• 제목/요약/키워드: GST genes

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아시아인종에서 만성골수성백혈병과 Glutathione S-transferase 유전자 다형성의 메타분석 (Association between the Polymorphism of Glutathione S-transferase Genes and Chronic Myeloid Leukemia in Asian Population: a Meta-analysis)

  • 김희성
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제17권10호
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    • pp.289-299
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    • 2017
  • 아시아인종에서 만성골수성백혈병 (Chronic myeloid leukemia; CML)과 Glutathione S-transferase(GST) 유전자 다형성과 관련된 감수성을 검증하기 위해, 2017년 7월까지 발표된 9편의 논문들을 메타분석에 인용하였다. GST 유전자 다형성의 아형 중 M1 (GSTM1)과 T1 (GSTT1)의 유전자의 null, present 유형을 개별적으로 분석하였다. CML환자와 GST 유전자 다형성 사이에 연관성이 발견되었다.(GSTM1; OR=1.306, 95% CI=1.091-1.563, p=0.004, GSTT1; OR=1.987, 95% CI=1.438-2.746, p=0.000). 또한, CML 환자와 GSTM1-GSTT1 유전자 다형성 조합 null 유형의 연관성이 있었다(OR=4.191, 95% CI=2.833-6.201, p=0.000). 이와 같이, 아시아인종에서 GSTM1 유전자 다형성, GSTT1 유전자 다형성, GSTM1-GSTT1 유전자 다형성 조합은 CML 환자의 위험인자가 될 수 있다.

해양 와편모조류 Prorocentrum minimum에 대한 아세트아닐라이드계 제초제 프레틸라클로르의 분자 생물학적 저해 효과 (Molecular physiological inhibitory effects of chloroacetanilide herbicide pretilachlor on marine dinoflagellate Prorocentrum minimum)

  • 김한솔;기장서
    • 환경생물
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    • 제39권4호
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    • pp.452-462
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    • 2021
  • Pretilachlor (PRE)는 전 세계적으로 사용되는 아세트아닐리드계 제초제이며 수생 광영양생물에 미치는 영향에 대해서는 알려진 바가 거의 없다. 본 연구에서 해양 와편모조류 P. minimum를 대상으로 PRE의 생리적, 분자적 독성 영향을 평가하였다. 그 결과, PRE는 P. minimum의 성장률, 색소, 광합성 지표를 유의하게 감소시켰다. 또한, 광합성 관련 유전자 PmpsbA, PmpsaA 및 항산화 단백질 PmGST의 상대적 유전자 발현율과 세포 내 ROS 증가가 유의하였다. 이는 PRE가 P. minimum의 광합성 효율 저하 및 광계 손상을 야기하며, GST가 세포 내 산화 스트레스 및 PRE의 무독화에 관여함을 보여준다. 본 연구 결과는 PRE를 비롯한 아세트아닐라이드계 제초제가 해양 와편모조류의 세포 독성을 야기하며, 광합성 저해가 스트레스의 주요 원인임을 제시한다. 다른 아세트아닐라이드계 제초제가 비표적 광영양 생물에게 미치는 독성 영향은 아직 연구가 부족하므로, 향후 연구에서 다양한 생물종을 대상으로 추가 연구가 필요하다.

Identification and Characterization of pH-Regulated Genes in Saccharomyces cerevisiae

  • Hong, Sung-Ki;Choi, Eui-Yul
    • Journal of Microbiology
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    • 제34권4호
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    • pp.327-333
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    • 1996
  • Yeast, like many other microbes, encounters large variations in ambient pH in their natural environments. Microorganisms capable of growing over a wide pH range require a versatile, efficient pH homeostatic mechanism protecting intracellular processes against extremes of pH. In several organisms, fusions to the bacterial lacZ gene have been extremely useful for the identification of genes expressed at different time during the life cycle or under different growth conditions. In this study, using the lacZ gene screening system, we surveyed a large number of yeast strains with lacZ insertion to identify genes regulated by pH. A yeast genomic library was constructed and inserted with lacZ by a shuttle mutagenesis procedure. The yeast transformants were individually picked up with a toothpick, replica-plated, and grown in alkaline pH medium. Among the 35,000 colonies screened, 10 candidate strains were identified initially by the $\beta$-gal assay. We finally confirmed two yeast strains carrying the genes whose expression are strictly dependent on pH of growth medium. One of the fusions showing a 10-fold induction in expression level in response to alkali pH was selected and further characterized. The pH-regulated gene was cloned by inverse PCR and a partial sequence of the gene was determined. Identification and characterization of the gene is currently under investigation.

