• Title/Summary/Keyword: Biovar

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Rhizoctonia solani 길항세균 Pseudomonas fluorescens의 Tn5 삽입 돌연변이주 분리 및 특성 (Isolation and Characterization of Tn5 Insertion Mutants of Pseudomonas fluorescens Antagonistic to Rhizoctonia solani)

  • 박서기;박기범;김기청
    • 한국식물병리학회지
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    • 제10권1호
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    • pp.39-46
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    • 1994
  • Pseudomonas fluorescens Biovar III strains S-2 antagonistic to Rhizoctonia solani was subjected to Tn5 mutagenesis by the transposon vector pGS9. Ampicillin and kanamycin resistant (Ampr, Kmr) transconjugants were recovered at a frequency of 1.3$\times$10-7 per initial recipient cell, when recipient cells were washed twice in TE buffer before conjugation. Of the ca. 3000 transconjugants, a frequency of noninhibitory (Inh-), nonfluorescent (Flu-) and auxotorphic (Pro-) mutants were 0.27%, 0.47% and 0.40%, respectively. In these mutants, all Inh- mutants showed the same colony morphology as wild type, whereas all Flu- and Pro- mutants inhibited the growth of R. solani. These mutants were also susceptible to chloramphenicol, indicating only the Tn5 element, except for parts of pGS9, was integrated into the recipient genome. In a Southern blot analysis, the Tn5 element inserted into one site on the chromosome for each of the chosen mutants. However, Tn5 insertion sites of Inh-, and Pro- mutants were differed in each other. These indicate that the genes essential for R. solani inhibition, fluorescent production and auxotrophic are chromosomally located, but not linked to each other.

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Occurrence and Epidemics of Bacterial Canker of Kiwifruit in Korea

  • Kim, Gyoung Hee;Jung, Jae Sung;Koh, Young Jin
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제33권4호
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    • pp.351-361
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    • 2017
  • Bacterial canker is the largest limiting factor in the cultivation and production of kiwifruit worldwide. Typical symptoms comprise necrotic spots on leaves, canker and dieback on canes and trunks, twig wilting, and blossom necrosis. Pseudomonas syringae pv. actinidiae (Psa), which is the causal agent of kiwifruit bacterial canker, is divided into four biovars based on multilocus sequence analysis of different genes, additional PCR testing of pathogenic genes (argKtox cluster, cfl, and various effector genes), and biochemical and physiological characterization. Bacterial canker caused by Psa biovar 2 designated Psa2 was detected for the first time on the green-fleshed kiwifruit cultivar Hayward in 1988 and the yellow-fleshed kiwifruit cultivar Hort16A in 2006 in Korea. Psa biovar 3 designated Psa3, responsible for the current global pandemics of kiwifruit bacterial canker, began to appear in Korea in 2011 and caused tremendous economic losses by destroying many vines or orchards of yellow-fleshed kiwifruit cultivars in one or several growing seasons. Bacterial canker epidemics caused by both Psa2 and Psa3 are prevalent in Korea in recent years. In this review, we summarize the symptomatology, etiology, disease cycle, diagnosis, and epidemiology of kiwifruit bacterial canker in Korea.

충북지역 토마토 시설재배지의 풋마름병균(Ralstonia solanacearum) 오염도 및 분리균주의 특성 (Contamination Level of Ralstonia solanacearum in Soil of Greenhouses Cultivating tomato Plants in Chungbuk Province and Characteristics of the Isolates)

  • 윤건식;박상용;강효중;이기열;차재순
    • 식물병연구
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    • 제10권1호
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    • pp.58-62
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    • 2004
  • 충북지역 토마토 시설재배지 토양의 풋마름병 병원균(Ralstonia solanaceaum)의 오염도 및 분리균의 특성을 조사하였다. 총 133개 조사 토양 중 27개 토양에서 선택배지로부터 R. solanacearum이 분리되어, 전체 시설재배지 토양의 20.3%가 풋마름병균에 오염되어 있음을 나타냈다. 오염 토양에서 병원균의 밀도는 토양 g당 $10^{2.4}$ cfu로 조사되었다. 병든 토마토로부터 분리한 12균주를 포함한 총 71개의 분리균주는 모두 레이스 1이었고, 35개 균주가 생리형 3으로, 36개 균주가 생리형 4로 구분되었다. 전체 분리균의 88% 이상이 각각 oxolinic acid 0.5$\mu\textrm{g}$/ml, streptomycin 25 $\mu\textrm{g}$/ml, tetracycline 5 $\mu\textrm{g}$/ml and cupric sulfate 375 $\mu\textrm{g}$ml(1.5 mM)을 함유한 nutrient agar에서 생장이 억제되었고, 전체균주의 11.3%, 4.2% and 5.6%가 각각 감수성균주의 최소억제농도보다 10배 이상의 oxolinic acid, streptomycin, tetracycline가 함유된 배지에서 생장하였다. 5개 균주는 2개의 살세균제에 동시에 그리고 1개 균주는 3개의 살세균제 모두에 저항성을 보였다.

