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Pseudomonas syringae pv. syringae에 의한 애호박 세균점무늬병 (Bacterial Spot Disease of Green Pumpkin by Pseudomonas syringae pv. syringae)

  • 박경수;김영탁;김혜성;이지혜;이혁인;차재순
    • 식물병연구
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    • 제22권3호
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    • pp.158-167
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    • 2016
  • 육묘장과 재배포장의 애호박에서 새롭게 발생한 병원균의 특성을 분석하여 동정하였다. 병징은 잎에 수침상의 병반과 강한 노란색의 둘레무리를 가진 점무늬, 꽃에서 갈색 병반, 열매에 노란색의 점무늬였다. 잎의 점무늬로부터 분리된 세균은 박과작물 8개의 식물체, 흑종호박, 애호박, 쥬키니호박, 풋호박, 참박, 참외, 멜론, 오이에 병원성이 있었지만 수박과 밤호박에서는 병을 일으키지 못했다. 분리세균은 다발모를 가진 막대형으로 그람음성이며 King's B 배지에서 형광성이었으며, LOPAT 1a 그룹에 속했다. 그들의 Biolog 기질이용성은 Biolog database의 P. syringae pv. syringae 이용성과 유사하였다. 16S rRNA 유전자 염기서열을 이용한 계통수와 4개의 항존유전자(gapA, gltA, gyrB, rpoD)의 염기서열과 PAMDB에 있는 P. syringae균주들의 염기서열을 이용한 MLST는 애호박 분리균주들이 P. syringae pv. syringae 균주들과 동일한 그룹(clade)으로 그룹화되었고, MLST 계통수에서 애호박 분리균주들의 그룹(clade)은 genomospecies 1에 속하였다. 표현형적, 유전적 특성은 애호박 분리균이 P. syringae pv. syringae임을 제시하였다.

국내 박과 작물에서 과실썩음병을 일으키는 Acidovorax citrulli 집단의 유전적 특성 (Genetic Characteristics of Acidovorax citrulli Population Causing Bacterial Fruit Blotch against Cucurbits in Korea)

  • 송정영;박수연;서문원;남명현;임현섭;이성찬;이윤수;김홍기
    • 식물병연구
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    • 제21권2호
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    • pp.82-88
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    • 2015
  • Acidovorax citrulli는 전 세계적으로 다양한 박과 작물 재배포장에서 과실썩음병(bacterial fruit blotch)을 일으키며, 경제적으로 큰 피해를 주고 있다. 효과적인 병 방제 전략을 수립하기 위한 기초자료를 얻고자 전국의 주요 박과 작물 재배지역으로부터 얻은 A. citrulli 33균주들을 대상으로 5개 유전자(16S rRNA, adk, gltA, glyA, pilT)를 이용한 multi-locus 유연관계 분석을 실시하였다. 국내 A. citrulli 집단은 종 특이적이며, 그룹 특이적인 유전적 특성들을 기반으로 KCC1과 KCC2 그룹으로 나누어졌으며, 이들은 수박과 오이와 멜론분리균들을 모두 포함했고 이들 중 KCC2 그룹 균주들의 발생이 우세했다. KCC1 그룹 균주들은 수박이외 기주에서의 발생비율이 64%였으나, KCC2 그룹에서는 수박분리균의 비율이 72%로 우세하였다. 본 연구결과는 국내 A. citrulli 집단에 유전적인 변이가 존재한다는 것을 밝혔으며, 효과적인 박과 작물 과실썩음병 방제체계 수립에 있어서 매우 유용한 자료로 활용될 것으로 판단된다.

Pseudomonas syringae pv. syringae에 의한 수박 잎점무늬병의 발생 (Occurrence of Leaf Spot Disease on Watermelon Caused by Pseudomonas syringae pv. syringae)

