• 생명과학회지
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• 제19권4호
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• pp.449-456
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• 2009

신경아세포종은 미분화된 신경외배엽 세포로부터 유래한 신경능세포에 의해 형성된 소아기에 보는 가장 많이 발생하는 악성 종양 중 하나이다. 신경아세포종인 Neuro-2a 세포는 신경세포의 분화, 세포사 억제 효능, 세포독성 검정 등에 활용되고 있다. Neuro-2a 역시 다른 신경아세종과 같이 염색체 변이를 가지고 있지만, 이에 대해 고밀도의 게놈수준에서 염색체 변이에 대해 보고된 바가 없다. 본 연구에서는 고집적 마이크로어레이(최소 43,000 개의 코딩, non-코딩 유전자 서열이 집적된 마이크로어레이)기반의 비교유전체보합법을 활용하여, 고해상도의 Neuro-2a 유전체 이상을 분석하였다. 마이크로 어레이 데이터는 Hidden Markov Model을 활용하여, 유전체 변이를 double loss, single loss, normal, single gain 그리고 amplification으로 나누어 분석하였다. Neuro2a는 MYCN 유전자의 증폭은 관찰되지 않았고, GDNF, BDNF, NENF등의 neurotrophic factor 가운데 NENF의 gain 현상이 관찰 되었다. 염색체의 이상은 4,8,10,11,15번에서 발견되었으며, 염색체 3,17,18,19에서는 전부 20개 미만의 염색체 이상이 발견되었다. 염색체 이상이 연속적으로 일어난 부위 중 gain으로서 가장 긴 부분은 Chr8:8,427,841-35,162,415의 약 26.7 Mb이며, single loss로서 가장 긴 곳은 Chr4:73,265,785-88,374,165의 약 15.1 Mb였다. 염색체의 위치는 UCSC 데이터베이스 (UCSC mm8, NCBI Build 36)에 근거하였다.

• 생명과학회지
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• 제14권6호
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• pp.1023-1027
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• 2004

본 연구는 출아형 효모 Saccharomyces cerevisiae에서 자외선의 상해 시 이를 정상으로 회복시키는 절제회복(excision repair) 유전자로 알려진 RADS의 특성 규명을 위하여 균류 Coprinus cinereus에서 이와 유사한 유전자를 분리하였다. RADS 유사 유전자를 분리하기 위하여 균류 C. cinereus의 염색체 DNA를 전기영동하여 분리한 다음 효모 RADS DNA를 probe로 하여 이와 hybridization하였다. 이 결과 RADS유사 유전자는 3.4kb의 insert DNA를 갖고 있었다. 또한 Southern hybridization으로 이 유사 유전자는 fungus C. cinereus의 염색체에 존재함을 확인하였다. 분리한 RADS 유사 유전자의 전사체 크기는 2.8kb 였으며, 자외선의 상해시 전혀 자외선에 대한 유도성이 없음을 Northern hybridization으로 확인하였다. 또한 유사유전자 부분을 삭제하였을 때 이 부분이 없는 세포는 전혀 생존을 못하였다. 이 결과 분리한 RADS 유사유전자는 세포의 생존에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.

• Journal of Genetic Medicine
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• 제10권2호
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• pp.99-103
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• 2013

Purpose: This study was designed to determine the frequency and echocardiographic findings of 22q11.2 deletions in fetuses with cardiac defects on fetal ultrasound or familial backgrounds of 22q11.2 deletions. Materials and methods: We retrospectively reviewed the medical and ultrasonographic records of 170 fetuses that underwent fluorescence in situ hybridization (FISH) analysis for chromosome 22q11.2 deletions between February 2001 and April 2013. Results: Among 145 fetuses with cardiac defects, six (4.1%) had 22q11.2 deletions. Deletions of 22q11.2 were detected in 6 (5%) of the 120 fetuses with conotruncal defects: 5 (8.9%) of 56 with tetralogy of Fallot (TOF) and 1 (5.9%) of 17 with double outlet right ventricle (DORV). No deletions were found in cases of pulmonary atresia, truncus arteriosus, right aortic arch, or transposition of the great arteries. No 22q11.2 deletions were found in non-conotruncal cardiac malformations. Among 25 fetuses with familial backgrounds of 22q11.2 deletions, one (4%) had a maternally inherited 22q11.2 deletion with no cardiac findings. Conclusion: Knowledge of the frequency and echocardiographic findings of 22q11.2 deletions might be helpful for prenatal genetic counseling. It is advisable to perform FISH analysis for 22q11.2 deletions in pregnancies exhibiting conotruncal cardiac defects such as TOF or DORV.

