• Title/Summary/Keyword: Extraction buffer

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사료작물 사일리지의 단백질 분획 및 Borate-phosphate Buffer 추출이 In vitro 발효성상, Gas 발생 그리고 분해율에 미치는 효과 (Protein Fractionation of Whole Crop Silages, and Effect of Borate-phosphate Buffer Extraction on In vitro Fermentation Characteristics, Gas Production and Degradation)

  • ;김광림;지병주;;오영균;홍성구;송만강
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제51권5호
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    • pp.369-378
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    • 2009
  • 본 시험은 여러 종류(호밀, RS; 볏짚, RSS; 소맥, WS; 트리티케일, TS; 귀리, OS; 청보리, BS)의 사일리지를 대상으로 단백질을 분획(fractionation)하고, in vitro 방법으로 buffer 추출 전과 추출 후의 사일리지를 배양하였을 때 반추위 미생물에 의한 발효성상, 가스발생량 및 분해율을 조사하고자 실시되었다. 사일리지의 가용성 물질은 boratephosphate 용액으로 추출하였으며, 반추위액과 인공 타액이 동일한 비율로 구성된 배양액을 혐기적인 조건에서 48시간동안 배양($39^{\circ}C$)하면서 발효 성상과 nylon bag을 이용한 사일리지의 in vitro 분해율을 조사하였다. 사일리지의 soluble protein (SP) 함량은 RSS에서 총 CP 함량 중 2.11%로 가장 낮았으며, RS와 BS 및 OS에서는 7% 이상의 높은 함량을 보였다. 또한 A fraction (NPN)은 RS에서 총 CP의 74.33%로 가장 높았으나 TS 및 RSS의 NPN 함량은 48% 정도로 비교적 낮았다. Buffer 불용성 단백질(IP) 중 B2 fraction은 RS, RSS 및 WS에서 총 CP의 7% 이상으로 비교적 높았던 반면 TS (1.45%)와 BS (2.13%)에서 매우 낮았다. 이와는 달리 $B_3$ fraction은 WS (4%)를 제외하고는 다른 사일리지에서 5.99~15.20%의 함량을 보였다. 체내 이용성이 매우 낮은 C fraction은 볏짚 사일리지(RSS)에서 27.07%로 다른 종류의 사일리지(1.40~9.93%)에 비하여 현저히 높은 수준이었다. 배양 12시간 까지는 추출 전에 비하여 추출 후의 사일리지 배양액에서 pH가 높았으나 (P<0.01~P<0.001) 48시간에는 오히려 추출 전의 사일리지 배양액의 pH가 낮았다(P<0.01). 배양액의 ammonia-N는 모든 사일리지에서 추출 전의 농도가 추출 후의 농도에 비하여 현저히(P<0.01~P<0.001) 높았으나 사일리지 종류에 의한 영향을 받지 않았다. 모든 사일리지에서 추출 후에 비하여 추출 전의 VFA 농도가 현저히 증가되었다(P<0.01~P<0.001). Acetate의 조성 비율은 buffer 추출 전에 비하여 배양 24시간까지 추출 후 모든 사일리지에서 높았던 (P<0.01~P<0.001) 반면 propionate와 butyrate 비율은 배양 24시간까지 추출 전에 더 높았다(P<0.001). 배양 12시간까지는 buffer 추출 전의 사일리지로부터 더 많은(P<0.01~P<0.001) 양의 gas가 발생되었지만 그 후로(24~48시간)는 오히려 buffer로 추출된 후의 사일리지에서 발생량이 더 많았다(P<0.01). 추출 후에 비하여 추출 전 사일리지의 DM과 CP 분해율이 현저히(P<0.001) 높았으나 NDF 분해율의 경우 오히려 추출 후의 사일리지에서 높았다(P<0.001). 그러나 각 사일리지에 대한 buffer 추출 전 후의 평균치에서는 사일리지 간에 차이가 없는 것으로 나타났다. 본 시험의 결과로 미루어 보아 사일리지로 인해 현저히 증가된 NPN 함량이 사일리지의 단백질 이용율을 크게 낮출 것으로 보이며, 단백질을 포함한 buffer 가용성 물질은 사일리지의 초기 발효를 크게 촉진할 수 있는 것으로 여겨진다.

