• 제목/요약/키워드: H1N1 influenza virus

검색결과 181건 처리시간 0.027초

생명정보학 기반 H5N1에 특이적인 진단키트 개발을 위한 epitope 선별 (Selection of epitope for development of H5N1 specific diagnostic kit based on bioinformatics)

  • 이인성;김학용
    • 한국콘텐츠학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국콘텐츠학회 2014년도 추계 종합학술대회 논문집
    • /
    • pp.57-58
    • /
    • 2014
  • 인플루엔자 A 바이러스의 아형인 H5N1은 고병원성으로 조류 독감을 일으킨다. H5N1 바이러스는 원래 조류끼리만 감염되는 독감이고, 사람에게는 전염되지 않는다고 알려져 있었으나, 2003년에 베트남과 중국을 시작으로 현재까지 168명의 사망자가 기록되고 있다. 그러나 현재 시판되고 있는 진단키트(Rapid diagnostic kits)들은 H5N1 에 특이적인 것이 아니라 influenza A virus 모두를 진단한다. 따라서 influenza 감염여부는 확인 할 수 있지만, 이것이 H5N1 인지는 확인 할 수가 없다. H5N1은 전염성이 강하기 때문에 빠르게 진단하여 감염조류를 살 처분 하여야 더 많은 경제적 손실을 줄일 수 있다. 따라서 H5N1 에만 특이적인 epitope를 네트워크 기반으로 예측하여 진단제에 응용할 수 있도록 하고자 한다. 각 서열 정보는 Openflu (http://openflu. vital-it.ch/browse.php)에서 얻었다. H5N1은 H1N1에서 유래되었기 때문에 두 subtype의 차이점을 알아보고자 TCOFFEE에서 multiple sequence alignment를 수행한 결과 N-terminal 부분이 상이하였다. 상이한 H5N1의 N-terminal 부분이 H5N1 virus에 감염된 모든 host에서 존재하는지 알아보기 위해 host가 사람인 경우와 조류인 경우를 TCOFFEE에서 alignment 하였다. 그 결과 H5N1의 N-terminal 부분은 사람과 조류에서 보존적이었다. 따라서 H5N1의 N-terminal이 다른 subtype과 유사하지 않고 H5에만 특이적이기 때문에 진단키트 제작을 위한 epitope로 사용할 수 있을 것으로 기대된다.

  • PDF

Development of Multiplex RT-PCR Assays for Rapid Detection and Subtyping of Influenza Type A Viruses from Clinical Specimens

  • Chang, Hee-Kyoung;Park, Jeung-Hyun;Song, Min-Suk;Oh, Taek-Kyu;Kim, Seok-Young;Kim, Chul-Jung;Kim, Hyung-Gee;Sung, Moon-Hee;Han, Heon-Seok;Hahn, Youn-Soo;Choi, Young-Ki
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제18권6호
    • /
    • pp.1164-1169
    • /
    • 2008
  • We developed multiplex RT-PCR assays that can detect and identify 12 hemagglutinin (H1-H12) and 9 neuraminidase (N1-N9) subtypes that are commonly isolated from avian, swine, and human influenza A viruses. RT-PCR products with unique sizes characteristic of each subtype were amplified by multiplex RT-PCRs, and sequence analysis of each amplicon was demonstrated to be specific for each subtype with 24 reference viruses. The specificity was demonstrated further with DNA or cDNA templates from 7 viruses, 5 bacteria, and 50 influenza A virus-negative specimens. Furthermore, the assays could detect and subtype up to $10^5$ dilution of each of the reference viruses that had an original infectivity titer of $10^6\;EID_{50}/ml$. Of 188 virus isolates, the multiplex RT-PCR results agreed completely with individual RT-PCR subtyping results and with results obtained from virus isolations. Furthermore, the multiplex RT-PCR methods efficiently detected mixed infections with at least two different subtypes of influenza viruses in one host. Therefore, these methods could facilitate rapid and accurate subtyping of influenza A viruses directly from field specimens.

