• 제목/요약/키워드: Extended-spectrum ${\beta}$-lactamase

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광안리 오수처리장에 분리된 Extended-Spectrum $\beta$-Lactamase (ESBL) Klebsiella와 Enterobacter의 유형 (Characterization of Extended-Spectrum $\beta$-Lactamases (ESBL) Producing Klebsiella and Enterobacter Isolated from Sewerage Plant Drain Water at Kwang-An in Pusan)

  • 이훈구
    • 미생물학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.277-283
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    • 2001
  • 본 논문은 임상검체 이외의 자연계내에서 extended-spectrum $\beta$-lactamase (ESBL) 생성균주의 분리 여부를 확인하고, 분리되었을 경우 이들의 유형을 조사하기 위함이었다. 하수종말처리장, 가물치양식장, 부경대학교 담수어양식장, 공중목욕탕으로부터 분리된 균주를 double disk synergy 검사, 교환접합시험, 등전점 조사 등을 실시하여 하수종말처리장 방류수로붙 extended-spectrum $\beta$-lactamase (ESBL) 생성균주가 26 균주 분리되었다. 균종은 Entero-bacter cloacae와 E. sakazakii, Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae 및 K. pneumoniae subsp. ozaenae 였다. 이들은 모두 PCR결과 TEM+SHV 복합형이었고 등전점 결과 Klebsiella속의 균들은 pI 5.9, 5.9+5.4 E. cloacae는 $pI{\ge}8.5$, 8.0+5.4, E. sakazakii는 8.0+5.4, 8.0+5.9+5.4였다. 교차접합시험(transconjugation) 결과 피전달 균주인 E. coli RG176 nal$_{r}$에게 K. pneumoniae subsp. pneumoniae (1 균주) K. pneumoniae subsp. ozaenea (5 균주)및 E. cloacae (1 균주)의 $\beta$-lactamase 생성유전자가 전달되었다. 이 결과는 국내에서 임상검체 이외의 자연계에서 분리된 ESBL생성 장내세균의 첫 번째 보고이다.

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병원획득 Extended-spectrum ${\beta}$-Lactamase 생성 Escherichia coli 균혈증의 위험인자 (Risk Factors of Nosocomial Bacteremia of Extended-spectrum ${\beta}$-Lactamase Producing Escherichia coli)

  • 고대식;문송미;이지성;박윤수;조용균
    • Journal of Yeungnam Medical Science
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    • 제30권2호
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    • pp.83-89
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    • 2013
  • Background: The prevalence of extended-spectrum ${\beta}$-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli is increasing rapidly worldwide. Treatment options for ESBL-producing E. coli are limited, and infections caused by this organism are associated with improper antibiotic use, a long hospital stay, and increased mortality. Thus, the assessment and early recognition of the risk factors of nosocomial infections due to ESBL-producing E. coli are important for the infection control and proper treatment. Methods: A case-control study was performed that included nosocomial episodes of ESBL-producing E. coli bacteremia at a tertiary care hospital from January 2004 to December 2007. For each case patient, three controls were randomly selected and data on predisposing factors were collected. Results: Fifty-five cases of nosocomial ESBL-producing E. coli bacteremia were studied. Carbapenem usage (OR: 11.3, 95% CI: 1.1-115.9, p=0.041), quinolone usage (OR: 4.5, 95% CI: 1.1-18.8, p=0.042), biliary obstructive disease (OR: 11.8, 95% CI: 3.0-46.7, p<0.001) and the APACHE II score (OR: 1.3, 95% CI: 1.2- 1.5, p<0.001) were analyzed as independent risk factors of nosocomial ESBL-producing E. coli bacteremia. Conclusion: Our results showed that physicians caring for patients with risk factors of nosocomial bacteremia should consider ESBL-producing E. coli as the causative organisms of the disease.

Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Analysis for Extended Spectrum ${\beta}-Lactamase$ Producing Klebsiella pneumonia Isolated from Clinical Specimens in Korea

  • Kim Yun-Tae
    • 대한의생명과학회지
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    • 제12권3호
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    • pp.267-274
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    • 2006
  • Klebsiella pneumoniae is the leading cause of nasocomial infection and the most commonly isolated from clinical specimens. $Extended-spectrum-{\beta}-lactamase$ (ESBL) producing K. pneumoniae infection was associated with a significantly longer duration of hospital stay and greater hospital charges. The purpose of this study is to investigate the antibiotic resistant patterns and the DNA fingerprint types of extended-spectrum ${\beta}-lactamase$ (ESBL) producing K. pneumoniae. 223K. pneumoniae strains were collected from three general hospitals with more than 500 beds in Busan, Korea from September 2004 to October 2005. The minimum inhibitory concentration (MIC) of antibiotics was measured using the Gram negative susceptibility (GNS) cards of VITEK (Vitek system, Hazelwood Inc., MO). Random amplified polymorphic DNA method was used to detect DNA fingerprint of the organisms. Of the 226 K. pneumoniae isolates 65 ESBL-producing K. pneumoniae strains were detected by the Vitek system and confirmed by the double-disk synergy test. All the 65K. pneumoniae strains were resistant cefazolin, cefepime, ceftriaxone and aztreonam, and 83.0% of the organisms were resistant to ampicillin/sulbactam, 66.1% to tobramycin, 67.6% to piperacillin/tazobactam, 61.5% to ciprofloxacin, and 47.6% to trimethoprim/sulfamethoxazole and 43.0% to gentamicin. The RAPD patterns were distincted as 10 types by three random 10-mer primers (208, 272, 277). Among ten type patterns, three types (Ic, IIb, IIIe) were remarkably represented at patient of internal department, nerve surgery department, general surgery department, and neonatal room. These results indicate that RAPD can be useful for DNA of strains typing in the epidemiological investigations. Therefore more investigation are needed in order to prevent the ESBL type-producing K. pneumoniae from spreading resistance to oxyimino cephalosphorin antibiotics.

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주변 수계에서 미생물유래 extended-spectrum beta-lactamase 유전자의 분포 (Distribution of the extended-spectrum beta-lactamase genes derived from microorganisms in the waterfront environments)

  • 배영민
    • 한국응용과학기술학회지
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    • 제39권6호
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    • pp.916-923
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    • 2022
  • 창원시의 3개 지점(남천, 창원천, 청운지)에서 물 시료를 채취하고, 채취한 시료로부터 genomic DNA를 분리하였다. 분리된 DNA와 class A extended-spectrum beta-lactamase(ESBL) 유전자 5가지(blaOXA-1, blaSHV, blaTEM, blaCTX-M-1, blaCTX-M-9)를 target으로 하는 primers를 사용하여 quantitative PCR을 수행하였다. 시료를 채취한 지점별로 ESBL 유전자들의 수와 비율에서 확연한 차이가 있음을 알 수 있었다. 남천의 경우 DNA 30ng당 ESBL 유전자가 1.93×106 copy나 존재하는 데에 반해 창원천의 경우에는 1.47×105 copy 그리고 청운지에는 9.5×103 copy 밖에 존재하지 않았다. 흐르는 하천인 남천과 창원천에서는 각 ESBL 유전자들의 비율에서 큰 차이가 없었다. 즉, 남천에서는 blaOXA-1 유전자가 65.3%, blaCTX-M-1 유전자가 33.6%를 차지하여서 이 두 유전자가 전체 ESBL 유전자의 99% 가까이를 차지하고 있었다. 창원천에서도 blaOXA-1 유전자가 64.1%, blaCTX-M-1 유전자가 19.1%를 차지하므로 이 두 유전자가 전체의 83% 이상을 차지하고 있었다. 하천과 다르게 폐쇄된 환경인 청운지 연못에서는 내성세균들의 총량 자체가 다른 두 하천에 비해서 월등하게 적었다. 또한 내성 세균의 비율도 달라서 blaCTX-M-1 유전자가 전체의 87.5%, 그리고 blaCTX-M-9 유전자가 9.8%를 차지하고 있었다.

Multiplex PCR을 이용한 Extended-Spectrum β-Lactamase 생성 Escherichia coli와 Klebsiella pneumoniae의 Quinolone 내성 qnr유전자 검출 (Multiplex PCR for Detection of Quinolone Resistance qnr Genes in Extended-Spectrum β-Lactamase Producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae)

  • 양병선
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.161-166
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    • 2007
  • To develop a rapid and reliable single-tube-based PCR technique for detection simultaneously the quinolone resistance qnrA, qnrB and qnrS genes. After multiple alignment, primers were designed to detect known qnr variants. I was used for A total of 43 extented-spectrum ${\beta}$-lactamases (ESBLs) producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolated from university hospital were tested for screening, as with qnr genes. In optimized conditions, all positive controls confirmed the specificity of the PCR primers. Out of 43 isolates, qnrA genes were detected 19 (44.2%), qnrB genes 5 (11.7%), qnrS genes 15 (34.9%) and 8 (18.6%) isolates were not detected. I report here a fast and reliable technique for rapid screening of qnr positive strains to be used for epidemiological surveys.