콩에서 분리한 근류균의 생리, 생화학적 특성 (Physiological and Biochemical Properties of Isolates of Rhizobia from Soybean)

  • 박기선;최재을
    • 한국식물병리학회지
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    • 제12권3호
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    • pp.351-357
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    • 1996
  • 콩으로부터 분리한 140균주의 근류균은 25균주(17.9%)가 Rhizobium fredii로 115 균주(82.1%)가 Brady-rhizobium japonicum으로 동정되었다. R. fredii에 속하는 분리 균주의 생존 pH 범위는 4..5∼9.0이었고 B. japonicum의 생육 pH 범위는 5.5∼8.0로 비교적 좁게 나타났다. B. japonicum에 속하는 98균주 중에서는 53균주(54%)가 IAA를 생산하지 않는 GT I group으로, 45균주(46%)는 IAA를 생산하는 GT II group으로 명확하게 구분되었으며, 항생물질에 대한 내성 유무에 의해 10개의 group으로 구분되었다.

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토양으로부터의 Agrobacterium tumefaciens의 분리, 동정 및 옥수수의 형질전환에 이용 (Identification of Agrobacterium tumefaciens from Soil and Transformation of Maize)

  • 노광수;강봉중
    • KSBB Journal
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    • 제7권3호
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    • pp.191-200
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    • 1992
  • 토양 시료로부터A. tumefaciens를 분리 동정하고 이를 옥수수의 형질전환에 이용하기 위하여 binary vector를 이용하여 형질전환시킨 후 옥수수의 중배축 조직과 공존배양을 실시하였다. Schroth의 선택배지에서 선별된 colony들은 단일 형태를 나타내었다. 분리 균주는 해바라기 유식물의 잎조직에 종양을 형성하였으며, 거대 plasmid를 가지고 있었는데 이는 대조균주인 C58이나 Ach5의 plasmid와는 다른 종류였다. 분리균주들에 의해 형성된 tumor의 형태 및 균주의 생리, 생화학적 특성들에 의하여 공시균주를 A. tumefaciens biovar 1으로 동정하였으며 nopaline 형으로 추정하였다. 분리 균주중 AK204를 사용하여 옥수수 조직을 형질전환시키기 위하여 선택maker를 가지고 있는 binary vector(pGA642)를 균주내로 전이 시켰다. 이로 인하여 형질전환된 AK204를 옥수수 중배축 조직과 공존배양하므로서 옥수수 조직세포를 형질전환 시킨 결과, 1차적으로 Km에 저항성을 띠는 형질전환체를 선발할 수 있었으며, 그들의 가용성 단백질의 PAGE pattern이 변화되었음을 확인하였다.

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키위 궤양병 효율적 관리를 위한 매뉴얼 (A Proposed Manual for the Efficient Management of Kiwifruit Bacterial Canker in Korea)

  • 고영진;김경희;정재성
    • 식물병연구
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    • 제23권1호
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    • pp.1-18
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    • 2017
  • 키위 궤양병균인 Pseudomonas syringae pv. actinidiae는 최근 전세계에서 심각하게 경제적 손실을 초래하고 있다. 궤양병균은 우리나라에서 그린키위와 골드키위 품종들을 각각 1988년과 2006년부터 침해해왔다. 최근에는 오염된 수입꽃가루에 의해 유입된 궤양병균 biovar 3 (Psa3)가 주변 키위 재배 농가로 2차감염에 의해 급속하게 확산되어 골드키위와 레드키위 품종들에 대발생하여 피해를 주고 있다. 이 총설에서는 지난 30년간 수행한 연구 업적과 현장 경험 그리고 세계적인 주요 연구 산물들을 기초로 하여 궤양병 발생 회피, 경종적 방제, 궤양병균의 전파 차단, 조기 진단, 전염원 제거, 침입 차단, 약제 방제, 나무 치료 등 다양한 키위 궤양병 관리방법들을 요약하여 장차 키위나무를 건강하게 재배할 수 있도록 농가에서 실용적으로 사용할 수 있는 매뉴얼을 제시하고자 한다.

