• 제목/요약/키워드: Gibbs Sampling Algorithm

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Gibbs Sampling for Double Seasonal Autoregressive Models

  • Amin, Ayman A.;Ismail, Mohamed A.
    • Communications for Statistical Applications and Methods
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    • 제22권6호
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    • pp.557-573
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    • 2015
  • In this paper we develop a Bayesian inference for a multiplicative double seasonal autoregressive (DSAR) model by implementing a fast, easy and accurate Gibbs sampling algorithm. We apply the Gibbs sampling to approximate empirically the marginal posterior distributions after showing that the conditional posterior distribution of the model parameters and the variance are multivariate normal and inverse gamma, respectively. The proposed Bayesian methodology is illustrated using simulated examples and real-world time series data.

Bayesian Parameter Estimation of the Four-Parameter Gamma Distribution

  • Oh, Mi-Ra;Kim, Kyung-Sook;Cho, Wan-Hyun;Son, Young-Sook
    • Communications for Statistical Applications and Methods
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    • 제14권1호
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    • pp.255-266
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    • 2007
  • A Bayesian estimation of the four-parameter gamma distribution is considered under the noninformative prior. The Bayesian estimators are obtained by the Gibbs sampling. The generation of the shape/power parameter and the power parameter in the Gibbs sampler is implemented using the adaptive rejection sampling algorithm of Gilks and Wild (1992). Also, the location parameter is generated using the adaptive rejection Metropolis sampling algorithm of Gilks, Best and Tan (1995). Finally, the simulation result is presented.

Bayesian Analysis of Randomized Response Models : A Gibbs Sampling Approach

  • Oh, Man-Suk
    • Journal of the Korean Statistical Society
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    • 제23권2호
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    • pp.463-482
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    • 1994
  • In Bayesian analysis of randomized response models, the likelihood function does not combine tractably with typical priors for the parameters of interest, causing computational difficulties in posterior analysis of the parameters of interest. In this article, the difficulties are solved by introducing appropriate latent variables to the model and using the Gibbs sampling algorithm.

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Application of Bayesian Computational Techniques in Estimation of Posterior Distributional Properties of Lognormal Distribution

  • Begum, Mun-Ni;Ali, M. Masoom
    • Journal of the Korean Data and Information Science Society
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    • 제15권1호
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    • pp.227-237
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    • 2004
  • In this paper we presented a Bayesian inference approach for estimating the location and scale parameters of the lognormal distribution using iterative Gibbs sampling algorithm. We also presented estimation of location parameter by two non iterative methods, importance sampling and weighted bootstrap assuming scale parameter as known. The estimates by non iterative techniques do not depend on the specification of hyper parameters which is optimal from the Bayesian point of view. The estimates obtained by more sophisticated Gibbs sampler vary slightly with the choices of hyper parameters. The objective of this paper is to illustrate these tools in a simpler setup which may be essential in more complicated situations.

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한우의 도체형질 유전모수 추정을 위한 REML과 Bayesian via Gibbs Sampling 방법의 비교 연구 (Comparison between REML and Bayesian via Gibbs Sampling Algorithm with a Mixed Animal Model to Estimate Genetic Parameters for Carcass Traits in Hanwoo(Korean Native Cattle))

  • 노승희;김병우;김효선;민희식;윤호백;이득환;전진태;이정규
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제46권5호
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    • pp.719-728
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    • 2004
  • 본 연구는 한우의 도체형질들에 대한 유전적 변이를 분석방법에 따라 어떠한 차이가 있는지를 알아보고자 한우 후대검정자료를 이용하여 분석하였다. 분석에 이용된 도체성적 관련 자료는 가축개량사업소와 한우개량단지에서 1996 년부터 2001 년까지 태어난 후대검정우 1526두로부터 조사었다. 한우에 있어서 주요 개량형질인 육량과 육질에 영향하는 도체중, 도체율,배최장근단면적, 등지방두께, 근내지방도를 대상으로 유전력과 유전상관을 추정하였다. 유전모수 추정에 있어서 REML 분석법과 Bayesian추론방법으로써 Gibbs Sampling 분석법을 사용하였는데 각각의 모수들에 대한 Gibbs Sampler는 100,000회 실시하였고 초기 1,000회는 모수의 사후분포에 대한 부정확성으로 간주하여 모수의 사후분포특성 규명에서 제외하였다. 각각의 형질들에 대한 유전변이는 이러한 두 가지 분석방법을 상호 비교 함으로써 최적의 통계분석 방법을 모색하였다. 도체형질에 대한 유전력 추정은 REML 방법을 통한 추정에서는 근내지방도가 0.51로 고도의 유전력을 보였고, 도체율이 0.25로 중도의 유전력이 추정되었다. Gibbs Sampling 방법을통한 추정에서도 근내지방도가 0.54로 고도의 유전력을 도체율에서 0.25로 중도의 유전력을 보였다. REML 분석방법과 Gibbs Sampling 분석방법에서의 유전력은 다소 큰 차이는 보이지 않았으나, 대체로 Gibbs Sampling 방법으로 분석한 유전력 추정치가 높게 추정되었다. 그리고, 유전상관분석에서는 REML 방법을 통한 분석에서 도체중과 배최장근단면적에서 0.651 로 높은 정의 유전상관을 나타내었고, 배최장근단면적과 등지방두께에서 -0.139로 부의 유천상관을 나타내었다. Gibbs Sampling 방법에서는 도체중과 도체율, 배최장근단면적에서 각각 0.814, 0.695으로 높은 정의 상관을 나타내었고, 배최장근단면적과 등지방두께에서 -0.126으로 부의상관을 나타내었다. Gibbs Sampling방법을 통한 분석에서 특정 형질간 유전상관이 높게 나타났으며, 다소 큰 차이를 보이지 않았다. REML 분석방법과 Bayesian Inference를 바탕으로 한 Gibbs Sampling 분석에서 모수 추정은 큰 차이를 보이지 않았다. 따라서 방대한 현장정보를 활용하여 보다 정확한 모수 추정을 수행하기 위해서는 분석모형에 대한 계수행렬의 역행렬 계산을 통한 REML 방법의 한계성을 극복할 수 있는 방법으로써 Gibbs Sampling 분석 방법이 가능할 것으로 사료된다.