Pandemic Influenza (H1N1) and Mycobacterium tuberculosis Co-infection

  • Park, Yehyun;Chin, Bum Sik;Han, Sang Hoon;Yun, Yujung;Kim, Young Ju;Choi, Jun Yong;Kim, Chang Oh;Song, Young Goo;Kim, June Myung
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
    • /
    • 제76권2호
    • /
    • pp.84-87
    • /
    • 2014
  • We hereby observe four co-infection cases of pandemic influenza H1N1 and Mycobacterium tuberculosis with various clinical presentations. It may be prudent to consider M. tuberculosis co-infections when patients with pandemic influenza reveal unusual clinical features that do not improve despite appropriate treatments against the influenza, especially in Korea, in the endemic areas of M. tuberculosis.

Intake of Korean Red Ginseng Extract and Saponin Enhances the Protection Conferred by Vaccination with Inactivated Influenza A Virus

  • Xu, Mei Ling;Kim, Hyoung-Jin;Choi, Yoo-Ri;Kim, Hong-Jin
    • Journal of Ginseng Research
    • /
    • 제36권4호
    • /
    • pp.396-402
    • /
    • 2012
  • Vaccination is the main strategy for preventing influenza infection. However, vaccine efficacy is influenced by several factors, including age and health status. The efficacy of the influenza vaccine is much lower (17% to 53%) in individuals over 65 yr of age compared with young adults (70% to 90%). Therefore, increasing vaccine efficacy remains a challenge for the influenza vaccine field. In this study, we investigated the impact of supplementing vaccination with the dietary intake of Korean red ginseng (RG) extract and RG saponin. Mice were immunized two times intranasally with inactivated influenza A (H1N1) virus. Mice received RG extract or RG saponin orally for 14 d prior to the primary immunization. After the primary immunization, mice continued to receive RG extract or RG saponin until the secondary immunization. Mice vaccinated in combination with dietary intake of RG extract and RG saponin showed elevated serum anti-influenza A virus IgG titers and improved survival rates in lethal influenza A virus infection: 56% and 63% of mice receiving RG extract or RG saponin survived, respectively, while 38% of mice that only received the vaccine survived. Moreover, mice receiving RG extract supplementation recovered their body weight more quickly than those not receiving RG extract supplementation. We propose that the dietary intake of RG extract and RG saponin enhances the vaccine-induced immune response and aids in providing protection against influenza virus infection.

인플루엔자 바이러스 감염 소아 환아에서 Oseltamivir 약제 효용성과 단기간.장기간 부작용 및 안전성에 관한 임상연구 (Oseltamivir efficacy, side effects, and safety in children with influenza)

  • 서은선;박근화;김성미;김성원;정우식;조경순;박연경;이창규;강춘;이주연;최우영
    • Clinical and Experimental Pediatrics
    • /
    • 제53권1호
    • /
    • pp.56-66
    • /
    • 2010
  • 목 적 : Oseltamivir는 neuramidase inhibitor으로 인플루엔자의 치료제로 국내에서 사용하고 있지만, 약제사용으로 인한 부작용이나 효용성 및 내성에 대한 국내 연구는 미흡하여 이에 대해서 연구하고자 하였다. 방 법 : 2008년 1월부터 2008년 6월까지와 2008년 11월부터 2009년 1월까지의 두차례의 인플루엔자 유행기간 동안, 부산 성모 병원에서 독감 유사 증상 있어, 신속 항원 진단법으로 독감 진단받고 입원한 321명의 환아를 대상으로 하여, 환아들을 oseltamivir 치료군과 비치료군으로 무작위하여 전향적인 연구를 시행하였다. 치료군에서는 oseltamivir를 5일간 투여하였고, 비치료군에서는 증상 조절제만 사용하였다. 양군 모두에서 임상증상과 부작용을 관찰하였고 입원 기간 등을 조사하였고, 퇴원 4-8개월 후 전화 상담을 통하여 신경정신학적인 이상 유무를 확인하였다. 바이러스 배양 검사 및 oseltamivir에 대한 내성검사를 실시하였다. 결 과 : 두 기간 동안 본원 소아청소년과에 입원하였던 총 321명의 환아들을 분석하였고, oseltamivir 치료군은 186명, 비치료군은 135명이었다. Oseltamivir 치료군에서 비치료군에 비해 입원 당시 발병후 48시간이 경과한 환아들이 많았음에도 하기도 합병증이 현저히 적었고, 두 기간 동안 의미 있는 입원 기간 단축을 보였다(4.4일 vs. 5.0일) (P =0.000). 두 기간 동안 치료 군에서 경미한 소화기계 부작용을 보였으나 심각한 정신신경학적인 부작용을 보인 예는 없었다. 전반기 동안에는 양군 모두에서 influenza B (치료군 vs. 비치료군; 41.7% vs. 49.6%)가 가장 많이 동정 되었고, A/H3N2, A/H1N1 순으로 동정되었으며, 후반기 동안에는 치료군에서 A/H3N2가 배양된 한명의 환아를 제외하고는 양군 모두에서 A/H1N1이 동정되었다. 전반기동안 배양된 바이러스에 대한 oseltamivir 내성 검사상 치료 시작 전이나 치료 후 48-72시간 모두에서 oseltamivir에 대한 약제 내성은 발견되지 않았다. 결 론 : oseltamivir 치료군에서는 정신신경학적인 부작용을 포함한 다른 심각한 부작용 없이 입원 기간을 단축시키면서 하기도 합병증의 감소를 보이는 임상적인 효용성을 보여 소아 인플루엔자 치료에 있어 oseltamivir 치료의 효용성과 안전성을 보여주었다.