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Glutathione S-Transferase 유전적 다형성이 항산화 체계에 미치는 영향 (Effect of Glutathione S-Transferase Polymorphisms on the Antioxidant System)

  • 전경임;박은주
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제36권6호
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    • pp.708-719
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    • 2007
  • 본 연구에서는 104명의 성인남녀를 대상으로 그들의 GSTT1, GSTM1, GSTP1의 유전적 다형성 분포도를 조사한 결과, 전체 대상자들 중 각각 60명(57.4%), 42명(40.6%)가 GSTT1 과 GSTM1의 유전자를 가지고 있었으며, GSTT1과 GSTM1 유전자가 둘 다를 가진 대상자는 27명(25.7%), 둘 중에 하나만 가지고 있는 사람은 47명(45.5%) 그리고 둘 다 없는 사람은 30명으로 28.7%에 해당되었다. GSTP1 유전자의 경우 homozygous(a/a) wild type은 79명(75.5%)으로 대부분의 대상자가 여기에 해당되었으며, heterozygous(a/b) heterozygous type은 22명(21.6%), 그리고 homozygous(b/b) wild type으로 나타난 대상자는 3명(2.9%)이었다. GSTT1 null type은 산화적 스트레스를 더 많이 받고 있는 것으로 알려진흡연자의 비율이 present 군에 비해 낮음에도 불구하고 적혈구 GSH의 농도는 유의적으로 낮고 임파구 DNA 손상정도는 유의적으로 높은 것으로 나타났다. GSTM1 유전자의 경우 적혈구 GSH-Px의 활성만이 GSTM1 null type이 presenttype에 비해 유의적으로 높은 것으로 나타났으며, 나머지 다른 지표에서는 GSTM1 null type과 present type 간의 유의적인 차이가 없었다. GSTP1 유전자 다형성에 따른 항산화 영양상태의 유의적인 차이는 없었다. 흡연과 GST 유전자 다형성의 상호작용결과, 혈장 ${\alpha}$-carotene 농도, 적혈구 GSH-Px와 GST 활성은 GSTT1 null type의 경우 흡연자에 비해 비흡연자가 유의적으로 높게 나타났으며, GSTT1 present type에서는 흡연자와 비흡연자간의 유의적인 차이가 없는 것으로 나타났다. GSTM1 유전자의 경우 GSTM1의 null type에서 흡연자의 경우 비흡연자에 비해 혈장 ${\gamma}$-tocopherol과 ${\beta}$-carotene 수준이 유의적으로 낮았다. GSTT1과 GSTM1 유전자가 둘 다 없는 경우(both null)에는 흡연자의 혈장 lycopene과 적혈구 GST 활성이 비흡연자에 비해 유의적으로 낮았다. GSTP1 유전자의 경우 혈장 ${\alpha}$-carotene과 적혈구 GSH-Px 활성은 a/a type의 흡연자가 비흡연자에 비해 유의적으로 낮았고, 적혈구 catalase의 활성은 a/b type에서 흡연자가 비흡연자에 비해 유의적으로 낮았으며, ${\beta}$-carotene 농도는 두 type 모두에서 유의적으로 흡연자가 낮았다. 이상의 연구 결과 GST 유전적 다형성에따라 산화, 항산화 관련 효소 활성 및 항산화 영양소 수준의상태가 차이가 있음을 알 수 있었으며, 특히 흡연자의 경우 GST 유전자 type에 따라 항산화 영양상태가 더 큰 영향을 받음을 알 수 있었다. 이러한 연구 결과는 유전적 다형성에따라 항산화 영양소의 권장수준을 책정하는데 기초연구자료로 활용될 수 있을 것이다. 즉, GSTT1 또는 GSTM1 null type의 경우 비흡연자에 비해 흡연자가 항산화 영양소 수준이 더 낮게 나타났으므로 그들의 체내 항산화 영양 상태를 증가시킬 수 있는 여러 방안들, 즉 항산화 비타민의 보충투여 및 야채와 과일의 섭취 권장 등이 고려될 수 있을 것이다. 또한 GST 유전자 다형성에 따라 항산화 영양상태의 차이가 있으므로 항산화 관련 in vitro 실험, 동물 및 인체 실험의 결과 해석 시 나타나는 개인 간의 변이차이는 GST 유전자 다형성으로 일부분 설명될 수 있으리라 기대된다. 향후대상자의 범위를 좀 더 넓혀서 GST 유전자 다형성과 항산화 영양상태의 관계를 규명하고자 하며 더불어 산화물질 해독에 관여하는 다른 유전자(CYP 450, SULT 등)의 역할에 대해서도 계속적인 연구가 필요하다고 사료된다.