수용성 식물 색소 추출 및 판별에 관한 간편한 방법 (Convenient Methods for the Extraction and Discrimination of Water-Soluble Plant Pigments)

  • 정상호;변영호
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제9권3호
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    • pp.353-360
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    • 2009
  • 식품이나 음료 첨가제로 사용하는 착색제는 소비자가 가공된 식품을 믿고 인정할 수 있는 중요한 요인의 하나로 꼽을 수 있다. 예전에 식품에 안전하다고 다량 사용되었던 인공 착색제나 염료들의 종류는 근래 독성학적 연구 결과 유해하다고 판정되어 그 수가 급격히 줄고 있다. 따라서 안토시아닌이나 베타시아닌과 같이 안전한 천연 색소는 항암성과 항산화성을 갖고 있기에 그 수요가 꾸준히 늘고 있다. 본 연구에서는 수용성 식물 색소인 안토시아닌과 베타시아닌을 에틸 아세테이트, 에틸 에테르 및 클로로포름과 같은 몇 가지 유기용매로 간단히 추출할 수 있었다. 또한, 추출한 이 두 가지 주된 식물 색소는 citrate buffer (pH 3.0)를 이용한 아가로즈 겔 전기영동법 하나만으로 간편하고 빠른 시간 내에 전개하여 서로를 구분할 수 있었다.

수수종자의 펩타이드 분석을 위한 SELDI-TOF MS 최적화 연구 (Optimization of SELDI-TOF MS for Peptide Profiling of Sorghum Seed)

  • 박세준;박준영;이용호;황수민;김아람;고지연;김태완
    • 한국작물학회지
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    • 제58권1호
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    • pp.50-56
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    • 2013
  • SELDI-TOF MS를 활용한 저분자 펩타이드 분석을 위해서는 분석시료에 대한 최적화 분석조건을 확립하는 것이 필수적으로 선행되어야 한다. 본 연구는 수수 종자 내 존재하는 10 kDa 이하의 저분자 펩타이드를 프로파일링하기 위하여 활용된 SELDI-TOF MS의 최적화 분석조건을 확립하는데 있다. 분석조건은 (1) 프로테인 칩: CM10(weak cation exchanger), Q10(strong anion exchanger), (2) 바인딩 버퍼의 희석배수: 1/2, 1/5, 1/10, 1/20, 1/50, 1/100, 1/200, (3) Q10의 바인딩 버퍼 강도: 10 mM, 100 mM, (4) 단백질 추출버퍼: sodium borate, sodium borate + acetone, phenol, TCA 버퍼로 하였다. 1. 바인딩 버퍼의 희석배수는 CM10과 Q10 모두 1/20과 1/50이 최적화로 나타났다. 2. Q10의 바인딩 버퍼 강도는 농도가 약한 10 mM에서 더 많은 피크가 검출되었다. 3. SELDI-TOF MS 분석에 적합한 수수 종자단백질 추출 버퍼로는 2~10 kDa 범위에서는 sodium borate 버퍼와 10~20 kDa 범위에서는 phenol 버퍼로 분석되었다.

방사선조사가 당뇨 백서의 발치와 치유에 미치는 영향 (Effect of irradiation on the healing of extraction sockets in diabetic rats)

  • 김일중;황의환;이상래
    • Imaging Science in Dentistry
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    • 제33권1호
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    • pp.5-14
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    • 2003
  • Purpose: To observe the histologic pattern of healing in molar tooth extraction sockets of streptozotocin-induced diabetic rats following irradiation. Materials and Methods: Mature Sprague-Dawley rats were divided into three groups: control, diabetic, and diabetic-irradiated groups. Diabetes mellitus was induced by injecting streptozotocin. Control rats were injected with a citrate buffer only. After 5 days, the right maxillary first molar was extracted under general anesthesia from each of the rats. After the extraction, rats in the diabetic-irradiated group were irradiated with a single absorbed dose of 10 Gy to the head and neck region. The rats were killed at 1, 3, 7, 14, 21, and 28 days after treatment. Tissue sections were stained with hematoxylin-eosin and Masson's trichrome. Results: In the diabetic and diabetic-irradiated groups, the early healing process of the socket extraction was similar to the control group, but bone formation was delayed at 7 days after the treatment. In the diabetic-irradiated group, alveolar bone surrounding the extraction socket showed signs of necrosis at 3 days after treatment, and hemorrhage was observed in connective tissue within the extraction socket at 14 days after treatment. Conclusion: This experiment revealed that the healing process of the extraction socket was severely delayed and retarded by irradiation in the diabetic state.