제주지역 돼지에서 Influenza 바이러스 항원 및 혈중 항체 조사 (The prevalence of swine influenza viral antigens and serum antibodiesin Piglets in Jeju)

  • 전용철;양형석;양나연;김대용;김재훈;배종희
    • 대한수의학회지
    • /
    • 제44권3호
    • /
    • pp.449-454
    • /
    • 2004
  • Ninety pigs under the age of 120-day-old requested at the diagnostic laboratory of animal diseases in Cheju National University were evaluated for the prevalence of tissue antigen and serum antibody to swine influenza virus (SIV). For histopathologic examination there was sampled at the consolidated area in cranioventral or dorsocaudal lobes of lungs. Lung tissues from all pigs were tested for the antigen of SIV type A by immunohistochemistry (IHC). Sera from 56 pigs were used for the antibody detection to SIV type A (subtype H1N1 and H3N2) by haemagglutinin inhibition test. Pneumonic lesions were observed in 72 cases (80%) of 90 pigs. Broncho-interstitial or interstitial pneumonia were more prevalent than suppurative or fibrinous bronchopneumonia. According to HI test, 46.4% of the tested sera showed seropositive. Positive sera were consisted with 5.3% for SIV H1N1, 28.6% for SIV H3N2, and 12.5% for both subtype to be tested, respectively. SIV antigens were detected in 51 cases(56.6%) of 90 pigs. Most SIV antigens were presented in the epithelium of the bronchi and bronchiole. Necrotizing bronchitis or bronchiolitis were observed in 28(31.1%) cases of all inspected pigs. These results suggested that SIV might be an important role to induce swine pneumonia in Jeju. Also IHC was very useful for the detection of SIV in the lung.

Clinical characteristics of children with 2009 pandemic influenza A (H1N1) admitted in a single institution

