• 대한골관절종양학회지
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• 제11권1호
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• pp.46-53
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• 2005

목적: Bisphosphonate(BPs)는 endogenous pyrophosphates의 유사체로 Paget's disease, 골다공증, 종양 유발성 골용해와 같은 골격계 질환의 치료에 쓰이고 있으며, 유방암의 골파괴성 전이에 대한 치료제로 사용되어 지고 있다. 골전이의 양상이 골흡수성 및 골생성이 혼합되어 나타나는 전립선암의 전이에서도 치료제의 하나로 이용되고 있다. BPs는 파골세포성 골흡수가 과하게 일어난 질환에 대해서는 비교적 널리 알려져 있지만, 골종양 세포에 대한 직접적인 효과에 대해서는 아직 밝혀져 있지 않다. 가장 강력한 질소 함유(nitrogen-containing) BPs인 Zoledronic acid(ZOL)로서 골육종이 발현된 nude mouse model을 이용하여 ZOL의 종양 억제능을 생체내 실험으로 확인하고자 하였다. 대상 및 방법: 인간 골육종 세포주로는 MG-63과 HOS 골육종 세포주를 이용하였고, 종양의 크기 변화를 육안으로 확인하기 위하여 GFP 유전자가 형질 전환된 MG-63-GFP, HOSGFP 세포를 6주령된 수컷 마우스 10마리에 각각 피하주사하여 종양의 조각이 $3{\times}3{\times}3$ mm이 될 때까지 사육한 후, ZOL을 120 ug/kg의 농도로 일주일에 2번 피하에 주사하였다. 종양의 크기를 일주일에 두 번씩 측정하고, 형광조명을 이용하여 촬영하였다. 결과: HOS 골육종 세포주를 이용한 생체실험에서 대조군의 종양의 평균 크기는 2,520 $mm^3$이며 ZOL 투여군은 131 $mm^3$로서 94%의 감소를 보이며, MG-63 골육종 세포주를 이용한 생체실험에서는 대조군의 종양의 평균 크기는 2,866 $mm^3$이며 실험군은 209 $mm^3$로서 72%의 감소를 보였다(P<0.05). 결론: Nude mouse를 이용한 생체실험에서 ZOL은 골육종의 세포사멸에 직접적인 영향을 미치며 이것은 앞으로 골육종 치료의 약제중 하나로 선택되어 질수 있다고 판단되며, 종양세포주에 따라 ZOL의 영향이 다를 수 있으므로 ZOL에 감수성 있는 종양세포를 찾아 적용하는 것이 좋을 것으로 사료된다.

• 한국작물학회지
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• 제68권4호
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• pp.225-235
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• 2023

벼의 수확기 기준온도 결정에 활용하기 위하여 2020~2021년 포장 조건에서 우리나라 자포니카 벼 품종(오대, 하이아미, 삼광)의 4회 이앙 처리에서 등숙 한계온도를 분석한 결과는 다음과 같다. 1. 이앙차수별 출수기 범위는 2020년에는 1차 8월 27~28일, 2차 9월 14~15일, 3차 9월 23~25일, 4차 9월 28~30일이었으며, 2021년에는 1차 8월 20~23일, 2차 9월 9~15일, 3차 9월 20~22일, 4차 9월 28~30일이었다. 2. 등숙비율, 정조 천립중, 정조중, 완전립 비율 중 등숙 한계온도 분석에 적합한 특성은 등숙비율과 정조중이었다. 3. 등숙비율과 정조중은 2020년 1~2차 이앙과 2021년 1~3차 이앙에서 sigmoid curve 형태의 변화를 나타내었으며, 2020년 3차와 2021년 4차 이앙에서는 일정 시기까지 증가한 이후 정체 또는 감소하는 양상을 보였다. 4. 비선형회귀 분석에서 등숙비율과 정조중이 최고값의 95%에 도달한 시기는 2020년 2차 이앙에서 출수 후 49~62일, 2021년 2차와 3차 이앙에서 각각 출수 후 37~46일과 30~36일이었으며, 2020년 3차와 2021년 4차 이앙에서 등숙특성의 실측 최고값은 출수 후 42일에 나타났다. 5. 비선형회귀 분석에서 등숙 한계온도 분석에 적합한 경우 최고값 대비 95% 시기의 7일 이동 평균기온은 품종과 특성에 따라 2020년 2차 이앙에서 8.4~9.4℃, 2021년 2차와 3차 이앙에서 9.4~10.9℃로 나타났으며, 품종별로 평가한 등숙 한계온도는 7일 이동 평균기온 8.4~8.7℃였다. 6. 2020년 3차와 2021년 4차 이앙에서 등숙비율과 정조중의 증가가 나타난 가장 낮은 7일 평균기온은 품종에 따라 9.4~10.1℃ 범위였으며, 정체 또는 감소가 나타난 가장 높은 온도는 8.7~9.1℃ 범위였다. 7. 종합적으로, 비선형회귀 분석에서 나타난 자포니카 벼의 등숙 한계온도는 품종에 따라 7일 이동 평균기온 기준 8.4~8.7℃로 분석되었으며, 실측 등숙 특성의 변화로 분석한 등숙 한계온도는 이전 7일 평균기온 기준 9.1~9.4℃ 사이로 나타났다. 8. 벼의 수확 한계기 기준 온도는 품종에 따라 등숙 진전이 관찰된 가장 낮은 온도인 이전 7일 평균기온 9.4~10.1℃에서 높은 온도인 10℃ 정도를 적용하는 것이 재배 안전성 측면에서 유리할 것으로 평가되었다.

