Objective: The Wannan Black pig is a typical Chinese indigenous, disease-resistant pig breed with high fertility, and a crude-feed tolerance that has been bred by artificial selection in the south of Anhui province for a long time. However, genome variation, genetic relationships with other pig breeds, and domestication, remain poorly understood. Here, we focus on elucidating the genetic characteristics of the Wannan Black pig and identifying selection signatures during domestication and breeding. Methods: We identified the whole-genome variation in the Wannan Black pig and performed population admixture analyses to determine genetic relationships with other domesticated pig breeds and wild boars. Then, we identified the selection signatures between the Wannan Black pig and Asian wild boars in 100-kb windows sliding in 10 kb steps by using two approaches: the fixation index (FST) and π ratios. Results: Resequencing the Wannan Black pig genome yielded 501.52 G of raw data. After calling single-nucleotide variants (SNVs) and insertions/deletions (InDels), we identified 21,316,754 SNVs and 5,067,206 InDels (2,898,582 inserts and 2,168,624 deletions). Additionally, we found genes associated with growth, immunity, and digestive functions. Conclusion: Our findings help in explaining the unique genetic and phenotypic characteristics of Wannan Black pigs, which in turn can be informative for future breeding programs of Wannan Black pigs.
본 연구는 제주도에서 사양기간이 같도록 사육한 재래 흑돼지($78{\pm}7kg$, female) 및 개량 흑돼지($115{\pm}5kg$, female) 고기의 물리적 특성과 관능성을 비교하기 위하여 실시하였다. 재래 흑돼지 고기는 개량 흑돼지 고기에 비하여 표면색도의 $L^*$값(명도)이 낮고 $a^*$값(적색도)과 $b^*$값(황색도)이 높았다. 재래 흑돼지와 개량 흑돼지 등심, 뒷다리 및 삼겹살의 보수력, 해동 감량, 가열 감량, 근원섬유 단백질의 추출성 및 소편화도는 동일한 부위 사이에 모두 유의적 차이를 보이지 않았다. 부위별 물리적 특성의 차이는 재래 흑돼지가 개량 흑돼지보다 작게 나타났다. 재래 흑돼지 고기는 개량 흑돼지 고기보다 물리적 특성의 경도, 저작성 및 전단력이 비교적 낮게 나타나서 관능 특성에서 가열육의 연도를 우수하게 하였다. 재래 흑돼지와 개량 흑돼지 고기의 종합적 기호도는 유의적 차이를 보이지 않았다.
Objective: Qingyu pig, a Chinese indigenous pig breed, exhibits two types of coat colour phenotypes, including pure black and white with black spotting respectively. Melanocortin receptor 1 (MC1R) and agouti signaling protein (ASIP) are two widely reported pivotal genes that significantly affect the regulation of coat colour. The objectives of this study were to investigate whether the polymorphisms of these two genes are associated with coat colour and analyze the molecular mechanism of the coat colour separation in Qingyu pig. Methods: We studied the phenotype segregation and used polymerase chain reaction amplification and Sanger sequencing to investigate the polymorphism of MC1R and ASIP in 121 Qingyu pigs, consisting of 115 black and 6 white with black spotted pigs. Results: Coat colour of Qingyu pig is associated with the polymorphisms of MC1R but not ASIP. We only found 2 haplotypes, $E^{QY}$ and $E^{qy}$, based on the 13 observed mutations from MC1R gene. Among which, $E^{qy}$ presented a recessive inheritance mode in black spotted Qingyu pigs. Further analysis revealed a g.462-463CC insertion that caused a frameshift mutation and a premature stop codon, thus changed the first transmembrane domain completely and lost the remaining six transmembrane domains. Altogether, our results strongly support that the variety of Qingyu pig's coat colour is related to MC1R. Conclusion: Our findings indicated that black coat colour in Qingyu pig was dominant to white with black spotted phenotype and MC1R gene polymorphism was associated with coat colour separation in Qingyu pig.