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Investigation of Klebsiella pneumoniae Isolates Producing SHV-12 and SHV-11 ${\beta}$-Lactamases in Korean Hospitals

  • Lee, Kyeong-Min;Yoo, Jae-Il;Yoo, Yong-Sun;Yoo, Jung-Sik;Chung, Gyung-Tae;Ahn, Tae-In;Lee, Yeong-Seon
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제19권9호
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    • pp.1065-1069
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    • 2009
  • Of 143 clinical isolates of Klebsiella pneumoniae collected from Korean non-tertiary hospitals, 24 (16.8%) showed an extended-spectrum ${\beta}$-lactamase-positive phenotype. PCR and sequence analysis revealed the presence of TEM-116 (n=13), CTX-M-3 (n=5), CTX-M-14 (n=2), CTX-M-15 (n=3), and SHV-12 (n=16). Each of the 24 isolates encoded more than one ${\beta}$-lactamase, and seven isolates (29%) harbored two different SHV-type ${\beta}$-lactamase genes ($bla_{SHV-11}$ and $bla_{SHV-12}$) bounded by insertion sequence IS26 in a single transferable plasmid.

부산 민락동 오수처리장에서 분리된 장내세균 Klebsiella pneumoniae와 Escherichia coli가 생성한 광범위 베타 락탐(Extended-Spectrum $\beta$-Lactamase, ESBL) 분해효소의 유형 (The Types of Extended-Spectrum $\beta$-Lactamase (ESBL) Produced by Enteric Bacteria, Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli Isolated from Sewage of Wastewater Treatment Plant at Minragdong in Busan, Korea)

  • 이훈구
    • 미생물학회지
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    • 제45권2호
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    • pp.163-169
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    • 2009
  • 본 논문은 부산소재 하수처리장 중계시설인 민락오수처리장의 하수에서 광범위 베타 락탐 분해효소(extendedspectrum $\beta$-lactamase, ESBL) 생성균주를 분리 동정하고 이들이 생성한 ESBL 유형을 조사하였다. 민락오수처리장은 부산 남구 수영구의 민락동 일대에 밀집한 횟집의 하수를 모아서 남구 용호동에 있는 하수종말처리장으로 중계시키는 시설이다. 2009 년 1 월 하수 검체로부터 항균제 이중 디스크 확산 시험(double disk synergy test)에 양성반응을 나타낸 19 균주를 1차 시험균주로 선택하였다. 인돌생성 시험 methyl-red, Voges-Proskauer, Simmon's citrate, decarboxylase-dihydrolase 및 당 발효능 생화학 시험을 통하여 Klebsiella pneumoniae (3 균주)와 Escherichia coli (16 균주)가 동정되었다. 이 균들을 공여균주로, Escherichia coli J53 (sodium $azide^r$)를 피전달균주로 하여 접합시험을 실시하여 plasmid로 매개된 4 균주 접합체를 얻었다. 이들로부터 plasmid를 추출하여 PCR로 유전자 증폭을 시켜 유전자를 분석하고 등전점을 조사한 결과 Klebsiella pneumoniae에서 생성된 ESBL 유형은 모두 SHV-12 (3 균주)였고, Escherichia coli에서 생성된 ESBL 유형은 SHV-12/TEM-1 (1 균주)였다.

