송아지 胸線 DNA의 nucleotide 당 spermine 0.016 분자의 비율로 結合되는 spermine 濃度에서 그 DNA와 ethidium과의 結合에 對한 Hill 係數는 1.7인 反面에 spermine이 存在하지 않는 條件에서는 그 Hill 係數가 0.38이었다. Spermine에 依한 DNA의 viscometric titration data, 260nm에서의 anomalous absorbance-temperature profile 및 粘性度-溫度 樣相과 더불어 이 data를 基礎로 하여 spermine 結合에 依하여 誘發되는 conformational transition의 allosteric propagation이 DNA의 凝縮된 構造로의 單分子的 collapse에 관여됨을 豫測할 수 있다.
송아지 胸線 DNA가 單分子的 凝縮된(collapsed) 構造를 이루는 spermine 濃度에서 얻어지는 異例的 吸光度-溫度 樣相(anomalous absorbance-temperature profile)의 trough 領域에 이르는 相變移에 對한 cooperativity, enthalpy, 및 相變移 midpoint를 구하여 그 값들을 Tm 領域의 값들과 比較한 結果 그 두 그룹의 값들은 서로 相異하였으며 前者의 값들이 後者의 값들 보다 ethidium bromide에 對하여 더 銳敏하였다. Ethidium bromide 濃度를 增加시킴에 따라서 그 trough의 깊이가 작아져서 終局的으로 없어졌으나 그와 對照的으로 Tm은 實驗的으로 一定하게 維持되었다. 本 硏究結果를 基礎로 하여 DNA 凝縮 메카니즘을 推理하였다.
The interaction of cationic surfactants, n-alkyltrimethylammonium bromide ($C_nTAB$; n = 12, 14, 16) with anionic polyelectrolyte, poly(styrenesulfonate) (PSS) has been studied by surface tension measurement. In the absence of added salt, the cationic surfactants bind to PSS quantitatively up to ca. 60% coverage of anionic sites of the polyanion and the complexes were surface inactive. Further binding of the surfactant cations on PSS caused a sharp conformational transition of the surfactant/ PSS complexes to surface active complexes and accompanied precipitation. The binding showed a biphasic behavior in the presence of NaCl and cooperativity of the binding became less as the concentration of NaCl increased. Binding of the cationic surfactants on poly(vinylsulfonate) also showed the biphasic behavior and the cooperativity of the binding was much less even in the absence of NaCl. The binding of surfactant to PSS provided hydrophobic environment to solubilized pyrene and reduced the viscosity of the solution greatly even at surfactant concentrations well below cmc. This study indicated that the surfactant bound to PSS up to $60{\%}$ coverage of PSS sites are present as surfactant aggregates which are wrapped up with PSS chains, and hydrophobic interaction is an important factor in the binding of the surfactants to PSS.
L-세린 탈수화효소(LSD)는 L-serine을 피루브산과 암모니아로 전환하는 반응을 촉매하는 iron-sulfur 함유 효소이다. 세균성 아미노산 탈수화 효소 중에서, L-serine에 대한 이들 특정 효소만이 촉매 부위에서 iron-sulfur cluster를 이용하는 것으로 보고되고 있다. 또한, 세균성 LSD는 구조적 특성과 도메인의 배열에 따라 네 가지 유형으로 분류된다. 현재까지, 이 효소들은 소수의 균주로부터 얻어진 LSD 효소에 대해서만 연구되었지만, 다양한 세균성 LSD의 촉매 메커니즘을 이해하기 위해서는 더 많은 자세한 조사가 요구된다. 본 연구에서, Mycobacterium tuberculosis H37Rv로부터 유래된 유형 II LSD (MtLSD) 단백질을 효소 동력학적 방법을 이용하여 생화학적 및 촉매적 특성을 규명하기 위해 발현 및 정제되었다. MtLSD에 대한 L-serine의 포화 곡선은 알로스테릭 협동성(allosteric cooperativity)을 나타내는 전형적인 S자형(sigmoid)의 특성을 보였다. 이때의 $K_m$과 $k_{cat}$ 값은 각각 $59.35{\pm}1.23mM$과 $18.12{\pm}0.20s^{-1}$로 계산되었다. 또한, 고정된 L-serine 농도 하에서 D-serine의 농도 대비 초속도에 대한 그래프는 비선형 쌍곡선 감쇠 형태를 보였고, $k_{cat}$ 값의 변화 없이 $30.46{\pm}5.93mM$의 겉보기 $K_i$ 값으로 D-serine에 대한 경쟁적 억제(competitive inhibition)를 나타내었다. 이들 연구는 MtLSD의 촉매 특성 및 기질 특이성에 관한 통찰력 있는 생화학적 정보를 제공한다.
