• 제목/요약/키워드: C. sp

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Agarase를 생산하는 Persicobacter sp. DH-3의 분리 및 β-agarase의 특성 (Isolation of an Agarase-producing Persicobacter sp. DH-3 and Characterization of its β-agarase)

  • 허다혜;이동근;이상현
    • 생명과학회지
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    • 제29권2호
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    • pp.158-163
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    • 2019
  • 이 연구의 목적은 agarase를 생산하는 새로운 해양 박테리아를 분리하는 것이다. Agarase는 agarose를 가수분해하여 다양한 생리활성을 가지는 agarooligosaccharides 또는 neoagarooligosaccharides를 생성할 수 있다. 전라남도의 여수연안에서 채취한 해수로부터 DH-3 균주를 분리하였다. DH-3 균주는 16S rDNA 서열분석을 통하여 Persicobacter sp. DH-3로 명명하였다. 세포 외로 분비된 효소는 Persicobacter sp. DH-3의 배양액으로부터 얻었으며, 특성연구에 사용하였다. 20, 30, 40, 50, 60 및 $70^{\circ}C$에서의 온도별 상대활성은 각각 50, 55, 70, 100, 90 및 50%였다. pH 5, 6, 7 및 8에서의 pH별 상대활성은 각각 75, 100, 90, 75%였다. 본 효소는 20 mM Tris-HCl 완충액에서 pH 6.0 및 $50^{\circ}C$에서 최대활성을 나타내었다. 본 효소는 한천이 액체상태로 존재하는 $50^{\circ}C$에서 최대활성을 나타내었으므로 산업적으로 유용한 효소로 판단된다. 본 효소는 20, 30 및 $40^{\circ}C$에서 2시간 동안 열처리하여도 80% 이상의 잔존활성을 보였다. TLC 분석결과, Persicobacter sp. DH-3 균주의 한천분해효소는 네오한천올리고당인 neoagarohexaose와 neoagarotetraose를 생성하였으므로 ${\beta}$-agarase로 확인되었다. Zymogram 분석결과, Persicobacter sp. DH-3는 적어도 45, 70 및 140 kDa 크기의 3종류 이상의 한천분해효소를 생산하는 것을 확인할 수 있었다. 그러므로, Persicobacter sp. DH-3 유래 agarase는 기능성을 가진 neoagarooligosaccharides의 생산에 활용될 수 있을 것으로 기대된다.

Serratia marcescens KCTC 2172로부터 pst operon의 클로닝 및 해석 (Molecular Cloning and Analysis of Phosphate Specific Transport (pst) Operon from Serratia marcescens KCTC 2172)

  • 이승진;이용석;이상철;박인혜;안순철;최용락
    • 생명과학회지
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    • 제19권5호
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    • pp.566-572
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    • 2009
  • S. marcescens KCTC 2172로부터 유전자 은행을 작성하여 재조합 클론 pDH3를 얻었으며, pDH3 유래의 서브클론을 작성하였다. 플라스미드 pPH4의 전염기서열 5,137 bp 영역을 결정한 결과 3개의 ORF가 있음을 확인하였다. 이들은 pst 오페론의 pstC, pstA, 및 pstB, 세 유전자를 동일 전사방향으로 코드하고 있었다. 타 세균의 유전자와 비교한 결과 S. marcescens의 pst 오페론은 pstS와 phoU가 결손되어 있다. 조절영역에는 CRP 결합영역과 pho box 서열이 존재하였다. 보고된 유전자와 상동성 조사결과, PstC 단백질은 Yersinia sp., Vibrio sp. 및 Pseudomonas sp.와는 49, 37, 33%의 상동성을, PstA 단백질은 Yersinia sp., Vibrio sp. 및 Pseudomonas sp.와 64, 51, 47%의 상동성을, PstB 단백질은 Methanocaldococcus sp., E. coli 및 Mycoplasma sp.와 60, 50, 48%의 상동성을 나타내었다. Pst 유전자들은 조절영역의 cAMP-CRP 복합체에 의해 in vivo에서 양성적으로 발현됨을 확인하였다. Pst 오페론을 포함하는 플라스미드를 도입한 대장균은 인산운송에 관여하는 능력을 확인하였다.