Gaines depicts the process of transformation of a black young who accepts his execution with dignity in A Lesson Before Dying. There two personas of the protagonist, Jefferson, appear in this novel. The former seen in the black and white community is the persona of falsehood and submission, and the latter appeared in the black community is the true persona. The former, the pig persona in black-and-white community is created, forced onto them by whites and the human persona in the black community is made by their own standards without being forced. Jefferson has been depersonalized by his pig persona. He implements their false persona by mimicking pigs to confront its reality. And then he retrospects the pleasure of relationship throughout his own life. Grant's expensive gift, the radio, becomes a trigger to realize the significance of his existence and the social solidarity. Moreover, many black visitors look at him with expectant eyes of fulfilling their historical burden. After all, Jefferson is executed as a human being with dignity, and the transformation of Jefferson from a pig to a human is getting rid of the white values and standing on the black values. In other words, it is the procedure of creating the new myth out of the false myth, from meaningless life to meaningful death.
Five hundred and forty crossbred (Korean native black pig${\times}$Landrace) F2 were selected at a commercial pig farm and then divided into six different coat color groups: (A: Black, B: White, C: Red, D: White spot in black, E: Black spot in white, F: Black spot in red). Birth weight, 21st d weight, 140th d weight and carcass weight varied among the different coat color groups. D group (white spot in black coat) showed a significantly higher body weight at each weigh (birth weight, 140th d weight and carcass weight) than did the other groups, whereas the C group (red coat color) showed a significantly lower body weight at finishing stage (140th d weight and carcass weight) compared to other groups. Meat quality characteristics, shear force, cooking loss and meat color were not significantly different among the different coat color groups, whereas drip loss was significantly higher in F than in other groups. Most blood characteristics were not significantly different among the different groups, except for the red blood cells.
Sixteen primary free amino acids were determined for each 10 longissimus muscles of Yorkshir, Landrace and Korean native black pig. Eight amino acids at 7 d classified three breeds at ca. 80% confidence. The difference in free amino acids for aged meats could be one of factors responsible for more desirable palatability of Korean native black pig.
Guevarra, Robin B.;Kim, Jungman;Nguyen, Son G.;Unno, Tatsuya
Journal of Applied Biological Chemistry
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제58권4호
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pp.369-375
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2015
Meat from black pigs (BP) is in high demand compared with that from modern white pig (WP) breeds such as Landrace pigs owing to its high quality. However, the growth rate of black pigs is slower than that of white pig breeds. We investigated differences in the fecal microbial composition between white and black pigs to explore whether these breeds differed in the composition of their gut microbial communities. The swine gut microbiota was investigated using Illumina's MiSeq-based sequencing technology by targeting the V4 region of the 16S rRNA gene. Our results showed that the composition of the gut microbiota was significantly different between the two pig breeds. While the composition of the WP microbiota shifted according to the growth stage, fewer shifts in composition were observed for the BP gut microbiota. In addition, the WP gut microbiota showed a higher Firmicutes/Bacteroidetes ratio compared with that of BP. A high ratio between these phyla was previously reported as an obesity-linked microbiota composition. Moreover, the WP microbiota contained a significantly higher abundance of cellulolytic bacteria, suggesting a possibility of higher fiber digestion efficiency in WP compared to BP. These findings may be important factors affecting growth performance and energy-harvesting capacities in pigs. Our findings of differences in the gut microbiota composition between the two breeds may provide new leads to understand growth rate variation across pig breeds.
