• 제목/요약/키워드: DNA함량

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DNA 복원에 관련된 박테리아 Spirosoma aerolatum KACC 17939T의 완전한 게놈 서열 (Complete genome sequence of Spirosoma aerolatum KACC 17939T, a bacterium related to the DNA repair)

  • 김동욱;김주영;김수정;김민지;이주연;김명겸
    • 미생물학회지
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    • 제53권3호
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    • pp.230-232
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    • 2017
  • 이 연구에서는 자동차의 에어컨의 바이오필름환경에서 분리 된 Spirosoma aerolatum KACC $17939^T$의 완전한 게놈 서열을 분석하였다. 이 게놈은 G + C 함량이 48.3%인 7,959,595 bp으로 구성되어 있고 6,471개의 유전자와 6,471개의 단백질 코딩 유전자, 9개의 rRNA 유전자 그리고 43개의 tRNA 유전자 및 115개의 위유전자(pseudogene)를 포함하고 있다.

고추 플러그묘 초기 생육을 촉진시키는 Bacillus amyloliquefaciens MJ-3의 분리 및 상토내 처리 효과 (Isolation of Bacillus amyloliquefaciens MJ-3 and Its Effect on the Early Growth Promotion of Red Pepper Plug Seedlings in Compost)

  • 김진호;최용화;강상재;주길재;서장선;임태헌
    • 생명과학회지
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    • 제13권5호
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    • pp.582-589
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    • 2003
  • 본 연구에서는 가지과 작물의 근권에서 유용한 균주를 분리하고 근권ㆍ길항ㆍ생육촉진미생물을 선별ㆍ제제화하고 상토에 첨가하여 미생물제제 혼입 상토를 제조한 후 고추 플러그묘의 초기 생장에 미치는 영향을 조사하였다. 근권미생물로는 가지과 작물의 뿌리 및 재배 토양 등 385점의 균원시료로부터 540여점을 분리한 후, 가지과 작물에 공통적으로 발생되는 Alternaria solani, Botrytis cinerea, Fusarium oxysporium, Phytophthora capsici, Sclerotinia sclerotiorum 등의 병원균에 높은 길항력을 가진 미생물 20여종을 선발하고, 이들 길항미생물 중에서 고추의 초기 생육을 촉진시키는 MJ-3균주를 최종 선발하였다. 근권ㆍ길항ㆍ생육촉진미생물인 분리주 MJ-3은 Bergey's manual of systematic bacteriology의 방법과 16S rDNA sequence법 등으로 조사하여 Bacillus amyloliquefaciens동정하였다. 제제화한 B. amyloliquefaciens를 상토에 첨하여 미생물 혼입 상토를 제조하였고, 이를 이용하여 재배한 고추 플러그 묘는 초장과 경경, 뿌리길이, 생체중량 등이 모두 대조구에 비해 소량 증가되었으나, 특히 뿌리의 생체중량이 대조구가 0.61g/plant인데 비해 시험구는 0.88g/plant로 44.3% 증가하였다. 미생물제제 첨가 상토에서 재배한 고추의 gib-berellin (GA$_1$) 함량은 0.559ng/g(건조중량)이었다.

새로운 절대 메탄올 산화세균의 분리 및 특성 (Characteristics of a New Obligate Methanol-Oxidizing Bacterium)