• Molecules and Cells
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• 제20권1호
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• pp.112-118
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• 2005

It was previously shown that AtNAP1 is a plastidic SufB protein involved in Fe-S cluster assembly in Arabidopsis. In this study, we investigated the effects of depleting SufB protein from plant cells using virus-induced gene silencing (VIGS). VIGS of NbNAP1 encoding a Nicotiana benthamiana homolog of AtNAP1 resulted in a leaf yellowing phenotype. NbNAP1 was expressed ubiquitously in plant tissues with the highest level in roots. A GFP fusion protein of the N-terminal region (M1-V103) of NbNAP1 was targeted to chloroplasts. Depletion of NbNAP1 resulted in reduced numbers of chloroplasts of reduced size. Mitochondria also seemed to be affected. Despite the reduced number and size of the chloroplasts in the NbNAP1 VIGS lines, the expression of many nuclear genes encoding chloroplast-targeted proteins and chlorophyll biosynthesis genes remained unchanged.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제26권1호
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• pp.38-43
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• 2016

Novel and specific recognition elements are of central importance in the development of a pathogen detection method. Here, we describe a simple method for identifying the cell-wall binding domain (CBD) from a sequenced bacterial genome employing homology search for phage lysin genes. A putative CBD (CPF369_CBD) was identified from a genome of Clostridium perfringens type strain ATCC 13124, and its function was studied with the CBD-GFP fusion protein recombinantly expressed in Escherichia coli. Fluorescence microscopy showed the specific binding of the fusion protein to C. perfringens cells, which demonstrates the potential of this method for the identification of novel bioprobes for specific detection of pathogenic bacteria.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제34권7호
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• pp.1961-1966
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• 2013

Theoretical investigations have been performed for the ground state ($S_0$) and the first excited state ($S_1$) of the hydrogen bonded green fluorescent protein (GFP) model. The potential energy surface (PESs) of $S_0$ was obtained by B3LYP method and that of $S_1$ was obtained by CIS method. Based on the relative stabilities of species and the energy barriers for the proton transfer, it was found that proton transfer could take place both under the ground state and the first excited state. As determined by the proton motions along the reaction coordinate, both the ground state proton transfer (GSPT) and the excited state proton transfer (ESPT) are considered as a concerted and asynchronous process.

• 한국생물공학회:학술대회논문집
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• 한국생물공학회 2000년도 춘계학술발표대회
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• pp.355-356
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• 2000

Three 'stress probe' plasmids were constructed and characterized which utilize a green fluorescent protein (CFP) as a non-invasive reporter to elucidate Escherichia coli cellular stress responses in quiescent or 'resting' cells. Facile detection of cellular stress levels was achieved by fusion of three heat shock stress protein promoter elements, those of the heat shock transcription factor ${\sigma}^{32}$, pretense subunit ClpB, and chaperone DnaK, to the reporter gene $gfp_{uv}$. When perturbed by chemical or physical stress (such as heat shock, nutrient (amino acid) limitation, addition of IPTG, acetic acid, ethanol, phenol, antifoam, and salt (osmotic shock), the E. coli cells produced GFPuv which was easily detected from within the cells as emitted green fluorescence. A temporal and amplitudinal mapping of these responses was performed, demonstrating regions where quantitative delineation of cell stress was afforded.

