• 제목/요약/키워드: Fish population

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Morphometric and genetic diversity of Rasbora several species from farmed and wild stocks

  • Bambang Retnoaji;Boby Muslimin;Arif Wibowo;Ike Trismawanti
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제26권9호
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    • pp.569-581
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    • 2023
  • The morphology and genetic identification of Rasbora lateristriata and Rasbora argyrotaenia between cultivated and wild populations has never been reported. This study compares morphology and cytochrome c oxidase (COI) genes between farmed and wild stock Rasbora spp. in Java and Sumatra island, Indonesia. We analyzed the truss network measurement (TNM) characters of 80 fish using discriminant function analysis statistical tests. DNA was extracted from muscle tissue of 24 fish specimens, which was then followed by polymerase chain reaction, sequencing, phylogenetic analysis, fixation index analysis, and statistical analysis of haplotype networks. Basic Local Alignment Search Tool analysis validated the following species: R. lateristriata and R. argyrotaenia from farming (Jogjakarta); Rasbora agryotaenia (Purworejo), R. lateristriata (Purworejo and Malang), Rasbora dusonensis (Palembang), and Rasbora einthovenii (Riau) from natural resources. Based on TNM characters, Rasbora spp. were divided into four groups, referring to four distinct characters in the middle of the body. The phylogenetic tree is divided into five clades. The genetic distance between R. argyrotaenia (Jogjakarta) and R. lateristriata (Malang) populations (0.66) was significantly different (p < 0.05). R. lateristriata (Purworejo) has the highest nucleotide diversity (0.43). R. argyrotaenia from Jogjakarta and Purworejo shared the same haplotype. The pattern of gene flow among them results from the two populations' close geographic proximity and environmental effects. R. argyrotaenia had low genetic diversity, therefore, increasing heterozygosity in cultivated populations is necessary to avoid inbreeding. Otherwise, R. lateristriata (Purworejo) had a greater gene variety that could be used to develop breeding. In conclusion, the middle body parts are a distinguishing morphometric character of Rasbora spp., and the COI gene is more heterozygous in the wild population than in farmed fish, therefore, enrichment of genetic variation is required for sustainable Rasbora fish farming.

Relationship of Socioeconomic Status and Food Intake to Cognitive Status of the Older Population

  • Kim, Hye-Kyung
    • Journal of Community Nutrition
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    • 제5권3호
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    • pp.173-177
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    • 2003
  • This study was done to investigate the relationship of socioeconomic status and food intake to cognitive status of the older population. The subjects of this study consisted of 214 older persons aged 60 - 84 years. Interviews were conducted using the health-related habits and food frequency questionnaires to provide basic information for nutrition education program. We evaluated the current food consumption-pattern and cognitive status of the subjects. The results of this study were as follows: Mean age of the subjects was 69.7${\pm}$7.4 years. The average cognitive function score of the subjects was 7.9${\pm}$2.0 (full score was 10.0). Male had a higher cognitive status score than female. There was significant difference between cognitive status score and age, education level, pocket money, physical activity and family type. The subjects who had a higher cognitive status score ate more fish and meats group and milk and milk products than the subjects that had a lower cognitive status score. These results have demonstrated that various socioeconomic variables and food intake pattern affect on cognitive status with aging and suggest that proper nutrition education and adequate nutrient intake in quality and quantity are essential in maintaining cognitive status in later life.

멸종위기어류 미호종개 $Cobitis$ $choii$ (Pisces: Cobitidae)의 분포양상 및 서식개체수 추정 (Distribution Status and Estimation of Population Size of the Endangered Species, $Cobitis$ $choii$ (Pisces: Cobitidae) in Guem River, Korea)

  • 고명훈;이일로;방인철
    • 한국어류학회지
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    • 제24권1호
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    • pp.56-61
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    • 2012
  • 멸종위기 어류 미호종개의 분포양상을 조사하고 대표서식지의 서식개체수를 추정하였다. 과거 (1984~2004)에는 20개 지점에서 출현하였으나 현재 (2006~2011)는 6개 지점에서만 서식이 확인되어 분포지역이 급격히 감소한 것으로 추정된다. 출현지역은 대부분 모래로 이루어진 하천 하류부였으며 서식구간은 매우 협소하였다. 대표서식지인 백곡천과 지천의 서식개체수를 표지-재포획법 등으로 추정한 결과 백곡천은 9,106개체, 지천은 34,717개체가 서식하는 것으로 추정되었다.