  • Kim, Si-Wook;Park, Yong-Ha
    • 미생물학회지
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    • 제31권4호
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    • pp.261-266
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    • 1993
  • 유일한 탄소 및 에어지원으로 메탄올만을 이용하여 성장하는 새로운 절대 메탄올 자화세균을 토양으로 부터 분리하였다. 분리균주는 그람음성의 운동성이 없고 포자를 형성하지 않는 간균으로 정대호기성 세균이었다. 이 균주는 catalase 활성과 oxidase 활성을 가지고 있으며, nitrate를 nitrite로 환원시킬 수 있고 성장시 vitamin이나 특이한 생육인자를 요구하지 않았다. 세대시간은 1.6시간으로 메탄올 동화경로로는 ribulose monophosphate pathway(Entner-Doudoroff 변형경로)를 이용하나 α-ketoglutarate dehydrogenase 활성은 없었다. Ammonium ion은 glutamate dehydrogenase를 이용하여 동화하였다. DNA의 guanine plus cytosine 함량은 61.0 mol%이고 세포내 지방산으로는 누고 straight-chain saturated C$^{16:0}$ acids(palmitie acids)와 unsaturated C$^{16:1}$ acids(palmitoleic acids)를 가지고 있으나 이외에도 두 종류의 unidentified C$_{17}$ branched fatty acid도 포함하고 있었다. Major ubiquinone은 Q-8이나 Q-6와 Q-7을 특이하게 소량 가지고 있었다. Phospatidylethanolamine과 Phosphatidylglycerol이 주요한 phospholip의 구성물질이나 diphosphatidylgycerol도 소량 포함하고 있었다. 위와같은 생리적, 생화학적 자료로 부터 분리균주를 새로은 종 즉, Methylohacillus methanolovorus sp. nov.로 명명하였다.

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분홍색 통성 메탄올 자화세균의 분리 및 특성 (Isolation and Characterization of a Pink-Pigmented Facultative Methylotrophic Bacterium)

  • 양석훈;김영민
    • 미생물학회지
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    • 제27권1호
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    • pp.63-69
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    • 1989
  • 흙으로부터 에탄올을 이용하여 성장하는 분홍색 통성 에단올 자화세율을 분리하여 Methylobacteriu~η sp. strain SY 1이라 명명하였다. 이 세균은 그람음성세균으호 약간 굽은 간균이고 한쪽 끝에 달련 한개의 편모로 운동하였다. 세균의 군략은 매끈 하고 밝은 분홍맺을 띄우며 정성이 높았다. 이 세균이 지니는 DNA의 G+C 함량은 약 66%로 나타났다. 이 제균은 칠대호가 성으호 catalase와 oxidase 활성을 나타내었고, carotenoid 색소와 poly-$\beta$-hydroxy butyrate를 가지고 있었다. 이 세균은 또 한 세가지 종류의 큰 plasmid DNA (45,000, 38,500, 23,000)을 가졌으며, $30^{\circ}C$와 pH7.0에서 0.5%(v/v)의 에탄올을 이용 하여 빼른 성장을 하였다($t_{d}$=6.5시간), 이 세균은 메탄올은 울온 여러까지 종듀의 당, 유기산, 아미노산, 아민 및 알코올을 이용하여 성장할 수 있었고, 메탄올은 serine pathway를 통하여 이 세균의 세포 구성물질로 전환됨을 알 수 있었다.

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호냉성 해양세균 Shewanella sp. L93로부터 Eicosapentaenoic Acid 생산 및 정제를 위한 최적화 조건 (Optimal Condition for Eicosapentaenoic Acid Production and Purification from Psychrophillic Marine Baterium Shewanella sp. L93)

  • 모상준;홍혜원;방지헌;조기웅
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.218-223
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    • 2011
  • Eicosapentaenoic acid 생산 세균을 얻기 위해 1999~2000년 하계연구 기간 중에 남극 생물 및 침적토를 사용하여 600주의 균주를 분리하였고 TLC와 GC를 사용하여 오메가-3 고도불포화 지방산 EPA를 생산하는 미생물 7 주를 성공적으로 분리하였으며, 이중 EPA 생산이 가장 높은 L93 균주를 선발하였다. 16S rDNA의 염기서열 분석을 통하여 Shewanella 속으로 조사되었으며, 이에 분리된 균주를 Shewanella sp. L93라 명명하였다. EPA를 생산 최적 배양온도 $4^{\circ}C$이며, 초기 pH 7에서 최적 EPA 함량을 보였다. 아울러 염 농도는 50 %(w/v)에서 생산이 최대였다. EPA 최적 생산 조건을 이용하여 리터당 320 mg 생산할 수 있는 생산 시스템을 확립하였다. Urea 침전법과 HPLC을 이용하여 수율 72% 이상의 97% 순도를 가진 EPA를 정제할 수 있는 분리 정제 시스템 또한 본 연구를 통하여 확립하였다.

