. By applying this Bayesian method to the publicly available CNV data, we identified the CNV loci that show signals of natural selection, which may elucidate the genetic basis of human disease and diversity.

주제공원 이용자들의 선택행동 연구 -Constraints-Induced Conjoint Choice Model의 적용- (A Study on the Theme Park Users' Choice behavior -Application of Constraints-Induced Conjoint Choice Model-)

  • 홍성권;이용훈
    • 한국조경학회지
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    • 제28권2호
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    • pp.18-27
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    • 2000
  • The importance of constraints has been one of major issues in recreation for prediction of choice behavior; however, traditional conjoint choice model did not consider the effects of these variables or fail to integrate them into choice model adequately. The purposes of this research are (a) to estimate the effects of constraints in theme park choice behavior by the constraints-induced conjoint choice model, and (b) to test additional explanatory power of the additional constraints in this suggested model against the more parsimonious traditional model. A leading polling agency was employed to select respondents. Both alternative generating and choice set generating fractional factorial design were conducted to meet the necessary and sufficient conditions for calibration of the constraints-induced conjoint choice model. Th alternative-specific model was calibrated. The log-likelihood ratio test revealed that suggested model was accepted in the favor of the traditional model, and the goodness-of-fit($\rho$$^2$) of suggested and traditional model was 0.48427 and 0.47950, respectively. There was no difference between traditional and suggested model in estimates of attribute levels of car and shuttle bus because alternatives were created to estimate the effects of constraints independently from mode related variables. Most parameters values of constraints had the expected sign and magnitude: the results reflected the characteristics of the theme parks, such as abundance of natural attractions and poor accessibility in Everland, location of major fun rides indoor in Lotte World, city park like characteristics of Dream Land, and traffic jams in Seoul. Instead of the multinomial logit model, the nested logit model is recommended for future researches because this model more reasonably reflects the real decision-making process in park choice. Development of new methodology too integrate this hierarchical decision-making into choice model is anticipated.

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확률론적 베이지언 모델링에 의한 케이블 교량의 복합열화 리스크 평가 및 예측시스템 (The Risk Assessment and Prediction for the Mixed Deterioration in Cable Bridges Using a Stochastic Bayesian Modeling)

  • 조태준;이정배;김성수
    • 한국구조물진단유지관리공학회 논문집
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    • 제16권5호
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    • pp.29-39
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    • 2012
  • 상관관계가 높은 복합열화의 완벽한 개별예측모델의 개발은 매우 어려운 문제로, 본 논문에서는 현수교 시스템의 미래열화와 유지 예산을 예측하기 위하여, 10년간의 유지 데이터가 주어진 매개변수(파손지표와 사용성)의 사후 확률 밀도함수를 찾기 위해 베이지언 추론을 적용하였다. 마르코프 연쇄 몬테카를로법을 이용하여 매개변수의 사후 분포를 조사하였다. 감소한 사용성의 모의위험예측은 사전분포와 연간유지 업무에서 업데이트한 데이터의 가능성에 따라 작성한 사후 분포이다. 기존의 선형 예측 모델과 비교하면, 제안된 2차 모델은 교량부품의 사용성, 위험요소, 그리고 유지 예산의 측정 데이터에 대하여 매우 개선된 수렴성과 근접성을 제공한다. 따라서 제안된 2차 추계학적 회귀 모델을 기반으로 복잡한 사회간접설비의 미래 성능과 유지관리예산을 예측하고 제어할 수 있는 기회를 제공할 것으로 기대한다.