국내 한 육아 기관을 다니는 소아에서 확인된 Extended-Spectrum β-Lactamase 생성 Shigella flexneri 감염 (Infection of Extended-Spectrum β-Lactamase Producing Shigella flexneri in Children Attending a Childcare Center in Korea)

  • 남은우;이건송;김준영;유천권
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제23권3호
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    • pp.223-228
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    • 2016
  • 국내 Shigella 감염은 대부분 Shigella sonnei 에 의해 발생하나 드물게 Shigella flexneri 에 의한 집단 감염이 보고되고 있다. 항생제 사용률이 높은 국내에서 extended-spectrum ${\beta}-lactamase$ (ESBL) 생성 S. sonnei 감염에 대한 보고는 있었으나 ESBL을 생성하는 S. flexneri 에 대한 예는 지금까지 없었다. 저자들은 국내 한 어린이집에 다니는 소아 2명에게서 CTX-M-14 유형 ESBL 생성 S. flexneri type 2a 감염 증례를 경험하였으며 이는 국내에서 ESBL을 생성하는 S. flexneri 감염의 첫 증례이다. 앞으로 국내에서도 Shigella 감염 시 ESBL 균주의 가능성을 고려하고 적극적인 역학조사와 경험적 항생제 투여에 대한 신중한 선택이 필요할 수 있을 것으로 생각된다.

하수처리수에서 분리된 장내세균의 광범위 베타락탐분해효소의 유형 (Types of Extended-Spectrum β-Lactamase Produced in Enteric Bacteria Isolated from Sewage Plant Drain Water)

  • 김군도;이훈구
    • 생명과학회지
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    • 제20권5호
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    • pp.676-682
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    • 2010
  • 본 연구는 임상검체만이 아닌 주변 생활환경에도 광범위 베타 락탐분해효소를 생성하는 균주(extended-spectrum $\beta$-lactamase, ESBL)가 존재하는지를 확인하고 만약 존재할 경우 그 균주를 분리하고 ESBL유형을 알아보기 위하여 실시되었다. 부산 광안리 하수처리 방류수에서 이중 디스크 확산 검사 결과 양성반응을 나타낸 29균주를 선별하였다. 이중 sodium azide에 내성을 가진 피전달 균주인 Escherichia coli J5에 교차접합이 이루어진 15균주를 대상으로 indole, methyl-red, Voges-Proskauer, Simmon's citrate 시험과 decarboxylase-dihydrolase 및 여러 종류의 당 발효 시험 등 생화학 검사를 실시한 결과 Klebsiella pneumoniae(13균주)와 Escherichia coli(2균주)가 동정되었다. 등전점, PCR, 유전자서열 분석을 실시하여 ESBL 유형을 결정하였다. Klebsiella pneumoniae의 ESBL 생성유형은 SHV-12(4균주)와 SHV-12/TEM-1(9균주)의 2종류로 구분되었고, Escherichia coli의 ESBL 생성유형은 TEM-1(2균주)로 판명되었다.

Patterns of Antimicrobial Resistance and Genotyping of Extended Spectrum $\beta$-Lactamase (ESBL) Producing Clinical Isolates in Korea

  • ;김종배
    • 대한의생명과학회지
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    • 제13권4호
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    • pp.293-304
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    • 2007
  • The emergence of extended spectrum $\beta$-lactamase (ESBL) producing bacteria is worldwide concern. Until recently, the most frequently identified strains in the Republic of Korea were E. coli and Klebsiella spp. The incidence of resistance to extended spectrum $\beta$-lactam antibiotics is increasing in Wonju city, Korea. Total 57 strains of ESBL producing E. coli and Klebsiella species were isolated from Wonju Christian Hospital during a 9 month-period from April to December, 2003. To determine the prevalence and genotypes of the ESBL producing clinical isolates, antibiotic susceptibility and ESBL activity test by VITEK system and double disk synergy (DDS) test, and PCR based genotyping were performed. Fourteen (82%) isolates of 17 ESBL producing E. coli were found to have $bla_{TEM}$ gene and 5 (29%) isolates were found to have $bla_{CTX-M}$ gene by polymerase chain reaction (PCR). Thirty (75%) isolates of 40 ESBL producing Klebsiella species with $bla_{TEM}$ gene, 38 (95%) isolates with $bla_{SHV}$ gene, and 7 (20%) isolates with $bla_{CTX-M}$ type gene were also identified. Enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC) PCR and similarity index by dendrogram for genetical similarity to band pattern of each clinical isolates were examined. ESBL producing E. coli were grouped into 6 clusters up to 84% of similarity index and Klebsiella species were grouped into 12 clusters up to 76% of similarity index. In conclusion, ESBL producing clinical isolates were characterized with the results from antimicrobial resistance pattern and genetical similarity using ERiC PCR.

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