Genetic Distances of Rainbow Trout and Masu Salmon as Determined by PCR-Based Analysis

  • Yoon, Jong-Man
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제24권3호
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    • pp.241-248
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    • 2020
  • This study used a PCR-based genetic analysis platform to create a hierarchical polar dendrogram of Euclidean genetic distances for two salmonid species, Oncorhynchus mykiss (rainbow trout, RT) and Oncorhynchus masou (masu salmon, MS). The species were distantly related to other fish species based on PCR results from using the designed oligonucleotide primer series. Five oligonucleotide primers were used to generate 330 and 234 scorable fragments in the RT and MS populations, respectively. The DNA fragments ranged in size from approximately 50 bp to more than 2,000 bp. The bandsharing (BS) results showed that the RT population had a higher average BS value (0.852) than that for the MS population (0.704). The genetic distance between individuals supported the presence of adjacent affiliation in cluster I (RT 01-RT 11). The observation of a significant genetic distance between the two Oncorhynchus species verifies that this PCR-based technique can be a useful approach for individual- and population-based biological DNA investigations. The results of this type of investigation can be useful for species safekeeping and the maintenance of salmonid populations in the mountain streams of Korea.

Development and Characterization of 10 Polymorphic Microsatellite Loci in the Korean Endemic Freshwater Fish Iksookimia koreensis, and Their Cross-species Amplification in the Endemic I. longicorpa

  • Kwan, Ye-Seul;Kim, Hyo-Jin;Lee, Bit-Na;Won, Yong-Jin
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제33권2호
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    • pp.136-139
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    • 2017
  • The genus Iksookimia (Actinopterygii: Cypriniformes: Cobitidae) is a bottom-dwelling freshwater loaches, which are well-known as their endemism and high geographic variation. However, population genetic relationships among Iksookimia spp. have remained unclear due to a shortage of genetic markers that can be applied generally in the genus. Here, we developed high-resolving microsatellite markers using I. koreensis and I. longicorpa as representatives of Iksookimia species because of their wide distribution range and phylogenetic position. Ten of polymorphic microsatellite loci were isolated from Iksookimia koreensis and were successfully cross-amplified in I. longicorpa. The mean number of observed alleles per locus was about 10.4 (range, 2-17) for I. koreensis and about 13.2 (range, 2-24) for I. longicorpa. The loci, IK03 and IK08, deviated from the Hardy-Weinberg equilibrium in I. koreensis, after applying the Bonferroni correction. The microsatellite markers obtained in the present study will be useful to evaluate population genetic structure and to establish conservation strategies for I. koreensis and related Iksookimia species.

한국 남해와 동해 연안역 주요 먹이 어종의 풍도변화에 따른 삼치 개체군의 변동 (Population Variation of Spanish Mackerel (Scomberomorus niphonius) according to Its Major Prey Abundance in Southern and Eastern Coastal Waters of Korea)

  • 김진영;김영순;김희용
    • 한국환경과학회지
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    • 제30권10호
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    • pp.811-820
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    • 2021
  • The population variation of Spanish mackerel (Scomberomorus niphonius) according to its major prey abundance was analyzed using monthly catches of coastal set net fisheries in the southern waters off Gyeongsangnam-do and eastern waters off Gyeongsangbuk-do of Korea from 2006 to 2019. The abundance of Spanish mackerel and its prey species fluctuated almost simultaneously with time lags of +2 to -2 months between the set net fisheries in the southern and eastern waters. The generalized additive model revealed that the abundance of Spanish mackerel was influenced by its prey species such as hairtail and anchovy in southern waters, and common mackerel and horse mackerel in eastern waters. The model deviance explained 49% and 42% of Spanish mackerel abundance in southern and eastern waters respectively. These results suggest that the abundance of Spanish mackerel is affected by seasonal migratory prey fish species in the coastal areas and can be linked to their northerly migration.