외환위기 전후 청년 코호트의 노동경력 비교 (The Change of Work Careers in Youth Cohort pre and post-the Economic Crisis-)

  • 문혜진
    • 한국사회복지학
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    • 제65권1호
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    • pp.201-226
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    • 2013
  • 외환위기 이후 청년실업의 증가가 사회적 문제로 부각되었으나, 청년층의 노동시장 경험에 관한 연구는 제한적으로 이루어져 왔다. 본 연구에서는 노동경력을 단순한 일자리 이동과 달리 노동지위의 연속적 배열과 순서적이고 위계적인 변화과정으로 개념화하였으며, 배열분석을 활용하여 외환위기 전후 청년층의 노동경력을 노동지위의 다양한 측면에서 비교하였다. 분석 결과, 외환위기 이후 첫 일자리로의 이행기간이 장기화되고 고용형태와 사업장 규모 면에서 첫 일자리의 질적 저하가 발생하였음이 확인되었다. 또한 외환위기 이후 청년 코호트는 미취업형과 실업형, 비대기업형, 비정규직형 및 이동형 특성을 갖는 경력유형에 속할 상대적 위험률이 높았다. 이러한 결과는 전반적으로 외환위기 이후 청년층의 고용불안정성이 더 커졌으며, 내부노동시장형에 비해 외부노동시장형 경력유형이 상대적으로 증가한 것을 의미한다.

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무응답을 가지고 있는 범주형 자료에 대한 모형 선택 방법 (Model selection method for categorical data with non-response)

  • 윤용화;최보승
    • Journal of the Korean Data and Information Science Society
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    • 제23권4호
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    • pp.627-641
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    • 2012
  • 본 연구는 다차원 분할표 형태로 정리된 범주형 자료가 결측치나 무응답을 가지고 있을 때 주어진 자료를 가장 잘 설명하고 예측의 정확도를 높일 수 있는 모형의 추정과 모형의 선택 문제를 다루었다. 무시할 수 없는 무응답 (non-ignorable non-response)체계하에서 최대우도 추정에서 발생할 수 있는 변방값 문제를 해결하기 위하여 계층적 베이지안 모형을 고려하였다. 또한 모형 적도를 높이기 위한 변수 조합을 찾는 모형 선택의 문제를 함께 다루었다. 베이지안 접근하에서 모형 선택의 문제를 다루기 위하여 베이즈 인자 (Bayes factor)를 모형 선택의 기준으로 이용하였다. 제시된 방법은 2004년 실시된 우리나라 국회의원 선거를 앞두고 수행된 여론조사 데이터를 이용하여 실증분석을 수행하였다. 분석결과 무시할 수 없는 무응답 체계하에서 설명변수로 투표참여여부를 이용하는 것이 가장 적합한 모형으로 판명되었다.

Human Error Analysis in a Permit to Work System: A Case Study in a Chemical Plant

  • Jahangiri, Mehdi;Hoboubi, Naser;Rostamabadi, Akbar;Keshavarzi, Sareh;Hosseini, Ali Akbar
    • Safety and Health at Work
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    • 제7권1호
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    • pp.6-11
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    • 2016
  • Background: A permit to work (PTW) is a formal written system to control certain types of work which are identified as potentially hazardous. However, human error in PTW processes can lead to an accident. Methods: This cross-sectional, descriptive study was conducted to estimate the probability of human errors in PTWprocesses in a chemical plant in Iran. In the first stage, through interviewing the personnel and studying the procedure in the plant, the PTW process was analyzed using the hierarchical task analysis technique. In doing so, PTWwas considered as a goal and detailed tasks to achieve the goal were analyzed. In the next step, the standardized plant analysis risk-human (SPAR-H) reliability analysis method was applied for estimation of human error probability. Results: The mean probability of human error in the PTW system was estimated to be 0.11. The highest probability of human error in the PTW process was related to flammable gas testing (50.7%). Conclusion: The SPAR-H method applied in this study could analyze and quantify the potential human errors and extract the required measures for reducing the error probabilities in PTW system. Some suggestions to reduce the likelihood of errors, especially in the field of modifying the performance shaping factors and dependencies among tasks are provided.