• 대한두경부종양학회지
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• 제9권1호
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• pp.25-32
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• 1993

저자들은 배양에 성공한 결절성 갑상선종 2예와 유두성 갑상선암 2예에서 염색체 이상을 찾아내어 이러한 이상들이 서로 연관을 갖는지 여부를 연구하고자 본 실험을 시행하였다. 결절성 갑상선종의 염색체 형태는 매우 다양하게 나타나면서도 2예 모두가 특이적인 염색체 이상은 보이지 않았다. 제 1 예 : modal 염색체 슷자는 42에서 46범위 내였고 염색체 8, 19, 21, 22는 빈번한 결손을 보였다. 51개 분석 세포들 중에 9가지 구조적 변성이 관찰되었으나 집단 염색체 변화는 없었다. 제 2 예 : modal 염색체 수는 43이었고, 염색체 17과 19는 흔한 결손을 나타내었다. 이 두 결절성 갑상선종의 세포유전학적 특성은 저이배체(hypodiploidy)와 매우 다양한 염색체 양상을 나타내었다. 유두성 갑상선암에 대한 분석 결과는 다음과 같다. 제 3 예 : 다소의 숫적, 구조적 염색체 변화가 관찰되었으나 특이적인 염색체 이상은 찾아볼 수 없었다. 제 4 예 : 염색체 양상이 del(11)(q23)의 집단 염색체 변화를 수반하는 매우 다양한 이질적인 양상을 나타내었다. 유두성 갑상선암의 del(11)(q23) 염색체 변화는 이미 Eva Olah등이 1989년 보고한 바 있다. 아마도 갑상선에서 유두성 갑상선암의 암화과정에 11q 결손이 중요한 역할을 할 것으로 추정된다. 이상의 결과에 따르면 유두성 갑상선암과 결절성 갑상선종 둘 다 염색체 이상을 나타냈지만 양자간의 염색체의 특이적인 상관 관계를 발견할 수 없었다.

• Journal of Genetic Medicine
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• 제2권1호
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• pp.35-39
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• 1998

Duchenne/Becker muscular dystrophy are the major neuromuscular disorders with X-linked recessive inheritance. Preimplantation diagnosis of sex determination has been generally used to avoid male pregnancies with these diseases. However, in order to determine if the embryo is normal, carrier or affected regardless of the sex, there is a need for a combined analysis of specific exon on dystrophin gene as well as sex determination of embryo using the same biopsied blastomere. If the exon deletion is not determinable, further diagnosis of carrier or patient can be performed by haplotype analysis. In this study, we applied the primer extension preamplification (PEP) method, which amplifies the whole genome, in 40 cases of single amniocyte and 40 cases of chorionic villus cell. We analysed haplotypes using two (CA)n dinucleotide polymorphic markers located at the end of 5' and 3' region of the dystrophin gene. Exon 46 of dystrophin gene and DYZ3 on chromosome Y were chosen as a target sequence for coamplification PCR. Upon optimizing the conditions, the amplification rates were 91.25% (73/80) for haplotypes (92.5% in amniocyte, 90% in chorionic villus cell) and 88.75% (71/80) for coamplification (85% in amniocyte, 92.5% in chorionic villus cell). The result of the study indicates that haplotypes analysis and coamplification of dystrophin and Y-specific gene using PEP can be applied to prenatal and preimplantation diagnosis in Duchenne/Becker muscular dystrophy making it possible to determine if the fetus is a carrier or an affected one.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제52권6호
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• pp.701-704
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• 2009

Smith-Magenis 증후군(SMS)은 17번 염색체에서 유전물질을 향유한 곳이 일부 떨어져 나가면서 생기는 질환으로, 신체, 발달 및 행동상의 특징적 이상이 나타나는 질환이다. 출생빈도는 출생아 25,000명 중에 한 명 꼴로 출생하는 것으로 알려져 있으나 최근 분자유전학적 진단 기술의 발달로 이 질환의 환자수가 점차 증가되고 있다. 다양한 임상증상과 더불어 수면장애, 경련에 대한 치료뿐만 아니라 적절한 언어, 행동학적 치료가 필요하다. 저자들은 SMS 환아 2예를 진단하고 치료하고 있는 경험이 있어 이를 보고하는 바이다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제20권2호
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• pp.415-424
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• 2010

The purpose of this study was to investigate the relationship between the global regulatory mechanism known as quorum sensing and expression of virulence factors in Escherichia coli O157:87. A nonpolar luxS deletion was introduced into the chromosome of strain CI03J, a human clinical isolate from South Korea, to create the ${\Delta}luxS$ mutant strain ML03J. Phenotypic characterization of wild-type and mutant strains demonstrated that ML03J had no obvious growth or metabolic defects on 0.2% glucose LB medium, produced a functionally defective flagellum, and could not utilize sorbose; the biological significance of sorbose utilization is unknown. Omics-based analysis revealed the involvement of LuxS in the transcriptional activation of several flagella/chemotaxisrelated genes (flhD; fliA, C, D, S, Z; and cheA, Y, Z), repression of glutamate-dependent acid resistance genes (gadAB), and expression of virulence factors including Shiga toxin, hemolysin, and SepD within the LEE pathogenicity island.

• Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
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• 제35권1호
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• pp.1-6
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• 2009

DNA double-strand breaks (DSBs) occur commonly in the all living and in cycling cells. They constitute one of the most severe form of DNA damage, because they affect both strand of DNA. DSBs result in cell death or a genetic alterations including deletion, loss of heterozygosity, translocation, and chromosome loss. DSBs arise from endogenous sources like metabolic products and reactive oxygen, and also exogenous factors like ionizing radiation. Defective DNA DSBs can lead to toxicity and large scale sequence rearrangement that can cause cancer and promote premature aging. There are two major pathways for their repair: homologous recombination(HR) and non-homologous end-joining(NHEJ). The HR pathway is a known "error-free" repair mechanism, in which a homologous sister chromatid serves as a template. NHEJ, on the other hand, is a "error-prone" pathway, in which the two termini of the broken DNA molecule are used to form compatible ends that are directly ligated. This review aims to provide a fundamental understanding of how HR and NHEJ pathways operate, cause genome instability, and what kind of genes during the pathways are associated with head and neck cancer.

• Journal of the Korean Academy of Child and Adolescent Psychiatry
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• 제8권1호
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• pp.133-138
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• 1997

Prader-Willi 증후군(Prader-Willi Syndrome, PWS)은 $50{\sim}-70%$ 정도의 환자에서 염색체 15번에 이상이 있음이 보고된 유전적인 질환으로서, 그 특징적인 임상양상은 심한 근긴장의 저하(hypotonia), 반사소실(areflexia), 섭식의 곤란(feeding difficulty), 저체온증(hypothermia), 성기왜소증(microgenitalia), 음낭저형성증(hypoplastic scrotum), 대식증(polyphagia), 포만감의 감소와 비만, 정신운동발달의 지연, 저성선기능증(hypogonadism) 및 안면과 척추의 기형 등이다. 또한 행동상의 여러 문제들이 동반되는데 분노발작, 피부를 심하게 뜯거나 발모광, 과도한 식욕과 관련된 음식 도벽증이 나타나므로 정신과적 치료가 필요하다. 본 증례는 14세된 PWS환자로서 비만과 대식증, 도벽증, 학업부진 및 생활부적응 문제 등으로 2주간의 입원과 약 1년간의 추적기간 동안 약물요법(fluoxetine 투여)과 행동요법, 그리고 가족요법을 받아 왔다. 장기간의 Fluoxetine투여를 통하여 비만과 식욕의 조절에는 효과가 만족스럽지 않았으나 우울감과 감정문제, 자살사고 및 행동문제들은 호전되었다.

• Toxicological Research
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• 제18권2호
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• pp.129-138
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• 2002

The mouse lymphoma assay (MLA) has been recently validated as a sensitive and specific test system to determine the genotoxic potential for a chemical. The objective of this study is to evaluate the utility of MLA for detecting mutagens. Especially, to compare MLA with the in vitro chromosomal aberration test (CA), we performed MLA using the microwell method with three chemicals (hydroxyurea, theophylline and amino acid copper complex), which were reportedly positive in the CA. In cell treated with hydroxyurea, anti-neoplastic agent that blocks DNA replication, evidence of a positive response was obtained without S9 mix for 4 h and 24 h. In addition, analysis of colony size distribution at concentration that gave an elevated mutant fraction showed that hydroxyurea induced a high proportion of small type colonies, indicating that hydroxyurea-induced mutation is associated with large chromosomal deletion. Conversely, negative MLA result was obtained for theophylline, which was wed as central nervous system stimulator. Although theophylline increased the mutant frequency at concentration of 1250 $\mu\textrm{g}$/$\textrm{m}{\ell}$ with S9 mix for 4 h, a concentration-related increase in mutant frequency was not observed. The MLA result of amino acid copper complex was considered equivocal because the positive result was obtained at concentration showing 10% or less RS or RTG. Thus, among 3 CA-positive chemicals, positive MLA result was obtained for one. The other two chemicals were negative and equivocal. However MLA, which evaluates mutagenic potential of chemicals through colony formation by cell grouth, may provide a higher predictivity of carcinogenesis than CA.