Inference of Parameters for Superposition with Goel-Okumoto model and Weibull model Using Gibbs Sampler

  • Heecheul Kim
    • Communications for Statistical Applications and Methods
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    • 제6권1호
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    • pp.169-180
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    • 1999
  • A Markov Chain Monte Carlo method with development of computation is used to be the software system reliability probability model. For Bayesian estimator considering computational problem and theoretical justification we studies relation Markov Chain with Gibbs sampling. Special case of GOS with Superposition for Goel-Okumoto and Weibull models using Gibbs sampling and Metropolis algorithm considered. In this paper discuss Bayesian computation and model selection using posterior predictive likelihood criterion. We consider in this paper data using method by Cox-Lewis. A numerical example with a simulated data set is given.

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A Comparison study of Hybrid Monte Carlo Algorithm

  • 황진수;전성해;이찬범
    • 한국통계학회:학술대회논문집
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    • 한국통계학회 2000년도 추계학술발표회 논문집
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    • pp.135-140
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    • 2000
  • 베이지안 신경망 모형(Bayesian Neural Networks Models)에서 주어진 입력값(input)은 블랙 박스(Black-Box)와 같은 신경망 구조의 각 층(layer)을 거쳐서 출력값(output)으로 계산된다. 새로운 입력 데이터에 대한 예측값은 사후분포(posterior distribution)의 기대값(mean)에 의해 계산된다. 주어진 사전분포(prior distribution)와 학습데이터에 의한 가능도함수(likelihood functions)를 통해 계산되어진 사후분포는 매우 복잡한 구조를 갖게 됨으로서 기대값의 적분계산에 대한 어려움이 발생한다. 이때 확률적 추정에 의한 근사 방법인 몬테칼로 적분을 이용한다. 이러한 방법으로서 Hybrid Monte Carlo 알고리즘은 우수한 결과를 제공하여준다(Neal 1996). 본 논문에서는 Hybrid Monte Carlo 알고리즘과 기존에 많이 사용되고 있는 Gibbs sampling, Metropolis algorithm, 그리고 Slice Sampling등의 몬테칼로 방법들을 비교한다.

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Bayesian Estimation of the Two-Parameter Kappa Distribution

  • Oh, Mi-Ra;Kim, Sun-Worl;Park, Jeong-Soo;Son, Young-Sook
    • Communications for Statistical Applications and Methods
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    • 제14권2호
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    • pp.355-363
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    • 2007
  • In this paper a Bayesian estimation of the two-parameter kappa distribution was discussed under the noninformative prior. The Bayesian estimators are obtained by the Gibbs sampling. The generation of the shape parameter and scale parameter in the Gibbs sampler is implemented using the adaptive rejection Metropolis sampling algorithm of Gilks et al. (1995). A Monte Carlo study showed that the Bayesian estimators proposed outperform other estimators in the sense of mean squared error.

Bayesian Parameter Estimation using the MCMC method for the Mean Change Model of Multivariate Normal Random Variates

  • Oh, Mi-Ra;Kim, Eoi-Lyoung;Sim, Jung-Wook;Son, Young-Sook
    • Communications for Statistical Applications and Methods
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    • 제11권1호
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    • pp.79-91
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    • 2004
  • In this thesis, Bayesian parameter estimation procedure is discussed for the mean change model of multivariate normal random variates under the assumption of noninformative priors for all the parameters. Parameters are estimated by Gibbs sampling method. In Gibbs sampler, the change point parameter is generated by Metropolis-Hastings algorithm. We apply our methodology to numerical data to examine it.

Semiparametric Bayesian Regression Model for Multiple Event Time Data

  • Kim, Yongdai
    • Journal of the Korean Statistical Society
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    • 제31권4호
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    • pp.509-518
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    • 2002
  • This paper is concerned with semiparametric Bayesian analysis of the proportional intensity regression model of the Poisson process for multiple event time data. A nonparametric prior distribution is put on the baseline cumulative intensity function and a usual parametric prior distribution is given to the regression parameter. Also we allow heterogeneity among the intensity processes in different subjects by using unobserved random frailty components. Gibbs sampling approach with the Metropolis-Hastings algorithm is used to explore the posterior distributions. Finally, the results are applied to a real data set.