Among edible insects, black soldier fly (Hermetia illucens), yellow mealworm (Tenebrio molitor), and common housefly (Musca domestica) have been considered as an alternative protein source for pigs. Because they are easy to breed and grow in the organic wastes, and they have well-balanced nutritional value as a protein source for pigs. The black soldier fly larvae and mealworm could replace the fish meal in the diets for weaned pigs without adverse effects on growth performance and nutrient digestibility. Black soldier fly could also be included in the finishing pig's diet without any negative effects on the growth performance and pork quality of the market pigs. Insect products showed a greater standardized ileal digestibility value of amino acids than conventional animal proteins in growing pigs. Due to the limited amount of insect products used for pig feeding study, most previous pig studies have been conducted in weaned pigs. Thus, further study is needed about the optimal inclusion level of insect products in every phase diet from weaned pigs to sows. The use of insect products in swine diets has some challenges in terms of cost, supply, and safety. Lastly, intrinsic differences among insect species, processing method, and feeding phase should be taken into consideration for the use of insect products in the swine diets.
Pork from Jeju black pig (population J) and Berkshire (population B) has a unique market share in Korea because of their high meat quality. Due to the high demand of this pork, traceability of the pork to its origin is becoming an important part of the consumer demand. To examine the feasibility of such a system, we aim to provide basic genetic information of the two black pig populations and assess the possibility of genetically distinguishing between the two breeds. Muscle samples were collected from slaughter houses in Jeju Island and Namwon, Chonbuk province, Korea, for populations J and B, respectively. In total 800 Jeju black pigs and 351 Berkshires were genotyped at thirteen microsatellite (MS) markers. Analyses on the genetic diversity of the two populations were carried out in the programs MS toolkit and FSTAT. The population structure of the two breeds was determined by a Bayesian clustering method implemented in structure and by a phylogenetic analysis in Phylip. Population J exhibited higher mean number of alleles, expected heterozygosity and observed heterozygosity value, and polymorphism information content, compared to population B. The $F_{IS}$ values of population J and population B were 0.03 and -0.005, respectively, indicating that little or no inbreeding has occurred. In addition, genetic structure analysis revealed the possibility of gene flow from population B to population J. The expected probability of identify value of the 13 MS markers was $9.87{\times}10^{-14}$ in population J, $3.17{\times}10^{-9}$ in population B, and $1.03{\times}10^{-12}$ in the two populations. The results of this study are useful in distinguishing between the two black pig breeds and can be used as a foundation for further development of DNA markers.
우리흑돈(Woori black pig, W)은 재래흑돼지와 두록(Duroc, D)을 이용하여 재래흑돼지의 낮은 경제적 특성을 개선시키기 위해 국립축산과학원에서 개발한 신품종이다. 따라서 본 연구는 교배 종료종모돈으로써 우리흑돈이 삼원교잡종의 성장, 체형 및 부분육 생산수율에 미치는 영향을 평가하기 위해 수행되었다. 총 32두의 삼원교잡종을 교배 종료 종모돈에 기반하여 2처리구로 완전임의 배치하였다. 교배 종료종모돈으로 두록과 우리흑돈에 기반한 2개의 다른 삼원교잡종은 LYD[(Landrace×Yorkshire)×Duroc]와 LYW[(Landrace×Yorkshire)×Woori black pig]이였다. 본 연구는 시험 개시 후 53일 동안 수행되었다. 우리흑돈과 두록 종모돈은 삼원교잡종의 53일 체중, 총증체량, 일당증체량 및 90 kg 체중 도달일령에 영향을 미치지 않았다. 체장, 체고 및 흉심에 차이가 발견되지 않았으나, 등지방두께에서 LYD(17.29 mm)와 LYW(18.96 mm) 간의 유의적인 차이가 있었다(p<0.05). LYW 삼원교잡종의 등심수율(13.11%)이 LYD(13.85%)에 비해 유의적으로 낮게 나타났다(p<0.05). LYW의 목심 수율(8.99%)은 LYD(8.21%)에 비해 유의적으로 높게 나타났다(p<0.05). 본 연구결과, 우리흑돈은 삼원교잡종의 사양성적, 체형 및 생산수율에 부정적인 영향을 미치지 않으며, 교배 종료종모돈으로 사용할 수 있을 것으로 사료된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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