IGF2 유전자는 최초로 연구된 각인 유전자이고 대부분 포유동물의 부계로부터 유전되는 각인 유전자이다. 근육성장과 지방축적에 연관된 경제 형질좌위가 2번 염색체에 위치하여 있다고 보고되었는데, IGF2-in3-G3072A가 원인 유전자변이라고 밝혀졌다. 본 연구는 IGF2 유전자의 Intron7번의 세 개의 SNP (IGF2-in7-G162C, IGF2-in7-C179G, IGF2-in7-G186T)는 IGF2-in3-G3072A와 품종 별 연관불균형으로 완전 연쇄되어 있는 것을 보고 하였다. Real-time quantitative PCR 실험 결과에서 부모세대가 부계가 IGF2-in3-3072A를 가진 요크셔품종 수퇘지가 IGF2-in3-3072G를 가진 한국재래 암퇘지와 교배하여 생산한 자손(Y그룹)과 IGF2-in3-3072G 유전자형의 한국재래품종 수퇘지와 IGF2-in3-3072A를 가진 요크셔 암퇘지와 교배하여 생산된 자손(K그룹)에서 보다 등지방 조직에서의 IGF2 유전자 발현양이 낮았다. 하지만 근육조직에서는 요크셔품종의 유전자형이 IGF2-in3-3072A를 부계로 하고 IGF2-in3-3072G를 한국재래돼지품종모계로 할 때 IGF2 유전자 발현양이 높은 결과를 보였다. 이러한 연구에서 IGF2 유전자의 근육과 지방조직에서의 발현양은 부계의 유전자형에 의해 결정되며, 한국재래돼지의 높은 체지방 축적과 낮은 성장률에 관련된 특성이 IGF2 유전자 유전자형에 의해 영향을 받는다는 유전적인 근거를 제공함으로써 한국재래돼지를 상업적으로 이용하는데 있어서 IGF2 유전자를 이용할 수 있는 분자유전학적 근거를 제시하였다.
고려인삼학회 1990년도 Proceedings of International Symposium on Korean Ginseng, 1990, Seoul, Korea
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pp.58-64
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1990
The effects of ginseng saponins, G-Rbl and G-Rc on the rat liver LDH A-gene transcnptional activity was investigated during pro-replicative phase of rat liver after partial hepatectomy. Changes in LDH A-mRNA levels in regenerating rat liver after intraperitoneal administrations of G-Rbl of G-Rc were tested by slot blot hybridization methods. The results showed that G-Rbl (1 mg/100g B.W) and G-Rc (1 ma/100g B.W) caused marked increases of LDH A-mRNA contents by respectively 1.9- and 1.5-fold in rat liver at 5·hours after partial hepatectomy. Dose dependent effect of G-Rbl and G-Rc (1-25 mg/100g B.W) on the LDH A-mRNA levels on regenerating rat liver were also analyzed. The maximal in- creases of liver LDH A-mRNA levels were observed with the doses of 1 mg for G-Rbl and 5 mg for G-Rc However, when the administration doses of G-Kbl and G-Rc were increased to 20 mg, G-Rbl caused a marked decrease of LDH A-mRNA level to 61% of those in sham-operated rat liver In contrast, G-Rc slightly decreased the liver LDH A-mRNA contents by 30% as compared to those of the maximum value but still maintained 22% higher LDH A-mRNA levels then those of sham-operated rate liver. On the basis of these experimental results, we conclude that ginseng saponin, G-Rb 1 and G·Rc have stimulatory effect at the lower concentration (1 mg/100g B.W) and inhibitory effect at the higher concentration (20 moi loos 5.W) on the LDH A-gene transcription during regeneration of rat liver, Additionally we also investigated the stimulatory effects of ginsenosides on the protein and DNA synthetic activities in hepatocyte primary cell cultures isolated from regenerating rat liver. Both of G·Rc and -Re increased the synthetic rates of hepatocytes proteins and DNA at the administration doses of 50 ug and 100 ug/3 ml/dish respectively representing 1.3-1.6 fold increases. From these results we postulate that G-Rc and -Re may have a mitogen enhancer activity for the hepatocyte proliferation during rat liver regeneration period. Keywords Inductive effects of ginsenosides, G-Rb, -Rc, and -Re, rat LDH A-gene transcription, the sin thetic rate of proteins and DNA in regeneration rat liver.
