• 제목/요약/키워드: Gene structure and expression

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The Histone Deacetylase Inhibitor Trichostatin A Sensitizes Human Renal Carcinoma Cells to TRAIL-Induced Apoptosis through Down-Regulation of c-FLIPL

  • Han, Min Ho;Park, Cheol;Kwon, Taek Kyu;Kim, Gi-Young;Kim, Wun-Jae;Hong, Sang Hoon;Yoo, Young Hyun;Choi, Yung Hyun
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제23권1호
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    • pp.31-38
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    • 2015
  • Histone acetylation plays a critical role in the regulation of transcription by altering the structure of chromatin, and it may influence the resistance of some tumor cells to tumor necrosis factor (TNF)-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL) by regulating the gene expression of components of the TRAIL signaling pathway. In this study, we investigated the effects and molecular mechanisms of trichostatin A (TSA), a histone deacetylase inhibitor, in sensitizing TRAIL-induced apoptosis in Caki human renal carcinoma cells. Our results indicate that nontoxic concentrations of TSA substantially enhance TRAIL-induced apoptosis compared with treatment with either agent alone. Cotreatment with TSA and TRAIL effectively induced cleavage of Bid and loss of mitochondrial membrane potential (MMP), which was associated with the activation of caspases (-3, -8, and -9) and degradation of poly (ADP-ribose) polymerase (PARP), contributing toward the sensitization to TRAIL. Combined treatment with TSA and TRAIL significantly reduced the levels of the cellular Fas-associated death domain (FADD)-like interleukin-$1{\beta}$-converting enzyme (FLICE) inhibitory protein (c-FLIP), whereas those of death receptor (DR) 4, DR5, and FADD remained unchanged. The synergistic effect of TAS and TRAIL was perfectly attenuated in c-$FLIP_L$-overexpressing Caki cells. Taken together, the present study demonstrates that down-regulation of c-FLIP contributes to TSA-facilitated TRAIL-induced apoptosis, amplifying the death receptor, as well as mitochondria-mediated apoptotic signaling pathways.

Alu 서열과 분자생물학적 특징 (Alu sequences and molecular features)

  • 박은실;홍경원;김희수
    • 생명과학회지
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    • 제14권6호
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    • pp.1028-1039
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    • 2004
  • 6500만년동안, Alu 서열은 RNA-중합효소 III에 의한 전사체를 통해 증폭해왔고, 영장류 게놈 내에 약 140만 복사의 수에 도달되었다. 그들은 가동성 인자 중에서 가장 큰 집단이며, 인간 게놈의 $10\%$를 구성한다. Alu 서열이 유전적으로 기능이 없다고 생각되었지만, 최근 많은 연구자들이 새로운 기능 및 질병과의 관련성을 증명해왔다 이들 Alu 서열은 삽입돌연변이, Alu-매개 재조합, 유전자 발현에 대해 유전자 전환 그리고 스플라이싱 사이트를 유발하고, 유전자 구조, 단백질 서열, 스플라이싱 모티프와 발현 양상에 영향을 준다. 우리는 Alu의 구조와 기원, 그들 패밀리의 컨센서스 서열, Alu의 진화와 분포 그리고 그들의 기능에 대하여 요약 정리하였다. 또한 영장류의 진화과정에 있어 질병과 관련하여 Alu 패밀리의 새로운 연구방향을 제시하였다.

Caerulein으로 유발된 흰쥐의 급성 췌장염에 대한 수념산(手拈散)의 효과 (The Effect of SuJeom-san on Caerulein-induced Acute Pancreatitis in Rats)

  • 박재석;최창원
    • 대한한방내과학회지
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    • 제31권3호
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    • pp.500-512
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    • 2010
  • Objectives : This study was designed to investigate the effects of SuJeom-san(SJS) extract in rats with caerulein-induced acute pancreatitis (AP). Methods : We examined changes of pancreatic weight, histological, immunohistochemical and gene expression of cyclooxygenase (COX-2). Thirty-six adult male Sprague-Dawley rats were divided into six groups as follow: normal(Nor), caerulein-induced (Con), caerulein + cefotaxime sodium(CT), caerulein + SJS 3 mg/kg(SJSA), caerulein + SJS 6 mg/kg(SJSB) and caerulein + SJS 12 mg/kg(SJSC) groups. Pancreatic tissues of rats from all groups were removed for histological observation and light, and electron microscopic examination. Platelet activating factor(PAF) and Interleukin-6(IL-6) levels were determined spectrophotometrically. Results : The ratio of pancreas/body weight was significantly(p<0.05) increased in the Con compared with Nor, but significantly(p<0.05) decreased in SJSA, SJSB, SJSC and CT groups compared with Con. Caerulein administration significantly increased(p<0.05) the levels of amylase, but SJSA, SJSB, SJSC and CT significantly(p<0.05) reduced the levels of these enzymes. The levels of platelet activating factor(PAF) increased in Con compared with Nor, but decreased in SJSA, SJSB, SJSC and CT groups compared with Con. Interleukin-6(IL-6) levels increased significantly in all groups compared to Nor at 6 hrs, but significantly(p<0.05) reduced in SJSA, SJSB, SJSC and CT groups compared with Con at 24 hrs. The levels of tumor necrosis factor(TNF)-${\alpha}$ levels increased in all groups compared to Nor at 6 hrs, but significantly(p<0.05) reduced in SJSA, SJSB, SJSC and CT groups compared with Con at 24 hrs. The COX-2 positive materials were observed in the pancreas of the Con, but these positive materials were decreased in the SJS extract treatment group. Conclusion : SJS is potentially capable of limiting pancreatic damage during AP by restoring the fine structure of acinar cells and tissue; therefore, we conclude that SJS may have beneficial effects in the treatment of caerulein-induced AP.