Genetic diversity of spotted scat (Scatophagus argus) in Vietnam based on COI genes

  • Huy Van Nguyen;Minh Tu Nguyen;Nghia Duc Vo;Nguyen Thi Thao Phan;Quang Tan Hoang
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제25권12호
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    • pp.637-647
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    • 2022
  • A spotted scat, Scatophagus argus, has a high nutritional value and is among Asia's most widely consumed fish species. Thua Thien Hue's consumption market considers this species to be of high economic value and requires protection and conservation of the population. However, the studies on the identification and genetic diversity of S. argus distributed in Vietnam are still lacking. Therefore, mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene was utilized to distinguish different populations and investigate the genetic diversity of two populations of S. argus from Tam Giang lagoon, Thua Thien Hue province (n = 31) and Ca Mau province (n = 14). The sequencing results indicated 13 distinct haplotypes among 45 sequences. Five single nucleotide polymorphisms were observed to distinguish Hue spotted scat population. The S. argus population in Ca Mau province was higher haplotype diversity (Hd) and nucleotide diversity (π) than those of Thua Thien Hue province, which demonstrates that there are minor differences between haplotypes. There were genetic distances ranging from 0%-4% within the populations and 6.67% between the two populations. In addition to the sequencing, the comparison of morphology, biology, culture, and the growth rate was sufficient to distinguish the spotted scat S. argus in Thua Thien Hue from Ca Mau.

횡성호 일대에 분포하는 피라미(Zacco platypus) 개체군의 생태적 특성 분석 (Spatial Analysis of Ecological Characteristics of Zacco platypus Population in Lake Hoengseong Region)

  • 이황구;신현선;김성원;최준길
    • 한국환경생태학회지
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    • 제26권3호
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    • pp.374-381
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    • 2012
  • 본 연구는 횡성호 및 횡성호 상 하류지역을 대상으로 2010년 4월부터 2010년 11월까지 총 4회에 걸쳐 피라미(Zacco platypus) 개체군의 생태적 특성을 조사하였다. 피라미 개체군의 지역별 동태를 비교한 결과 상류지역에서 1,707개체(78.70%)로 가장 큰 개체군을 유지하고 있는 것으로 나타났다. 피라미 개체군의 전장-체중 상관도 분석 결과 횡성호 일대에 분포하는 피라미 개체군의 회귀계수 b값은 3.28로 비교적 안정적인 서식을 하고 있는 것으로 나타났으며, 지역별로는 상류지역 3.28, 횡성호 3.10, 하류지역 3.09로 상류지역에서 가장 양호한 생육상태를 나타내고 있었다. 비만도 지수는 slope가 0.003으로 안정적인 개체군을 형성하고 있는 것으로 나타났으며, 상류지역 0.003, 횡성호와 하류지역이 0.001로 상류지역에서 가장 양호한 영양상태를 유지하고 있었다. 피라미 개체군을 대상으로 전장크기를 비교한 전장빈도 분포 결과 상류지역은 30~50mm, 70~90mm 사이의 개체가 상대적으로 많이 나타났으며, 횡성호에서는 60~80mm의 개체, 횡성호 하류지역은 70~100mm의 개체가 비교적 풍부하게 분포하는 것으로 조사되었다. 결과적으로 횡성호 일대 피라미 개체군은 상류지역에서 가장 안정된 생육상태를 나타냈으며, 서식조건이 충족될 경우 유수역 및 정수역 모두를 선호하는 것으로 확인되었다.

금강수계(백제보)에서 발생된 어류폐사에 대한 종 조성 및 트로픽/내성도 길드 영향 분석 (Influence of Fish Compositions and Trophic/Tolerance Guilds on the Fishkills in Geum-River Watershed (Backje Weir))

  • 권혁현;한정호;윤조희;안광국
    • 환경생물
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    • 제31권4호
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    • pp.393-401
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    • 2013
  • 본 연구는 금강의 백제보에서 2012년 10월 중 하순 발생된 어류폐사 전 후의 어종 분포 및 길드분석을 통한 어류 군집특성 비교 및 생태건강도 평가모델(IBI)을 이용하여 생태건강도 특성을 평가하였다. 백제보 상 하류 구간에서 채집된 어류는 총 32종이었으며, 이들 중 한국고유종은 10종으로 35%를 차지하였다. 외래종은 3종이었고, 폐사 후($A_f$) 0.4%까지 감소하였다. 우점종은 폐사 전(Bf) 끄리(13%), 폐사 후($A_{f-I}$, $A_{f-II}$, $A_{f-III}$) 몰개(17%)로 나타났다. 폐사 후($A_{f-I}$) 생체량은 폐사 전($B_f$)과 비교해 1/10 수준으로 감소한 것으로 나타났다. 대형종인 붕어의 생체량은 어류폐사 이후 98%가 감소하였고 이후 시간이 경과하면서 폐사 전 수준으로 회복하였다. 중형종인 끄리는 지속적으로 감소하였고, 소형종인 밀어는 꾸준히 증가한 것으로 나타났다. 군집분석 결과에 따르면, 종 풍부도 지수, 종 균등도 지수, 종 다양도 지수는 폐사전($B_f$)에 가장 높게 나타났고, 이후 감소하였다. 어류의 내성도 길드분석에 따르면, 내성종(TS)은 67%로 가장 높은 출현빈도를 나타냈고, 반면 민감종(SS)은 2%로 나타나 가장 낮은 출현빈도를 보여, 생태계가 악화 된 것을 나타냈다. 백제보에서 생태건강도 평가에 따르면, IBI 모델 값은 17.5로 보통상태로 진단되었다. 종합적으로, 어류폐사는 어류 종 성분, 어류군집 구조 및 트로픽 길드/내성도 길드 지표 특성에 큰 영향을 미친 것으로 나타났으며, 점차 회복하는 것으로 나타났다. 따라서 백제보에서의 대규모 어류폐사를 예방하기 위해서는 지속적인 생태모니터링이 중요하다고 사료된다.