Leptin, the hormone product of the obese gene, is secreted predominately from white adipose tissue and regulates feed intake, energy metabolism and body composition. It has been considered a candidate gene for performance, carcass and meat quality traits in beef cattle. The objective of this study was to identify SNPs in the promoter region of the leptin gene and to evaluate the possible association of the SNP genotypes with carcass and meat quality traits in Korean cattle. We identified a total of 25 SNPs in the promoter region (1,208-3,049 bp upstream from the transcription start site) of the leptin gene, eleven (g.1508C>G, g.1540G>A, g.1545G>A, g.1551C>T, g.1746T>G, g.1798ins(G), g.1932del(T), g.1933del(T), g.1934del(T), g.1993C>T and g.2033C>T) of which have not been reported previously. Their sequences were deposited in GenBank database with accession number DQ202319. Genotyping of the SNPs located at positions g.2418C>G and g.2423G>A within the promoter region was performed by direct sequencing and PCR-SSCP method to investigate the effects of SNP genotypes on carcass and meat quality traits in Korean cattle. The SNP and SSCP genotypes from the two mutations of the leptin promoter were shown to be associated with the BF trait. The average BF value of animals with heterozygous SNP genotype was significantly greater than that of animals with the homozygous SNP genotypes for the g.2418C>G and g.2423G>A SNPs (p<0.05). Analysis of the combined genotype effect in both SNPs showed that animals with the AC SSCP genotype had higher BF value than animals with BB or AA SSCP genotypes (p<0.05). These results suggest that SNP of the leptin promoter region may be useful markers for selection of economic traits in Korean cattle.
무지개송어 등의 연어과 어류에서 발생하는 전염성 조혈기괴사증 바이러스의 국내분리주인 IHNV-PRT 의 특성을 규명하기 위하여 IHNV-PRT 의 당단백질인 G를 암호화하고 있는 유전자의 일부를 PCR로 증폭한 후 cDNA를 클로닝하여 이들의 염기서열을 분석하였다. 이 PCR product 는 442 bp의 크기이었다. IHNV-PRT 의 G의 염기서열을 IHNV 의 다른 strain 과 비교 분석한 결과 IHNV-RB-76, IHNV-RB, IHNV-LR-73, IHNV-K, IHNV-WRAC, IHNV-SRCV, IHNV-CoI-85들의 G와 각각 95,94,94,94,93,93%의 상동성을 보였다. 그러나 넙치로부터 분리된 fish rhabdovirus 인 hirame rhabdovirus 의 G와는 81%의 사동성을 보였다. 이 결과로부터 IHNV 의 G 유전자는 비록 HRV 의 G 유전자와 유사성은 높지 않지만, IHNV 의 strain 에 관계없이 유사하다는 것을 알 수 있다.