Small Molecule-Based Strategy Promotes Nucleus Pulposus Specific Differentiation of Adipose-Derived Mesenchymal Stem Cells

  • Hua, Jianming;Shen, Ning;Wang, Jingkai;Tao, Yiqing;Li, Fangcai;Chen, Qixin;Zhou, Xiaopeng
    • Molecules and Cells
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    • 제42권9호
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    • pp.661-671
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    • 2019
  • Adipose tissue-derived mesenchymal stem cells (ADSCs) are promising for regenerating degenerated intervertebral discs (IVDs), but the low efficiency of nucleus pulposus (NP)-specific differentiation limits their clinical applications. The Sonic hedgehog (Shh) signaling pathway is important in NP-specific differentiation of ADSCs, and Smoothened Agonist (SAG) is a highly specific and effective agonist of Shh signaling. In this study, we proposed a new differentiation strategy with the use of the small molecule SAG. The NP-specific differentiation and extracellular matrix (ECM) synthesis of ADSCs were measured in vitro, and the regenerative effects of SAG pretreated ADSCs in degenerated IVDs were verified in vivo. The results showed that the combination of SAG and transforming growth factor-${\beta}3$ ($TGF-{\beta}3$) is able to increase the ECM synthesis of ADSCs. In addition, the gene and protein expression levels of NP-specific markers were increased by treatment with SAG and $TGF-{\beta}3$. Furthermore, SAG pretreated ADSCs can also improve the disc height, water content, ECM content, and structure of degenerated IVDs in vivo. Our new differentiation scheme has high efficiency in inducing NP-specific differentiation of ADSCs and is promising for stem cell-based treatment of degenerated IVDs.

꼼치에서 특징적으로 발현되는 새로운 유전자 곰신의 분리 및 동정 (Molecular Cloning and Identification of Novel Genes, Gomsin, Characteristically Expressed in Snailfish, Liparis tanakae)

  • 송인선;이석근;손진기
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제6권1호
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    • pp.7-16
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    • 2002
  • 점액질이 풍부한 꼼치 조직에서 NIH 3T3 세포주를 이용하여 subtracted cDNA 라이브러리를 얻어 200례의 클론을 제작하였다. 이 클른 중에서 비반복성 유전자를 선택하고, RNA in situ hybridization을 실행하여 꼼치 조직에서 특이하게 발현되는 곰신 클론(C90-171)을 선택하였다. 이 클론은 사람의 타액선 조직에서도 특이하게 발현되는 유전자로서 이를 확인하기 위하여 C90-171(곰신) 항체를 제작하였다. 꼼치의 cDNA 라이브러리에서 곰신의 항체를 통하여 스크리닝한 결과 PRP(proline-rich protein)와 가장 많이 교차반응하며, 면역조직화학적 염색으로 PRP와 유사한 양성반응으로 나타나 PRP와 유사한 기능을 하는 단백질로 사료된다. 또한 타액 내에서의 꼼치 단백질의 분해에 대한 실험결과 거의 분해가 일어나지 않는 것으로 보아, 곰신은 꼼치의 몸통을 보호하는 유전물질일 뿐만 아니라, PRP와 유사하게 조직을 보호하는 안정된 새로운 기능성 단백질로 사료된다.