한국산 Actinolaimoidea상과의 (Dorylaimida:Nematoda) 4신종 기재 (Descriptions of Four New Species of Actinolaimoidea (Dorylaimida:Nematoda) from Korea)

  • 최영연
    • 한국토양동물학회지
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    • 제5권2호
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    • pp.85-96
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    • 2000
  • Actinolaimoidea 상과에 속하는 4신종을 기재 하였다. Neoactinolaimus gosungensis n. sp.는 체장이 2.2-2.4 mm 이고, b = 4.3-4.9; c = 10.7-11.2; 교접자는 60-62 $mu extrm{m}$이다. 구순부는 낮고, 비대칭형인 창침과 넓은 관공을 가진다. Egtitus arcuatus n. sp.는 체장이 1.5-1.8 $\mu\textrm{m}$이고, b = 3.6-4.2; c = 14-15, 창침은 배부로 굽었고, 식도의 기부에 식도장간개가 있다. Paractinolaimus tuberculantus n. sp.는 체장이 1.9-2.5 mm이고, b = 3.3-4.0, c = 7.2-8.8, 교접자는 66-69 $\mu\textrm{m}$이고 특이하게 몸통이 꼬였고, 식도의 기부에 결절이 있다. Carcharolaimus koriensis n. sp.는 체장이 1.7-1.9 mm이고, b = 3.6-4.5, c = 65-76 그리고 표피에 매우 뜨겁고 창침공이 큰 것이 특징이다.

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호알칼리성, 고온성 Bacillus sp. TA-11에 대한 오골계 난백 Lysozyme의 용균특성 (Characteristics of the Egg White Lysozymes from Ogol Fowl and Fowl for the Lysis of an Alkalophilic and Thermophilic Bacillus sp. TA-11)

  • 이성훈;조창호;안용근;이종수
    • 한국식품영양학회지
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    • 제9권4호
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    • pp.447-451
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    • 1996
  • Bacillus sp. TA-11에 대한 오골계 난백 lysozyme과 일반 난백 lysozyme의 용균성을 비교분석 하였다. 오골계 난백 lysozyme의 용균활성은 Bacillus sp. TA-11를 5$0^{\circ}C$에서 18시간 정치배양한 대수기 후기의 세포에 대하여 가장 높았고, lysozyme의 농도는 0.25%가 최적이었다. 또한 lysozyme의 최적반응 pH와 온도는 각각 4.5와 35$^{\circ}C$였다. 일반 난백 lysozyme의 용균활성은 시험균주를 24시간 배양한 정지기의 세포에 대하여 가장 높았고 lysozyme의 최적 농도는 0.5%였으며 반응 최적 pH와 온도는 각각 5.5와 4$0^{\circ}C$이었다.

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아가미지렁이 (Branchiura sowerbyi)에 기생하는 포자충류에 관한 연구 (A study on Actinosporeans parasitized in Branchiura sowerbyi (Oligochaeta : Annelida))

  • 김영길
    • 한국어병학회지
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    • 제8권1호
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    • pp.13-21
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    • 1995
  • 1994년 6월부터 9월사이에 장포자충병이 발생했던 3 개 저수지산 아가미지렁이에서 4 종의 방선포자충인 Aurantiactinomyxon sp. A, B, C와 Neoactinomyxon sp. D가 방출되었다. 방선포자충이 기생한 아가미지렁이는 식도에서 항문에 이르기까지 장상피조직 전체에 기생하였고, 몸의 뒷쪽으로 갈수록 성숙한 방선포자충을 볼 수 있었다. 방출 직전의 성숙한 방선포자는 지렁이 장관 상피에서 각각 개체적으로 분리되어 있었으나, 미숙한 것은 $60{\times}65{\mu}m$ 크기의 포낭체속에 원형질 크기 $20{\times}25{\mu}m$인 미숙한 방선포자가 6 개씩 들어 있었다. 3 개 저수지에서 조사한 아가미지렁이 총 1,762 마리에서 4.88% 인 88 마리가 기생되었다. 이중 Aurantiactinomyxon sp. A는 0.74% (13 마리), Aurantiactinomyxon sp. B 는 2.27% (40 마리), Aurantiactinomyxon sp. C 는 1.59% (28 마리) 이었고, Neoactinomyxon sp. D는 0.28% (5 마리) 이었다. 22.6-$30.7^{\circ}C$ 실온에서 32 일동안 아가미지렁이에서의 방선포자충의 방출 일수는 1 일 (1 회)이 전체의 23.4% 이었고, 그 다음이 5 일 (5 회)로 11.7% 이었으며, 대부분이 15 일이내에 방출이 완료되나, 32 일째에서도 방출하는 것 (6.7%)도 있었다.

