• 제목/요약/키워드: DNA hybridization

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분열형 효모 Schizosaccharomyces pombe에서 자외선 유도유전자 UVI-180의 특성 연구 (Characterization of UV-Inducible Gene (UVI-180) in Schizosaccharomyces pombe)

  • Park, In-Soon
    • Environmental Analysis Health and Toxicology
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    • 제18권3호
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    • pp.225-230
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    • 2003
  • 본 연구는 DNA 상해유도기작을 규명하기 위하여 하등 진핵생물인 분열형 효모 Schizosaccharomyces Pombe로부터 subtraction hybridization방법을 이용하여 자외선 유도 유전자인 UVI-180을 분리하고 그 유전자 구조와 발현양상을 조사하였다. UVI-180유전자의 발현양상을 Northern hybridization 방법으로 살펴본 결과 자외선(ultraviolet-light)조사 1시간 후에 최대의 발현 증가를 나타내었다. 반면 알킬화제인 MMS(methyl methanesulfonate)처리에 의해서는 전혀 발현이 증가되지 않았다. 이 결과 UVI-180유전자는 DNA상해에 따라 각기 다른 발현양상을 나타냄을 알 수 있었다. 유전자의 기능을 알기 위하여 null-mutant세포 주를 제조하여 그 특성을 살펴본 결과 이 유전자는 세포의 성장에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.

진핵세포에서 DNA 상해에 반응하는 유전자 (UV150과 UV200) 기능연구 분리 및 특성 연구 (Isolation and Characterization of UV-Inducible Gene UV150 and UV200 in Eukaryotic Cells)

  • 최인순
    • Environmental Analysis Health and Toxicology
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    • 제21권1호
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    • pp.21-26
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    • 2006
  • 본 연구는 DNA 상해유도기작을 규명하기 위하여 하등 진핵생물인 분열형 효모 Schizosaccharomyces pombe로부터 subtraction hybridization방법을 이용하여 자외선 유도 유전자인 UV150과 UV200을 분리하고 그 유전자 구조와 발현양상을 조사하였다. 분리한 유전자의 발현양상을 Northern hybridization 방법으로 살펴본 결과 자외선 조사 1시간 후부터 발현이 증가되었다. 또한 알킬화제인 Methyl Methanesulfonate (MMS) 처리에 의해서도 발현이 증가되었다. 이 결과 다른 UV-inducible유전자와는 다르게 분리한 UV150유전자는 UV에 UV200유전자는 MMS에 의하여 발현이 증가됨을 알 수 있었다. 유전자의 기능을 알기 위하여 URA4 유전자를 이용하여 null-mutant 세포주를 제조하여 그 특성을 살펴본 결과 분리한 UV150 유전자는 세포의 성장에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.

효모 Schizosaccharomyces pombe에서 자외선 유도유전자 UVI-155의 분리 및 특성 연구 (Characterization of UV-Inducible Gene(UVI-155) in Schizosaccharomyces pombe)

  • 진지영;최인순
    • 생명과학회지
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    • 제16권1호
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    • pp.126-130
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    • 2006
  • 본 연구는 DNA상해유도기작을 규명하기 위하여 하등 진핵생물인 분열형 효모 Schizosaccharomyces pombe로부터 subtraction hybridization방법을 이용하여 자외선 유도 유전자인 UVI-155을 분리하고 그 유전자 구조와 발현양상을 조사하였다. UVI-155 유전자의 발현양상을 Northern hybridization 방법으로 살펴본 결과 자외선(ultraviolet-light) 조사 1시간 후에 최대의 발현 증가를 나타내었다. 반면 알킬화제 인 MMS (methyl methanesulfonate) 처리에 의해서도 발현이 증가되었다. 이 결과 다른 UV-inducible 유전자와는 다르게 UVI-l55 유전자는 UV와 MMS 등의 DNA 상해에 모두 발현이 증가됨을 알 수 있었다. 또 한 유전자의 기능을 알기 위하여 null-mutant세포 주를 제조하여 그 특성을 살펴본 결과 이 유전자는 세포의 성장에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.