황화수소 산화세균인 새로운 Thiobacillus sp.의 분리 및 특성 (Isolation and Characterization of a New Hydrogen Sulfide-Oxidizing Bacterium Thiobacillus Sp.)

  • 차진명;이인화
    • 미생물학회지
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    • 제32권4호
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    • pp.252-257
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    • 1994
  • 황화수소 산화세균인 Thiobacillus sp.를 전남 화순의 폐탄광수에서 분리하였다. 분리된 균주는 그람음성의 운동성이 있고, 포자를 형성하는 간균이었으며, 환원된 무기 황화합물을 산화하여 에너지원으로 사용하는 호기성 통성 화학합성 영양균이었다. 분리균주는 thiosulfate를 첨가한 기본배지에서 유기물을 동화하며 성장하였고, 에너지원으로 사용된 thiosulfate는 32mM 이상의 농도에서는 오히려 기질억제 인자로 작용하여 균의 성장을 억제하였다. 최적 thiosulfate 농도는 32mM이었다. DNA의 G+C 함량은 65.0mol%이고, 세포내 주요 지방산중 비순산화 지방산은 16:1+7$_{cyc}$, 16:0과 수산화 지방산은 3-OH 12:0을 가지며, $C_{18}$의 미동정 가지형의 지방산도 포함하고 있었다. Ubiquinone system은 Q-9을 가지고 있었다. 위와 같은 생리생화학적 특성 결과로부터, 본 분리균주는 Thiobacillus sp. iw.의 새로운 종으로 판단하였다.

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효모의 미토콘드리아와 M-DNA (On the Mitochmria of Yeast and M-DNA)

  • 홍순우
    • 미생물학회지
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    • 제9권1호
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    • pp.39-45
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    • 1971
  • saccharomyces cerevisiae J170, mutant를 사용하여 YEP 배지에서 20시간 진탕 배양하여 생장이 왕성한 영양시기의 효모세포를 얻었다. 이 세포를 sporulation medium에 접종하여 3$0^{\circ}C$에서 20시간 진탕 배양하면 약 80%의 ascospore를 형성함을 볼 수 있었다. 포자형성시기와 생장시기를 택하여 D-C-glucose 운반에 관하여 비교 검토한 결과는 다음과 같다. haploid인 포자형성시나 diploid인 생장시기의 포도당 흡수는 PH6.0에서 최대이었다. 이 두 시기는 포도당 운반은 2,4-dinitrophenol에 의하여 저해되었으므로 포자형성기의 포도당운반도 역시 energy를 요구하는 능동수송과 연관이 있음을 알게 되었아. 생장시기의 포도당 흡수정도는 포자형성기 보다 높았으며 이때에 fructose나 galactose와 포도당흡수의 관계는 서로 경쟁적으로 작용함을 알 수 있었다. 효모세포의 당 성분은 ribose, mannose, $\alpha$,$eta$-glucose로 되어 있으며 특히 포자형성기의 mannose 함량은 영양세포 때보다 현저히 적었다.

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형질전환 오이(Cucumis sativus L.) 식물체에서 완두 Superoxide Dismutase 유전자의 발현 (Expression of Pea Superoxide Dismutase Gene in Transgenic Cucumber (Cucumis sativus L.) Plants)

  • 김재훈;오승용;이행순;조만현;이은모;우인식;곽상수
    • 식물조직배양학회지
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    • 제25권3호
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    • pp.201-206
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    • 1998
  • Superoxide dismutase (SOD)를 많이 생산하는 신기능성 오이(Cucumis sativus L.) 과실을 개발하기 위하여, 발아 7일째의 자엽절편에 완두콩(Pisum sativum) 유래 MnSOD 유전자를 Agrobacterium tumefeciens LBA4404의 매개로 형질 전환시켰다. 1mg/L zeatin, 0.1mg/L IAA, 300mg/L claforan, 100mg/L kanamycin이 포함된 선발배지에서 부정아를 유도한 후, 1주일 간격으로 계대배양하면서 kanamycin 저항성 형질전환체를 선발하였다. 선발배지 배양 6주 후 kanamycin 저항성을 가진 부정아만을 절단하여 0.2mg/L NAA가 함유된 발근배지에 옮겨 뿌리를 유도한 후, 화분에서 순화시켰다. 소식물체의 잎에서 DNA를 분리하여 PCR 로 분석한 결과, 3개의 식물체에서 선발마커유전자인 NPTII 유전자가 존재함을 확인하여 SOD 유전자가 오이에 도입됨을 확인할 수 있었다. 이중 한 개체의 과실에서 SOD 함량이 무처리개체에 비해 약 3.2배 높았으며 native gel 전기영동에서 도입한 SOD isoenzyme 밴드가 강하게 검출되었다.