  • 박경수;이지혜;김영탁;김혜성;이준우;이현수;이혁인;차재순
    • 식물병연구
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    • 제27권4호
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    • pp.180-186
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    • 2021
  • 경남과 전남의 육묘중인 수박과 정식한 포장의 유묘에서 황색의 둘레무리와수침상의 갈색 및 검은색의 반점의 병반이 관찰되었다. 병반에서 분리한 분리균은 수박과 쥬키니에서 높은 병원성을 보여주었다, 분리균은 4개의 속생모를 가진 막대형 세균이었다. 분리균은 그람음성으로 LOPAT group 1a에 속하였으며, King'B 배지에서 형광성이 없었다. 16S rRNA 유전자 염기서열을 이용한 계통수 분석과 4개의 항존유전자 염기서열(gapA, gltA, gyrB, rpoD)을 이용한 multi-locus sequencing typing 분석 결과 분리균들은 Pseudomonas syringae pv. syringae와 가장 높은 상동성을 보여주었고, 같은 그룹(clade)으로 묶이었다. 또한 이들은 P. syringae genomospecies group 1에 속하였다. 수박의 잎점무늬병징에서 분리한 세균의 형태적, 생리적, 유전적 특징은 이들이 P. syringae pv. syringae임을 제시한다. 본 논문은 한국에서 P. syringae pv. syringae가 수박에서 점무늬병을 일으키는 최초의 보고이다.

볼바키아 세균에 의한 절지동물 기주의 생식적 변화와 생물적방제 프로그램에 이용 방안 (Wolbachia-mediated Reproductive Alterations in Arthropod Hosts and its use for Biocontrol Program)

  • 엘라히 로스타미;후세인 마다디;하비브 아바시포르;쉬바 시바라마크리쉬난
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제55권2호
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    • pp.177-188
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    • 2016
  • 알파 프로테박테리아(${\alpha}-proteobacterium$)인 볼바키아(Wolbachia) 세균은 절지동물 세포내의 중요한 공생균 중의 하나이다. 그람 음성 세균인 이 공생균은 기주동물의 여러 생물적 과정에 관여하고 있으며, 현재 생물적 방제 수단으로 주목 받고 있다. 볼바키아는 기주 세포의 세포질에 서식하는 세균인데 암컷을 통하여 세대간 전염된다. 볼파키아의 감염 개체 밀도를 높이기 위해 기주의 생식방식을 조작하는 다양한 전략을 발달시켰다. 볼바키아 유전자형 계통은 볼바키아 표면 단백질(WSP)의 고변이영역 아미노산 서열과 복합좌위 서열 타이핑(Multilocus sequence typing, MLST)으로 결정된다. 상이한 유전계통 판별은 wsp, 16S rRNA, ftsZ, gltA, groEL 등 유전자 분자표지를 이용하게 된다.. 이 계통 볼바키아 세균과 그들의 우월한 표현형이 농업해충과 인간의 질병매개 곤충에 대한 방제 프로그램에서 이용 가능성이 고려되고 있다. 볼바키아 표현형들은 세포질불일치(cytoplasmic incompatibility, CI), 단성생식 유도(parthenogenesis induction, PI), 여성화(feminization, F), 수컷치사(male killing, MK) 등을 유발하는 것으로 알려져 있다. 기타 볼바키아 세균의 농업과 위생곤충 방제 프로그램에서 응용 방안을 고찰하였다.

Molecular Identification of Bartonella melophagi and Wolbachia Supergroup F from Sheep Keds in Xinjiang, China

  • Liu, Yonghong;He, Bo;Li, Fei;Li, Kairui;Zhang, Luyao;Li, Xianqiang;Zhao, Li
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제56권4호
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    • pp.365-370
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    • 2018
  • To confirm that Bartonella and Wolbachia were carried by sheep keds (Melophagus ovinus) in southern Xinjiang of China, 17 M. ovinus samples, which were collected in Aksu Prefecture, Xinjiang, were randomly selected. In this study, the Bartonella gltA and Wolbachia 16S rRNA gene were amplified through conventional PCR and the sequence of those amplified products, were analyzed. The results demonstrated that Bartonella was carried by all of the 17 sheep keds and Wolbachia was carried by 15 out of them. Bartonella was identified as B. melophagi. Three strains of Wolbachia were supergroup F and 1 strain has not been confirmed yet. It is the first report about Wolbachia supergroup F was found in sheep keds and provided the molecular evidence that B. melophagi and Wolbachia supergroup F were carried by sheep keds in Aksu Prefecture of southern Xinjiang, China. The 2 pathogens were found in sheep keds around Taklimakan Desert for the first time.