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Effect of Fc Fusion on Folding and Immunogenicity of Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus Spike Protein

  • Chun, Jungmin;Cho, Yeondong;Park, Ki Hoon;Choi, Hanul;Cho, Hansam;Lee, Hee-Jung;Jang, Hyun;Kim, Kyung Hyun;Oh, Yu-Kyoung;Kim, Young Bong
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제29권5호
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    • pp.813-819
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    • 2019
  • Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) induces severe respiratory impairment with a reported mortality rate of ~36% in humans. The absence of clinically available MERS-CoV vaccines and treatments to date has resulted in uncontrolled incidence and propagation of the virus. In vaccine design, fusion with the IgG Fc domain is reported to increase the immunogenicity of various vaccine antigens. However, limited reports have documented the potential negative effects of Fc fusion on vaccine antigens. To determine whether Fc fusion affects the immunogenicity of MERS-CoV antigen, we constructed a Fcassociated MERS-CoV spike protein (eS770-Fc, 110 kDa), whereby human IgG4 Fc domain was fused to MERS-CoV spike protein (eS770) via a Gly/Pro linker using baculovirus as the expression system. For comparative analyses, two eS770 proteins lacking the IgG4 Fc domain were generated using the IdeS protease ($eS770-{\Delta}Fc$) or His tag attachment (eS770-His) and the immunogenicity of the above constructs were examined following intramuscular immunization in mice. Contrary to expectations, non-Fc spike proteins ($eS770-{\Delta}Fc$, eS770-His; 90 kDa) showed higher immunogenicity than the Fc fusion protein (eS770-Fc). Moreover, unlike non-Fc spike proteins, eS770-Fc immunization did not elicit neutralizing antibodies against MERS-CoV. The lower immunogenicity of Fc-fused eS770 was related to alterations in the structural conformation of the spike protein. Taken together, our results indicate that IgG Fc fusion reduces the immunogenicity of eS770 by interfering with the proper folding structure.

Assessment of the effects of virus-mediated limited Oct4 overexpression on the structure of the hippocampus and behavior in mice

  • Sim, Su-Eon;Park, Soo-Won;Choi, Sun-Lim;Yu, Nam-Kyung;Ko, Hyoung-Gon;Jang, Deok-Jin;Lee, Kyung-Min;Kaang, Bong-Kiun
    • BMB Reports
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    • 제44권12호
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    • pp.793-798
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    • 2011
  • Recently, pluripotency induction or cellular reprogramming by introducing critical transcription factors has been extensively studied, but has been demonstrated only in vitro. Based on reports that Oct4 is critically involved in transforming neural stem cells into pluripotent cells, we used the lentiviral vector to introduce the Oct4 gene into the hippocampal dentate gyrus (DG) of adult mice. We examined whether this manipulation led to cellular or behavioral changes, possibly through processes involving the transformation of NS cells into pluripotent cells. The Oct4 lentivirus-infused group and the green fluorescent protein lentivirus-infused group showed a similar thickness of the DG and a comparable level of synaptophysin expression in the DG. Furthermore, our behavioral analyses did not show any differences between the groups concerning exploratory activity, anxiety, or memory abilities. This first trial for pluripotency induction in vivo, despite negative results, provides implications and information for future studies on in vivo cellular reprogramming.

남생이(Geoclemys reevesii) 대뇌에 있어서 raf Protein Kinase의 면역세포화학적 분포 (Immunocytochemical Localization Qf raf Protein Kinase in Cerebrum of Geoclemys reevesii (Gray))

  • 최원철;문현근
    • 한국동물학회지
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    • 제33권2호
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    • pp.141-151
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    • 1990
  • Raf protein kinases and protein kinase C는 세포질내 serine/threonine-specific protein에 속한다. 그리고 기능적인 구조와 세포내의 분포 양상은 서로 비슷하다. Raf family oncogene를 발현시키는 a-raf와 c-raf protein kinase에 대한 antibodies로써 남생이 대뇌의 raf protein kinase의 분포를 조사하였다. 일반적으로 raf protein kinase는 제한된 지역에서 즉,general pallium,hippocampal formation, pdmordiuin hippocampi,nucleus of lateral olfactory tract, basal amygdaloid nucleus와bed of stria terminalis에 나타났으며, c-raf protein kinase의 면역학적 labeling은 a-raf보다 그 범위가 넓었다. 그렇지만 labeling되는 intensity는 오히려 a-raf보다 낮았다. 그런데 a-raf에서 가장 명확한 좋은 예는 basal amygdaloid nucleus내의 구형모양의 세포인데, 이 세포는 세포질이 매우 강하게 labeling되어 지므로 ring모양과 같이 나타났다. 특히 c-raf는 protein kinase C 가 많이 나타나는 pyramidal 세포나 Purkinje세포에 많이 존재하는 것을 볼 때 protein kinase에 의하여 활성화되는 myc와 서로 상협작용을 유도한다고 제안하는 바이다.