  • Park, San-In;Kim, Min-Ji;Hwang, Ho-Yeon;Oh, Chi-Eun;Lee, Jung-Hyun;Park, Jae-Sun
    • Clinical and Experimental Pediatrics
    • /
    • 제53권10호
    • /
    • pp.886-891
    • /
    • 2010
  • Purpose: This study aims to investigate the clinical characteristics of children diagnosed with the novel influenza A (H1N1) in the winter of 2009 at a single medical institution. Methods: Out of 545 confirmed cases of influenza A (H1N1) in children, using the real time RT-PCR method at Kosin University Gospel Hospital from September to December of 2009, 149 patients and their medical records were reviewed in terms of symptoms, laboratory findings, complications and transmission within a family. Results: Median age of subjects was 7 years (range: 2 months-18 years). New cases increased rapidly from September to reach a peak in November, then declined rapidly. Most frequently observed symptoms were fever (96.7%), cough (73.2%), rhinorrhea (36.9%) and sore throat (31.5%). Average body temperatures on the 1st, 2nd and 3rd hospital day were $38.75{\pm}0.65^{\circ}C$, $38.08{\pm}0.87^{\circ}C$ and $37.51{\pm}0.76^{\circ}C$, respectively. Complete blood counts and biochemical tests performed on the first admission day showed within the reference values in most cases. Of the 82 patients with simple chest radiography, 18 (22%) had pneumonic lesions; multi-focal bronchopneumonia in eleven, single or multi-segmental lobar pneumonia in five, and diffuse interstitial pneumonia in two patients. All of the 149 patients improved from their symptoms and discharged within 9 days of admission without any late complication. Conclusion: Children with 2009 pandemic influenza A (H1N1) at our single institution displayed nonspecific symptoms and laboratory findings, resembling those of common viral respiratory illnesses, and did not appear to develop more severe disease.

Quick Real-time PCR을 이용한 Avian Influenza Virus Subtype H5N1의 신속검출법 (Rapid Detection Method of Avian Influenza Subtype H5N1 using Quick Real-Time PCR)

  • 김을환;이동우;한상훈;권순환;윤병수
    • 미생물학회지
    • /
    • 제43권1호
    • /
    • pp.23-30
    • /
    • 2007
  • 조류 인플루엔자바이러스(AIV) H5N1 아형을 Real-time PCR법을 이용하여 가장 빠르게 진단할 수 있는 방법을 개발하였다. 검색 대상의 염기서열은 AIV H5N1 아형의 hemagglutinin 유전자 중 가장 상동성이 높은 387 bp의 부위를 선택하였고, 실험의 안전을 위하여 인공합섬의 방법으로 제작하였다. Microchip을 기반으로 한Real-time PCR법을 사용하였으며, 총PCR 반응액의 양을 $1{\mu}l$로, PCR 과정 중 각 단계, 즉 해리, 접합, 신장의 시간을 각1초, 1초, 3초로 하여 총 실험시간을 단축하였다. 진단을 위한 실험과정에서 PCR 및 융점분식에 소요된 최단 시간은 12분28초였으며, 민감도측정에서 최소2.4개의 hemaggutinin 유전자를 기질로 하여 목적한 특이 189 bp의 PCR 산물을 증폭할 수 있었기에, 본 연구에서는 이런 초고속 PCR 실험방식을 Quick Real-time PCR이라 명명하였다. 이 결과들은 가금류 및 사람에게 전파된 AIV H5N1아형의 진단에 적용될 수 있을 뿐 아니라, PCR이 사용되는 다른 신속검색법에도 널리 적용 될 수 있을 것으로 기대한다.

고병원성 조류인플루엔자(H5N1)에 대한 이산화티타늄 광촉매 처리 필름의 항바이러스성 연구 (Antiviral Effects of Titanium Dioxide Photocatalyst Treated Films against Highly Pathogenic Avian Influenza)

  • 이상도;박현
    • 한국융합학회논문지
    • /
    • 제12권4호
    • /
    • pp.201-206
    • /
    • 2021
  • 고병원성 조류독감 바이러스(H5N1)에 대한 피해가 지속적으로 증가하고 있으나, 이에 대한 항바이러스성 연구는 부족한 상황이다. 본 연구에서는 폴리에틸렌 필름에 Cu/TiO2 광촉매를 코팅하여 H5N1에 대한 항바이러스 특성을 분석하였다. 시료는 광촉매 마스터배치를 제조하여 압출코팅기에서 280℃로 3중 레이어 폴리에틸렌 원단의 양면을 코팅하였다. 그 결과 황색포도상구균과 대장균의 균수가 99.9% 감소되는 것으로 나타났다. 특히 인체감염이 가능한 H5N1형 고병원성 조류인플루엔자는 Cu/TiO2계 필름에 접촉 5분 이내 99.9% 감소하는 것으로 확인되었다. 광촉매를 코팅한 필름의 항균성에 대해서는 알려져 있지만 본 연구를 통해 항바이러스성에 대해서도 확인이 가능하였다.