The most stable adsorption structures and their corresponding energies of 4-pyridone, 4-hydroxypyridine, 2-pyridone and 2-hydroxypyridine have been investigated by Density Functional Theory (DFT) calculation and high-resolution photoemission spectroscopy (HRPES). We confirmed that between the two reaction centers of 4- and 2-pyridone, only O atom of carbonyl functional group can act as a Lewis base while both the two reaction centers of 4- and 2-hydroxypyridine (tautomers of 4- and 2-pyridone) can successfully function as a Lewis base. On the other hand, owing to their molecular structures, there is a remarkable difference between the adsorption structures of 4- and 2-hydroxypyridine. Through the analysis of the N 1s and O 1s core level spectra obtained using HRPES, we also could corroborate that two different adducts coexist on the surface at room temperature due to their activation energy investigating the coverage dependent variation of bonding configurations when these molecules are adsorbed on the Ge(100) surface.
The electronic state of ZnO doped with Y was calculated using the density functional theory. In this study, the program used for the calculation on theoretical structures of ZnO and doped ZnO was Vienna Ab-initio Simulation Package (VASP), which is a sort of pseudo potential method. The detail of electronic structure was obtained by the descrite variational $X\alpha$ (DV-$X\alpha$) method, which is a sort of molecular orbital full potential method. The optimized crystal structures obtained by calculations were compared to the measured structure. The density of state and energy levels of dopant elements was shown and discussed in association with optical properties.
본 연구는 그래핀과 유사한 IV족 나노 시트로서 말단을 수소로 처리한 게르마닌(Germanene) 이차원(2D) 시트에 여러 유해 가스(COx, NOx, SOx)를 흡착시켰을 때 구조적 변화와 흡착에너지를 이론적으로 계산하였다. 이론 방법은 밀도 범함수 이론(density functional theory, DFT) 가운데 B3LYP와 CAM-B3lYP을 사용하였으며, 바탕집합(basis set)으로는 cc-pvDZ를 사용하였다. 분자 구조를 각 이론 수준에서 최적화한 후 진동 주파수를 계산하여 열역학적으로 가장 안정한 분자 구조를 확인하였다. 게르마닌 시트에 기체의 흡착은 CO, CO2, NO, SO2 가스의 경우 물리 흡착을 나타내었으며, NO2, SO, SO2 등은 화학 흡착을 나타내었다.
To understand the electronic structure of $[NiS_4]^-$ complex ions, two complexes with such $[NiS_4]^-$ core, $FcCH=CHPymCH_3[Ni(dmit)_2]$ (Pym = pyridinium, $dmit^{2-}$ = 2-thioxo-1,3-dithiole-4,5-dithiolate) and $FcCH=CHPymCH_3[Ni(dddt)_2]{\cdot}{\frac{1}{2}}H_2O$ ($dddt^{2-}=5,6-dihydro-1,4-dithiin-2,3-dithiolato$), were synthesized to be characterized by X-ray crystallography, single crystal electron paramagnetic resonance (EPR) and density functional theory (DFT) calculation. Powder EPR spectra show narrow g-anisotropy but the anisotropy is bigger in $[Ni(dmit)_2]^-$ than in $[Ni(dddt)_2]^-$, indicating bigger spin density in Ni(III) d-orbital of $[Ni(dmit)_2]^-$ than in $[Ni(dddt)_2]^-$, which is consistent to DFT results. EPR studies of the crystals of the complexes surprisingly suggest that the $g_y$-axis of $[Ni(dddt)_2]^-$ is approximately on or perpendicular to the $[NiS_4]^-$ plane while the $g_y$-axis of $[Ni(dmit)_2]^-$ is on the plane, though DFT study of the complexes of this study and previously reported $[NiS_4]^-$ complexes indicate that the $g_y$-axis is on the $[NiS_4]^-$ plane.
The structural, electronic, and optical properties of poly(3-hexylthiophene) (P3HT) have been comprehensively studied by density functional theory (DFT) to rationalize the experimentally observed properties. Rather, we employed periodic boundary conditions (PBC) method to simulate the polymer block, and calculated effective charge mass from the band structure calculation for describing charge transport properties. The simulated results of P3HT are consistent with the experimental results in band gaps, absorption spectra, and effective charge mass. Based on the same calculated methods as P3HT, a series of polymers have been designed on the basis of the two types of building blocks, furofurans and furofurans substituted with cyano (CN) groups, to investigate suitable polymers toward polymer solar cell (PSC) materials. The calculated results reveal that the polymers substituted with CN groups have good structural stability, low-lying FMO energy levels, wide absorption spectra, and smaller effective masses, which are due to their good rigidity and conjugation in comparison with P3HT. Besides, the insertion of CN groups improves the performance of PSC. Synthetically, the designed polymers PFF1 and PFF2 are the champion candidates toward PSC relative to P3HT.