섬강 상류의 어류상 변화 및 어류군집 특성 (Change in the Fish Fauna and Fish Community Characteristics in the Upper Reaches of the Seomgang (River), Korea)

  • 김형수;한미숙;고명훈
    • 한국환경생태학회지
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    • 제38권3호
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    • pp.246-262
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    • 2024
  • 섬강 상류의 어류상 변화와 어류군집 특성을 밝히기 위해 2018년부터 2020년까지 조사를 실시하였다. 조사기간 동안 35개 지점을 조사한 결과, 채집된 어류는 12과 40종 7,817개체였다. 출현종 중 우점종은 참갈겨니(Zacco koreanus, 34.5%), 아우점종은 피라미(Z. platypus, 28.7%)였고, 그 다음으로 버들치(Rhynchocypris oxycephalus, 10.2%), 돌고기(Pungtungia herzi, 5.3%), 긴몰개(Squalidus gracilis majimae, 4.3%), 참종개(Iksookimia koreensis, 2.1%), 참마자(Hemibarbus longirostris, 1.6%), 모래무지(Pseudogobio esocinus, 1.5%) 돌마자(Microphysogobio yaluensis, 1.4%), 한강납줄개(Rhodeus pseudosericeus, 1.4%) 등의 순으로 우세하였다. 법정보호종은 환경부지정 멸종위기 야생생물 II급인 한강납줄개와 묵납자루(Acheilognathus signifer), 돌상어(Gobiobotia brevibarba), 둑중개(Cottus koreanus) 4종이 출현하였는데, 주로 한강납줄개와 묵납자루, 돌상어는 중·하류에, 둑중개는 최상류에 서식하고 있었다. 출현종 중 한국고유종은 19종(고유화율 47.5%)이었고, 기후변화민감종(냉수성 어종)은 둑중개 1종, 외래어종은 떡붕어(Carassius cuvieri)와 배스(Micropterus salmoides) 2종이 확인되었다. 군집분석 결과, 대체로 상류에서 하류로 갈수록 우점도는 낮아지고 다양도와 풍부도는 높아지는 경향을 보였으며, 군집구조는 크게 최상류, 상류, 중하류, 호수로 구분되었다. 섬강 상류는 횡성댐이 건설되면서 직·간접적으로 어류군집에 큰 영향을 미쳤는데, 댐 건설 직후 멸종위기종 묵납자루와 한강납줄개, 돌상어 서식지 및 개체수가 급격히 감소하고 수몰지역은 유수성 어류에서 정수성 어류로 변화되었다. 약 20년이 지난 현재, 서식지가 안정화 되면서 서식하는 어류가 증가하고 급격히 감소하였던 멸종위기종 한강납줄개와 돌상어의 서식지 및 개체수가 증가하였다. 또한 하천건강성(FAI)은 27개 지점은 매우 좋음(A), 7개 지점은 좋음(B), 1개 지점은 보통(C)으로 평가되어 비교적 우수하였다. 하지만 멸종위기종 묵납자루는 댐 공사 및 하천공사로 지역절멸에 처해 있고, 둑중개는 하천공사로 개체수가 심각하게 감소하였으며, 횡성호에서 생태계교란 생물 배스의 서식이 확인되어 우려되었다. 따라서 섬강 상류의 안정적인 어류 서식을 위해서는 무분별한 하천공사를 지양하고, 멸종위기종 묵납자루는 시급히 복원정책이 필요하며, 생태계교란 생물 배스의 확산을 방지할 수 있는 관리방안이 요구되었다.