Annual Conference on Human and Language Technology (한국정보과학회 언어공학연구회:학술대회논문집(한글 및 한국어 정보처리))

  • 2003.10d
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  • Pages.293-299
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  • 2003
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  • 2005-3053(pISSN)
Human and Language Technology (한국정보과학회 언어공학연구회)
권호 표지

Plasmid-DNAgram : Anagram Solving by Molecular Computing Based on GFP-Expressing Plasmid DNA

Plasmid-DNAgram : 녹색형광단백질 발현 Plasmid DNA 기반 분자컴퓨팅에 의한 언어 퍼즐 문제 해결

  • Kim, Su-Dong (Interdisciplinary Program in Cognitive Science, Seoul National University) ;
  • Lee, Eun-Seok (Interdisciplinary Program in Cognitive Science, Seoul National University) ;
  • Zhang, Byoung-Tak (School of Computer Science & Engineering, Seoul National University)
  • 김수동 (서울대학교 대학원 인지과학 협동과정) ;
  • 이은석 (서울대학교 대학원 인지과학 협동과정) ;
  • 장병탁 (서울대학교 컴퓨터공학부)
  • Published : 2003.10.10
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Abstract

인간 게놈 프로젝트가 완료됨에 다라 생체서열과 언어 사이의 대응 관계가 부각되고 있다. 본고에서는 Lewis Carroll의 언어 유희 사례를 컴퓨터생물학의 측면에서 재조명하고, Carroll이 제시한 문제 중에서 간단한 anagram 문제의 해결을 다루고자 한다. 우선 DNA 컴퓨팅의 방법론을 적용한 DNAgram의 개념을 확장하여 plasmid-DNAgram의 개념을 새롭게 도입하였다. 이 개념을 형광단백질에 대한 DNAgram의 개념을 확장하여 plasmid-DNAgram의 개념을 새롭게 도입하였다. 이 개념을 형광단백질에 대한 FRET(fluorescent resonance energy transfer)분석기법의 응용 사례인 cameleon 형광단백질에 대한 FRET 분석기법에 적용함으로써 anagram 문제의 어휘론적, 구문론적, 의미론적, 화용론적 측면에 대응하는 바이오분자 컴퓨팅 방법론을 제안하였다.

Keywords