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Study on Solid Phase Extraction and Spectrophotometric Determination of Nickel in Waters and Biological Samples

  • Hu, Qiu-Fen;Yang, Guan-Gyu;Huang, Zhang-Jie;Yin, Jia-Yuan
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제25권4호
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    • pp.545-548
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    • 2004
  • A sensitive, selective and rapid method for the determination of nickel based on the rapid reaction of nickel(II) with QADMAA and the solid phase extraction of the Ni(II)-QADMAA chelate with $C_{18}$ membrane disks has been developed. In the presence of pH 6.0 buffer solution and sodium dodecyl sulfonate (SDS) medium, QADMAA reacts with nickel to form a violet complex of a molar ratio of 1 : 2 (nickel to QADMAA). This chelate was enriched by solid phase extraction with $C_{18}$ membrane disks. An enrichment factor of 50 was obtained by elution of the chelates form the disks with the minimal amount of isopentyl alcohol. The molar absorptivity of the chelate was $1.32{\times}10^5L\;mol^{-1}cm^{- 1}$ at 590 nm in the measured solution. Beer's law was obeyed in the range of 0.01-0.6 ${\mu}$g/mL. This method was applied to the determination of nickel in water and biological samples with good results.

Study on the Solid Phase Extraction of Hg(II)-SBDTR Chelate with C18 Disks and Its Application to the Determination of Mercury in Tobacco and Tobacco Additive

  • Yang, Guan-Gyu;Xia, Zhen-Yuang;Wu, Yu-Ping;Sun, Han-Dong;Yin, Jia-Yuan
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제25권4호
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    • pp.549-552
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    • 2004
  • A sensitive, selective and rapid method has been developed for the determination of mercury based on the rapid reaction of mercury(II) with p-sulfobenzylidenethiorhodanine (SBDTR) and the solid phase extraction of the colored chelate with $C_{18}$ disks. In the presence of pH 3.5 sodium acetate-acetic acid buffer solution and Emulsifier-OP medium, SBDTR reacts with mercury(II) to form a red chelate of a molar ratio 1 : 2 (mercury to SBDTR). This chelate was prconcentrated by solid phase extraction with $C_{18}$ disks. An enrichment factor of 50 was achieved. The molar absorptivity of the chelate is $1.28{\times}10^5 L{\cdot}mol^{-1}{\cdot}cm^{-1}$ at 545 nm in measured solution. Beer's law is obeyed in the range of 0.01-3 ${\mu}$g/mL. The relative standard deviation for eleven replicates sample of 0.01 ${\mu}$g/mL is 1.65%. This method was applied to the determination of mercury in tobacco and tobacco additive with good results.

Study on Solid Phase Extraction and Spectrophotometric Determination of Vanadium with 2-(2-Quinolylazo)-5-Diethylaminophenol

  • Hu, Qiu-Fen;Yang, Guan-Gyu;Huang, Zhang-Jie;Yin, Jia-Yuan
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제25권2호
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    • pp.263-266
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    • 2004
  • A sensitive, selective and rapid method has been developed for the determination ${\mu}$g/L level of vanadium ion based on the rapid reaction of vanadium(V) with 2-(2-quinolylazo)-5-diethylaminophenol (QADEAP) and the solid phase extraction of the colored chelate with $C_{18}$ cartridge. The QADEAP reacts with V(V) in the presence of citric acid-sodium hydroxide buffer solution (pH = 3.5) and cetyl trimethylammonium bromide (CTMAB) medium to form a violet chelate of a molar ratio 1 : 2 (V(V) to QADEAP). This chelate was enriched by solid phase extraction with $C_{18}$cartridge and the enrichment factor of 50 was obtained by elution of the chelates from the cartridge with ethanol. The molar absorptivity of the chelate is $1.28 {\times}10^5L\;mol^{-1}cm^{-1}$ at 590 nm in the measured solution. Beer's law is obeyed in the range of 0.01-0.6 ${\mu}$g/mL. The detection limit is 0.04 ${\mu}$g/L in the original samples. This method was applied to the determination of vanadium(V) in water and biological samples with good results.