본 연구는 수정란을 수란우에 이식하기 이전에 형질전환가능 수정란을 선발할 수 있다면 형질전환동물의 생산에 크게 도움이 되므로 3.2 kb $\beta$-actin promoter (lacZ/n대) DNA를 미세주입하여 배반포기배에서의 발현을 확인하여 이들을 선발할 수 있는가를 규명하고자 하엿다. 채란된 난포란은 10%FBS, 5$\mu\textrm{g}$/ml LH, 0.5$\mu\textrm{g}$/ml FSH, 100 unit/ml penicillin 및 100 $\mu\textrm{g}$/ml streptomycin이 함유된 TCM199에 22~24 시간동안 체외성숙을 유도후 5$\mu\textrm{g}$/ml heparin으로 수정능획득을 유도한 1$\times$106 sperm/ml의 정자로 체외수정을 시켰다. 체외수정후 18~20시간째에 vortexing에 의해 과립막세포를 제거하고 원심분리시켜 자/웅전핵이 확인되는 수정란의 핵에 3~4 ng/${\mu}\ell$ lacZ/neo DNA를 미세주입하였다. 모든 수정란의 배양은 3 mg/ml BSA, 20${\mu}\ell$/ml NEM AMINO acids 및 40${\mu}\ell$/ml BME amino acids가 함유되어 있는 CR1aa 배양액에 neo/DNA로 transfected 된 BRL 단층에서 실시하였다. G418에 대한 적정농도를 찾기 위하여 정상적인 수정란에 0, 50, 100 및 200 $\mu\textrm{g}$/ml G418를 첨가하여 배양한 결과 8일째에 30.3%(44/145), 8.7%(13/150), 0.7%(1/151) 및 0% (0/134)의 수정란이 배반포기까지 발달하였다. 그래서 본 실험에서는 일정하게 100$\mu\textrm{g}$/ml G418을 첨가하여 배양하였다. 총 1,127개의 수정란을 미세주입후 G418 없는 배양액에서 710개 (63.0%)가 분할하였다. 미세주입후 48시간째에 2-세포기이상 분할된 수정란을 대조구 및 100$\mu\textrm{g}$/ml G418처리구를 무작위로 할당하여 배양하였으며, 또한 740개의 정상수정란도 같은 반복수로 배양을 실시하였다. 미세주입한 수정란은 8일 후 11.6%(26/255) 및 5.2% (14/267)가 대조구 및 G418 처리구에서 배반포기까지 발달하였으며 정상수정란은 27.2% (151/740)가 배반포기 배까지 발달하였다. 미세주입후 대조구에서는 23.1$\pm$2.6/70.7$\pm$4.7 (32.7%)의 할구가 $\beta$-Gal 활력을 보였고, 반면에 100$\mu\textrm{g}$/ml G418 처리구에서는 40.3$\pm$4.1/48.8$\pm$7.5 (82.6%)가 $\beta$-Gal 활력을 보였다. 비록 mosaic 형태로 외래유전자가 발현되었지만 대조구에서 87.0% (26/30개) 배반포기가 $\beta$-Gal 활력을 보인 반면, G418 처리구에서는 모든 배반포기가 $\beta$-Gal 활력을 보였다 (P<0.05). 그러나 대조구 및 G418 처리구의 ICM colony에서는 영양배엽과 내배엽을 제외한 epiblast에서는 확인되지 않았다. 그러나 이 결과로부터 $\beta$-actin promoter/lacZ gene이 integration되지 않는 것인지 또는 다만 염색 확인이 되지 않는 것인지를 판단할 수는 없다. 이상의 결과는 미세주입후 G418에서 배양한 배반포기배에서는 대부분의 할구에서 주입된 gene을 발현하고 있었으나 ICM colony에서는 특히 epiblast에서는 발현되지 않거나 침묵하고 있었다. 비록 G418 처리구에서 훨씬 더 높은 비율로 주입된 gene이 발현되고 있으나 총세포수는 유의적으로 감소하여 이후 형질전환동물의 생산과 ES like-cell의 설립에는 감소될 것으로 사려된다. 그러나 형질전환 수정란의 선발 및 형질전환동물의 생산능력에 관해서는 더 많은 연구가 필요하다고 사려된다.
김(Porphyra yezoensis, Laver)의 MeOH 추출에 의한 유기용매 별 분획물에서 폴리페놀 함량과 항산화 활성 및 간암세포주 HepG2의 세포증식 억제효과를 확인하였다. $CHCl_3$ 분획물의 폴리페놀 함량은 $10.34{\mu}g/mg$으로 물 분획물의 $13.08{\mu}g/mg$ 보다는 다소 적게 나타났으나, DPPH 자유라디칼 소거에 의한 전자공여능(EDA)에서 나타난 $ED_{50}$은 $16.96{\mu}g/ml$로 가장 높게 나타났다. $CHCl_3$과 EtOAc 분획물은 농도의존적으로 HepG2 세포의 증식을 억제하였으며, 특히 $900{\mu}g/ml$의 $CHCl_3$ 분획물을 24시간 동안 처리하여 90%의 세포증식이 억제되었다. 한편 $CHCl_3$ 분획물이 처리된 HepG2 세포의 유전자 발현 양상을 microarray로 확인하였다. P. yezoensis의 효능과 연관지은 gene ontology 분석으로 비타민 D 합성 과정, 항균작용에 대한 반응 및 영양물질에 대한 반응에 관련된 유의 유전자들을 탐색하였다. 유의 유전자로 IL6R와 CYP1A1를 선정하였고, 이들 유전자의 상위 조절자는 ARNT 유전자가 선정되었다. 또한 50 및 $100{\mu}g/ml$의 $CHCl_3$ 분획물이 처리된 HepG2 세포에서 IL6R와 CYP1A1 단백질의 발현과 상위 조절자인 ARNT의 활성을 Western blotting으로 확인하였다.