균류 Coprinus cinereus에서 DNA 회복에 관여하는 RAD3 유사유전자의 분리와 특성 (Characterization of RAD3 Homologous Gene from Coprinus cinereus)

  • 최인순
    • 생명과학회지
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    • 제14권6호
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    • pp.1023-1027
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    • 2004
  • 본 연구는 출아형 효모 Saccharomyces cerevisiae에서 자외선의 상해 시 이를 정상으로 회복시키는 절제회복(excision repair) 유전자로 알려진 RADS의 특성 규명을 위하여 균류 Coprinus cinereus에서 이와 유사한 유전자를 분리하였다. RADS 유사 유전자를 분리하기 위하여 균류 C. cinereus의 염색체 DNA를 전기영동하여 분리한 다음 효모 RADS DNA를 probe로 하여 이와 hybridization하였다. 이 결과 RADS유사 유전자는 3.4kb의 insert DNA를 갖고 있었다. 또한 Southern hybridization으로 이 유사 유전자는 fungus C. cinereus의 염색체에 존재함을 확인하였다. 분리한 RADS 유사 유전자의 전사체 크기는 2.8kb 였으며, 자외선의 상해시 전혀 자외선에 대한 유도성이 없음을 Northern hybridization으로 확인하였다. 또한 유사유전자 부분을 삭제하였을 때 이 부분이 없는 세포는 전혀 생존을 못하였다. 이 결과 분리한 RADS 유사유전자는 세포의 생존에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.

부분적 기능화된 다이아몬드를 이용한 single mismatched DNA 검출 특성 (Characterization of partially functionalized diamond for detecting single mismatched DNA)

  • 양정훈;송광섭
    • 한국기계가공학회지
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    • 제12권4호
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    • pp.29-33
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    • 2013
  • Here we report a partially aminated micropattern via direct functionalization and examine eleven different solution-phase probe DNAs hybridizing with the same target DNA on both hydrogen and oxygen terminated diamond. The hybridization intensities determined by epifluorescence microscopy were compared and are influenced strongly by the negatively charged surface and mismatched position of its sequence with immobilized probe DNA.

FISH기법 적용을 위한 Y 염색체 특이 DNA Probe의 개발

  • 조은정;류란숙;류은경;손시환
    • 한국동물번식학회:학술대회논문집
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    • 한국동물번식학회 2003년도 학술발표대회 발표논문초록집
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    • pp.24-24
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    • 2003
  • Fluorescence in situ Hybridization(FISH)는 특정 염기서열을 이용하여 염색체나 염색체상의 DNA위치를 확인하는 기술로서, 면역세포화학 기술과 결합되어져 현미경으로 이들의 유전적 활성도를 직접 확인할 수 있는 방법으로 지금까지의 radioisotopes 대신 non-radioactive labeling 방법으로서 fluorescence을 이용한 분자세포유전학적 검정 방법이다. 따라서 특정 염색체의 FISH probe의 개발은 FISH 기법을 이용하여 조직 또는 세포내 특정 염색체나 DNA의 존재나 이상 유무를 신속하고 정확하게 파악할 수 있다. 본 연구는 소와 사람을 대상으로 Y-염색체 특이 DNA probe를 개발하고 이를 이용하여 FISH를 시행함으로서 본 probe의 신뢰성을 확인하고 임상적 적용 가능성을 제시 하고자 하였다.

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Construction of cDNA Library from Posterior Silk Gland (PSG) of Korean Oak Silkmoth, Antheraea yamamai and Molecular Cloning of Fibroin Heavy Chain Gene(FHC)

  • Lee, Jin-Sung;Kim, Soon-Jung;Kim, Ki-Hwan;Park, Young-Min;Suh, Dong-Sang
    • Journal of Life Science
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    • 제10권1호
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    • pp.10-13
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    • 2000
  • To develope the genetic source of oak wild silkworm, Antheraea yamamai, the cDNA library was constructed with poly A+ mRNA isolated from posterial silk gland of fifth instar larvae. Titer of the cDNA library was about 5.1$\times$105 pfu in total. We presumed that the titer covered almost all transcripts existed in Antherea yamamai. From cDNA library of Antheraea yamamai, fibroin heavy chain gene, which is specifically expressed from posterial silk gland of Antheraea yamamai, was screened using oligonuclotide probe specific to alanine rich motif of fibrin heavy chain gene of Antheraea pernyi. As a result, fibroin clones isolated from 5$\times$104 plaques showed the highest homolgy (95%) with that of Antherea pernyi in nucleotide of Anthereaea yamamai and Bombyx mori shows that there is no homologous sequence in the 3+ partial 채야후 region Genomic southern hybridization suggested that one copy is present. Northern hybridization showed that fibroin transcript was approximateely 9 kb in length.

