본 논문은 이미지에서 불필요한 영역을 삭제하고, 그 영역을 배경과 어울리게 채워넣는 이미지 인페인팅 방법을 제안한다. 제안하는 인페인팅 방법은 크게 인페인팅 영역을 채우는 밴드 인페인팅(band in-painting)과 seamless cloning으로 나눌 수 있다. 밴드 인페인팅(band in-painting)은 인페인팅 영역의 경계를 따라서 일정한 두께를 가지는 타겟 밴드(target band)를 정의하고, 인페인팅 영역 밖의 모든 픽셀을 중심으로 하는, 타겟 밴드와 같은 모양과 크기를 가지는 소스 밴드(source band)와 타겟 밴드 차이를 계산하여, 그 값의 차이가 가장 작은 소스밴드 영역의 값을 인페인팅 영역에 복사하는 것이다. Seamless cloning은 인페인팅 영역과 입력 이미지의 경계를 없애는 것이다.
Although the human genome has been nearly completely sequenced, the functions and the roles of the vast majority of the genes, and the influences of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in these genes are not entirely known. A modified mutation detection method was developed for large-scale cloning of the possible SNPs between tumor and normal cells for facilitating the identification of genetic factors that associated with cancer formation and progression. The method involves hybridization of restriction enzyme-cut chromosomal DNA, cleavage and modification of the sites of differences by enzymes, and differential cloning of sequence variations with a designed vector. Experimental validations of the presence and location of sequence variations in the isolated clones by PCR and DNA sequencing support the capability of this method in identifying sequence differences between tumor cells and normal cells.
A new GFP-based T-vector for cloning of PCR products was developed by using a green fluorescent protein (GFP) as a mafker. In order to facilitate the DNA inserts, multiple restriction sites, SP6 and T7 RNA polymerase promoter sites, were introduced close to the PCR DNA insertion site of a pCRGv vector. The XcmI-digested pHNT plasmid can be used to clone a 3' A-overhanged PCR DNA amplified by Taq DNA polymerase. A potential method of easing some difficulties from its use along with its cost savings proveded by this vector are likely to lead to the replacement of other T-vectors for PCR DNA cloning.
Clostridium thermocellum의 cellulase 유전자를 pBR322를 이용하여 Escherichia coli에 cloning하였다. 삽입된 Hind III 분해 DNA 단편의 크기는 약 1. 8kb였으며 이미 알려진 C. themocellum의 cellulase gene과는 다른 제한효소 분해위치를 가진 새로운 cellulase gene으로서 E, coli에서 CMCase와 FPase 활성을 나타내었다. 이 유전자는 생육의 전시기를 통해 표현되었고 고온성 cellulase의 구조적, 기능적 특성이 그대로 유지되었을 뿐만 아니라 상당량이 세포밖으로 분비되었다.
Cloning by nuclear transfer in mammals using somatic cells has enormous potential applications. However, somatic cloning has been inefficient in all species in which NT is successful. High abortion and fetal death rates have been observed. These developmental defects have been attributed to incomplete nuclear reprogramming by the somatic cloning process. In this review, we will discuss studies conducted in our labs to understand the nuclear reprogramming process.
Hong, Soon-Gyu;Choi, Ji-Young;Pryor, Barry M.;Lee, Hong-Kum
Mycobiology
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제37권3호
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pp.240-242
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2009
An improved procedure for preparing PCR cloning vectors was developed. This procedure includes the incorporation of adapters to create XcmI restriction enzyme sites in pBluescript II SK(+) vectors, digestion with XcmI followed by further digestion of the small fragment produced by XcmI digestion with additional enzymes, and purification with PCR purification kits. Using this procedure, PCR cloning vectors with high ligation efficiencies and low blue or false-positive colonies were obtained.
토양에서 분리한 알카리 내성 Bacillus sp. YA-14 의 promoter를 Bacillus promoter probe vector인 pPL703을 이용하여 Bacillus subtilis내에 cloning 하였다. 얻어진 형질전환체 중 promoter 활성이 가장 높은 균주의 CAT 비활성은 8.07로 expression vector인 pPL708의 CAT 비활성보다 2.5배 이상 높았으며 대수 증식기가 끝난 이후에 그 활성이 급격하게 증가하였다. 재조합 plasmid내의 삽입 DNA 단편은 그 크기가 2.8kb이고 제한효소 BamHI, Sal I 인식부위가 각각 한군데 존재하였다.
It is clear that the construction of large insert DNA libraries is important for map-based gene cloning, the assembly of physical maps, and simple screening for specific genomic sequences. The bacterial artificial chromosome (BAC) system is likely to be an important tool for map-based cloning of genes since BAC libraries can be constructed simply and analyzed more efficiently than yeast artificial chromosome (YAC) libraries. BACs have significantly expanded the size of fragments from eukaryotic genomes that can be cloned in Escherichia coli as plasmid molecules. To facilitate the isolation of molecular-biologically important genes in Ashbya gossypii, we constructed Ashbya chromosome-specific BAC libraries using pBeloBAC11 and pBACwich vectors with an average insert size of 100 kb, which is equivalent to 19.8X genomic coverage. pBACwich was developed to streamline map-based cloning by providing a tool to integrate large DNA fragments into specific sites in chromosomes. These chromosome-specific libraries have provided a useful tool for the further characterization of the Ashbya genome including positional cloning and genome sequencing.
핵 이식 기술을 이용한 cloning 송아지 생산이 처음 보고(Prather et al., 1987) 된 후, 소 수정란 Cloning에 대한 많은 연구가 분자 생물학 등 여러 분야에서 꾸준히 계속되고 있다. 이 기술은 빈우의 번식 능력을 향상시켜 유전적 개량량을 증대할 수 있는 번식과 육종을 위한 도구로써 많은 잠재력을 지니고 있다. 최근 핵 이식 기술을 이용하여 유전적으로 우수한 빈우로부터 수천개의 수정란을 생산하여, 이들 수정란에게 생산된 송아지가 번식 축군으로 공시되어 있으므로, 그 결과가 주목되나 아직까지는 비용이 많이 들고 송아지 생산 효율이 저조하므로, 가까운 장래에 일반 양축가에 이용될 가능성이 낮다. 그러나 이 기술의 실용화를 위하여 선결되어야 할 많은 문제점들 중, 지난 몇 년 동안 많은 연구기관에서 수행된 활발한 연구의 결실로써, 난포란 제핵, cell fusion 과 oocyte activation의 방법등 주요 장애 요인들이 점차 극복되면서 실용화를 위한 접근이 예견되어지며, 구미의 일부 개량 기관에서는 이를 상업화 하기 위한 여건을 다지고 있다. 그러므로 이 Review에서는 fllicular dynamics, 난포란의 성숙, cell cycle, 난포란 제핵, cell fusion과 oocyte activation, 이식후 핵의 remodeling과 reprogramming에 대한 현재까지의 보고된 자료를 기초로 그 기본 원리를 재고하는데 초점을 맞추었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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