Journal of the Korean Data and Information Science Society
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제24권6호
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pp.1331-1339
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2013
지질 단백질 리파제 (lipoprotein lipase; LPL) 유전자는 지방산 합성을 조절하는 유전자로 알려져 있다. 특히, 한우의 LPL 유전자 내의 지방산 합성과 단일염기다형성 (SNP) 사이의 유전적 연관성이 밝혔진 바 있다. 최근에는 LPL 유전자 내의 3가지 SNP 즉, c.322G>A, c.329A>T 그리고 c.1591G>A는 한우의 불포화 지방산 조성과 도체형질과 관련된 새로운 유전자로 밝혀진 바 있다 (Oh 등; 2013). 본 논문은 최근 밝혀진 3개의 새로운 LPL 유전자를 활용 한우의 도체경제형질은 물론 맛과 향이 좋은 여러 경제형질에 영향을 주는 우수 유전자 조합을 선별하려 하였다. 우수 유전자 선별 조합을 선별하기 위해 유전자 조합 방법으로 많이 활용되는 다중인자 차원 축소 방법을 이용하였다. 순수 유전자 효과만의 결과를 활용하기 위해 실험에서 얻어진 자료의 환경요인을 보정한 후 분석을 시도하였다 (Matsuhashi 등, 2011).
Objective: Uncoupling protein 3 gene (UCP3) is a candidate gene associated with the meat quality of pigs. The aim of this study was to explore the regulation mechanism of UCP3 expression and provide a theoretical basis for the research of the function of porcine UCP3 gene in meat quality. Methods: Bisulfite sequencing polymerase chain reaction (PCR) and quantitative real-time PCR (Q-PCR) were used to analyze the methylation of UCP3 5′-flanking region and UCP3 mRNA expression in the adipose tissue or skeletal muscle of three pig breeds at different ages (1, 90, 210-day-old Putian Black pig; 90-day-old Duroc; and 90-day-old Dupu). Results: Results showed that two cytosine-guanine dinucleotide (CpG) islands are present in the promoter region of porcine UCP3 gene. The second CpG island located in the core promoter region contained 9 CpG sites. The methylation level of CpG island 2 was lower in the adipose tissue and skeletal muscle of 90-day-old Putian Black pigs compared with 1-day-old and 210-day-old Putian Black pigs, and the difference also existed in the skeletal muscle among the three 90-day-old pig breeds. Furthermore, the obvious changing difference of UCP3 mRNA expression was observed in the skeletal muscle of different groups. However, the difference of methylation status and expression level of UCP3 gene was not significant in the adipose tissue. Conclusion: Our data indicate that UCP3 mRNA expression level was associated with the methylation status of UCP3 promoter in the skeletal muscle of pigs.
Previously, we observed high level expression of goat β-casein/genomic hGH fusion gene in mammary gland of transgenic mice. To develop an expression vector to make a human granulocyte-colony stimulating factor (hG-CSF) protein efficiently produced in milk of transgenic animals, we designed a new bicistronic vector using the goat β-casein/genomic hGH fusion gene as regulation sequences for expression and internal ribosome entry site (IRES) as a mediator for second gene expression. This vector was constructed by insertion of encephalomyocarditis virus (EMCV) IRES-dependent second gene region coupled with hG-CSF cDNA into 3' untranslated region of an intact hGH gene. By microinjcetion, four transgenic mice were generated and three of them transmitted the bicistronic vector to their progeny. (omitted)
폴리히드론 프로모터, 수포성구내염 바이러스G, 폴리A, 사이토메가바이러스 프로모터, 강화녹색형광단백질, 단백질전달부위 유전자 등을 포함한 새로운 베큘로바이러스 시스템이 제조되었다. 본 재조합벡터 시스템은 인간 섬유아세포에 적용하여 시험하였고 재조합된 유전자의 전달과 유전자 발현을 대조 벡터시스템과 비교하였다. 본 연구로부터 새롭게 제작된 본 베큘로바이러스 시스템이 유전자의 전이와 유전자 발현 면에서 대조 벡터시스템 보다 고효율을 나타내었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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