Alexander Disease

  • Kang, Ji Hae;Hong, Seung Jee;Kim, Doo-Kwun
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제10권2호
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    • pp.88-93
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    • 2013
  • Alexander disease (ALXD) is a rare demyelinating disease of the white matter of the brain that is caused by a mutation in the glial fibrillary acidic protein (GFAP) gene. The overexpression of GFAP in astrocytes induces a failure in the developmental growth of the myelin sheath. The neurodegenerative destruction of the myelin sheath of the white matter is accompanied by an accumulation of abnormal deposits of Rosenthal fibers in astrocytes, which is the hallmark of ALXD. The disease can be divided into four groups based on the onset age of the patients: neonatal, infantile, juvenile, or adult. Early-onset disease is more severe, progresses rapidly, and results in a shorter life span than late-onset cases. Magnetic resonance imaging and genetic tests are mostly used for diagnostic purposes. Pathological tests of brain tissue for Rosenthal fibers are definitive diagnostic methods. Therapeutic strategies are being investigated. Ceftriaxone, which is an enhancer of glial glutamate transporter (GLT-1) expression, is currently in clinical trials for the treatment of patients with ALXD. To date, there are no clinically available treatments. The cause, pathology, pathophysiology, inheritance, clinical features, diagnosis, and treatment of ALXD will be reviewed comprehensively.

Genetic Association Analysis of Fasting and 1- and 2-Hour Glucose Tolerance Test Data Using a Generalized Index of Dissimilarity Measure for the Korean Population

  • Yee, Jaeyong;Kim, Yongkang;Park, Taesung;Park, Mira
    • Genomics & Informatics
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    • 제14권4호
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    • pp.181-186
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    • 2016
  • Glucose tolerance tests have been devised to determine the speed of blood glucose clearance. Diabetes is often tested with the standard oral glucose tolerance test (OGTT), along with fasting glucose level. However, no single test may be sufficient for the diagnosis, and the World Health Organization (WHO)/International Diabetes Federation (IDF) has suggested composite criteria. Accordingly, a single multi-class trait was constructed with three of the fasting phenotypes and 1- and 2-hour OGTT phenotypes from the Korean Association Resource (KARE) project, and the genetic association was investigated. All of the 18 possible combinations made out of the 3 sets of classification for the individual phenotypes were taken into our analysis. These were possible due to a method that was recently developed by us for estimating genomic associations using a generalized index of dissimilarity. Eight single-nucleotide polymorphisms (SNPs) that were found to have the strongest main effect are reported with the corresponding genes. Four of them conform to previous reports, located in the CDKAL1 gene, while the other 4 SNPs are new findings. Two-order interacting SNP pairs of are also presented. One pair (rs2328549 and rs6486740) has a prominent association, where the two single-nucleotide polymorphism locations are CDKAL1 and GLT1D1. The latter has not been found to have a strong main effect. New findings may result from the proper construction and analysis of a composite trait.

mRNA Expression of Ovine Angiopoietin-like Protein 4 Gene in Adipose Tissues

  • Zhang, Jing;Jing, Jiong-Jie;Jia, Xia-Li;Qiao, Li-Ying;Liu, Jian-Hua;Liang, Chen;Liu, Wen-Zhong
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제29권5호
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    • pp.615-623
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    • 2016
  • Angiopoietin-like protein 4 (ANGPTL4) is involved in a variety of functions, including lipoprotein metabolism and angiogenesis. To reveal the role of ANGPTL4 in fat metabolism of sheep, ovine ANGPTL4 mRNA expression was analyzed in seven adipose tissues from two breeds with distinct tail types. Forty-eight animals with the gender ratio of 1:1 for both Guangling Large Tailed (GLT) and Small Tailed Han (STH) sheep were slaughtered at 2, 4, 6, 8, 10, and 12 months of age, respectively. Adipose tissues were collected from greater and lesser omental, subcutaneous, retroperitoneal, perirenal, mesenteric, and tail fats. Ontogenetic mRNA expression of ANGPTL4 in these adipose tissues from GTL and STH was studied by quantitative real time polymerase chain reaction. The results showed that ANGPTL4 mRNA expressed in all adipose tissues studied with the highest in subcutaneous and the lowest in mesenteric fat depots. Months of age, tissue and breed are the main factors that significantly influence the mRNA expression. These results provide new insights into ovine ANGPTL4 gene expression and clues for its function mechanism.