퍼지 클래스 벡터를 이용하는 다중센서 융합에 의한 무감독 영상분류 (Unsupervised Image Classification through Multisensor Fusion using Fuzzy Class Vector)

  • 이상훈
    • 대한원격탐사학회지
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    • 제19권4호
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    • pp.329-339
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    • 2003
  • 본 연구에서는 무감독 영상분류를 위하여 특성이 다른 센서로 수집된 영상들에 대한 의사결정 수준의 영상 융합기법을 제안하였다. 제안된 기법은 공간 확장 분할에 근거한 무감독 계층군집 영상분류기법을 개개의 센서에서 수집된 영상에 독립적으로 적용한 후 그 결과로 생성되는 분할지역의 퍼지 클래스 벡터(fuzzy class vector)를 이용하여 각 센서의 분류 결과를 융합한다. 퍼지 클래스벡터는 분할지역이 각 클래스에 속할 확률을 표시하는 지시(indicator) 벡터로 간주되며 기대 최대화 (EM: Expected Maximization) 추정 법에 의해 관련 변수의 최대 우도 추정치가 반복적으로 계산되어진다. 본 연구에서는 같은 특성의 센서 혹은 밴드 별로 분할과 분류를 수행한 후 분할지역의 분류결과를 퍼지 클래스 벡터를 이용하여 합성하는 접근법을 사용하고 있으므로 일반적으로 다중센서의 영상의 분류기법에 사용하는 화소수준의 영상융합기법에서처럼 서로 다른 센서로부터 수집된 영상의 화소간의 공간적 일치에 대한 높은 정확도를 요구하지 않는다. 본 연구는 한반도 전라북도 북서지역에서 관측된 다중분광 SPOT 영상자료와 AIRSAR 영상자료에 적용한 결과 제안된 영상 융합기법에 의한 피복 분류는 확장 벡터의 접근법에 의한 영상 융합보다 서로 다른 센서로부터 얻어지는 정보를 더욱 적합하게 융합한다는 것을 보여주고 있다.

Associations Between Conventional Healthy Behaviors and Social Distancing During the COVID-19 Pandemic: Evidence From the 2020 Community Health Survey in Korea

  • Rang Hee, Kwon;Minsoo, Jung
    • Journal of Preventive Medicine and Public Health
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    • 제55권6호
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    • pp.568-577
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    • 2022
  • Objectives: Many studies have shown that social distancing, as a non-pharmaceutical intervention (NPI) that is one of the various measures against coronavirus disease 2019 (COVID-19), is an effective preventive measure to suppress the spread of infectious diseases. This study explored the relationships between traditional health-related behaviors in Korea and social distancing practices during the COVID-19 pandemic. Methods: Data were obtained from the 2020 Community Health Survey conducted by the Korea Disease Control and Prevention Agency (n=98 149). The dependent variable was the degree of social distancing practice to cope with the COVID-19 epidemic. Independent variables included health-risk behaviors and health-promoting behaviors. The moderators were vaccination and unmet medical needs. Predictors affecting the practice of social distancing were identified through hierarchical multiple logistic regression analysis. Results: Smokers (adjusted odds ratio [aOR], 0.924) and frequent drinkers (aOR, 0.933) were more likely not to practice social distancing. A greater degree of physical activity was associated with a higher likelihood of practicing social distancing (aOR, 1.029). People who were vaccinated against influenza were more likely to practice social distancing than those who were not (aOR, 1.150). However, people with unmet medical needs were less likely to practice social distancing than those who did not experience unmet medical needs (aOR, 0.757). Conclusions: Social distancing practices were related to traditional health behaviors such as smoking, drinking, and physical activity. Their patterns showed a clustering effect of health inequality. Therefore, when establishing a strategy to strengthen social distancing, a strategy to protect the vulnerable should be considered concomitantly.