Development of a Novel Long-Range 16S rRNA Universal Primer Set for Metagenomic Analysis of Gastrointestinal Microbiota in Newborn Infants

  • Ku, Hye-Jin;Lee, Ju-Hoon
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제24권6호
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    • pp.812-822
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    • 2014
  • Metagenomic analysis of the human intestinal microbiota has extended our understanding of the role of these bacteria in improving human intestinal health; however, a number of reports have shown that current total fecal DNA extraction methods and 16S rRNA universal primer sets could affect the species coverage and resolution of these analyses. Here, we improved the extraction method for total DNA from human fecal samples by optimization of the lysis buffer, boiling time (10 min), and bead-beating time (0 min). In addition, we developed a new long-range 16S rRNA universal PCR primer set targeting the V6 to V9 regions with a 580 bp DNA product length. This new 16S rRNA primer set was evaluated by comparison with two previously developed 16S rRNA universal primer sets and showed high species coverage and resolution. The optimized total fecal DNA extraction method and newly designed long-range 16S rRNA universal primer set will be useful for the highly accurate metagenomic analysis of adult and infant intestinal microbiota with minimization of any bias.

Utility of solid phase extraction for colorimetric determination of lead in waters, vegetables, biological and soil samples

  • Al-Mallah, Zakia;Amin, Alaa S.
    • Journal of Industrial and Engineering Chemistry
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    • 제67권
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    • pp.461-468
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    • 2018
  • A highly sensitive, selective and rapid method for the determination of lead based on the reaction of lead (II) with 5-(4'-chlorophenylazo)-6-hydroxypyrimidine-2,4-dione (CPAHPD) and the solid phase extraction of the Pb(II)-CPAHPD complex with Amberlite XAD-2000 was developed, in the presence of pH 5.6 buffer solution and Triton X-114 medium. CPAHPD reacts with lead to form a violet complex with a molar ratio of 2:1 (CPAHPD to lead). This complex was enriched by the solid phase extraction with Amberlite XAD-2000. An enrichment factor of 500 was obtained by elution of the complex from the resin with a minimal amount of isopentyl alcohol(0.2 mL). In isopentyl alcohol medium,the molar absorptivity of the complex is $1.13{\times}10^6L\;mol^{-1}cm^{-1}$ at 647 nm. Beer's law is obeyed in the range of $5.0-160ng\;mL^{-1}$ in the measured solution. The relative standard deviation for 10 replicate samples of $50ng\;mL^{-1}$ level is 1.26%. The detection and quantification limits reaches 1.5 and $4.7ng\;mL^{-1}$ in the original samples. The presented procedure was successfully applied for determination of lead content in real samples such as vegetables, waters, biological and soil samples with satisfactory results.

Capillary electrophoresis를 이용한 율무의 원산지 판별 (Identification of Cultivate Sites for Job's-tears (Coix lachrymajobi var. mayuen) using Capillary Electrophoresis)

  • 류미라;김은영;김상숙
    • 한국식품과학회지
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    • 제34권5호
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    • pp.787-791
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    • 2002
  • 수입자유화이후 유입량이 급증한 농산물중 하나인 율무의 원산지 판별을 위하여 CE의 적용가능성을 검토하였다. 분석을 위한 지표물질의 추출을 위해 30% ethanol을 사용하였으며, $50\;{\mu}m\;I.D.{\times}27\;cm$(20 cm inlet to detector)의 capillary를 이용하여 $45^{\circ}C$, 15 kV로 200 nm에서 detect 하였다. 분석 buffer는 0.1 M phosphate buffer(pH 2.5)에 30% methanol과 26 mM HSA를 첨가하였으며, pressure injection 20초, detector rise time 0.1초로 하였다. 분석시 초기에 증류수와 0.1 M phosphate buffer(pH 2.5)로 각 5분씩 capillary를 rinse하고 분석 buffer로 10분간 equilibration 시킨 후 30분간 분석하고 다시 1 M phosphoric acid로 14분간 rinse하여 다음 시료 분석시의 오차를 줄였다. 이 조건으로 2000년 및 2001년의 국산 및 수입산 율무 총 240점을 분석한 결과 서로를 구분하는 peak JT5의 도출이 가능하였으며 이 peak JT5에 의한 국산 및 수입산 율무의 판별율은 2000년 시료에서는 국산이 총 47점 중 39점(판별율 약 83%), 수입산은 총 48점 중 39점(판별율 약 81%), 2001년 시료는 국산 총 74점 중 60점(판별율 약 81%), 수입산은 총 71점 중 59점(판별율 약 83%)이었으며 전체적으로 약 82%의 판별율을 나타내었다.