• 한국정보과학회 언어공학연구회:학술대회논문집(한글 및 한국어 정보처리)
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• 한국정보과학회언어공학연구회 2003년도 제15회 한글 및 한국어 정보처리 학술대회
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• pp.293-299
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• 2003

인간 게놈 프로젝트가 완료됨에 다라 생체서열과 언어 사이의 대응 관계가 부각되고 있다. 본고에서는 Lewis Carroll의 언어 유희 사례를 컴퓨터생물학의 측면에서 재조명하고, Carroll이 제시한 문제 중에서 간단한 anagram 문제의 해결을 다루고자 한다. 우선 DNA 컴퓨팅의 방법론을 적용한 DNAgram의 개념을 확장하여 plasmid-DNAgram의 개념을 새롭게 도입하였다. 이 개념을 형광단백질에 대한 DNAgram의 개념을 확장하여 plasmid-DNAgram의 개념을 새롭게 도입하였다. 이 개념을 형광단백질에 대한 FRET(fluorescent resonance energy transfer)분석기법의 응용 사례인 cameleon 형광단백질에 대한 FRET 분석기법에 적용함으로써 anagram 문제의 어휘론적, 구문론적, 의미론적, 화용론적 측면에 대응하는 바이오분자 컴퓨팅 방법론을 제안하였다.

• Mycobiology
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• 제45권2호
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• pp.84-89
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• 2017

Fungi of the Metarhizium genus are a very versatile model for understanding pathogenicity in insects and their symbiotic relationship with plants. To establish a co-transformation system for the transformation of multiple M. robertsii genes using Agrobacterium tumefaciens, we evaluated whether the antibiotic nourseothricin has the same marker selection efficiency as phosphinothricin using separate vectors. Subsequently, in the two vectors containing the nourseothricin and phosphinothricin resistance cassettes were inserted eGFP and mCherry expression cassettes, respectively. These new vectors were then introduced independently into A. tumefaciens and used to transform M. robertsii either in independent events or in one single co-transformation event using an equimolar mixture of A. tumefaciens cultures. The number of transformants obtained by co-transformation was similar to that obtained by the individual transformation events. This method provides an additional strategy for the simultaneous insertion of multiple genes into M. robertsii.

• BMB Reports
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• 제44권4호
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• pp.285-290
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• 2011

Caenorhabditis elegans undergoes a developmental molting process that involves a coordinated interplay among diverse intracellular pathways. Here, we investigated the functions of two fatty acid biosynthesis genes; pod-2, encoding acetyl-CoA carboxylase, and fasn-1, encoding fatty acid synthase, in the C. elegans molting process. Although both the pod-2 and fasn-1 genes were expressed at constant levels throughout C. elegans development, knockdown of the proteins encoded by these genes using RNA interference produced severe defects in triglyceride production, molting, and reproduction that were coupled to suppression of NAS-37, a metalloprotease. An assessment of the structure and integrity of the cuticle using a COL-19::GFP marker and Hoechst 33258 staining showed that downregulation of either pod-2 or fasn-1 impaired cuticle formation and disrupted the integrity of the cuticle and the hypodermal membrane.

• 한국정보기술응용학회:학술대회논문집
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• 한국정보기술응용학회 2005년도 6th 2005 International Conference on Computers, Communications and System
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• pp.331-334
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• 2005

This paper suggests the Ethernet aggregation to XGMII framing procedure (EAXFP) mechanism to economically combine the traffic adaptation technology with the link aggregation method in designing 10 Gigabit Ethernet (10 GbE) interfaces. This design sidesteps the data-loss issues that can result from designing an interface with only one link. The most critical issue in relation to the link aggregation interface is the algorithm used to control frame distribution between the ten ports. The proposed EAXFP mechanism offers an efficient link aggregation method as well as an efficient frame distribution algorithm, which maximize the throughout of the 10 GbE interface. In the experiment and analysis of the proposed mechanism, it was also discovered that the 10 GbE interface that uses the proposed EAXFP mechanism significantly reduced the packet loss rate. When there will be heavy traffic loads come about in the future, the proposed EAXFP mechanism assures an efficient and economical transmission performance on the router system.