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Filter Hybridization과 Solution Hybridization 방법에 의한 백서 Surfactant Protein C mRNA 정량측정의 비교 (Comparative Quantitative Study of Surfactant Protein C mRNA by Filter Hybridization and Solution Hybridization in Rats)

  • 김진호;손장원;양석철;윤호주;신동호;박성수
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제51권6호
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    • pp.517-529
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    • 2001
  • 연구배경 : Filter hybridization이나 solution hybridization 방법들은 Northern blot나 slot blot에 비하여 빠르며 재현성이 높고 소량의 RNA를 측정할 수 있으며 한꺼번에 많은 시료들을 동시에 측정하는것이 가능하다. 방 법 : 저자들은 쥐를 대상으로 하여 SP-C mRNA를 filter hybridization과 solution hybridization 방법들로 각각 정량측정하여 방법론에 따른 분자생물학적 정도관리에 대한 관찰을 하기 위하여 이 연구를 시행하였다. 결 과 : 1) Solution hybridization 방법에 의한 SP-C mRNA의 정량측정을 위한 RNA 검체물의 최소량은 3pg 이상이었다. 2) Solution hybridization에 쓰이는 SP-C sense mRN A input 양과 유전자 cpm과의 Y=6.46 X+244(X=SP-C mRNA 전사체 Y=cpm)였고, 양자간의 상관계수 r은 0.99로 매우 밀접한 상관성을 보였다. 3) Filter hybridization방법에 의한 SP-C mRNA의 정량측정을 위한 RNA검체물의 최소량은 0.1ng 이상이었다. 4) SP-C의 sense 전사체 0, 0.1, 0.5, 1.0, 2.5 및 5 ng에 대한 cpm과의 표준곡선은 Y=2541.6 X+252.7 (X=SP-C mRNA 전사체 Y=CPM) 이고 상관계수 r은 0.99로 매우 밀접한 상관성을 보였다. 결 론 : Solution hybridization 방법은 다른 방법에 비해 RNA input 양을 아주 소량 사용하면서도 주위에 높은 배후 방사성 산란을 보이는 비특이성 DNA가 있음에도 불구하고 특정 시료의 양이 한정되어 있는 상황에서 RNA를 분석 검토하는데 매우 유용한 연구방법이며, 뿐만아니라 filter hybridization 방법은 mRNA를 정량 측정하는데 있어서 신속하고 재현성이 높으며, 한꺼번에 많은 시료들을 시행할 수 있고, 사료의 mRNA를 정량측정 하는데 있어서 유용한 방법임을 알 수 있었다.

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공간 영역에서의 평활한 완전 8방향 윤곽선 부호화 기법 (A coding technique for the smoothly perfect 8-connected contours in the spatial domain)

  • 조성호;김인철;이상욱
    • 전자공학회논문지S
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    • 제35S권1호
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    • pp.114-121
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    • 1998
  • In this paper, we introudce the notion of the smoothly perfect 8-conntected (SP8C) contour and describe a coding technique for the SP8C contours. Based on the simplificationusing the majority filter proposed by Gu, SP8C contours are restricted on the contour lattice from the segmented image. By noting thating SP8C contours are restricted to travel in only 3 different directions along the contours, we attempt to encode the SP8C contours using the following two techniques. The one is the neighbouring direction segmentcoding, while the other is to employ the notion of the entropy endoding. Computer simulations reveal that the contours can be efficiently encoded by the two technique.

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Bacillus sp. SW29-2의 분리 및 Colletotrichum coccodes에 대한 항진균 활성 (Isolation of Bacillus sp. SW29-2 and Its Antifungal Activity against Colletotrichum coccodes)

  • 한영환
    • 생명과학회지
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    • 제27권6호
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    • pp.688-693
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    • 2017
  • 하수 슬러지로부터 감자 뿌리썩음병 및 토마토 탄저병을 유발하는 Colletotrichum coccodes에 대해 항진균 활성이 있는 세균을 분리하였다. 분리균의 partial 16S rRNA sequence는 Bacillus methylotrophicus CBMB205 및 Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum FZB42와 각각 99%의 상동성을 보여주었다. 분리균은 neighbor-joining phylogenetic tree, BlastN 염기서열 분석, 형태학적 및 배양학적 특성에 따라 Bacillus sp. SW29-2로 동정하였다. 분리균 Baciilus sp. SW29-2는 B. methylotrophicus CBMB205 type strain과 비교시 4% 이상 NaCl에서 생육하는 것이외에 형태학적, 생리학적 특성이 모두 동일하였다. 분리은 호기성, Gram-양성, 내생포자를 형성하는 세균이었다. 실험한 $18-47^{\circ}C$(최적, 약 $38^{\circ}C$)의 온도범위에서, pH 3-9(최적, 약 6.0) 범위의 초기 배지 pH에서 모두 생육이 관찰되었다. Baciilus sp. SW29-2의 C. coccodes에 대한 생육저지환(직경)은 23 mm에서 29 mm의 범위이었다. 분리 세균은 또한 사과 푸른곰팡이병(penicillum rot disease)을 유발하는 Penicillium expansum에 대해 우수한 항진균 활성을 보여주었다. 현재까지, Bacillus속 세균의 C. coccodes에 대한 항균활성 연구는 파악할 수 없었다. 이 결과는 분리균 Bacillus sp. SW29-2가 식물 병원성 C. coccodes에 대해 생물학적 방제제로의 활용 가능성이 있으며, 추후, 식물병을 유발하는 다른 진균에 대해서 적용할 예정이다.