Molecular Parameters for Assessing Marine Biotoxicity: Gene Expressions of Rockfish (Sebastes schlegeli) Exposed to Polycyclic Aromatic Hydrocarbons

  • Woo, Seon-Ock;Yum, Seung-Shic;Park, Hong-Seog;Jung, Jee-Hyun;Lee, Suk-Chan;Kim, So-Jung;Lee, Taek-Kyun
    • Molecular & Cellular Toxicology
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    • 제3권4호
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    • pp.267-272
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    • 2007
  • Environmental and anthropogenic changes affect the health and stability of marine ecosystem. In this study we aimed to identify molecular biomarkers for ecotoxicological pollutants risk assessment in the rockfish (Sebastes schlegeli). We designed primers based on conserved sequences by multiple alignments of target genes from related species, and cloned the partial cDNAs of cytochrome P450 (CYP1A1), glutathione S-transferase (GST), metallothionein (MT), superoxide dismutase (SOD), ubiquitin (UB), vitellogenin (VTG) and $\beta$-actin by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) from S. schlegeli. Northern blot results indicated that these six genes expressions were significantly induced by benzo[a]pyrene (BaP, 1 ${\mu}M$) and that the level of each of their transcripts increased in BaP-exposed rockfish in a time-dependent manner. This study suggests that transcriptional changes in these six genes may be used for monitoring environmental exposure to polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs).

Genetic mapping and sequence analysis of Phi class Glutathione S-transferases (BrGSTFs) candidates from Brassica rapa

  • Park, Tae-Ho;Jin, Mi-Na;Lee, Sang-Choon;Hong, Joon-Ki;Kim, Jung-Sun;Kim, Jin-A;Kwon, Soo-Jin;Zang, Yun-Xiang;Park, Young-Doo;Park, Beom-Seok
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제35권4호
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    • pp.265-274
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    • 2008
  • Glutathione S-transferases (GSTs) are multifunctional proteins encoded by a large gene family divided into Phi, Tau, Theta, Zeta, Lambda and DHAR classes on the basis of sequence identity. The Phi(F) and Tau(U) classes are plant-specific and ubiquitous. Their roles have been defined as herbicide detoxification and responses to biotic and abiotic stresses. Fifty-two members of the GST super-family were identified in the Arabidopsis thaliana genome, 13 members of which belong to the Phi class of GSTs (AtGSTFs). Based on the sequence similarities of AtGSTFs, 11 BAC clones were identified from Brassica rapa. Seven unique sequences of ORFs designated the Phi class candidates of GST derived from B. rapa (BrGSTFs) were detected from these 11 BAC clones by blast search and sequence alignment. Some of BrGSTFs were present in the same BAC clones indicating that BrGSTFs could also be clustered as usual in plant. They were mapped on B. rapa linkage group 2, 3, 9 and 10 and their nucleotide and amino acid sequences were highly similar to those of AtGSTFs. In addition, in silico analysis of BrGSTFs using Korea Brassica Genome Project 24K oligochip and microarray database for cold, salt and drought stresses revealed 15 unigenes to be highly similar to AtGSTFs and six of these were identical to one of BrGSTFs identified in the BAC clones indicating their expression. The sequences of BrGSTFs and unigenes identified in this study will facilitate further studies to apply GST genes to medical and agriculture purposes.