The synthesis and characterization of third- and fifth-generation poly(propylene imine) dendrimers terminated with imidazole moieties is reported. Functionalization was achieved using simple peptide coupling reagents. These materials were characte rized by MALDI-MS, NMR, and titration. The use of these endgroup-functionalized dendrimers as catalysts for the hydrolysis of 2,4-dinitrophenyl acetate is described. Molecular simulations provide a basis for interpreting the catalytic data.
The reaction of [(2-N,N-dimethylaminomethyl) pheny] methylvinychlorosiane with t-BuLi in hexane solvent gave dimers, five isomeric 1,3-disilacyslobutanes which were weparated and charaterized. In trapping experiments with various trapping agents, no corresponding silene-trapping aduct was observed. We suggest that more important species for the formation of five isomeric dimers might be the zwitterionic species generated by virtue of intramolecular donor atom rather than the silene.
Kim, Jeong-Hwan;Lee, Jin-Woo;Shin, Eun-Jung;Nam, Soo-Wan
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제21권2호
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pp.212-217
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2011
${\alpha}$ and ${\beta}$-subunits (ApCpnA and ApCpnB) are group II chaperonins from the hyperthermophilic archaeum Aeropyrum pernix K1, specialized in preventing the aggregation and inactivation of substrate proteins under conditions of transient heat stress. In the present study, the cooperativity of ${\alpha}$- and ${\beta}$-subunits from the A. pernix K1 was investigated. The ApCpnA and ApCpnB chaperonin genes were overexpressed in E. coli Rosetta and Codonplus (DE3), respectively. Each of the recombinant ${\alpha}$- and ${\beta}$-subunits was purified to 92% and 94% by using anionexchange chromatography. The cooperative activity between purified ${\alpha}$- and ${\beta}$-subunits was examined using citrate synthase (CS), alcohol dehydrogenase (ADH), and malate dehydrogenase (MDH) as substrate proteins. The addition of both ${\alpha}$- and ${\beta}$-subunits could effectively protect CS and ADH from thermal aggregation and inactivation at $43^{\circ}C$ and $50^{\circ}C$, respectively, and MDH from thermal inactivation at $80^{\circ}C$C and $85^{\circ}C$. Moreover, in the presence of ATP, the protective effects of ${\alpha}$- and ${\beta}$-subunits on CS from thermal aggregation and inactivation, and ADH from thermal aggregation, were more enhanced, whereas cooperation between chaperonins and ATP in protection activity on ADH and MDH (at $85^{\circ}C$) from thermal inactivation was not observed. Specifically, the presence of both ${\alpha}$- and ${\beta}$- subunits could effectively protect MDH from thermal inactivation at $80^{\circ}C$ in an ATP-dependent manner.
