The importance of including spin-orbit interactions for the correct description of structures and vibrational frequencies of haloiodomethanes is demonstrated by density functional theory calculations with spin-orbit relativistic effective core potentials (SO-DFT). The vibrational frequencies and the molecular geometries obtained by SO-DFT calculations do not match with the experimental results as well as for other cations without significant relativistic effects. In this sense, the present data can be considered as a guideline in the development of the relativistic quantum chemical methods. The influence of spin-orbit effects on the bending frequency of the cation could well be recognized by comparing the experimental and calculated results for $CH_2BrI$ and $CH_2ClI$ cations. Spin-orbit effects on the geometries and vibrational frequencies of $CH_2XI$ (X=F, Cl, Br, and I) neutral are negligible except that C-I bond lengths of haloiodomethane neutral is slightly increased by the inclusion of spin-orbit effects. The $^2A^{\prime}$ and $^2A^{{\prime}{\prime}}$ states were found in the cations of haloiodomethanes and mix due to the spin-orbit interactions and generate two $^2E_{1/2}$ fine-structure states. The geometries of $CH_2XI^+$ (X=F and Cl) from SO-DFT calculations are roughly in the middle of two cation geometries from DFT calculations since two cation states of $CH_2XI$ (X=F and Cl) from DFT calculations are energetically close enough to mix two cation states. The geometries of $CH_2XI^+$ (X=Br and I) from SO-DFT calculations are close to that of the most stable cation from DFT calculations since two cation states of $CH_2XI$(X=Br and I) from DFT calculations are energetically well separated near the fine-structure state minimum.
We investigate dissociation of diatomic molecules and anions using density functional theory (DFT) and density-corrected density functional theory (DC-DFT). We scan the potential energy curve of CH, NH and NO neutral molecule and its anion with both DFT and DC-DFT (in form of Hartree-Fock DFT, HF-DFT) using various functionals. Using CCSD(T) results as reference, we perform the error decomposition scheme recently proposed by Kim et al. The results show while most neutrals are $functio{\acute{n}}al$ error $domi{\bar{n}}ating$ normal calculations, $CH^-$ and $NO^-$ anions are density-driven error dominating abnormal calculations. In case of $NH^-$, traditional DFT goes to a wrong dissociation limit indicating abnormality, but both HF-DFT and CCSD(T) results need further investigation due to the kinks on the curve.
In this work, we discuss where the failure of Kohn-Sham Density Functional Theory (DFT) occurs in weak interactions. We have adopted density-corrected density functional calculations and dispersion correction separately to find out whether the failure is due to density-driven error or functional error. The results of Benzene Ar complex, one of the most common examples of van der Waals interactions, show that DFT calculations of van der Waals interaction suffer from functional error, rather than density-driven error. In addition, errors in DFT calculations of the S22 dataset, which contains small to relatively large (30 atoms) complexes with non-covalent interactions, are governed by functional errors.
We carried out DFT calculations for monohydrated sulfuric and phosphoric acids. We are interested in clusters which differ in orientation of hydrogen atoms only. Such molecular complexes are close in energy, since they lie in the vicinity of the global minimum energy structure on the flat potential energy surface. For monohydrated sulfuric acid we identified four different isomers. The monohydrated phosphoric acid forms five different conformers. These systems are difficult to study from the theoretical point of view, since binding energy differences in several cases are very small. For each structure, we calculated harmonic vibrational frequencies to be sure that if the optimized structures are at the local or global minima on the potential energy surface. The analysis of calculated -OH vibrational frequencies is useful in interpretation of infrared photodissociation spectroscopy experiments. We employed four different DFT functionals in our calculations. For each structure, we calculated binding energies, thermodynamic properties, and harmonic vibrational frequencies. Our analysis clearly shows that DFT approach is suitable for studying monohydrated inorganic acids with different hydrogen atom orientations. We carried out MP2 calculations with aug-cc-pVDZ basis set for both monohydrated acids. MP2 results serve as a benchmark for DFT calculations.
We compared methodologies based on the density functional theory (DFT), e.g., time-dependent DFT (TD-DFT), TD-DFT within Tamm-Dancoff approximation (TDA-DFT), and spin-unrestricted DFT (UDFT), that are usually employed to optimize the geometries of ${\pi}$-conjugated molecules in their lowest lying triplet excited ($T_1$) state. As a model system for ${\pi}$-conjugated molecules, we employed 1,2,3,4,5-pentacyano-6-phenyl-benzene. In conjunction with 6-31G(d) basis sets, we made use of gap-tuned range-separated ${\omega}B97X$ functional which is often employed recently in the calculations of molecular excited states. Near the equilibrium geometries, we found that the important difference between the geometries derived at UDFT level and those at TD-DFT or TDA-DFT methods: more stable ground-state energies but higher triplet excitation energies for UDFT derived geometries. In the studies, we discuss such differences in more detail.
Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
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2013.08a
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pp.136-136
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2013
High-resolution photoemission spectroscopy (HRPES) measurements were collected and density functional theory (DFT) calculations were conducted to track the coverage dependent variation of the absorption structure of 2-thiophenecarboxaldehyde (C4H3SCHO: TPCA) on the Ge(100) surface at room temperature. In an effort to identify the most probably adsorption structures on the Ge(100) surface, we deposited TPCA molecules at a low coverage and at a high coverage and compared the differences between the electronic features measured using HRPES. The HRPES data provided three possible adsorption structures of TPCA on the Ge(100) surfaces, and DFT calculations were used to determine the plausibility of the structures. HRPES analysis, corroborated by DFT calculations, indicated that an S-dative bonded structure was the most probable adsorption structure at relatively lower coverage levels, the [4+2] cycloaddition structure was the second most probable structure, and the [2+2]-C=O cycloaddition structure was the last probable structure on the Ge(100) surfaces at relatively higher coverage levels.
Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
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2016.02a
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pp.142.2-142.2
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2016
The metal intercalation to an organic semiconductor is of importance since the charge transfer between a metal and an organic semiconductor can induce the highly enhanced conductivity for achieving efficient organic electronic devices. In this regard, the changes of the electronic structure of copper phthalocyanine (CuPc) caused by the intercalation of potassium are studied by ultraviolet photoemission spectroscopy (UPS) and density functional theory (DFT) calculations. Potassium intercalation leads to the appearance of an intercalation-induced peak between the highest molecular occupied orbital (HOMO) and the lowest molecular unoccupied orbital (LUMO) in the valence-band spectra obtained using UPS. The DFT calculations show that the new gap state is attributed to filling the LUMO+1, unlike a common belief of filling the LUMO. However, the LUMO+1 is not conductive because the ${\pi}$-conjugated macrocyclic isoindole rings on the molecule do not make a contribution to the LUMO+1. This is the origin of a metal-insulator transition through heavily potassium doped CuPc.
Proceedings of the Polymer Society of Korea Conference
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2006.10a
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pp.230-230
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2006
Density functional theory (DFT) calculations using the B3LYP hybrid functional and the 6-311++G(d,p) basis set have been performed to predict the wavelength dispersion of optical absorbance and refractive indices for organic compounds and polymers in the range between the vacuum UV (${\sim}157\;nm$) and near-IR (${\sim}850\;nm$). The DFT calculations can reproduce the experimental dispersions of absorbance and refractive indices with high accuracy and low costs. The calculated dispersions demonstrate that the judicious introductions of $-F\;and\;-CF_{3}$ into alicyclic and heterocyclic compounds are effective in reducing the absorption at shorter wavelengths. In addition, the calculated Abbe numbers that represent the refractive index dispersion in the visble region are linearly proportional to the calculated refractive indices at 589 nm.
Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
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2011.08a
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pp.216-216
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2011
We will investigate the bonding configurations of phenylalanine and tyrosine adsorbed on the Ge(100) surface using CLPES and DFT calculations. First, the C 1s, N 1s, and O 1s spectra obtained at 300 K revealed that both the amine and carboxyl groups of phenylalanine and tyrosine concurrently participated in adsorption on the Ge(100) surface without bond breaking using CLPES, depending on the extent of coverage. In the second place, we confirmed that the "O-H dissociated-N dative bonded structure" is the most stable structure implying kinetically favorable structure, and the "O-H dissociation bonded structure" is another stable structure manifesting thermodynamically advantageous structure using DFT calculations. This tendency turns up both phenylalanine and tyrosine, similarly. Furthermore, through the CLPES data and DFT calculation data, we discovered that the "O-H dissociated-N dative bonded structure" and the "O-H dissociation bonded structure" are preferred at 0.30 ML and 0.60 ML, respectively. Moreover, we found that the phenyl ring of phenylalanine is located in axial position to Ge(100) surface, but the phenyl ring of tyrosine is located in parallel to Ge(100) surface using DFT calculations.
As an aid towards improving the treatment of exchange and correlation effects in electronic structure calculations, it is desirable to have a clear picture of concepts of exchange-correlation functionals in computational calculations. For achieving this aim, it is necessary to perform different theoretical methods for many groups of materials. We have performed hybrid density functional theory (DFT) methods to investigate the density charges of atoms in rings and cages of carbon nanotube. DFT methods are engaged and compared their results. We have also been inclined to see the impression of exchange and correlation on nuclearnuclear energy and electron-nuclear energy and kinetic energy. With due attention to existence methods, B3P86, B3PW91, B1B96, BLYP and B3LYP have used in this work.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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