The adsorption structures of threonine on the Ge(100) surface were investigated using core-level photoemission spectroscopy (CLPES) in conjunction with density functional theory (DFT) calculations. CLPES measurements were performed to identify the experimentally preferred adsorption structure. The preferred structure indicated the relative reactivities of the carboxyl and hydroxymethyl groups as electron donors to the Ge(100) surface during adsorption. The core-level C 1s, N 1s, and O 1s CLPES spectra indicated that the carboxyl oxygen competed more strongly with the hydroxymethyl oxygen during the adsorption reaction. Three among six possible adsorption structures were identified as energetically favorable using DFT calculation methods that considered the inter- and intra-bonding configurations upon adsorption onto the Ge(100) surface. These structures were O-H dissociated N dative inter bonding, O-H dissociated N dative intra bonding, O-H dissociation bonding. One of the adsorption structures: O-H dissociated N dative inter bonding was predicted to be stable in light of the transition state energies. We thus confirmed that the most favorable adsorption structure is the O-H dissociated N dative-inter bonding structure using CLPES and DFT calculation.
The hydrogen abstraction reaction of $CF_3CH_2CHO$ + OH has been studied theoretically by dual-level direct dynamics method. Two stable conformers, trans- and cis-$CF_3CH_2CHO$, have been located, and there are four distinct OH hydrogen-abstraction channels from t-$CF_3CH_2CHO$ and two channels from c-$CF_3CH_2CHO$. The required potential energy surface information for the kinetic calculation was obtained at the MCG3-MPWB//M06-2X/aug-cc-pVDZ level. The rate constants, which were calculated using improved canonical transitionstate theory with small-curvature tunneling correction (ICVT/SCT) were fitted by a four-parameter Arrhenius equation. It is shown that the reaction proceeds predominantly via the H-abstraction from the -CHO group over the temperature range 200-2000 K. The calculated rate constants were in good agreement with the experimental data between 263 and 358 K.
고전압에서도 사용 가능한 바인더 개발에 대한 요구가 증대됨에 따라 이에 적합한 내산화성이 우수한 바인더를 양자화학적 모델링에 기반하여 제안하고자 하였다. 각 고분자 poly(acryl amide)(PAM), poly(methyl acrylate)(PMA), poly(vinylidene fluoride)(PVDF), poly(hexafluropropylene)(PHFP)에 대하여 반경험적 방법(Semi-empirical method) 및 밀도범함수 이론(Density Functional Theory, DFT) 방법을 이용하여 단량체부터 사량체까지의 고분자 바인더에 대한 최고 점유 분자 궤도함수(Highest occupied molecular orbital, HOMO) 에너지와 이온화 에너지(Ionization Potential, IP) 값을 구하여 실험 값과 비교하였다. 밀도범함수 방법으로 해석한 결과, PHFP, PVDF, PMA, PAM 순으로 고분자의 내산화성이 좋은 것으로 시뮬레이션을 통해 예측되었고, 이러한 결과는 선형 훑음 전압-전류법(Linear Sweep Voltametry, LSV)으로부터 얻은 실험값과 일치하였다. 또한 이 결과는 HOMO 오비탈의 구조를 분석하여 내산화성이 좋은 원인을 규명하였다.
$Cu^{+}$ 및 $Cu^{2+}$와 proline의 결합형태에 따른 구조 및 금속 친화도를 DFT(Density Functional Theory) 방법으로 조사하였다. 금속-proline의 결합과 여러 결합형태에 따른 에너지 순서는 $Cu^{+}$-Proline및 $Cu^{2+}$-proline 착화합물에서 서로 매우 상이함을 알았다. $Cu^{+}$-Proline의 경우, 바닥상태의 구조는 $Cu^{+}$가 중성 proline의 카르보닐 산소 및 이미노기 질소에 배위된 두 자리 배위를 하며, 이에 비해 $Cu^{2+}$-Proline 의 바닥상태의 구조는 zwitter이온 형태 proline의 카르복시기의 두 산소 사이에 chelation을 형성하는 구조임을 확인하였다. 가장 안정한 $Cu^{+}$-Proline 착화합물에서 proline의 금속 이온 친화도는 6-311++G(d,p) 수준에서 76.0 kcal/mol로 계산되었으며, proline의 $Cu^{2+}$ 이온 친화도는 258.5 kcal/mol로 나타났다.
본 연구는 정방정계-$HfO_2$/Si 초격자의 계면 층 구조를 범밀도함수론 (density functional theory)을 이용하여 계산하였다. 입방정계-$HfO_2$는 Si 기판과 에피택시 접합을 위하여 a와 b축의 길이가 증가되면 c축의 길이가 2% 감소하여 정방정계 구조가 되었다. 정방정계-$HfO_2$와 Si 기판의 말단층에 따라서 8 개의 계면 층 모델이 생성되었다. 정방정계-$HfO_2$ (004)$_{1/4}$/Si $(004)_{3/4}$ 초격자구조가 에너지 관점에서 가장 안정하였고, 정방정계-$HfO_2$$(004)_{1/4}$/Si (002) 초격자구조는 가장 불안정하였다. 에너지 관점에서 가장 불안정한 구조의 경우, 정방정계-$HfO_2$의 계면에 존재하는 2 개의 산소 원자가 Si 기판으로 이동하여 정방정계-$HfO_2$ 초격자구조에 2 개의 산소 공공이 생성되었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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