Isolation and Characterization of UV-inducible gene in Eukaryotic cells

  • Choi, In-Soon
    • Journal of Life Science
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    • 제11권1호
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    • pp.52-56
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    • 2001
  • The present study intends to characterize the DNA damage-inducible responses in eukaryotic cells. The fission yeast, S. pombe, which displays efficient DNA repair systems, was used in this study as a model system for higher eukaryotes. To study UV-inducible responses in S. pombe, five UV-inducible cDNA clones were isolated from S. pombe by using subtration hybridization method. To investigate the expression of isolated genes, the cellular levels of the transcripts of these genes were determined by Northern blot analysis after UV-irradiation. The transcripts of isolated gene (UV130) increased rapidly and reached maximum accumulation after UV-irradiation. Compared to the message levels of control, the levels of maximal increase were approximately 5 fold to UV-irradiation. In order to investigation whether the increase of UV130 transcripts was a specific results of UV-irradiation, UV130 transcript levels were examined after treating the cells to Methylmethane sulfonate (MMS). The transcripts of UV130 were not induced by treatment of 0.25% MMS. These results implied that the effects of damaging agents are complex and different regulatory pathways exist for the induction of these genes. To characterize the structure of UV130 gene, nucleotide sequences were analyzed. The nucleotide sequence of 1,340 nucleotide excluding poly(A) tail contains one open reading frame, which encodes a protein of 270 amino acids. The predicted amino acid sequences of UV130 do not exhibit any significant similarity to ther known sequences in the database.

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Molecular Level Relationships of Purple Nonsulfur Bacteria and their Relatives

  • 이상섭;윤병수;김재수;이현순
    • 미생물학회지
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    • 제32권1호
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    • pp.1-6
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    • 1994
  • 광합성 세균과 비광합성 세균에 속하는 종들 사이의 유연관계를 파악하기 위해 DNA 혼성화 방법을 실시하였다. 혼성화도는 종내 균주들 사이와 Rhodobacter capsulatus와 Rhodopseudomonas blastica 사이를(72-88%) 제외하고는 전체적으로 낮게 나타났다(2-35%). 광합성 세균 Rhodopseudommonas Palustris와 비광합성 세균 Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Bradyrhizobium japonicu, 사이의 D%는 광합성 세균 사이의 D%보다 약간 높게 나타났다(26-33%). Rhodopseudomonas blastica와 Rhodobacter capsulatus 사이의 D%는 72%로 유전적 유연관계가 매우 높은 것으로 나타났다.

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벼 (Oryza sativa L.)배양세포의 고중력유도성 cDNA의 탐색 (Screening of Gravity Inducible cDNAs in Rice(Oryza sativa L.) Cultured Cell)

  • 권순태;김길웅
    • 식물조직배양학회지
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    • 제21권2호
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    • pp.111-115
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    • 1994
  • 벼(Oryza sativa L. cv Nipponbaie)배양세포에 중력 450,000 x g를 처리하여 cDNA library를 만들고, 무처리 및 고중력을 처리한 cDNA 프로브로 스크리닝을 실시하여 고중력에 특이적으로 양성반응을 나타내는 GSC 13 및 GSC124 cDNA를 선발하였다. 선발된 두 유전자 GSC 13 및 GSC 124의 길이는 각각 1.34 및 0.67 kilobase pairs였으며, 배양세포내에서 관련된 transcript의 크기는 각각 2.0 및 1.9 kilobase pairs인 것으로 나타났다. 두 유전자를 프로브로한 Northern hybridization을 실시한 결과 GSC 13, GSC 124 공히 배양세포내에 고중력처리에 의해 특이적으로 축적되는 mRNA가 나타났으며, 중력강도 300,000 x g 에 비해 450,000 x g 처리에서 더욱 강한 축적을 보였고 450,000 x g 4시간 처리에서 최대의 수준을 보였다.

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