Genomic partitioning of growth traits using a high-density single nucleotide polymorphism array in Hanwoo (Korean cattle)

  • Park, Mi Na;Seo, Dongwon;Chung, Ki-Yong;Lee, Soo-Hyun;Chung, Yoon-Ji;Lee, Hyo-Jun;Lee, Jun-Heon;Park, Byoungho;Choi, Tae-Jeong;Lee, Seung-Hwan
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제33권10호
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    • pp.1558-1565
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    • 2020
  • Objective: The objective of this study was to characterize the number of loci affecting growth traits and the distribution of single nucleotide polymorphism (SNP) effects on growth traits, and to understand the genetic architecture for growth traits in Hanwoo (Korean cattle) using genome-wide association study (GWAS), genomic partitioning, and hierarchical Bayesian mixture models. Methods: GWAS: A single-marker regression-based mixed model was used to test the association between SNPs and causal variants. A genotype relationship matrix was fitted as a random effect in this linear mixed model to correct the genetic structure of a sire family. Genomic restricted maximum likelihood and BayesR: A priori information included setting the fixed additive genetic variance to a pre-specified value; the first mixture component was set to zero, the second to 0.0001×σ2g, the third 0.001×σ2g, and the fourth to 0.01×σ2g. BayesR fixed a priori information was not more than 1% of the genetic variance for each of the SNPs affecting the mixed distribution. Results: The GWAS revealed common genomic regions of 2 Mb on bovine chromosome 14 (BTA14) and 3 had a moderate effect that may contain causal variants for body weight at 6, 12, 18, and 24 months. This genomic region explained approximately 10% of the variance against total additive genetic variance and body weight heritability at 12, 18, and 24 months. BayesR identified the exact genomic region containing causal SNPs on BTA14, 3, and 22. However, the genetic variance explained by each chromosome or SNP was estimated to be very small compared to the total additive genetic variance. Causal SNPs for growth trait on BTA14 explained only 0.04% to 0.5% of the genetic variance Conclusion: Segregating mutations have a moderate effect on BTA14, 3, and 19; many other loci with small effects on growth traits at different ages were also identified.

건강신념모델을 적용한 호남지역 방사선사의 방사선 방어행위 수행도 관련 요인 (The Associated Factors of Protective Behaviors for Radiation Exposure based on Health Belief Model Honam Province Radiologic Technologists)

  • 윤요상;류소연;박종;최성우;오혜종
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제21권3호
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    • pp.96-107
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    • 2020
  • 본 연구는 방사선사를 대상으로 건강신념모델을 적용하여 방사선사 방사선 방어행위 수행도와의 관련 요인을 규명하고자 하였다. 연구대상은 호남지역 내에 근무하는 방사선사 541명을 대상으로 시행되었다. 자료 분석은 SPSS version 18.0 프로그램을 이용하여 t-test, ANOVA, Pearson's correlation, 위계적 다중회귀분석을 하였다. 자료 분석을 실시한 결과는 수정변수에서 교육수준이 높을수록, 일반촬영실 보다는 핵의학검사실 업무 담당자, 신체활동이 많은 경우, 스트레스는 나쁜 경우 보다는 보통인 경우, 방어시설이 좋을수록 방사선 방어행위 수행도가 높았다. 개인의 인지에서 행동계기(β=.292, p<.001), 인지된 심각성(β=.075, p=.010)이 방사선 방어행위 수행도에 영향을 미치는 요인이었다. 행위가능성은 유익성(β=.168, p<.001), 자기효능감(β=.148, p=.007)이 높을수록 방사선 방어행위 수행도가 높았다. 결론적으로 적절한 행동계기가 방어행위에 수행하도록 자극을 줄 수 있는 방어교육을 제공하고, 방사선 방어행위에 있어서 이익을 부각시키는 한편, 높은 수준의 자기효능감을 강화시켜 방어행위 수행도를 높일 필요가 있다. 또한, 방사선에 대한 심각성을 제대로 인지할 수 있도록 관련 정보를 제공하면, 궁극적으로 방사선사의 방사선 방어행위 수행도가 증가할 것이다.