Park, Bong-Sun;Hirotani, Aiko;Nakano, Yoshihisa;Kitaoka, Shozaburo
유기물자원화
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제1권1호
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pp.115-125
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1993
Euglena gracilis 에서 arginine deiminas는 mitochondrial matrix 내에 존재한다. 고도로 정제된 효소가 0.23 nM의 $K_m$ 값을 갖고 효소반응을 하기 위해서는 $Co^{2+}$가 필요하며, 이때 최적 pH는 9.3~10.3이었다. Gel filtration에 의해서 얻어진 조효소 단백질의 분자량은 87,000이었으며, SDS-acrylamide gel electrophoresis에 의해 효소는 48,000의 분자량을 갖는 2개의 동일한 subunit로 구성되어 있음이 밝혀졌다. Euglena의 arginine deiminas는 sulfhydryl inhibitors에 의해서 활성이 저지되었는데, 이는 sulfhydryl group이 효소의 활성부위에 관여함을 나타낸다. 이 sulfhydryl group은 arginine이 효소와 결합하는데 있어서 negative cooperativity를 나타내었다. ${\beta}-guanidinopropionate$, ${\gamma}-guanidinobutyrate$와 guanidinosuccinate는 효소의 활성을 저지시키지 않는데 반하여, $L-^{\alpha}-amino-{\beta}-guanidino-propionate$, D-arginine, 그리고 L-homoarginine은 효소의 활성을 강력하게 저지시켰다. Citrulline과 ornithine에 의해서도 상당한 정도의 효소활성저지가 관찰되었다. 우리는 Euglena의 arginine deiminase의 독특한 성질이 Euglena 라는 원생동물 내에서 arginine 대사의 조절에 어떻게 영향을 미치는지를 토의하고자 한다.
UCC의 활용은 네티즌 상호간의 정보와 즐거움 공유라는 측면에서 급속한 양적 질적 확산추세에 있다. 그렇지만 학교에서 교육적 목적을 위한 UCC 활용에 대한 연구는 미진한 편이다. 본 사례연구는 초등학교 학생들의 UCC 활용교육에 대한 인지적 태도와 관련 영향요인을 분석하는 데 목적이 있다. 이를 위해 UCC 활용교육의 교육적 가치, 제작과정의 용이성, 사회적 영향요인, 협동성, 재미, 컴퓨터 자기효능감, 집중력 등을 태도에 영향을 미치는 선행요인으로 설정하고, 초등학교 5,6학년 246명의 설문응답 결과를 토대로 모형의 타당성을 통계적으로 검증하였다. 분석결과, 교육적 가치와 용이성 및 사회적 영향은 모두 태도에 유의한 영향을 미치는 것으로 나타났으며, 용이성, 재미, 협동성 등 교육적 가치의 선행요인도 모두 유의한 것으로 나타났다. 용이성의 선행요인으로 도입한 재미, 효능감, 집중력도 모두 통계적으로 유의한 요인으로 판정되었다. 분석결과를 바탕으로 초등학교에서의 UCC 활용교육 활성화에 대한 시사점도 제시하였다.
Cr-B2, a Gram-negative hexavalent chromium [Cr(VI)] reducing bacteria, was isolated from the aerator water of an activated sludge process in the wastewater treatment facility of a dye and pigment based chemical industry. Cr-B2 exhibited a resistance for 1,100 mg/l Cr(VI) and, similarly, resistance against other heavy metal ions such as $Ni^{2+}$ (800 mg/l), $Cu^{2+}$ (600 mg/l), $Pb^{2+}$ (1,100 mg/l), $Cd^{2+}$ (350 mg/l), $ZN^{2+}$ (700 mg/l), and $Fe^{3+}$ (1,000 mg/l), and against selected antibiotics. Cr-B2 was observed to efficiently reduce 200 mg/l Cr(VI) completely in both nutrient and LB media, and could convert Cr(VI) to Cr(III) aerobically. Cr(VI) reduction kinetics followed allosteric enzyme kinetics. The $K_m$ values were found to be 43.11 mg/l for nutrient media and 38.05 mg/l for LB media. $V_{max}$ values of 13.17 mg/l/h and 12.53 mg/l/h were obtained for nutrient media and LB media, respectively, and the cooperativity coefficients (n) were found to be 8.47 and 3.49, respectively, indicating positive cooperativity in both cases. SEM analysis showed the formation of wrinkles and depressions in the cells when exposed to 800 mg/l Cr(VI) concentration. The organism was seen to exhibit pleomorphic behavior. Cr-B2 was identified on the basis of morphological, biochemical, and partial 16S rRNA gene sequencing chracterizations and found to be Acinetobacter sp.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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