미소역학 시험기법에 의한 9Cr1MoVNb강의 열화도 평가 (A Study on Material Degradation Evaluation of 9Cr1MoVNb Steel by Micromechanics Test Method)

  • 백승세;나성훈;유현철;이송인;안행근;유효선
    • 대한기계학회:학술대회논문집
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    • 대한기계학회 2000년도 추계학술대회논문집A
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    • pp.105-110
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    • 2000
  • The Micromechanics test is new test method which uses comparatively smaller specimen than that required in conventional material tests. There are several methods, such as small-specimen creep test, the continuous indentation test, and small punch(SP) test. Among them, the small punch(SP) test method has been applied to many evaluation fields, such as a ductile-brittle transition temperature, stress corrosion cracking, hydrogen embrittlement, and fracture properties of advanced materials like FGM or MMC. In this study, the small punch(SP) test is performed to evaluate the mechanical properties at high/low temperature from $-196^{\circ}C$ to $650^{\circ}C$ and the material degradation for virgin and aged materials of 9Cr1MoVNb steel which has been recently developed. The ${\Delta}P/{\Delta}{\delta}$ parameter defined a slope in plastic membrane stretching region of SP load-displacement curve decreases according to the increase of specimen temperature, and that of aged materials is higher than the virgin material in all test temperatures. And the material degradation degrees of aged materials with $630^{\circ}C$ -500hrs and $630^{\circ}C$ -1000hrs are $36^{\circ}C$ and $38^{\circ}C$ respectively. These behaviors are good consistent with the results of hardness($H_v$) and maximum displacement(${\delta}_{max}$).

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Methanol 자화세균에 관한 생물학적 연구 (A Biological Study on the Methanol-Utilizing Bacteria)

  • 이영녹;배광성;박정호
    • 미생물학회지
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    • 제16권4호
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    • pp.170-179
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    • 1978
  • By the successive enrichment culture, more than 250 methanol-utilizing bacteria were isolated from various samples such as soil, waste water and sewage. Two strains of which were selected and tentatively identified as Acinetobacter sp. and Pseudomonas sp. experiments were carried out to determine the growth conditions for the higher biomass yield and to demonstrate the difference to protein composition dependent upon carbon sources of these two species. the results were as follows ; 1. the optimum pH was determined as 8 in the both species. The optimum temperature in Acinetobacter sp. was $25^{\circ}C{\sim}30^{\circ}C$ and pseudomonas sp. was $30^{\circ}C-35^{\circ}C$. The optimum initial concentration of mthanol was determined as 1-2% in Acinetobacter sp. and 2-3% in pseudomonas sp. 2. The optimum concnetrations of nitrogen source, micro-elements, and vitamins such as biotin and thiamine-HCl in Acnetobactar sp. were 1g $(NH_4)_3SO4,\;1{\sim}3mg\;Mn^{++},\;4mg\;Fe^{++},\;10{\mu}g\;biotin,\;and\;100{\mu}g$ thiamine-HCl per liter medium. In the Pseudomonas sp., 2g $(NH_4)_3SO4,\;1mg\;Mn^{++},\;trace\;amounts\;of\;Fe^{++},\;5{\mu}g\;biotin,\;and\;100{\mu}g$ thiamine HCl per liter were effective. Maximum biomass yield was 2.5g/l in Acinetobacter sp. and 4.8g/l in Pseudomonas sp. 3. Protein composition of the two strains exhibited that alkai-labile protein was higher than alkali-stable protein. In Pseudomonas sp., the contents of acid soluble fraction and alkali-stable protein of the cells grown in the methanol medium were higher than in sucrose medium. On the other hand, in Acinetobacter sp., alkalilabile protein of the cells grown in sucrose medium was higher than in methanol medium.

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