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인산가용화 활성을 갖는 바실러스 서브틸리스 HR-1019 분리와 특성 (Isolation and Characterization of a Novel Bacterium, Bacillus subtilis HR-1019, with Insoluble Phosphates Solubilizing Activity)

  • 이용석;박동주;김재훈;김형석;최용락
    • 생명과학회지
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    • 제23권2호
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    • pp.242-248
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    • 2013
  • 본 연구의 목적은 우수한 미생물 제제 개발용 인산염 가용화 균주의 개발이다. 경작지 토양에서 분리한 인산염 가용화 균주의 특성 및 16S rDNA 염기서열을 조사한 결과 Bacillus subtilis HR-1019로 동정되었다. Bacillus subtilis HR-1019는 hydroxyapatite, tri-calcium phosphate 및 aluminum phosphate 3가지의 난용성 인산염을 모두 가용화하였다. 난용성 인산염의 분해능이 최대가 되는 배양온도는 $37^{\circ}C$이었으며, 배양초기 pH가 5.0이었다. 탄소원으로 glucose를 5% 첨가시 가용화능이 높았으며, 가용화된 유리인산의 함량이 증가함에 따라 pH가 크게 감소하였다. 분리균주 HR-1019가 식물병원균에 대하여 균의 생육을 저지하는 clear zone 확인으로 항균효과를 확인하였다.

초기계배의 뇌 형성에 관한 세포 생물학적 연구 (Cell Biological Studies on Brain Formation at the Early Stage of Chick Embryogenesis)

  • 최임순;주충노;최춘근;김재원;주상옥
    • 한국동물학회지
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    • 제29권3호
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    • pp.215-233
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    • 1986
  • Tryptophan을 계란에 투여하고 배양하였을 때의 초기 계배의 뇌형성에 미치는 영향을 대뇌피질세포의 전자현미경 관찰과 계배두부의 단백질 및 핵산과 serotonin의 정량 그리고 몇가지 기초대사에 관여하는 효소활성을 관찰하였다. 계란에게 tryptophan을 투여하고 $5\\sim10$일간 부란한 계배의 대뇌피질세포 전자현미경으로 관찰한 결과 정상에 비해 크게 손상되었으며 특히 핵막이 불규칙하고 핵응축현상이 심하며, 염색질이 핵막에 응집되어 있고 인이 심하게 분해되었고 핵막이 팽출되어 수포가 많이 생기고 확장된 Golgi체가 많으며 조면소포체가 확장되고 소포화왼 것들도 있었으나 lysosome은 드물게 보였으며 tryptophan 투여로 인한 기형현상이 뚜렷하였다. Tryptophan을 투여한 10일 계배의 DNA 함량은 크게 저하되지는 않았으나 RNA 함량과 단백질 함량 그리고 lactate dehydrogenase, succinate dehydrogenase, malate dehydrogenase, glucose 6-phosphate dehydrogenase와 같은 기초대사에 관여하는 효소들의 활성이 저하된 것으로 보아 tryptophan은 단백질 합성을 저하시킨 것으로 관찰되었다. 한편 10일 계배의 serotonin의 함량은 시험군에서 크게 늘고 있으며 serotonin의 증거가 intracellular yolk granule의 분해를 지연시켜 기형현상이 일어나는지는 분명치 않으나 tryptophan 투여로 인하여 단백질 합성이 저하되고 따라서 효소활성이 저하됨으로서 세포분화에 지장을 초래하는 것으로 생각된다.

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