아시아인종에서 자가면역질환과 GST 유전자 다형성의 메타분석 (Association between the Polymorphism of Glutathione S-transferase Genes and Autoimmune Diseases in Asian Population: a Meta-analysis)

  • 김희성
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제17권7호
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    • pp.648-663
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    • 2017
  • 아시아인종에서 GSTM1/GSTT1 유전자 다형성과 자가면역질환과 관련된 감수성을 검증하기 위해, 2015년 12월까지 EMBASE, Google, KISS, MEDLINE, PubMed에 발표된 18편의 논문들을 메타분석에 인용하였다. GSTM1/GSTT1 유전자의 null, present 유형을 개별적으로 분석하였다. 전체 인구에서 GST 다형성과 자가면역질환 사이에 연관성이 발견되었다(GSTM1, OR=1.334, 95% CI=1.137-1.567, p=0.000, GSTT1, OR=1.212, 95% CI=1.012-1.452, p=0.037). 아시아인종에서 자가면역질환, 특히 vitiligo와 아토피 피부염(p<0.05)에서 GSTM1 유전자와의 연관성이 있었고, RA와 SLE에서 GSTT1 유전자와의 연관성은 없었다(p>0.05). GSTM1 null 유형과 GSTT1 present 유형은 아시아인종에서 자가면역질환과 연관이 있었다(p<0.05). 자가면역질환과 GSTM1-GSTT1 다형성 조합 null 유형의 빈도는 대조군보다 높았다. 이와 같이, GSTM1-GSTT1 다형성 조합 null 유형이 아시아인종에서 자가면역질환의 위험 인자가 될 수 있다.

Effects of absorbents on growth performance, blood profiles and liver gene expression in broilers fed diets naturally contaminated with aflatoxin

  • Liu, J.B.;Yan, H.L.;Cao, S.C.;Hu, Y.D.;Zhang, H.F.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제33권2호
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    • pp.294-304
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    • 2020
  • Objective: The study was conducted to evaluate the effects of the absorbent (a mixture of activated carbon and hydrated sodium calcium aluminosilicate) on growth performance, blood profiles and hepatic genes expression in broilers fed diets naturally contaminated with aflatoxin. Methods: A total of 1,200 one-day-old male chicks were randomly assigned to 6 treatments with 10 replicate cages per treatment. The dietary treatments were as follows: i) control (basal diets); ii) 50% contaminated corn; iii) 100% contaminated corn; iv) control+1% adsorbent; v) 50% contaminated corn+1% absorbent; vi) 100% contaminated corn+1% absorbent. Results: During d 1 to 21, feeding contaminated diets reduced (p<0.05) body weight (BW), average daily gain (ADG), and average daily feed intake (ADFI), but increased (p<0.05) feed-to-gain ratio (F/G). The absorbent supplementation increased (p<0.05) BW, ADG, and ADFI. There were interactions (p<0.05) in BW, ADG, and ADFI between contaminated corn and absorbent. Overall, birds fed 100% contaminated diets had lower (p<0.05) final BW and ADG, but higher (p<0.05) F/G compared to those fed control diets. The absorbent addition increased (p<0.05) serum albumin concentration on d 14 and 28 and total protein (TP) level on d 28, decreased (p<0.05) alanine transaminase activity on d 14 and activities of aspartate aminotransferase and alkaline phosphatase on d 28. Feeding contaminated diets reduced (p<0.05) hepatic TP content on d 28 and 42. The contaminated diets upregulated (p<0.05) expression of interleukin-6, catalase (CAT), and superoxide dismutase (SOD), but downregulated (p<0.05) glutathione S-transferase (GST) expression in liver. The absorbent supplementation increased (p<0.05) interleukin-1β, CAT, SOD, cytochrome P450 1A1 and GST expression in liver. There were interactions (p<0.05) in the expression of hepatic CAT, SOD, and GST between contaminated corn and absorbent. Conclusion: The results suggest that the naturally aflatoxin-contaminated corn depressed growth performance, while the adsorbent could partially attenuate the adverse effects of aflatoxin on growth performance, blood profiles and hepatic genes expression in broilers.