중국 연변 쇼시난차 반암동 광상의 광화작용 및 변질작용: 유체포유물 및 황동위원소 연구 (Alteration and Mineralization in the Xiaoxinancha Porphyry Copper Deposit, Yianbin, China: Fluid Inclusion and Sulfur Isotope Study)

  • Seong-Taek Yun;Chil-Sup So;Bai-Lu Jin;Chul-Ho Heo;Seung-Jun Youm
    • 자원환경지질
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    • 제35권3호
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    • pp.211-220
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    • 2002
  • 중국 북경에서 북북동쪽으로 800 km에 위치한 길림싱의 쇼시난차 동-급 광상은 섬록암에 배태되어 있다. 쇼시난차 동-금 광상의 광석은 망상세맥상으로 산출되며, potassic 및 phyllic변질대에 농집되어 있다. 쇼시난차 동-금 광상의 남측 및 북측광체의 품위는 각각 0.8% Cu, 3.64 g/t Au 및 0.63% Cu, 3.80 g/t Au이다. 본 광상의 열수변질 작용은 암주에 집중되어 있고, 암주의 정치와 폭넓게 관련되어있는 것으로 사료된다. 초기 열수변질 작용은 K-변질작용이 지배적이며, 시간이지나면서 프로필라이트화 작용으로 전환되는 양강을 보인다. 본 광상에서는 적철석과 수반된 휘동석이 채광품위의 동을 산출하고 있으며, 황동석, 반동석, 석영, 녹염석, 녹니석 및 방해석의 광물조합이 전형적으로 관찰된다. 상기 광물조합외에 본 연구에서 인지된 기타 광물들에는 황철석, 백철석, 자연금, 에렉트럼, hessite, hedleyite, volynskite, galenobismutite, covellite및 goethite등이 있다. 유체포유물 자료에 의하면, 본 동-금 광상은 시간이 지나면서 희석되고 차가운 천수의 혼입에 의한 냉각작용의 결과로 형성되었음을 지시하고 있다. 광화시기별로 보면, 광화 2기 초기에는 약 497$^{\circ}C$에서 비등현상이 발생하고 시간이 지나면서 균질화 온도가 10$0^{\circ}C$정도 낮은 암염을 배태하고 있는 제3형 유체포유물이 포획된다. 그리고, 광화 2기 맥내 제 3형 유체포유물의 염농도는 383$^{\circ}$~459$^{\circ}C$의 균질화 온도에서 54.7~66.9 wt.%의 상당염농노에 해당되며, 1 km이하의 생성심도를 지시하고 있다 광화 3기맥의 제 1형의 함동 유체는 168$^{\circ}$~3$65^{\circ}C$의 균질화온도와 1.1~9.0 wt.% 상당 염농도를 보이며, 해당 유체포유물들은 심하게 균열된 각력암을 배태하고 있는 석영맥내에 포획되어 있다. 이는 비등증거를 강하게 지시하고 있으며 50~80 bar의 정수압에 해당된다. 본 광상의 황화물의 $\delta$$^{34}$ S 값은 후기로 가면서 미약하게 증가하는 경향을 보이며, 계산된 $\delta$$^{34}$ $S_{H2S}$값은 0.8~3.7$\textperthousand$에 해당한다. 산소분압이 감소했으리라는 광물학적 증거는 없으며, 광화유체의 산소분압은 자철석과의 반응을 통해서 완충되었으리라 사료된다. 이와같은 사실을 종합해 본 결과, 황화물이 $\delta$$^{34}$ $S_{H2S}$값은 쇼시난차 동-금 광상의 함동금 열수유체에 두 가지 정도의 황source가 병합되었으리라 추정할 수 있다. 첫번째 source는 동위원소적으로 가벼운 1~2$\textperthousand$$\delta$$^{34}$ S값을 지닌 광화작용과 관련된 중생대 화강암이다. 이는 본 광상지역의 모암으로서의 섬록암이 plagiogranite를 관입하고 있다는 사실로부터 추론 가능하다. 그리고, 두번째 source는 >4.0$\textperthousand$$\delta$$^{34}S$ 값을 지닌 동위윈소적으로 더욱 무거운 source로서, 산출이 미약하여 지질도상에는 기재되어 있지 않지만 국부적인 반암의 존재를 상정할 수 있다. 있다.