우리나라에 분포하는 고추와 토마토 풋마름병균(Ralstonia solanacearum) 계통들의 유전적 다양성 (Genetic Diversity of Ralstonia solanacearum Strains Isolated from Pepper and Tomato Plants in Korea)

  • 서상태;박종한;한경숙;정승룡;이승돈
    • 식물병연구
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    • 제13권1호
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    • pp.24-29
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    • 2007
  • 풋마름병징을 나타내는 고추와 토마토 식물체로부터 35개의 풋마름병균 계통들을 분리하여 생리.생화학 실험, 병원성 실험, 유전학적 실험을 통해 유전적 다양성을 연구하였다. 생리 생화학 실험과 종특이적 polymerase chain reaction(PCR)을 실시한 결과 풋마름병균 계통들은 모두 Ralstonia solanacerum biovar 4로 동정되었다. 분리균은 고추와 토마토 유묘를 이용해 병원성이 확인되었다. Repetitive sequence-based PCR(rep-PCR) 결과를 토대로 계통도 분석을 한 결과 고추와 토마토 분리균은 6개의 group으로 나뉘었으며, 유전적 다양성은 높게 나타났다. 풋마름병균 계통들의 그룹간에는 지역별, 기주별 특이성은 관찰되지 않았다.

Outbreak and Spread of Bacterial Canker of Kiwifruit Caused by Pseudomonas syringae pv. actinidiae Biovar 3 in Korea

  • Kim, Gyoung Hee;Kim, Kwang-Hyung;Son, Kyeong In;Choi, Eu Ddeum;Lee, Young Sun;Jung, Jae Sung;Koh, Young Jin
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제32권6호
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    • pp.545-551
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    • 2016
  • A bacterial pathogen, Pseudomonas syringae pv. actinidiae (Psa), is a causal agent of kiwifruit bacterial canker worldwide. Psa biovar 3 (Psa3) was first detected in 2011 at an orchard in Dodeok-myeon, Goheung-gun, Jeonnam Province in Korea. In this study, we present the results of an epidemiological study regarding Psa3 occurrence on kiwifruit orchards in Korea for the period of 2013 to 2015. Since the first detection of Psa3 in 2011, there was no further case reported by 2013. However, Psa3 was rapidly spreading to 33 orchards in 2014; except for three orchards in Sacheon-si, Gyeongnam Province, most cases were reported in Jeju Island. Entering 2015, bacterial canker by Psa3 became a pandemic in Korea, spreading to 72 orchards in Jeju Island, Jeonnam, and Gyeongnam Provinces. Our epidemiological study indicated that the first Psa3 incidence in 2011 might result from an introduction of Psa3 through imported seedlings from China in 2006. Apart from this, it was estimated that most Psa3 outbreaks from 2014 to 2015 were caused by pollens imported from New Zealand and China for artificial pollination. Most kiwifruit cultivars growing in Korea were infected with Psa3; yellow-fleshed cultivars (Yellow-king, Hort16A, Enza-gold, Zecy-gold, and Haegeum), red-fleshed cultivars (Hongyang and Enza-Red), green-fleshed cultivars (Hayward and Daeheung), and even a kiwiberry (Skinny-green). However, susceptibility to canker differed among cultivars; yellow- and red-fleshed cultivars showed much more severe symptoms compared to the green-fleshed cultivars of kiwifruit and a kiwiberry.

Identification of a Prophage-encoded Abortive Infection System in Levilactobacillus brevis

  • Feyereisen, Marine;Mahony, Jennifer;O'Sullivan, Tadhg;Boer, Viktor;van Sinderen, Douwe
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제48권3호
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    • pp.322-327
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    • 2020
  • Abortive infection systems (Abi) are phage resistance systems that can be prophage-encoded. Here, two genes encoding an Abi system were identified on a prophage sequence contained by the chromosome of the Levilactobacillus brevis strain UCCLBBS124. This Abi system is similar to the two-component AbiL system encoded by Lactococcus lactis biovar. diacetylactis LD10-1. The UCCLBBS124 prophage-derived Abi system (designated here as AbiL124) was shown to exhibit specific activity against phages infecting L. brevis and L. lactis strains. Expression of the AbiL124 system was shown to cause reduction in the efficiency of plaquing and cell lysis delay for phages of both species.

The Influence of Environmental Conditions on the Production of Pigment by Serratia marcescens

  • Hardjito, Linawati;Huq, Anwar;Colwell, Rita R.
    • Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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    • 제7권2호
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    • pp.100-104
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    • 2002
  • Serratia marcescens biovar A2/A6, isolated from an Indonesian freshwater source, was identified based on extensive morphological, biochemical and genetic characterization. Formation of pigment was found to be strongly influenced by environmental conditions. Placket-Burman design was used to analyze the effect of carbon and nitrogen sources. Based on results of physiological and biochemical studies, the optimum conditions for growth and pigment formation were incubation 30$^{\circ}C$ in a neutral to slightly alkaline medium containing lactic acid and beef extract.