Modulated Gene Expression of Toxoplasma gondii Infected Retinal Pigment Epithelial Cell Line (ARPE-19) via PI3K/Akt or mTOR Signal Pathway

  • Zhou, Wei;Quan, Juan-Hua;Gao, Fei-Fei;Ismail, Hassan Ahmed Hassan Ahmed;Lee, Young-Ha;Cha, Guang-Ho
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제56권2호
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    • pp.135-145
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    • 2018
  • Due to the critical location and physiological activities of the retinal pigment epithelial (RPE) cell, it is constantly subjected to contact with various infectious agents and inflammatory mediators. However, little is known about the signaling events in RPE involved in Toxoplasma gondii infection and development. The aim of the study is to screen the host mRNA transcriptional change of 3 inflammation-related gene categories, PI3K/Akt pathway regulatory components, blood vessel development factors and ROS regulators, to prove that PI3K/Akt or mTOR signaling pathway play an essential role in regulating the selected inflammation-related genes. The selected genes include PH domain and leucine- rich-repeat protein phosphatases (PHLPP), casein kinase2 (CK2), vascular endothelial growth factor (VEGF), pigment epithelium-derived factor (PEDF), glutamate-cysteine ligase (GCL), glutathione S-transferase (GST), and NAD(P)H: quinone oxidoreductase (NQO1). Using reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and quantitative real-time reverse transcription polymerase chain reaction (qRT-PCR), we found that T. gondii up-regulates PHLPP2, $CK2{\beta}$, VEGF, GCL, GST and NQO1 gene expression levels, but down-regulates PHLPP1 and PEDF mRNA transcription levels. PI3K inhibition and mTOR inhibition by specific inhibitors showed that most of these host gene expression patterns were due to activation of PI3K/Akt or mTOR pathways with some exceptional cases. Taken together, our results reveal a new molecular mechanism of these gene expression change dependent on PI3K/Akt or mTOR pathways and highlight more systematical insight of how an intracellular T. gondii can manipulate host genes to avoid host defense.

Screening Differential Expressions of Defense-related Responses in Cold-treated 'Kyoho' and 'Campbell Early' Grapevines

  • Ahn, Soon Young;Kim, Seon Ae;Han, Jae Hyun;Kim, Seung Heui;Yun, Hae Keun
    • 원예과학기술지
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    • 제31권3호
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    • pp.275-281
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    • 2013
  • Low temperature is one of the major environmental factors that affect productivity including reduced growth and budding of vines, and changes of metabolic processes in grape (Vitis spp.). To screen the specific expression of abiotic stress-related genes against cold treatment in 'Kyoho' and 'Campbell Early' grapevines, expression of various defense-related genes was investigated by RT-PCR and real-time PCR. Among the 67 genes analyzed by RT-PCR and real-time PCR, 17 and 16 types of cDNA were up-regulated, while 5 and 6 types were down-regulated in cold-treated 'Kyoho' and 'Campbell Early' grapevines, respectively. Genes encoding carotene (Cart3564 and Cart4472), chalcone isomerase (CHI), cytochrome P450 (CYP), flavonol synthase (FLS), endo-${\beta}$-glucanase precursor (Glu), glutathione peroxidase (GPX), glutathione-S-transferase (GST), leucine-rich repeats (LRR), manganese superoxide dismutase (Mn-SOD), phenylalanine ammonia lyase (PAL), polygalacturonase-inhibiting protein (PGIP), proline rich protein 2 (PRP2), small heat shock protein (sHSP), temperature induced lipocalin (TIL), and thaumatin-like protein (TLP) were up-regulated, while those encoding CBF like transcription factor (CBF1), chitinase-like protein (CLP), cold induced protein (CIP), glycerol-3-phosphate acyltransferase (GPAT), and mitogen-activated protein kinase (MAPK) were down-regulated by low temperature treatment in both in 'Kyoho' and 'Campbell Early'.