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암세포주와 공동 배양된 인간 지방 조직 유래 중간엽 줄기 세포의 유전자 발현 분석 (Analysis of Global Gene Expression Profile of Human Adipose Tissue Derived Mesenchymal Stem Cell Cultured with Cancer Cells)

  • 김종명;유지민;배용찬;정진섭
    • 생명과학회지
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    • 제21권5호
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    • pp.631-646
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    • 2011
  • 중간엽 줄기 세포는 다분화능을 가지고 있으며 골수, 지방, 태반, 치아속질, 윤활막, 편도 및 가슴샘 등 인체의 다양한 조직에서 분리된다. 중간엽 줄기세포는 조직의 항상성을 조절하며 다분화능, 분리와 조작의 용이함, 암세포로의 화학주성 및 면역 반응 조절 등의 특징을 가지고 있어서 재생 의학, 암 치료 및 식대주 질환(GVHD) 등에 이용할 수 있는 세포치료제로 주목 받고 있다. 하지만 주위 세포와 조직을 지지하고 조절하는 특징과 관련하여 중간엽 줄기세포가 혈관 생성을 촉진하고 성장인자를 분비하며 암세포를 공격하는 면역 반응을 억제함으로써 암의 진행을 촉진시킨다는 사실 또한 보고 되고 있다. 이러한 사실들로 인해 중간엽 줄기세포의 임상 적용이 제한되고 있다. 본 연구에서는 어떠한 기전을 통해서 중간엽 줄기세포가 암의 진행을 촉진하는 지지 세포로 기능하는지를 밝히기 위해서 인체 지방 조직에서 유래한 중간엽 줄기세포를 두 개의 암세포주(H460, U87MG)와 각각 공동 배양하고 microarray를 이용해서 암세포와 공동 배양되지 않은 중간엽 줄기세포와 유전자의 발현을 비교하였다. 두 암세포주와 공동배양에서 공통적으로 2배 이상 차이 나는 유전자를 DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery)와 PANTHER (Protein ANalysis THrough Evolutionary Relationships)를 이용해 분석하였으며 생물학적 과정, 분자적 기능, 세포의 구성 성분, 단백질의 종류, 질병과 인체 조직 그리고 신호전달에 관련된 정보를 획득하였다. 이를 통해서 암세포는 중간엽 줄기세의 분화, 증식, 에너지 대사, 세포의 구조 및 분비기능을 조절하여 유전자의 발현 양상을 암 연관 섬유모세포(cancer associated fibroblast)와 유사한 세포로 변형 시킨다는 사실을 알 수 있었다. 본 연구의 결과는 중간엽 줄기세포를 이용한 임상 치료제의 효과와 안정성을 개선하는데 응용될 수 있을 것이다.

곤충의 페로몬 생합성 활성화 신경펩타이드(PBAN) (Pheromone Biosynthesis Activating Neuropeptide (PBAN) in Insects)

  • 최만연
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제61권1호
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    • pp.15-28
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    • 2022
  • 신경펩타이드(Neuropeptide)는 신경세포에서 분비되는 단백질성 물질로, 곤충 호르몬에서 가장 큰 그룹으로 차지한다. 이들은 곤충의 전 생육단계에 걸쳐 지방체의 항상성, 섭식, 소화, 배설, 순환, 번식, 탈피/변태 등 다양한 생리적 기능과 행동을 조절하는데 관여하고 있다. 신경호르몬 일종인 PRXamide (NH2) 펩타이드 계열 호르몬은 카르복실기 끝에 PRX (X, 다양한 아미노산)라는 공통의 아미노산 서열이 특징적으로 존재하고 있으며, 곤충 전반에 걸쳐 발견된다. 곤충에서PRX 신경호르몬은 다양한 생물학적 기능에 관련하고 있는데 호르몬구조와 기능에 따라 크게 3가지로 분류한다. Pyrokinin (PK)계열의 호르몬은 페로몬 생합성 활성화 신경펩타이드(pheromone biosynthesis activating neuropeptide, PBAN) 및 휴면 호르몬(diapause hormone, DH)이 속하며, 카파(CAPA) 펩타이드 호르몬, 그리고 탈피촉진 호르몬(ecdysis trigging hormone, ETH)이 여기에 속한다. PK 계열의 PBAN 호르몬은 지금으로부터 약 30년전 나방에서 처음 밝혀졌으며, 성페로몬 생합성을 자극하는 신경호르몬으로 확인되었다. 그 이후, PBAN의 연구는 절지동물 전반에 걸쳐 다양한 연구자들에 의하여 광범위하게 이루어졌다. 본 종설은 PBAN의 유전자 구조와 발현, PBAN에 의한 세포신호 전달과 성페로몬 생합성에 관련된 생리적 기작, 그리고 신경호르몬과 PBAN을 이용한 새로운 해충 방제법 개발의 가능성과 예를 소개한다.